EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS092-04796 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HFF 
Coordinate
chr1:221897850-221901010 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:221899869-221899890AATGTAAAAATGAAACTAGGC-6.34
RUNX1MA0002.2chr1:221900945-221900956TTCTGTGGTTT+6.32
YY1MA0095.2chr1:221899558-221899570CAAAATGGCAGC+6.18
ZNF263MA0528.1chr1:221898388-221898409TAAGGAGTAGGGGGAAGAAAA+6.09
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04249chr1:221897812-221899915Brain_Anterior_Caudate
SE_05268chr1:221894479-221899945Brain_Cingulate_Gyrus
SE_08233chr1:221897820-221900053Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09465chr1:221894191-221902221CD14
SE_12905chr1:221898705-221899851CD34_Primary_RO01480
SE_13404chr1:221898637-221900264CD34_Primary_RO01536
SE_14214chr1:221898545-221899665CD34_Primary_RO01549
SE_20410chr1:221898637-221902069CD56
SE_26005chr1:221898468-221900254Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29951chr1:221898845-221899614Fetal_Muscle
SE_32563chr1:221898183-221902778GM12878
SE_36211chr1:221896302-221900304HMEC
SE_37566chr1:221895001-221900255HSMMtube
SE_48429chr1:221897741-221898954Psoas_Muscle
SE_48429chr1:221898983-221899461Psoas_Muscle
SE_51295chr1:221897827-221904146Skeletal_Muscle
SE_52175chr1:221895486-221899980Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54816chr1:221897959-221899962Stomach_Smooth_Muscle
SE_63303chr1:221886936-221925458NCI-H82
SE_64034chr1:221895405-221899994HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1221899063221899285
chr1221899063221899693
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I221721chr1221895207221901673
Enhancer Sequence
ATATATTTTA CACCTACAGC ACATCTCTGT TTGGACTGGC CCCATTTCAA GTGCTCAATG 60
GCCACGTTTG GCTTGCAGCA AGGCTACTAT ATTGGACGCT GCAGATAGAT TTAATACTAT 120
TGCTATCCCC ATTAAATGAG TTAATGCTCA GTGTCATAAT TGTTCCCATT CTACAAATGT 180
TAACTAAAAT ATGTGTTTGT TTGCATGTGA ATGTGTGTGC ATGCACATGG AGGGGTAGTG 240
ACCAATGACT AAAATCTACG GTGCTATAAG CCACACTACA CCAGGAAGTC ATTCGGCTCC 300
CATGGAACAT CAAATAGCCA CTCTATTTTC AGGAAAAGAA ACACTTCAAC TTGGAGAAGA 360
GAGGCTCTCT GATCGATTAA CTACAGCATG CTCTTTTATT TCAGCACTCC AACATCTCCC 420
AGTGCACGTT TTAATATGAG CCAAATCAAG TAGCCACGAC AATAGCTTTG AATGAGAAAA 480
GACACCCCAA AAGCAGTGCG CAGATACATG GGGATGCCTG AAGGAGCTCA GAATGGCTTA 540
AGGAGTAGGG GGAAGAAAAA CTGCAGAGAG GAGCTTTGAC TCACTGAGTC ATTGAGCAAC 600
TGTTCTGTGC CCTCTCAGGC TACTTCCCAC AGCCACCGCC CAGCCAACAG CTAGCTGCAC 660
CCAGCCAATC ACTCACTCCA CTCCCTGGAA AAAGCTCCAC ATTGGGAAGC CAGAAGAATG 720
TCACTAGCAA GAGATTGATT TCAAGGTAAT TATTTAGGCA ACTTTGTAGC ATCTCATTCT 780
CAGGCCTAAA AGTGTTCTCA AAGTTTGTTT TAATAAATGC ATGTATTAAT ATGAAGTCTC 840
TGTGTCTTTT AATAATGATA TACCACATTC AGCTCCTCCC AATCTTTGTA AGAGAGGGCT 900
TCCTGGACTC CATAACCACA GCATTCCTCC AGCTCTTTCT ATTCACTGGA GCAGAAATGG 960
GGCTTTCTAG CCATCCTCAA GGTAGGAATT AAGAGATTCA CCTAGTAAGT GTACATGAAT 1020
AGATTTTTAC ATAATATGCA AAATTAATTA TAATATACTC AACCAATTCA CATATTTTAT 1080
CAAGGAAGAC AAGCTAATTA TCTGTCAAAG AATTATCTCC TATTTAAAGG GCACTTTACC 1140
TCAATTTGGC AAAATGAACT AATGGGAATT ATCTTTCCAT TCTGATGTGT TTTTGCTGCC 1200
TGTGTTTGCT TAAGCCCCTA GAAGACTTCA GCACTGCACT AAAACCTCAG GATTTAGAAA 1260
AGTTGAGAGG AAGGGAGACA CAAACACATC TACTCAGCAT CTCACTAAAT CTACCTCTTG 1320
CTGCTTTTAT TGTCCCTTTC AGAGTGTTTT ATCTACAGTG TAAAACTGGG AGTGACTCAT 1380
ATTTATGAAA TAAGGAGCCG TTGTTAGCCT TGCCAGATCA TTCACTTCCA CAATAGCTTC 1440
TGATTTTTAA TAGCGCTGAG TGGTGCTTCC TCATGTCCTC ACTCTATCCA CCAAAGAGGT 1500
CCAAGATCTG CAATATGTGC CTTACAGGAC ATGTGGTAAA CACACACATT CAGGATCAGT 1560
ATCAAGACCT GTGGTCAAGG ATAAAGATGT CCCTAAAAAC TCACAACTTT GATAGGTATT 1620
TGGATCTTAC ACTCAGGAAA GAAAAGCAGA AGTTAAAAAG TGAAAGAGAA TTGGGGGGAA 1680
AAATAAACTC AAACTGGCAA CTAGCACCCA AAATGGCAGC TAGTACCCAT TTCTCTAAAT 1740
GGGGAGTGCA GTTGGGTGGG AAGGTGGAGA AAATTCCAAA CAAGGGTTTC CTTCAAGAGG 1800
TTTCTCTTGT CATACCAAAA CCTTGGAAAC AATCTTAATT TATATTAATA GGCAAGTAAG 1860
TAAAATGTGG TAATAAGACA GGTTACAGCA TTAAAGAAGA AAATCTATGA TCACAACACA 1920
GGAAGCAAAA GTACATGCAA TATAAAGTGA AAATGAATTT CAGTTACTAT GTGAGAAACC 1980
CTGAAAAACA TGCACATATA TGGGTAGAGA ACAAAAAGAA ATGTAAAAAT GAAACTAGGC 2040
CAGTCAGGGC GGGATTAGTA ATATTATGTT TTTCTTTCTA AAATGTTCTT AATATCTTAA 2100
CAATAAGTAT ACATAAAGTG TTTCTGCTAA GACTTTTATA AGATTTCCTT ACATAGAAAT 2160
AGCATATAAT TTTTCAGCAC AGCACTATTT CAGGAAAAAA AAAAAAAAAA ACCCTATGTA 2220
GTTATCTATC CACCCCAAAA GAAACACTGG GTTTTTCCAA ACTTTTAAAC AAAAAGATCT 2280
ACCAAGCATC AGAAAAGTAT CTCCTACTTG TACTGCATTA GTGGTGACAT CAAAGCATTT 2340
TACTGAACTA TACCACTCAT ATATCAGTTG AATATAAGCA GATTATGAAT TATTATTGTA 2400
GAGATTCAAT ATTATAATTA TGGTTGATTT TCAATAAATG TTAGCTAGTA TGCATTCGTT 2460
ATTGTTCAAA GCACTTCTAC ATATGTTATC TAATTCTCAA TTGAGCCCAT GAGAAAAGAG 2520
CCATTACCCT CCCCATTTTA TAGACAAGCA AACAGAGGCA CAGAAAAGTG AATTTGTCCA 2580
AAATTATAAT AATTGGCAAA ATCAGAATTC AAACTCAGCA GCCTGGTTCC AGAATCTGTG 2640
CCCTTAACCT CCAAACTATA CTCCCTTCGC AAGAAAATAT ATAAACTGAA TACAAATATA 2700
AGGGAGCATC AGCCGGCTCA TTCAATTAGT CACTATATAC GCTCCTAAGA AAGGTAATGA 2760
GAAAAATTAT GGAATGACCT GGCTGAATAC TTGAACCCAC AAGATTTGCT TATTTAACAA 2820
CAACTCAGAT ACTAATCCAA AGGATTATAT ACTGGTTGGG CTTCTAAACA CCCTAAACTG 2880
AGAGTTAGGA AACATGAATC CTATGCCAGT ACTGCTAATA GCTATTTATA TCCTCCTGGA 2940
TAAGTAATCA GTTTCTATGT CTGTAAAATG GGATGGTTAG ATCAAATGCT TGATAACATC 3000
TCTCACAATT CTGTAACACC ATGTTCTTTG AAAAATGTCT TTCCTTTCTA ATTCAACATA 3060
GAGTAAGTGA ATGCTTGCTG TGCAATGGAC TATAATTCTG TGGTTTTTCA ACATTTCTAA 3120
AGTCATCCTG GGGTTGTTGT GGTTCAGAAA ACTTACCTTG 3160