EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS092-12122 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HFF 
Coordinate
chr12:56326700-56329080 
Target genes
Number: 40             
NameEnsembl ID
METTL7BENSG00000170439
RP11ENSG00000258311
BLOC1S1ENSG00000135441
ITGA7ENSG00000135424
RDH5ENSG00000135437
CD63ENSG00000135404
GDF11ENSG00000135414
SARNPENSG00000205323
ORMDL2ENSG00000123353
TMEM198BENSG00000182796
DNAJC14ENSG00000135392
MMP19ENSG00000123342
DGKAENSG00000065357
WIBGENSG00000170473
CDK2ENSG00000123374
PMELENSG00000185664
RAB5BENSG00000111540
AC034102.1ENSG00000255990
SUOXENSG00000139531
IKZF4ENSG00000123411
RPS26ENSG00000197728
ERBB3ENSG00000065361
PA2G4ENSG00000170515
RPL41ENSG00000229117
ZC3H10ENSG00000135482
ESYT1ENSG00000139641
MYL6BENSG00000196465
MYL6ENSG00000092841
SMARCC2ENSG00000139613
RNF41ENSG00000181852
OBFC2BENSG00000139579
SLC39A5ENSG00000139540
ANKRD52ENSG00000139645
COQ10AENSG00000135469
CSENSG00000062485
CNPY2ENSG00000257727
PAN2ENSG00000135473
IL23AENSG00000110944
STAT2ENSG00000170581
RBMS2ENSG00000076067
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Stat4MA0518.1chr12:56328033-56328047CCATTTCCTAGAAC-6.08
ZNF263MA0528.1chr12:56327140-56327161AGAGGAGGGAAGGGAAGGGTG+6.28
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_14808chr12:56319132-56330903CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15615chr12:56319793-56328596CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15615chr12:56328628-56330449CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16222chr12:56320106-56328470CD4_Naive_Primary_7pool
SE_17756chr12:56318690-56337112CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18571chr12:56318526-56337305CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19515chr12:56324282-56331515CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_22236chr12:56319466-56330682CD8_Naive_8pool
SE_25638chr12:56318758-56329599DND41
SE_26850chr12:56324307-56328480Esophagus
SE_31107chr12:56318932-56329826Fetal_Thymus
SE_36130chr12:56322770-56334475HMEC
SE_54035chr12:56324171-56327019Spleen
SE_55420chr12:56326996-56327615Thymus
SE_55420chr12:56327775-56328588Thymus
SE_58813chr12:56314637-56334486Ly1
SE_61902chr12:56318620-56334637Toledo
SE_62592chr12:56319159-56334646Tonsil
SE_64736chr12:56322937-56334125NHEK
Enhancer Sequence
GGCCTGGGCC CTCAAATTCG GGGCTCCTGC CCCTCTGGGG CAGCCTCAAT ATTCTGGAGA 60
CATAGCTATT TCCTGAGTAA TGGTCGACTT AAAGGACTTG GAATGTGAGC AATGAACGCT 120
TAAGTGAAAA AAGGAAACTT TAAATACTAA CACAGGCTTT GGAAACAATA TTTATCTCTT 180
GGTTAAAATT TTAGTATTTG ATGTTTAAAA TTAGATCCAG AGAGCCATGA GCTCTAAGAT 240
TTAGTGGAAT GTACTAAGGA TGGGTGTCTA GAGTCTGACT GTGCCCTTAA GAGAGTAATT 300
CTCTCTCTAT GCCTCAATTT CCTCCTCTGT AAAATACGAG GGTTGGTGAC TCCCAGCTCT 360
GTGGATGTTC TAAGATTCTC TGCCTCCAAG TCAACTTCTT CCTTTCTCGC CCCAATTGGG 420
TAGGGGCGGG CAGGGAAACC AGAGGAGGGA AGGGAAGGGT GAGTCACAAA TAGCTGGCAG 480
GCTGGCAGCA GACCCCACCC TCCCAGCCCT GGCCTTCGCC TAGACTAGCC CAGGTTATAG 540
CCTCAGGGTT GGGATGGACC TGGAGGAAAA AAAATGGACT TGTTCTAGGT CTTCAAGTCC 600
CCAGGATCCC ACAGTTTGCT GCCCTTCAGC TCCAGGGATA GCTAAACTTT CAGTCAGAGA 660
AGTCAAGAAA ACCACTGAAA AGATCCCAGG AGCACTCGTT TCCAAGATTC CAGCCCAGGG 720
GTGTCCTTGA ACCCTGAGAG TCTAGCTCTA GCCACCTCGT CATCCTCCCA GAGGCAAAGT 780
TCAGAATCCT GATACTACAT GTTTGCACCT GACAGATATA TTAATAACAA GGGGTAAGAC 840
GTACAACTGG GCTTCACTGA TGCTAGCAGT CCCTGAAATT TATGCCTTCC TGGTTCAAAG 900
ACATCATTTT TCCTAATCTC CAGAAATGTT TCTCTAGGTA CTACCCTTGT GTAATAATGA 960
TAATAGCTGA TGTTCATTGA GTTCTTATTC TGTGCCATGC TGTTTGCTAA GTACATTGCA 1020
TATATCATCT TATTTAATGC CCACATTGCG ACTGATTTCT GTAGGTGCCC ACTTTACTGA 1080
TGAGAAAACT GAGGCTCAGG GAGATGAAAT GACCTTTTAA AGAGCTAGGA TTCTGATCCT 1140
TGCCTGTCCA ATTTGCAAGT CCATTCTCTT AACTTCTACT GTATACTACT TCTCCAGGTT 1200
TAAGACCTGG GGAGCTAGGA AGGAGCAAGA AAGAGTTAGA TCATTGTAAA AAGAGAGGCA 1260
GAGAAGAAGC CTGTCCTCTC TCCTTTGCAT TGTAACTTGT TTGCTCCCTC CTTGTCACTT 1320
TCTCCCTCAG ATTCCATTTC CTAGAACTTT GGAGTCATCT TAGAATCCCC AGGGGTAATC 1380
AGAGAGGCTA ATTAAGCTAT AGAGGCCCCA TTAGCCATAA GACTATTAGT ATTCATTAGG 1440
TCTGTTGGCA GCAGAAGTTG GACTATGGTC ATTGAAAAGT GCCAGATGGG TAGAGTCCTT 1500
TCTCTAGGAT GTCAGTATCC CAGAACCCTC TTCTGAGTGT TCCCAGAGAG CTGCTGGAAT 1560
AGGAATGGTG TGCTGCATAA AAGTAGGCAG CAGAGATGTC CCAAGGGAAG AGGCTGCAGA 1620
GAAAGTTCTT GCATCATCAG AAAGGAAAAG GGCTAGGCTG TTCTTGAACA CCCAAACTGC 1680
TTCCCTTACC CAACAAGCCC TAAATGAGTG GGTGGAGATC AGGGTGTTTG ATGGGGTAGT 1740
CAATAAGTGC TTTTCAGCAT CATTCATTTA TTTAACAAAT ATTTATTTAG CACCTACTCT 1800
ATGTACTACA AATTATCTCC TTTCCTCTGA CTGTCAGGTG GACACTCTGG CATCCTATTC 1860
CCATGTAACC ATATTTGGAT TAATAGCCCC AAATTATGAA TCCCCAGCTT TACACAATCA 1920
TGTGTACAAC CAATATTCAG CACCCACTAC ATACTGGGAA GGGTATCCCA GGCAGACAGA 1980
ACAGTAAGAC TCATTGCTTT GAGCAGGGGA GAGCTTGGCA TGCCTGAGGA ACAGAAAGGA 2040
GCACAGTGAG ACCAGATGGC GGGGTGTGAG GAGAGAGTGG AACAAGAGGA GGGCAGAGGG 2100
ACAAACAGAG GCACTACCAC ATGGCCTTGG GCTGGAGCCT TGGATTTTCC ATCTATCAAC 2160
TGCCTTAGGA AATCCAAGCT TCTCTGAGCT CCAGTTTCTT CATCTGTAGA ATGGTTATGC 2220
CAATAATTTC CTATGTCTGA TGATTTGATT CTAATTGTTA GTACAATAAT AACTAGCATT 2280
TCTTGTAGGC CTCCTAAATG TCAGGCATTG TATGAGTGAC TTTTCATATA TTGTTTTACG 2340
TAAGCCACAC AACTGTGAAA AATGGTTCTC ATTCTCCCCA 2380