EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS092-31489 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HFF 
Coordinate
chr5:52325770-52329600 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr5:52328173-52328183GTCACGTGAT-6.02
LMX1BMA0703.2chr5:52329413-52329424TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr5:52329423-52329436TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:52329427-52329440TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:52329431-52329444TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:52329420-52329433AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:52329424-52329437AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:52329428-52329441AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:52329419-52329432AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr5:52329432-52329445AATTAATTAATTT-6.92
MEOX2MA0706.1chr5:52328319-52328329AGTAATTAAC+6.02
NR2F1MA0017.2chr5:52326729-52326742CTCATGACCTCTG-6.04
PHOX2AMA0713.1chr5:52329414-52329425TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr5:52329421-52329431ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52329425-52329435ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52329429-52329439ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52329433-52329443ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52329421-52329431ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52329425-52329435ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52329429-52329439ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:52329433-52329443ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr5:52329414-52329425TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr5:52329414-52329425TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr5:52329414-52329425TAATTAAATTA-6.62
TFAP4MA0691.1chr5:52328572-52328582ATCAGCTGTT-6.02
TFEBMA0692.1chr5:52328173-52328183GTCACGTGAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_05244chr5:52325290-52328440Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07139chr5:52326878-52328432Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_35966chr5:52325696-52328970HMEC
SE_38428chr5:52322459-52329244HUVEC
SE_55777chr5:52316677-52329551u87
SE_64538chr5:52325081-52329136NHEK
SE_67732chr5:52316677-52329551u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr55232713852327422
chr55232743552328022
chr55232906952329210
chr55232759252327905
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH05I053029chr55232512452329278
Enhancer Sequence
AGGACATCTG GCACCGAGTT TGAAGCAATT CTTTTAAGTA ACAGCTTTCC TGGACAGAGT 60
AAATCTAAGA GCCACCATCA GTAATAGACA TTATTGAAGG TGATAAGCCT TTCAAGGATT 120
GTAAGGGGCT CAACCACTGG CCATGCTGCT GGTTGGAAGT TGAACAAGAC GAAAAGGGAC 180
ACAGAGTTGA GAGGATCCCA CCAGGCAGAG TTCTGGGAAC ATGAGAGGCA GCCATATCTC 240
CTTTCTCTGT CCAGGATTAC CTCTAAGTAT CCAAGACATT GTTGAAAGAC AAGTATATTT 300
GTAGTTTATA GTGAGATCCT AGTGCTGGTA AGACCAGGGA CACTGGACAT TTCTAAATCC 360
TGCCTGGACC TTCTCATGAC ATCCCTGAAT GATGTATAAA CACAGGACAA TAGGTCTGGG 420
AAGCAAGGCA CCACTCTATT ATTGGCTGGG CCAGGGCTTT GAACTCCAGT ATAGAGCTTT 480
CTGGCAAGGT GTAGCACTGA GATTAGGCTC AAGGCCTAAC CACCAGATGA TACAAGCATA 540
CCCCACCATG CAAGAGGAAG AGACAGCACC TGTCTGACCT GAAGGGCTGA ACCATATGGA 600
ATTCAGAAGC AGGAAGGACA GAGAACAAAA GTTGGCCAAG CAAGTCTGTC TGGGTCCTTT 660
TGTTGATCTG GTCTTATGAA GCAAAGAAAC AAGAGAGGCA AAACCATGGG CATGATTTTC 720
TAAACTACAT GAGGTGCAAA AAATGCAAAA CATAGTTGTT GGCCTTAAGG AGTGTAAAAT 780
AGAGTCAGTG AGGAAGATTT ATATGCAGAA TAGGCAACTT TGAATAATAT AGAAGACATC 840
AGTCAGTGTA AACCCCTTGC AGTTAATGGT GTTTGTTTTC TTTCAGTGTC ACTAGCTATA 900
ATAACTTAAG AGCTCATTTT CTTTTCCCAA GGCCTGGGTC ATTAGAGAGA CAAGGTTTTC 960
TCATGACCTC TGTCATTTGC CCAGCCCTGC CAAGGTACCT TGCCACAGAG GGCAGGGCTG 1020
TGGCCAGGAT CCAGGTGAAT GGGTTATCCC ATTACAGTGC TAGAGTGGGC CATGTTAGGA 1080
CAAGCAGTCT TCACGACTCT CAGGCTCAAG GAAAATTATA TGAAACTTGG AACCCAGAAT 1140
TGCCTGTTTG TTTTGACAGT GGGCCCTGTG CCCTTCTCTA CTCTTAATTT ATGACAGTTG 1200
CATAGGCATT ATGGAAGTAG CAGATGTGGG AAGGACTGTT TAAACATTGA CTTTCCTTCT 1260
GATACTAATC AAGTTAGTTT TGGACACAGA AATTGGTATG ACCATGAATT ATTCCTTTAG 1320
CAAATTGCGA GTTCTTTTTC CATGGATTTA TCATGTAATA CATGCACACA CACACAACTT 1380
TGTTTTCTTT ATTCCCTTAC TGCTTATTCT GAAGCTGTCA TTTTGGTATC TTTTTCCTCT 1440
GCTTACTTTG ACTTTCTTTG TAATCTTTCT ATCTAAGTCC TGACTTCACT CCTTTCCCTC 1500
AGACAACTCA CTGAAGGCTC TAGTCTGAGT ATTCTTAAAT CACACTCTGT TATTTTTAAA 1560
GTACAATTTT AGCTCTGTCA TGTGTGCCAT GTTTTCTAAG AATTTATGGG CATATTTACA 1620
TCAGGATCTA CCAGATTTTA ACAAAATAAT CTTAACTCTT TTGCTAGTTT CATTTATGAG 1680
ACTTTCATTG CACTATGAAC TTCAACTCTA GAAACAGTGG TGACATGGCT TTGATAATTC 1740
TGGAGCCTTT TTAACAGTCT CAAGTGAGCG GGATAATTTT AAAACAAGCT GACCTCCCAA 1800
GTAGAGTACC TGGGCAGCCC TCTGGCTGTA AGTAAGGCTG TGGTCTGTTC TCTTTTCGGT 1860
GTAGGCGGAG GGCCATCCCG CTTCAGAGCC CTCACTTCAC ACACAGGATG TTCCAATGTG 1920
GATGATGCAA TTCTTATCAC AAACAATCTA CAAAGGATTG AGATATGTTT AAAATCATTT 1980
CCTGGAGTTT GTGGTGATAT GCACTCTTTC TGTTTGTCTA ATCTGAAGGC CTGTTGCAAG 2040
AACAATCTGA GCTCATTATG TGACTCAAAA ACCAGAGAGA ACTGCAATCT CTCTGTGTGA 2100
TGAGGACTGA CTGGGAATTA GGGTATTTCC AGTTGTAGAA ATGTCTTTCA TTCTAACAAG 2160
GACTAGTGCA TTCTTTTTCC TTAAAGAGAG AGGAGAAATA GAAAGAACAA GTGTCATAGC 2220
AAAAAATAAA AATAAAAAAA ATCCACCTAT ATATGAGCTT ATAGTTTTAA CTTTTTAATT 2280
GAGAAAAACT TTAATAAAGC TCTACATGTG TTATGAATAT AGCATTGTCA TCCACAGATG 2340
TGCCTATAGG AGAACTTTAA ATAAAAAAAA AAGTTTAATT CTATAACAGA CATCAAAGAT 2400
TATGTCACGT GATACTTTGA TAATAACACC ACCTGGTATT TATTGAGTAC TCTTTCCTTG 2460
CCAAACATGT AATACCCATA ATTACTCTAG GAGCTTTGCA AAATTATTAC CCCCTTTACA 2520
AATGAGAGGA GTGTGACTCA GAAATGTTAA GTAATTAACC TAAGATTACA GAGCTGATAA 2580
TTAATAAAGA TAGGGGAAGC TAATGCAAAA TGAGACAAAA TGTTCCAAAC GTACATATTT 2640
TTGTAAGTAT CCAAGAAGGA GAGTGACAGG ATGTAGTTGG CATTTATAAA TAATATTTAA 2700
ATTTTATTTT AACATAAACT TTATGAAGTA AGAGAAACTT TCAGAATCTT GAATGAAAAA 2760
TTCTGTTAGA GAATTTCCAA TGTTAGCATC ATTGGCTTTA CCATCAGCTG TTTCCTGGGC 2820
AAAGATGATA GTTACCATCC ATCTTTTCAT CCTATCATAG ACAGGAATTT CTTGTATGAA 2880
TATACTCAGG AGCCGGAGCA CAAGGGTTTT ACCCTCAGCT TCCCCACCAC TCCCTGGGTG 2940
ACTTTGGGAA AGTCACACAA CTTCTCTGGA GCAGAAAGTA TGCCATCCTT ATCAAACTGG 3000
AATGTTATGA GCACCTTGTG TGAGAATAAA AGTAAAGCAC TTCAGGGCTG GGCTCGGTGG 3060
CTCATGCCTG TAATTCCAGC ACTTTGGGAG GCCAAGGCGG GCGGATCACT TGAGGTCAGG 3120
AGTTCGAGAC CAGTCTGGCT AACATGGTGA AACCCCATCT CTACCAAAAC CATAAAAAAT 3180
TAGCAGGGCG TGGTGGCAGG CACCTGTAAT CCCAGCTCCT TGGGAGGCTG AGGCAGGAGA 3240
ATCACTTGAA CCTGGGAGGC AGATGTTGCA GTGAGCTGAG ATCATACCAC TGCAGTCTAG 3300
CCTTGGCAAC AGAGGGAGAT TCCATCTCAA AAAAAAAACT GGGTCCTCCC TACCTCTTCC 3360
TATCCCCTCA ACCAATTCTC ATCTGTCATG GATGAGCTTC CATGCATATT GGATTAGCTT 3420
CATGAAGTCC ATTTCTTCTT CTTGGCCAAG AATGCTATTC TATTCCAATC CTCTTTCCAA 3480
AATAATCATG TCTTTGTCTT TTATGATATA GCCTTTTAAA TATTAGCCAA TTATCATCCT 3540
TTATATCTCT TTCAAAGATA AAAGTCTCTT ACCATTAGGT TGTCCTGGCA GTGCCATTTA 3600
ACATGCCAAC TTCATTTATT CACAGAGTTT GCTTATATCT TATTTAATTA AATTAATTAA 3660
TTAATTAATT AATTTGAGAC AGAGTCTCAG TCTGTCACCA AGGCTGGAAT GCAGTGGCTC 3720
AATTTTGGCT CACTGCAACC TCTGCCTCCT GGGTTCAAGT GATTCTCATG CCTCAGCCTC 3780
CTGAATAGCT GGAATTATAG GCATGTGCCA CCATACTAGG CTAATTTTTT 3830