EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-00100 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:8192470-8196260 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:8192606-8192627AAAAAAAAAGTGAAACTCAAA-8.1
Sox6MA0515.1chr1:8194006-8194016AAAACAATGG-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:8193306-8193327GTCTCTACTCCCCCCTCCCCC-6
ZNF263MA0528.1chr1:8194444-8194465AGTGGAGGAGGGGGTGGGGGA+7.23
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02013chr1:8192603-8193697Aorta
SE_02013chr1:8194089-8198750Aorta
SE_26216chr1:8192873-8196580Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29143chr1:8192907-8195393Fetal_Intestine_Large
SE_33765chr1:8192378-8195587HCC1954
SE_33765chr1:8195625-8199317HCC1954
SE_34231chr1:8191032-8196847HCT-116
SE_36931chr1:8192440-8199276HSMMtube
SE_38712chr1:8192844-8195316HUVEC
SE_39254chr1:8193133-8195375IMR90
SE_47106chr1:8190652-8200946Panc1
SE_52130chr1:8192885-8199222Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54673chr1:8191985-8196826Stomach_Smooth_Muscle
SE_55699chr1:8192532-8197359u87
SE_63913chr1:8193083-8199304HSMM
SE_67928chr1:8192532-8197359u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr181932008195181
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008132chr181922118199160
Enhancer Sequence
GTCTGGATGA CAGAGCGAGA CCCTGTCTCA AAAAAATGAA ATAAAATAAA AGAGCAAAAA 60
AAAAAAAAAA AAAAAACAGG TTAACAGGAG ACAAAGCACA CAATTTTTAT AAACATTTAC 120
ATGCATAAGA GTTTAAAAAA AAAAAGTGAA ACTCAAAGAA GTGGTTAGGC TCAGGAATTT 180
ATACCATTTT AACAAAGAAA GGCAGGTTTG AGCTTGGAGA GACAACGGAT CGTAGGAAAG 240
TGACTAAGAA GCGTATGGGG ACGAATGGGG AGTCAGGCGT TATTTCAGTA AGGGTCTCTT 300
CATGTAGACT CATCTTGGAG CCAACCGCCT CTGGGGATGA GTGCTCTTCT CGTCCTCTGA 360
TGGGGGTGCA GGGACACCTT TACGGGGGAA ATTGATGCCT GGCTTTCAGG CAGTGAAGGG 420
GAGGGCAGAG AACTGTACTT GCTTGTCGAT TCTCAAGTGC CTCCAGCTCA GAATAATCCT 480
TAACGCCAAA GTGTGGTGGC ACGCGCCTGC AGTCCCAGCT CCTTGGAAGG CTAAGGTGGG 540
AGGATAGCTT GAGCTTAAAA GGTGGAGGTT GCAATGAGCA TCCTATCTTT TAAAATTTTC 600
TTTTAAATTC ATTTTAATTT TTTAAATTAA AAATTTTTTT TATTTTTAAT ATTTATTATA 660
TAGAGATGGG ATCTCACTGT GTTGCCCAGG CTGGTCTCGA ACTCCTGGAC TCAAGTGATC 720
TGCCCACCTC AGCTTCTCAA AGTGCTGAGA GCCACTGCAC CCGGCCTGGG GATGGCGTAT 780
TCTGAGTCCC TTCTCAGGGA AAACCATCAG CAAGTGAACA TCACAGAGGG CTCTGTGTCT 840
CTACTCCCCC CTCCCCCCGC CACCCCTGCC ATTTTATTGG ACTTGACTGT GGGACAAGGA 900
GGTGTGGGAA CCTGGGCCAG TCTGCCTTGA GGGTGACTGA GCTGGCACCC CTCTAGGGTT 960
CGGCATTTTG CATATCTCCT CTTCCACGCC CTGGAGTCTC CATCCTCCTC CCTCTCTCTT 1020
GCCCTGGGCA CCCGCACCTC CCCACAGATC ATCTGCATTT CTGACTTCCT CCCTCTGTTC 1080
TCCTCCTGAG ACTGGGTGCC AGGATCAGCT TTTGCATCTT TTAAAACCAT ATGCAGTATT 1140
TTCCCTCAAA GTTTGTTTCT CTAACGGGTT CACAGTTTTT CTGATTTACT GACTACACAC 1200
TTTTATGAAC ACCGATCATT TATTTTTTCC AATACAAAAT ATTTTCTTCT GCTTAATATT 1260
TTCCATATAA TATCTCCCTA CTTTGAAAAA CTTTTAAATA ACCTCTTAAA AAAAAAAAGG 1320
AGTATGACTC AGAAGCCTTA AAAGCTGTGG CCACCAGCTG AGATCCTAAA ATGACCCAAC 1380
TGTGGAGCAG GGATAGAGTG AAATAAAATA AACCCCTTTC CAAGAAGCTC AGCCCTGGAG 1440
AAGAACATTT GTGAACAGAA CTGTGGGCCT GTTGCCATTC TCCACCCTTC TGTTTGGGTT 1500
GGCCCCCATC CTACACGGTC ATCTTCTCTC CTAACCAAAA CAATGGCTGA GCTCATGGAG 1560
ATTTTTACAT TTTTCCTAAA AAGAAGTTTT ATATCTCAAT TAATATTTAA AATTCCAAGT 1620
TAGAAGGTAC CTTTGGAAAA GTACATTCTT AGGTCAGAAA CCCTGTCCTC TGAACACCAC 1680
TTAAAATAAC TCAACAGCCT GCACGAATCT GAGAATTCCA AGGTCATAGG TTTTTTTTAG 1740
CCTTGTTTGT AAGAACAACA AGACCAGCTC ACACATGTCC AAGCGTATTA CTCACAGTTA 1800
AAAGTAATAG TAAGATTTAA TTGGTTTTCT TTTTTCTTCT GTGGTGTGTG TCTATTCATC 1860
AGCCTCTTGC CGCTCTAAGT TTTTCCTCCC TCCCTTAACC CACATCCTCA AGAAGAATTG 1920
AAGAATTTTC CAGTTATGCA ATTTTGCCTG CAACTTTGCC TAGTGCTAGT CTGGAGTGGA 1980
GGAGGGGGTG GGGGATCTTC AGGTTCTGTT CCATTTCCTT AGCTCCCCCG ACTCCGTAAT 2040
TTGAAATCAT GAACATTTTC GAACATACCA GAAACAGAGC AAATAGAACA ATGAGCCCAT 2100
CTTCCAACTC TAACAATCGT TACCATTTTT CAATGTTGTT TTGTTTAGTC TCCACGCTCC 2160
AGCCTCTTTC GTTTTGAAGT ATTTTAAGCA AACCCTAGAA ATAACATAAT TTCACCCATA 2220
AATGCTTCAG TGTGTACCTA CCACAGAGAA TGTCTTGCCC CCAGTGTAAT GCAATACTGC 2280
GATGAAGCTA ATGCAATGAA CAAAAACCCT TTAATAAGAA CTGCTCCAGC CAGAGTGGAC 2340
CCCAGGCAAG CATCTGGAGG CTGGCTCAGG GCCGTTGCTG GTCAGCAGAG TTGGTGGTCG 2400
GGGAGAAGTG GATGGGGACA GGAGAGTGGG GACAAGCTGG ACTTCGTTGA TACCTGTGTG 2460
TGTGTCTGTC ATGCATCAAG TCTAAGAACT TTGGAGAGTC ACGGCTGATG CTTCACGCAG 2520
CCTCCCGAAT CCCACGACAG TGCCTCTTTG GGCCACCTCT TCACCCAGAA CTCCACAGAG 2580
AAAGGGATGT GGAGGAATCT AGCTCCAGCT TCACCACAAT GACGTGGTCC AAGCCACCAC 2640
CACCCTTTCA GGCCCTGTCT GCTTTCCCAT TTCCCTGCTT TCTCAATCAT GGATTTTTAC 2700
TGTTGGTTTG TACAGATTCG GAAACAAACA AAACACCAAG GTTGCCGCTG ACTGTTCCGT 2760
CTCTTTTAAT CTGCCACACT TCCTGCTCCA TCTTTTCCCA TGACATTGTT TCTTGATGTA 2820
CCTGGGCCGT TTGCCCTGCA GAAATTCCCC ATATCCGAAT CTGGCCAGTT CTATGCTCCT 2880
GGTATAATGG TGGTTGGCTC TCGAGGCTTG ATAAGGTTCA AGGTTTTGTT TTTGCTGTTT 2940
TGTTTTGTTA GCTTTTTGTT TTGTTTGTTT TGAGACAGGG TCTCGCTCTA TTGCCCAGGC 3000
TGAAGTGCAG TGGCATGGTC TTAGCTCACT ACAACCTCTG CCTCCTGGGG TCAGGTGGTC 3060
CTCCCGCCTA AGCTACCTGA GTAGCTGAGA TTACAGGATT GCGCCAACAT GCCCAGTTCA 3120
TTTTTGTAGT TTTTTTTAGA GACGGGGTTT CACCATGTTG GCCAGGCTGC TCTCCAGCTC 3180
TTCAGCTCAA GTGATCAGCC CTCCTTGGCT TCCCAAAGTG CTGGGACCAC TGCGCCCAGC 3240
CTGAGGTTCT TAGTTTTTTA ACTCCCTTTG GGTTCCAAGT CTTGTCCAGG TCATAGGTGG 3300
CTGGGAGAAG CCAGGGAACA GTCAGTGGGC TACCTGGACT TTACTGAGCT TCCTTAACCA 3360
CTGTGTGTGA ATTGTCCCAG GTAGGGAAAC TGCATAAATT CCATTGTTAC AATTGGCTCT 3420
GTATCCACCT TGGAAATAGC TAGCTCAGTG TTTCTTCTTT CGGCTTGATG AATCTTCCAC 3480
GCCTGGTAGT GCCTGTCTCA CTTTAGATAC CAACTGTAGT GTTTCAGTTG GATGAATGTC 3540
CAGTGGGAAG GAACCACATC TCTCCCCACC CTGTACGACA ACTCTAGGTT CTCTGTTTAA 3600
CAAAGGACAT GGAAACTTAT GGAAGTGGGA CCCCTCTCAC CAGGGTGGAA GCAGATGAAA 3660
CACATTTCAG TGTAGCTTCT AGAGACCCAC GGTGGCCTCT CCATGGATTC CCTAATGCGG 3720
CCGATTAACA TTGTCCATGC GTTTTGCTAT GTCCTTTAGC TTGTTTAGCC TGGTCTTATT 3780
GTCACAGTTC 3790