EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS094-00090 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
hMADS-3 
Coordinate
chr1:8062310-8067430 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs147539868chr18065945hg19
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr1:8066589-8066600TTTGATACATT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065680-8065698CCTTCCTTTCCTTCCTCC-6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065668-8065686CACAGCTTCCTTCCTTCC-6.42
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065693-8065711CCTCCCTTCCTTCCTTTT-6.66
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065676-8065694CCTTCCTTCCTTTCCTTC-7.26
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065672-8065690GCTTCCTTCCTTCCTTTC-8.73
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065685-8065703CTTTCCTTCCTCCCTTCC-8.96
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:8065689-8065707CCTTCCTCCCTTCCTTCC-9.83
Foxd3MA0041.1chr1:8062831-8062843GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:8064650-8064662AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:8064654-8064666AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr1:8065984-8066005TTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT+6.09
POU2F2MA0507.1chr1:8067402-8067415AAATGCAAATTAA-6.25
RREB1MA0073.1chr1:8066362-8066382CCCCACACCAAAACCCCACC+6.72
ZNF263MA0528.1chr1:8065676-8065697CCTTCCTTCCTTTCCTTCCTC-6.17
ZNF263MA0528.1chr1:8065689-8065710CCTTCCTCCCTTCCTTCCTTT-6.55
ZNF263MA0528.1chr1:8066746-8066767CTCTCCTCTCCTCCTTTCTCC-6.5
ZNF263MA0528.1chr1:8065685-8065706CTTTCCTTCCTCCCTTCCTTC-6.64
ZNF263MA0528.1chr1:8065677-8065698CTTCCTTCCTTTCCTTCCTCC-6.66
ZNF263MA0528.1chr1:8065680-8065701CCTTCCTTTCCTTCCTCCCTT-6.84
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01874chr1:8063992-8066026Aorta
SE_26425chr1:8064054-8065901Duodenum_Smooth_Muscle
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SE_33765chr1:8066161-8067182HCC1954
SE_34231chr1:8064006-8065902HCT-116
SE_34231chr1:8066086-8066652HCT-116
SE_34846chr1:8062960-8067246HeLa
SE_36407chr1:8062975-8067223HMEC
SE_36931chr1:8063255-8067283HSMMtube
SE_43122chr1:8063878-8066645Lung
SE_45526chr1:8063740-8066094NHLF
SE_45858chr1:8063107-8066058Osteoblasts
SE_45858chr1:8066119-8067206Osteoblasts
SE_47106chr1:8062173-8071866Panc1
SE_51696chr1:8063859-8066059Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54897chr1:8063809-8066053Stomach_Smooth_Muscle
SE_55872chr1:8063778-8065976u87
SE_63484chr1:8063858-8066059HSMM
SE_64486chr1:8062964-8066094NHEK
SE_64486chr1:8066114-8067465NHEK
SE_67534chr1:8063778-8065976u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr180668968067015
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008002chr180628908067152
GH01I008012chr180673618067481
Enhancer Sequence
TGTTTGCTTT GTGAAATGTT TGCATGGGGA GTTGCATGTT TATTGAGTTT TGTACTTTTC 60
TTGATATTAA TTTTCCTCAA ATGCTTCGCA ATTTAAATTT TGGGCTCATA TTTCAAAATT 120
CCTATTCTCC TGTCTGTTGA ACCAGGTTCT GATGACATGA GTTTGCCTCT GATAACCACA 180
GCAGAGGAAA CACAGGGCAG TGTGAGGAAG GCTGAGTCCT CTCAGTCAGG AGGGCCTTTC 240
TAGCCCACCT AGAAATAGTG CAGATTTCTT GCTACCCAGG GTCTTGCTGT GCCTCTTGTC 300
ACCAGTGCTC TGGCCTGTGT GCACATACTC ACTGTGACAC AGTTTAGCAT GAGAGAGGTG 360
GGGAAGGGGG CGAAGGCAGC TGGCTGATCC TCCAAAAGCC CCCAGATAAT CACCCTGACT 420
CCTGCCCCAG GGCTCCTTCC TGTTCCCTAT TTCCATAAAG GGCAGAGCTT TCTCAGAACT 480
CACAGCCACC TTCACAGAAG TCATCTCCTA TAGATTTTTT TGTTTGTTTG TTTTTTGAGA 540
CGGAGTCTCA CTCTGTCCCC CAGGCTGGAG TGCAGTGGCA AGATTTCGGC TCACTGAAAC 600
CTCCGCCTCC TGGGTTCAGC AATTTTCCTG CCTCAGCCTC CCGAGTAGCT GGAACTACAG 660
GTGTGAGCCA CCATGTCTGG CTAATTTTTG TATTTTTAAT AGAGATGGGG TTTCACCATG 720
TTGGCTAGGC TGGTCTCAAA CTCCTGGCCT CAAGTGATCC ACTCGCCTCG GCCTTCAAAG 780
TGCTGGGATT ACAGGCGTGA GCCACTGCAC CCGGCCCCTC CTGTAGATCT TTTAGCCTTT 840
GGTCTTTTCT TTGGTCTTAT TTCTCCATCA CACAAGACCC ATCTGTTTTC TATCTTTCAT 900
GAATTCCTGA AACAGTCTGG TATGCCAATA AACACTTTTG TTTTTCAGTA ATGGGTTTAT 960
TCTGAATTTC AGGAGATTTT CAGATGTGTA GCAGGAGGGC TATGGGACTC TTTGTGGCCC 1020
TCCATATCCA TGTTACATTA CACTCCTGGC TATGACCTGT CACATAGTTG TTCTGTGCCA 1080
CTTTGATTAA CAGCACAGTG TACCTTGTCT TGGTTGGTCT TCATGCTTAC AGGAAAAAGA 1140
CCTGCCAACA TCAGGATTTG TAACCAGAAA AGGCATTGAA AACATATCCT CAAAATCAGG 1200
CTATCAAATT TTAGAAGGAA ACCTTTCAGA CCTAGAATCA GTTATGGAGA AGTGAGATGA 1260
TAAACAGTTC CAGAAACTGT AAATGGACTG CTTCTAAGCC ACAACTTGTC TTCGTACACA 1320
CTGATGTATA CATAATATGG CAAAGTTTTA TGTGCAACTG AGGGTGTGGC ATTTATGATT 1380
CAGAAAGAAT GAGTTCGTGT AGATGGAAAT GGGCATTTGG GTGGGGATTA GGCAAGGACA 1440
GAATTATAAT GCACGCCGGG TGGATGGTAA CACCTCTTTT TGTCTATACC AAAACTGTTC 1500
AGAGAAAACT GTATCCATAA AACTGACTTT TTGCGATTAC TAAATACATA GAATCATTTA 1560
AGTATCCAAT TTGAGAAAAA AAATTACATG AGTAGAAGTC ATCCACAGAT GAGTAGTCCA 1620
GGTTTTAGAG GAAAAAAACT TTAAGTGAAC ATTTCAGTTG GGTAAATTCA GTTTCTCACT 1680
GAGAATCTTC TCAATCTCAT CTTGCCAGAT GACAAATGAC TGTCTATTAT TGTTAAGGTT 1740
TGTGGACTCT TACAAAAGGA ACAGTCGAAT TGATTCAGCA TCAGCTAAGC ATGGAAGAAA 1800
AAAAAATATG TAACTGTGAA AACAAAAACA AAACAGATTT CTGGCTGCTG TCCTCAGAAG 1860
CCTCCCGCAC AGACGATGTT CCTGACAGGA TCAACAAACG TCGCATTTCA CTGTCCCACA 1920
GTGCAGCTTC GTCCATCAGC CACTGACTGG CATGGGCCAG GAGCAGTGTT GGTCTCGGTG 1980
ACAGTGACTT CCTTGCCCTG CTCTGAATGA GTGTCCTTTC TGTGAAAGTA GGTCTCATGG 2040
TTCTAGGGCT GATCCCAGCG CCATCCCACA ACATTTCAGT GTGCCCGACA GCGTGCCTGG 2100
CAAGCAGCGA GCTCCTGACA ATTGGAAGCT GCTAATGCTG TTACAGACAT CTGCAAGCAA 2160
GTCAGATCAG CCAGCTTCCA TCACGTGAGA CACCTTGGAG GACAAAGCCA CATTGTGTGG 2220
AGGAAAACAC ACCACCATTC AGGCCCATCG TCATCCTGCT TTCTCCTATA CTCAGTCTCC 2280
CACAGTGCCA GGTAGTTTTC TGCCTGTACT AAGAAGGGTG AATGGAAAGG TGAGATGTAA 2340
AAACAAACAA ACAAACAAGG GCTCGAAATG TCTATGGGAA GATAAAATTG TAGCAGTGCT 2400
TTAGAAAACA AGAAGCGCAT GATTAAATGG ACTGTTGTTT TCTTTAGAAT GCGGGTATTA 2460
TCATTGGTAT TGAGGTGACG CATTAGGACT TTGAGGTGCC TCCCCCACCC TGGCCTCTGC 2520
GCTGGCAGTG AGAACCCAGC CCGTGCTATC TTCACAGTTC TCAGCCCATG GAAGCACAGG 2580
CCACCTGGGC TCCTGCAAAC ACCAGACGTG TAATTAGAGG CTCCTGGGCT GGGATGATGT 2640
GGTGTGCAGA CAAGTCTTAT CACGCGTCTG AGCCGCTGTG GGTGCCTGGA GTTGCCTCTG 2700
CAGCCCGGAG CGGATGAGCG GAGGCTCCCG TGACTCACCC AACTGCAGGA ACTGTCAACT 2760
GGCTTCTGCC CAGCCAAGAA CTTTTATCAA TCACTAAGTA GAGACACTGT GTACAAGGAC 2820
ACCGGTTCAT CCAAGAACAT CAGGACAGCC AGGAATTCAA AACACAAAAC ACAGCTTCCT 2880
GCATGTTGCA CCCCAGGCGG CTCTGAGGCT CAGCCCAAGG AAGGTTTGGG GCTCGGGCCA 2940
GAAAGACACG ATTCACTCTG ACTTACACAA GAGGGGAGTG TACAAAAGTC ATGCAGTCTC 3000
AGGGGAAGGC ACTGGGCTAA ACCCTCATGA CTGTAAAATG AAGAAATAGG CATGAAGCAT 3060
GACTAGGGTG TTTATTTGAC GAGGACCCAG AGTTATGTCC AAGGAATGAA GGCGTTGCCT 3120
TTCTACAACA GAGCAAAATG TCAAGTTAAC TGATAACATG TACATTCCTC AGGACTGGTC 3180
CCTCAGTGAG ACAGCGTTTT TAGCGGGGAA AAAAAGAACA AATATAAGTG TTTTCCTGGA 3240
TGCTGTTTTA GGGAGCTTGC TACAGGTTTA CTTGCTTGCG GTTCCTGGTA GGTTTCAGGA 3300
TTCCCAGGGT GAGAGGTGAT GGGCCAAAGA GAGGCACGCT AAACTGATAG CCTGAGATCA 3360
CAGCTTCCTT CCTTCCTTTC CTTCCTCCCT TCCTTCCTTT TCTTTTTTTT TTTTTGAGAT 3420
GGAGTCTTGT TCTGTGGCCC AGGCTAGAGT GCAGTGGCGC GATCTTGGTT CACTGCGAAC 3480
TCCGCCTCAC GAGTTCAACT GCCTCAGCCT CCGAGTAGGT GGGATTACAG GCGCCCACCA 3540
CTGCGCCCGG CTGATTTTTG TATTTTTAGT AGAGACGGGG TTTCACCATC TTGGCCAGGC 3600
TGGTCTCAAG ATCCACCCGC CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG CGTAAGCCAC 3660
CGTGCCTGGC CTTCTTTTTC TTTTTCTTTT TTTTTTGAGA CGGAGTCTTG CTCTGCTGCC 3720
CAGGCTAGAA TGCAGTAGTG CGATCTCCGC TCACTGCAAA CTTCGCCTCC CAGGTTCAAG 3780
CCATTCTCCT GCCTCAGCCT CCTGAGTAGC TGGGATTACA GGCATGCACT ACCATGCTCG 3840
GCTAATTTTT GTATTTTTAG TAGACGGGAT TTCACCATGT TGGTCAGGCT GGTCTCGAAC 3900
TCCTAACCTC AAGTAATCTG CCCACCTTGG CTTCCCAAAG TGCAGGGATT ACAGGCATGA 3960
GCCACCATGC CCAGCCCCCA CAGCTCTCTC TCTAAGACAA GTGCAAACTA GTACCTGGAA 4020
AGGAGTCCTT TCTTTCCATT CCCGAGCCCC CTCCCCACAC CAAAACCCCA CCTGCTGCCA 4080
TGTGGCGGGG ACGCTGAGGA ACACTGACTA TCACAGAGCT GCCTTAATGT AAATGATTTC 4140
CTCAGGTGCA GAAAAACATA CACACCAAGT ATGGTTTGCC ACTCTGAATT CTGGACAGAT 4200
AACATGACGG CAGAAGTAAG CTTGTTTAAA CACGCTCTAG TAATAGCTTC TTAGTGGCTG 4260
AGGTTAAAGC ATAGTGAAAT TTGATACATT CAGGTGAAAA GCAAACATGA AAATTTGCAT 4320
CCTCCCAGCA ATCAAATTAC ATTAGACATG GCTAAATCAT GATTTCATGT AGTTAACAAG 4380
CAGTGAAGGG TGAGGCCAAC CAAGTTCAGA CAAATTGAAC CTTCTACCCA ATTCTACTCT 4440
CCTCTCCTCC TTTCTCCGAA TAAAACCCAA TACTCCTCTT TAACAAGTTG TATGATTCAC 4500
ATGCCGAGAG GAAAAGGGCC AGGTTGTTTG TCAATTGATC TAGTCTAAAG AAAACAAGTC 4560
CTTGACTGTA TTTTAGTTTG AACAAAACTT ATTTTCCTAA GGATAAGAAT ACCTCGAAAC 4620
TCTAGTACTA AGTTAGAAAT TCACACTATG CCTCCTGGCT TGTCACGCAC TTCCAATTTG 4680
AAAATATGGA ACCTCAAGGC TGTAGATATT TGAGGCCCTT AAGAGAAAAA CAATTCATGT 4740
TTTTTTGTGT GTGTGTTTTT TTTTTTTTTT TGAGACAGAG TCTGGCTCTG TCGCCCAGGC 4800
TGTAGTGCAG TGGTGTGATC TCGGCTCAGT GCAACCTCCA CCTCCTGGGT TCAAGCAGTT 4860
CTCCCTCCTC AGCCTCCCGA GTAGCTGGGA CTACAGGCAC ACGCCACCAT GCCTGGCTAA 4920
TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGGTTT CACTATGCTG GCCAGGCTGG TCTCGAACTC 4980
CTGACCTCGT GATCTGCCCG CCTCAGCCTC CCAAAGTGCT GGGATTACAG ACGTGAGCCA 5040
CCGTGCCCGG CCATGAATTC TTAAAAGTGT AAAGGACTGT TTTTATTAGA GCAAATGCAA 5100
ATTAACCTTG CAGGAAACCA 5120