EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS092-28089 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HFF 
Coordinate
chr3:40157140-40159510 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:40157957-40157978TCTCTCTTTCATTTTCCCTTG+6.64
KLF4MA0039.3chr3:40157414-40157425CCACACCCTCC+6.32
Nr5a2MA0505.1chr3:40157214-40157229AAGTCCAAGGTCACT+6.2
ONECUT3MA0757.1chr3:40158348-40158362ATTATTGATTTTGC-6.26
RREB1MA0073.1chr3:40157831-40157851CCCCAACACACACACACCTA+6.07
RREB1MA0073.1chr3:40157829-40157849CCCCCCAACACACACACACC+6.69
SOX10MA0442.2chr3:40158160-40158171TCCTTTGTTTT-6.32
Sox3MA0514.1chr3:40158161-40158171CCTTTGTTTT+6.02
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I040115chr34015716140159378
Enhancer Sequence
CTGAGCTGAA ATCAACCTTT AAAATATGGT ATTTCTATTC TCTTAGTTTA CAGAAGAGAA 60
ACCTGAGATT TACAAAGTCC AAGGTCACTC AAAAAGCTAG ACTCAGGAAC AAACTTGGAG 120
ATTCCCAGTC CCTGGTTCAC AGTTCTTTTT TTTTTTTTTA TGTGATGCTC TTTGTTGTAG 180
AATTTATGTC ACGATTTTAT TATGGAGTAT CAGTCTCTCC AAGTGGGCTT CCGTAAGAGA 240
TCACATATAA AACACCAAAA CTAGGCTCTG AGGTCCACAC CCTCCTGCCC GCTCACTCTG 300
CCATGGAGAC AGCTCATGCC ACTGCAGGTA ATGACAACTG CACAGCACGA GCAAGGTTGA 360
GTAGAACAGG TATAGAAATT GGCATGGAGT GGTGAAGAGT CTGAATTCCC AAATGTCATT 420
ATAGAAGCCA GCTGCAGTGC TCCCTGGCTC ACAGGTTCCC TGGGGCTGAC TATCCTCCTG 480
GGTCTCCAGC TGTCATCTTT TGCTTGATCC CTGGATGGGG GCACACTCAC ATCCCTGTGA 540
TGTGTTTTGC CCCTGATGCT GGTATCCCCT AGCACTTTAC CTTTAGCCAG CTTTAGCCTA 600
GCAGATGCAT TCACACCTCC TCCATGAGTT GTGTAGACCT TAGGAAAGTA AGACGTGGTC 660
TCAAGTTTCC CAAGGAACAA CTTACATTGC CCCCCAACAC ACACACACCT AGCAGCATAA 720
GACACATCTC TGATACTGCC ATCTTCAGAA ACTTCTAGAT GGAAAACATC CCCCTACTGT 780
AAGTAACTCC CTGCCATCCT ATTTATGTAT TTGTTTATCT CTCTTTCATT TTCCCTTGTC 840
CCTGAGAGTA GAGTAAGGAA AGGGCTCATT GCTTTCAACA CTTTATTTTC TCTGAATTCA 900
GCAGTCTTCA CCTCAGCACA GTTTAGTCTG GCCCAATTTT GATAGGCATG GGCCTGTCTC 960
TTTGCATCTT TGTCTCAGGC TGGGAGGCAC ATTTTGAACC TGGAAGTTTA GAACACGGCG 1020
TCCTTTGTTT TTGACAGGCT GTTAAGGATA TGCACAGGGC TAGAAAACTG AATAGAACAT 1080
CCCTTGTGGA TGCTGCAGGT TCTTAGCCAC AAATTAATAC ACAAAAACGG TTTGGGGTGT 1140
ATCCCAAAAA CCGTTAAAAT GACTTGTTTA TGTGGAGAAG TTAAAGCATT TCTCTACAAT 1200
CTCATAACAT TATTGATTTT GCCATGAACC TCTTTTCTCA TGAGTCATTC TAAGATATTT 1260
TTCAAGCAGT TTCCCTTCCA TAGTTTCATA AGTTTGGAAT GAGTGGAGGC CCAACCTCTG 1320
TGAATCGTTC TCTTGTGTGT TCTTTCCCTC CTGTCTCCGT CTCACAGTCT CACATGAGTG 1380
GCTGCACCCC CGGCTATAGC TTGTTTGCAG TTTGCTGCCA ATATGACTGG AGCATCCGGT 1440
GAGGCCACAT CTGCCTTTCA ATCCCCCCGC CCTGATATTG TAAAATAAAA GTTTGTTATT 1500
TTGACATTTT TGTAGCTCAC TGCACCACCC TTTGGTGGCC AGTTTAGAAA AATTTGATAA 1560
TTAATGAAGA TATCATACAC CGGTTATGTA AAAGCAGGAT AGGAGTAGCC ACAAAGACCC 1620
TGGAGGCTGA AAATCAGGAA CAGAACTGAG AGCCTTACAA AGTGTGATTT CATCAAAGCC 1680
ATATGATAGC TACTGTGTTT ATGTAAATTA ATTTTACTAC GTTGTGTCAC AACCTCCCCC 1740
CTTTTAAAAA GCTCTTGCCC TCTGTAGCTT GAGGCAACCT TCTGCCCATC ATTGATCCCT 1800
TCTTTCCAGG TTATTCCCAT TTCTACATTC TTAGCTGTTA CATTTTCAAA TTGAAATATT 1860
TTATTCACTA CTCATGTCCA GTGTCCTCAC TTACCTTGGC ATCATTTCTT CCCTCAAGAG 1920
TAATATTGGC ACAACTAAGA AAATATCATC CATTATCATC AATACAGCAT ATTGATGTTC 1980
TGACGTAGTC CATCAGTGTA GAGGCAGAAG AGCAACAGCA GCCCTTAGGA TGCGATGGAC 2040
ATAAAGGCAG CTTTATAGCC AGACCTCAGT TCCAATCTTA GCTCCATCTG GAAAAAATAA 2100
ATAACTTTAG ACTCTTACCC TCTACCTGAC ATTGAAATTA ATTTACTTTA GAGCAAAGAC 2160
TTCAGCATAA AAAATAAACC CAAATACAAA GAAGAAATCA TGAGAGGCCT TACTATGGCC 2220
CCAAACCAGA AGCTCCATAA AAATAAAAAC ATCTCTACAG CACAAAAATC ACCATTAACA 2280
AAGTCAAAAG CAAATGGCAG ACTAGGGTAA TTATTTGTAA TTTAAATTGC AAAAACTAAT 2340
TTTTCTAACA TAGAAATACT CCTACAAATC 2370