EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-00111 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:8454080-8459840 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:8457948-8457959TAATTCAATCA+6.14
FOXP1MA0481.2chr1:8454265-8454277ATGTAAACAGAC+6.44
FOXP2MA0593.1chr1:8454265-8454276ATGTAAACAGA+6.02
Foxa2MA0047.2chr1:8454262-8454274CCAATGTAAACA-6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:8455317-8455332AAGGTCAGGAGTTCA+6.04
POU2F2MA0507.1chr1:8459035-8459048TTAATTTGCATTT+6.25
SNAI2MA0745.2chr1:8458908-8458918AACAGGTGCA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 40             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00045chr1:8452127-8460150Adipose_Nuclei
SE_02022chr1:8455562-8457961Aorta
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SE_02685chr1:8455412-8458882Astrocytes
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SE_04978chr1:8455327-8458485Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06073chr1:8455339-8458577Brain_Hippocampus_Middle
SE_07042chr1:8455426-8457730Brain_Hippocampus_Middle_150
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SE_11329chr1:8446106-8460302CD20
SE_18764chr1:8453940-8459116CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_23717chr1:8455522-8456365Colon_Crypt_1
SE_25808chr1:8455157-8458849Duodenum_Smooth_Muscle
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SE_27457chr1:8456762-8458594Esophagus
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SE_31622chr1:8455468-8456548Gastric
SE_31622chr1:8456995-8457584Gastric
SE_37218chr1:8454074-8459264HSMMtube
SE_39132chr1:8455453-8458614IMR90
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SE_45170chr1:8454207-8458904NHLF
SE_45677chr1:8452328-8460198Osteoblasts
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SE_50481chr1:8455471-8458823Sigmoid_Colon
SE_51176chr1:8455007-8458926Skeletal_Muscle
SE_52016chr1:8454055-8455308Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52016chr1:8455374-8458830Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52725chr1:8455454-8458751Small_Intestine
SE_53408chr1:8455166-8459067Spleen
SE_54752chr1:8455534-8458192Stomach_Smooth_Muscle
SE_58576chr1:8455425-8501956Ly1
SE_60758chr1:8454848-8500160DHL6
SE_62661chr1:8450826-8509851Tonsil
SE_63725chr1:8453894-8455322HSMM
SE_63725chr1:8455410-8458900HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr184555358455974
chr184560118457893
chr184546558455368
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008393chr184539948459064
Enhancer Sequence
AACCCAAGAA AAATCCCTGA TTTCTCCACT AAGGGCTCCT GAGACCAGAA AGACAAGATG 60
AAGGATGGTG ACCTATACTT TGGGAAAACC AAATTAGCTG CCATTTCTTG ACATTCTATA 120
ATCCCAACTT TCAATTTCTA ATGCAGGTGG CTCTAACTGC ACAGGTAGGA CAGAGCTGAA 180
ATCCAATGTA AACAGACACA ATTCATCTTG CACACAACAC TATACAGAGC TTTCCCCATT 240
ATTAAAAAGC TTCACCAAAA TCTTGATTGG AAGTATGCTA AACATACTGC CCACAATTCC 300
AAATTAAACA ATTTTGAGAA ATATTTCTTG CTTTTCAGAT TCTCAAAATA TTTGAAGTTC 360
GACAACTACA TACAGGCAAG ATCATTCTGA CCATCAACTA CTCAATTAAT TCTCACTACT 420
GTCCTGGGAA GCAGATAATA TTATCACCAT TTTATAGATG AGAAAACTAA AGCACAGAGA 480
GATGAAATAA TTTGTCCAAG GACAGCGGGA GTGGAAAAGG AATTCACACA CATTTCCGTT 540
TTCCAGTAAT TTAACTTAAG AAAGGAGCTA CTGCAGAGAA CAAACTTATC AGTCATGGAA 600
TCCCACATCA CTCAGTGCTG GAGAGGGGGA ATGAGCAACA AAAAAGTGAC AAATCATAAG 660
GTCTGAGTCC CAACTCTCAG CCAGAGTCAC CCAATTGCTT CAGAAGACTG TTACCCCAAG 720
GAAATAAGAA AAAAATACGT TAACTTGCTC TGTAAACCAT AAAATCCACT ACTAGTATAT 780
ATATATATTA TATCTCCATG AAGCACTTAC CACAGTTACA CTTGGTTTTT GTTTGCATTT 840
CTTAGCAGGT GATTAATACT TTAAGGGGAG AGAAACTGTA TTACTCATTT TTATATCCTC 900
AGCATCTATC TAAAATGTCT TTCCCATAGA AACTCAAACG TCTGTTGAGT GGTTGAGTGA 960
GTAAATAAAT GTAAATAAAA TAAAAAAGAA AACATATTTT AAGGGCCAAA CAGCCCAAAG 1020
GCATTCCATG AGGGAAGTTT GTTACTAAAC TTTCAGATAA GGTGTCTAGT ATTTCCTGTA 1080
ATAAGATATT GTATATTCCC CTTCTCCTGC CCACAGAATA AATCAAGTAC AAAGAAACTA 1140
AAAATAATAA TACCAAAGAA TGAGCAATTT CCGGGTCGGG TGCAGTGGCT CATGCTTGTA 1200
ATCTGAGCAC TTTGGGAAGC CGAGGCGGGT GGATCACAAG GTCAGGAGTT CAAGACCGGC 1260
CTCGCCAATA TGGTGAAACC CCATCTCTAC TAAAAATATA AAAAATTAGC CGGGCGTGGT 1320
GGCACACGCC TGTAGTCCCA GCTACTCGGG AGGCTGAGGC AGGAGAATAG CTTGAACCCG 1380
GGAGGCAGAG GTTGCAGTGA GCTGAGATCA CGCCACTACA CTCCAGCCTG AGCAACAGAG 1440
TGAGGCTCTG TCTCAAAAAA AAAAAAAAAA GAATGAACAA TTTCCTCTTT GGTCTTGTCT 1500
GCATAAAAAA GGAACCTCTC CTGCTCAGCT ATGCAGGCAC CTGGAGACAT TTGAAGCTGG 1560
AGGTAGGAAA AAAAAAAGGT GAAGGTGAGC TTGACCTAGA AGGGCAACTG TGAACAAGGT 1620
GCTTTGAGGA AGCAATGTCA AACCTGTGTG GACCTTTTTG TAAACAGGTT AATTTCCTAA 1680
ATTCTTTTGT GGGAATATAA GACATCCGTG TTTCTAAAAC GGGAGAGGAG AGGAAACAAA 1740
AACCAAAACC AAAACCACCA CCATGCACTG AAGGCCTGCA GTGGGGGCAC AGGAGGAAGT 1800
ATGAGAGGTT CCATGCCTGA GTTGTGATGT TTGCAGAGAA TTAGCCAGTG AGAGTGCCCA 1860
AGGAACACGG GAGCACAAAT CTGAGAAGGA ACACTCGAAC GAGGACCAAT TCTATTATTA 1920
TTATTCTGCT CTGTAAGGCA TAGGTGACAC CACCCCTCTC TCTGTGCTTA AAGGACAGCC 1980
ATTCCATTAA CTACCCACCT TGAATGGATT CCAGAGAAAG ACTTTGTTCC CCAAGAAATA 2040
TTAGCAAAAG CCTTCAAGCC AGGGCTAAGA GCCTTAGTGA CAAGTGAGAA GGCACAGAAC 2100
AACTGAGCAG AGATCATCTC TTGAAAACCT ATGCTAATTA TCCTGTTTCT ACCATCAGGA 2160
AAGTGGGAGG GGGGAAGGGC TGCTGTGCTA TCACTTGGGG TCCATTCTGG GGTCAAATTT 2220
GAATCCCAGC TTCTAGAGCT GAATTCAATG TGGAGTTTGT TGTCCATGCC AAAATTCAAA 2280
GGCTGATCAA GTTGAAGAAC GTGACATGGA CATAATGTGA AGTACATGAA AACTCACATA 2340
CAAAGTACCT GCCCTCCTGG AACCAGTCCC CAGTTATCAC AGAGCCGAGA GGAAACCAGT 2400
CCCCTATTAT CAAATCCTCT TACTCTTGAC TAGAGTGATG GAATTTGGGA AGAATGCAGC 2460
AGACTTCTAA AGACTGCTCA GCTACAAGCA GGATCTTCAT CTCCTTTTCA GCTGTGGATA 2520
ACAACGGAAG CAGTCAGCCG TCTAATAAAT CAAGTTTAAT TTTAACAGCA TGAAGTATTG 2580
CCCGCTTTGT AATTATACTT CCAAAGGTAA AACCCAACTC GAATTAACTT AAAAAAATTG 2640
TTATTGAGGT AAAATTCACA TAACATAAAA TTAATCATTT TAAAGTTTAC AATTCAGAGG 2700
CAGTTAATAC ATCTACAATG CGTGCAGCCC TCAGATCTAA TTCCAAAACG CTTTCATCAT 2760
CCCCCAAAGG AGACCCCTCC CCCTCATTAA GCAGTCAAAG TGAACTTTTT CCACAATGGC 2820
ATTCTTTGTG ATATATCATG CTTTCTCCAC AGTATCAGTT TATTCACTTT CAACAGCATC 2880
TTTGCATTTT AAAGGTAAGG GAAAACTCAA AGGACCATGA GAACTAACAC TCACAAATGT 2940
GCTTTCCAGT CTACCACGTG ACTGTATACA CATCTGGTGA GACAGTTATC TCAGGCAAAA 3000
TGTACTGTGT GTCTTCCCTG GGAGGAGAAA CAGGAGCTGA TTCTAATGGA ATGTTTACTA 3060
TGTGACAGAT ACTGAGTCAG AAACAGCACA GCAGCTAAGA CTGGGTGCTC TGCAACCACA 3120
CTGCCCAAGT TCCAGTTCCA ATTCAGTGTG AACTCTGTGT TCTTTGGGCA AGTCATCATA 3180
ATCTCTCTGC CTCCTTTCTC TTCACACGTA TTGTGATGGC AACACCACCA CTTGCCTCAT 3240
GGAGATGCTA TGAAGGTTAA GTAAGTTCAA GTGCTTAGAA CAGTGCCTAG TGCATAATAA 3300
GAGCTCAATC ACTGCTGCCT TATTCGACTT TCACTACGAC TCTGAGGGAG GTTCTATTTG 3360
TGCCCCCATT TCATTACTGA GGAACTTAAA TTTTACAGCA TCTAAGAGAC TTACCCCAAA 3420
CCCCCAGAGA ATAAGTGGGA TAGCTGGGAT TTGAACTCAA TTCTGAGTTC TGTTGGCTTA 3480
GCAACCATTC TGTAAAATGT ACCAAGGAAC AAAACCTTTC TGATCCCAGT TACCAAACTC 3540
ATGTTGAGCA AAATCACACT CACACAGGAA AAAAAAAAAA AAACACATGA AACTGTCACC 3600
AAAATGGCAA TAACCCAACT GTGCTACAGT TTTATTTCCT GCTGGCTTCT CAGTTCTCTA 3660
AGCCTTGAGG ATCCACGCGC CTTAGACCAT TATTACCTCC TCCCCCATAT GCAGTAAGTT 3720
CCTGACTCTT CTGATCTTTC CTGTTCTTAC TGGGCACCAT CCCCCAAGAC CTTCTGCTAT 3780
TTGTACTTTC TGATTTCAGG CTCTTTATTC TCTGATACAC ACTGTTGCCA GAATAATCTT 3840
CAAAAAGATT GACTGCAACT TTCAACTTTA ATTCAATCAT ACAAATATTT CTTGAGCATC 3900
TAGGTGCAAG GCACCATGAT GAAGATAATG TGAGTAAGAC AGTCCTTGCC TTCAGGAGCT 3960
CAATCCAAAA AGGGAGGTGT AAGATAGAAT TTCATAAGAC AATGCAGAGC CAGAGAAAGG 4020
CCCTAAGAGA GGCATGATGT TCTACAGGGG TATTCAAAGG ACAGAGTTAT ATCCTCCTCA 4080
GATTAGAGAA AGATTAATGA AGGAAATTAA GTTTAAAAAT GTAGAGCATT TCCACATGGA 4140
GTAACAGAAG GGCAGGCATT CTGGGCAGAA CACTGCAGGA AGAAATGGCA GACAGGAAGC 4200
CTGAGTGTTT GGCAAGGGCC AGAGGTGCAG AAAGAAAAGC AGTAGGGAAG GGGCTTGGAG 4260
AAGCTGATTT GGACCACAGT ATAAAAGGTC TTGACTCTCA GGCAAGGGGG TTAGTACTGA 4320
GTGTGGCTGA TGAAATCTCC ATAGCTTTGC TCTCCTGTGT GCTTTGCTCA GGGTTGGTTC 4380
TCACCATCTC CCCATCACTC AAGGCCTAGT TCAAGTCTCA GCTTCTTCCT GACGTGTGTC 4440
TTGACCGCCC CAGTGTAAAA TAAGATCCTC TTCTATTAAC AACGACCATC TCTACAATTT 4500
ATTTGGCAAT TAATCACGTA GTGCTTCTAA CATCTGTTAT CAGTCTTAAA TGATTTTTCC 4560
TTTTTCTTAT TATTTATCAT GCGTATTTAT GTTTTGACTC CCCAGTGAAG TATTCACTGA 4620
ACTCTAGTGT GGGGGAGGAG TCTTCCCCAA CTCTGGAAGA TCACCAGAAA ATACGCAGCC 4680
TAAAAACAGA TTTTGTCAGG TGACTCTGAT GACCAGTTGG GTATGCAATC CACTACACCC 4740
ATGGAATCTG GCACAGGGCC TTGCTATACA TCGAAAAATT TGCTATTTTT ACAGGTATCT 4800
GTGATTTTCA CTTCATATCT CAACAACAAA CAGGTGCATC AATGTGCGCG GCCACTAGGA 4860
GTACATGAGA GTACCTGCTT TTCAACAACC TCACTTCTAC TTAGAACTGA TAAACTTTTT 4920
TGTAAATATA ACGGGTGTGA AGTAATATGT GTATTTTAAT TTGCATTTCC CTGTTAGTGA 4980
GGCTGCAAAA CTTTGCAGAC TTTTCAGATT TTCTCAGCTA AAACTACCTG TTCTCATCTT 5040
TCACCCATTT TTCTATTGAA CTGCTTGTGT CTATTATAGA TTTCTACAAG TTCTTCATGC 5100
ATTCTAGATA CTAATCCAGT TATGTTATAA ATATCTTCTC TCAGTCTGTC ACTTTTTTCT 5160
CACTTTATGG TTTCCTATAA AACACAGACT TTTTAAGTCT TAATATAGAT AAATATATTA 5220
TCATTTACTT TTTGAGTTGT ACTTTTTGTA CTATTTCTTA TAAACCCTTC CCTACTCAGG 5280
GAACATTAAA ATGTTCTATT TTCTTACAGT TTTAAAGTCT TGTTTTTCCT GGCTTTAACT 5340
TATCTGAAAG TTACAATCTT ATTTTATTTT GTTCCCATAT GCCAGCTAAG CCCATTGGTC 5400
CCAAACCATT TACTGAATAA TTGGTTAGTT CCCCACGGAT ATCACATAGT TCTGCCCCCA 5460
TTACACTGAC GTCTCTATTT TGCATCAATA CCACCAGGTC TTAATTACTC TAACTTTACA 5520
AGTCTTATCT CATTTGTATA AAGCCTATCT TCCTTGTTTC TTACTCAATT TTCTTGCTAT 5580
TCTTGGACCT TTATTCTACC ACACAAATCA GTCTGCTGGT TCCACAAAAA AATCCTGTTA 5640
AAGTTTTGAT TGAAATGATA TAGCAATGAG AGAGTAAGGG GATCTTTATA ATGCAGAGTA 5700
CTTTTTCCAT TAACATCGGC GCATCATCTC TCCATTTATC TACGTCTTTT TTTTAGGTCT 5760