EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-00416 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:23445350-23450910 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10799792chr123446441hg19
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:23445890-23445911TAACTGAAAGTGAAAGCAAGT-8.14
IRF2MA0051.1chr1:23445894-23445912TGAAAGTGAAAGCAAGTA+6.58
Lhx3MA0135.1chr1:23448518-23448531TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:23448522-23448535TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:23448526-23448539TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:23448515-23448528AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:23448519-23448532AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:23448523-23448536AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:23448514-23448527AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr1:23448527-23448540AATTAATTAATTT-6.92
Nkx3-2MA0122.3chr1:23448718-23448731AAAACCACTTAAG+6.74
POU6F1MA0628.1chr1:23448516-23448526ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23448520-23448530ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23448524-23448534ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23448528-23448538ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23448516-23448526ATTAATTAAT-6.02
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POU6F1MA0628.1chr1:23448524-23448534ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23448528-23448538ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr1:23449467-23449478AAAACAAAGAA+6.62
ZfxMA0146.2chr1:23449746-23449760GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
SE_65235chr1:23448535-23449688NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr12344943523449527
chr12344882123449200
chr12344537023445689
chr12344648123446594
chr12344875323449635
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I023122chr12344861723450984
GH01I023118chr12344509023447083
Enhancer Sequence
CTAAAGACCA CTAGAACTGA TCACCTCTAC CTGTCCTTTT GGTTCTAATA TTCTAAGATT 60
CTTGGGCCTA TGTTCCCAAT GCACTTTGTC TGTATCTCTA CTTGAGCAAT TTTCTTAGTC 120
TACTTTGCAT TACAGGTTTA TCTGACACCA TCTCCTAAAG AAAAAGCCAC AGGTAGGTTG 180
TCCTATGTTG TTTTATATTC CCCGTAGCAA TTAACGTGGA GCTTCACAAA AGTATTAGTT 240
GAATTGACTT GATGCTAATT TCTCATTTTT TTATACTTAC TATCCCTACT ACACCATAAT 300
TATAGACCAC CTTATTCTTT TGTACTGCCA TTGGCCTGGT ACAGTGTGAA ATAAACAGTC 360
AACATTTTTT TTAACGACCT GATGTGACTA GCTCTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG 420
AGACAGGGTA TCACTCTGTT GCCCAGGCTA CGGTGAAGTG GCACAATCAC AGCTCACTAT 480
AACCTCGAAC TCCTGGGCTC GAGCAATCCT CCTGCCTCAG CCTCCTGATT AGCTAGGACA 540
TAACTGAAAG TGAAAGCAAG TATGACAACT CAGATCTTAG TTTTAGCTTT AAAAATAACA 600
AGCTATGGGT GTGACCTTAG GCAAACTGCT TCATTTCTCC AGGCCTCATT AAGATATCTC 660
TTACAACTTT TAAACAAAGT CTGGAGAGGA TGTTGAGAGG AATCAAGTAA GAATAAGCCC 720
TTCTGAAAAA CCCTAGGTTT ATCTCTAGTA TAGCACTTAT CATTCTGTAT TATAATTGTC 780
TACTTGTTAC TCTCCTGTAC CAAACCCCGA GCTCCTGAAA GGCCAGAATT ATGTATTTCA 840
TCTCTGAATC CAAGCATGTG CATAGAACGT GGCACACAGT AACAGTTCAG TAAATGTTCA 900
ATGGCCAAAC TACTGAAAAT TATAAGTGCC TATACTTACG AAGACTCTTA TGTATAAATG 960
GACTTATATA AACTTATAAG AAAGAATAAT TCATCTCCCT CATGTACAAC CCTTTCAAAT 1020
AACATTAAAT AAAAGTATTT TTCTTATTAT CACCAGCTCA AGTCCAGGTT TTGTTTTTTG 1080
TTGGTAGTTT TTTTTTTTTT TAAAGACAGA GTCGTGCTCT GTCACCGAAG CTGGAGTGCG 1140
GTGGAGCAAT CGTGGCTTCC TGCAGTCTCA ACCCCCTGGA CTCAAGCAAA TCCTCCCCGC 1200
TCAGCTCCCA GAGTAGCTGG GACTACAGGG ATGTGTCACC ACAACAAGCT AAGTTTTGTA 1260
AGTTTTGTAG AGATGGGGTT TCACCATGTT GCCCAGGCTG GTCTCAAACT CCAGAGCTCG 1320
AGCAATTCAC CCACCTCAGC CTCCCAAAAT GCTGGAATTA TAGACATGAG ACACGGCACC 1380
AGCCTAGGAA GTCCAATTAT TGAATGCCCA GAATCATCTG AAATTCAGGA TCCCTAGAAG 1440
ATATCCTGAC AAGGGCCTCA GAAGTGCATG CCTCCTACGC TCTAAATAAT ATACCTCCTA 1500
ATAAATAAAT AAACATATAT ATATGGAGAC AGGTCTCTCT GTCACCCAGG CAGGAGTGCA 1560
ATGGTGCAAT CATGGCTTAA TGCAGCCTTA AGCTCCTGGG CTCAAGAGAC CCTCCCACCT 1620
CAGCCTCCCA AGTATCTGTG CACCAAAATG CCCAGCTAAT TTTTTTTATT TTTATTTTTT 1680
TGTAGAGACA GGGTCTTGCT ATGTTGCCCA GGCTGGTCTT GAACTCCTGG CCTCAAACGA 1740
TCCTCTTCTC TCGACCTCCC AAAGTGCTAG GATTACAGGC ATGAGCCACT ACGCCTGACA 1800
ATAATACCTA ATGCTTATAC ATTATTTCAT AGTTCAAAGC ACTTTCACAT CCATACTCTC 1860
AATCCTTAAT AATGACCCCA TAAGGATATT ATCAAATTCA TTTTATATGT TGAAGAAATT 1920
GAGGCTCATA TTTTAAATAC TTTGCTAACC TAAGGCAAGC TGATATCAAC TAAAGGAGGG 1980
CTTTCATATT TAGCCTCTCT TGCTTCAGTG CCCAAAAGAG GCAGAAACAA GAACACCACC 2040
ATCTCCACTC CCCTGGCCTC TACAAACGAG GTGGATCAGA CCACTATCTG CTATTGCTTT 2100
ACTGAGCTGA CTACCTCTTA AGTTTTTCTC GTCTCCATAA AAATCAGTTA CCCAGAGTAT 2160
TTTATTATGT CTTAAGCAAA AAATAAGACC AGCCCAGGGA GAAAAATCCC CAAGATTACA 2220
AACAACCACA TTTATAAGCT GCTGGCTTAT ATCTTTATAA ACAAAGCTAA AAAAATAAGG 2280
GGAAAACCTG CTCCAATGGG GAGCTGTAAA CCCTACTGAC CAAACAGCCC CTTGGCACTT 2340
AGGTAGGTAG TTATATACAG CTAATTTAGT CTGTAATAGT TTTTGTACTT CTTCAATAAT 2400
TTGTACTGCC TATTGTTTTC TCCATACCAT TCTAAATGCC TCAAGAGCAG AGATCACATC 2460
TTCTAGTTAA TTTACATCTG TTCCTGTACA ATGACCATAT AGTACCCAAA CCAAAATTGG 2520
TTTTTCTGGC CTAGAAATTT ATATAAAGTC TTATCCAAAT TTAAAAATTA AAATACATAG 2580
GCTAGGCACA GTGGTTCATG CCTGTAATCC CAGCACTTGG GAGACCAAGA CAGAAGGATC 2640
ACTTGAGGCC AGGAGTTCAA GACTAGCCTG GGCAACATAG TAAGACCTTG TCTCTATAAA 2700
AAATAAAACA AAATTAGTCA GGCGTAGTGG CACACACCTG TGGTCCCAGC TACTTGGGAG 2760
GCTGAAGTGG GAGGATAGCT TAAGCCCCAG AGGTCAAGGC TGCAGTGAGC CGAGATCAAG 2820
TCACTGCACT CCAGATGACA GAGCAAGACC CTGCCTCAAA CATTAAAAAG TAGTCTGGGC 2880
ATGGTGGCTC ACGCCTGTAA TCTCAGCACT TTGGGAGGCC AAGGCAGGTG GATCACCTGA 2940
GGTCAGGAGT TTGAGACCAG CCTGGCCAAC ATGGTGAAAC CCCCCCTCTA CTAAAAATAC 3000
AAAAATTAAC TGGGTGTGGT GGCGCACGCC TGTAATCTCA GTTACTCAGG AGGCTGAGGC 3060
AGGAGAATTG CTTGAACCCA GGAGGCAAAG GTTGCAGTGA GCTGAGATCA TACCACTGCA 3120
CTCCAGCCTG GGTGACAGAG CAAGAGTCTG TCTTAAAAAT AAATAAATTA ATTAATTAAT 3180
TAATTAATTT TAAAAAGACT TTAAGTAATT GACATTCTTC AACTGAGTAA CATTTATAAA 3240
ATCAACAGTT TCTAATAAAG AAACACCAAA AGACACTTAA CACCTACAAT GGTGCCAGGC 3300
ATACATTTGA GTGGGCACTC AATAAAGTTG TGCTGAATGA ATGATAACTG AGAGCTTAAA 3360
ATCCATTAAA AACCACTTAA GGCAGAATAA AATATCCAGG ACAAGAGCCA AAAGAAATGA 3420
CTAGAGACTG TCAAGTTAAT TGGAAAAATA AGATTCTAAG GTAGTTCCAC TCAAAGTCAT 3480
ACTTAGGGTA CCACAAGTGA ACACTCTGGA TTCAAGCACC ACATTATATG TACAGCCAGA 3540
GTGAATGCAT TAGGGCAGTG ACTTAGCACG AGGGTTCTCT CTGCTCAGAC CAGCAGCATG 3600
CAACCAGCAG CAGCTTGCCC CTTCCCCCAG TTAGTCCCCA TTACCAACGC CCTGAAGCCT 3660
AGTCACAGAA CTACAGCAGT TAAGCCAGGC AGTACTAAAA GTTAGAAGGA AATGAGCATG 3720
CCACCTGACA CTTTTCTGGC ACAGGCTAAG CCGATTAGTT TAGGTTACAA ACACAACTAC 3780
AAGATTCCAG GACACTGAAG AAACTACTCT TTTTCTGCAA ACTAAAAATA ACTTATTAAA 3840
ACGGGAGTGT TCTTCAAGTA TTTCTGCCCT GCCAGCAACC CAAAGTTCCA TTTCCTCAAA 3900
TCCTTCTTAG TCTTATTGGA TCCAAGTCTC CACACCTCCC CCATCTTCCC AACTCTTCAT 3960
CCTAATGCTA TGAACACAGT AAAAGACCTA AACTCCTTTC CTAACTCATG CTTTTAACGT 4020
TTCTTTTCTA ATAAGCAATC GTGCAGAACT TCTATGGCTC CTGCCTTGTG TAGAACCACA 4080
ACTGGAAGAC ATGCTGAGCT TCAGCAAAGA ATAATGAAAA ACAAAGAAAA ACTGAAGGAC 4140
AAGATGCAGC ATGCTCGGGA AGTCAGCTAA ATGCTTTTCA TTCAGGCAGG AATAGAAGGA 4200
GCCTCACCTA CCTAGAAGAA TACAGCATAA GGACAAATGG TGTCTAGTAT AGAGCTAGAC 4260
TATACTTTAT CACTTTAGAA CAAAGCCATC AAGCGTGTTC TAGAGACAGA CTCATGTCCA 4320
AATAGCTTTA GTATCCTATA AGAATCATTA GGCTGGCCGG GCGCGGTGGC TCACCCCTGT 4380
AATCCCAGCA CTTTGGGAGG CCGAGGCGGG GGGATCCCGA GGTCAGGAGT TCGAGATCAG 4440
CCTGACCAAC ACAGTGAAAC CCCGTCTCTA CTAAAAATAC AAAAATTAAC CAGGCGTGGT 4500
GGTGCATGCC TGTAGTCCCA GCTACTCAGG AGGCTGAGGC AGAAGAATCA CTTGAACCCG 4560
GGAGGCGGAG GTTGCAGTGG GCCAAGATCA CACCACTGCA CTCCAGCCTG GGCAACAGAG 4620
TGAGACTTTG TCTCCAAAAA AAAAAAAAAA AAAGCATCAT TAGGCTATCT CAAGGTTGAA 4680
GTGACATTTT TCAGGGTTAA ACAAACTCCC ATCATTTAAG CCAAATAAAT CAAGATTGAA 4740
TTGCAGACTT TCTGGTCATA CAGAGCTGAG AGAAGGACTC AAATCCTACT ACTAGGAAGT 4800
GGAAATTCCA AGGAAGCTAG AAAACCCTGT CCTCAGTAGC TCTCCCTGCT CTCAGGCCCT 4860
GAGGTAAGCC AGCATTTCCT TTCCAAGGTC AAAAATTAAC CATAGACTTT GAACATCTCT 4920
GTGCTTTGCA ACAGCACCAG GAAAATGCCA CAATGCTAAG CCACCCTATA TAGACCTAAG 4980
ACATTTGCTA TTCTTGATTA TTCCCAAGAG TAGTCACTTG GGATACTCAT TAATGTACTT 5040
TCTAAAGATC CAACTTTCAA AGTAGTCTTT TCTCATTCTT ATTTTTAACC TTTCACCATC 5100
TCTCTTTAAA AAAACAAAAA CATTCAGATG TCTTAGAGCA CTGAAGAAAA AGAAAACAAA 5160
AATTGGCTTA TCTATATAAT CTACACTCTC AGAAAAATTC CTCCTGAAAA AAAAAATTTT 5220
TGCCCTAAGA CCACCCAAGG TACACACCAT GGTAAAGTTT CAATGCAGAA TCATGCTGTG 5280
AGCAAGAGCA AATGGAAAGC TGCAGCCCTT CATCAAACAG CATTAGAACC TTCCAAGATT 5340
CGTGAAATCA AAGAATATCA GAGCTGGAAA GATACTTAGG GTGCAATAAT CTAGTCTAGC 5400
CTTTCATTTT AAAGATGGGG AAAATAAAGC CCAAAGAGAG GAAACGGAGT CTTGAAGCAA 5460
AGCTGGACCT AGGACCTAAG TGGCCAGACT CCCAACTCTG GTATCTTCTG CCACACCATA 5520
CCTCTTCACA AGACTGACTT TAAGGGAGTC AAGTGGCTAA 5560