EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS092-01240 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HFF 
Coordinate
chr1:39623110-39627140 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT+6.22
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT-6.22
Foxq1MA0040.1chr1:39624109-39624120TATTGTTTATT+6.62
Hnf4aMA0114.3chr1:39624505-39624521GTGGTCAAAGTCCAGT+6.51
KLF4MA0039.3chr1:39625567-39625578ACAGGGTGTGG-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr1:39625399-39625412AATAAGTGGTTTT-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:39625134-39625155TGGGGAGGAGGGTGGAGGGAG+6.03
ZNF263MA0528.1chr1:39625137-39625158GGAGGAGGGTGGAGGGAGGAA+7.19
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02052chr1:39623700-39625273Aorta
SE_06399chr1:39623194-39625443Brain_Hippocampus_Middle
SE_08441chr1:39623554-39625364Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_14598chr1:39623413-39625353CD4_Memory_Primary_7pool
SE_25799chr1:39623252-39625649Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30410chr1:39623509-39626362Fetal_Muscle
SE_32006chr1:39623632-39626196Gastric
SE_35822chr1:39623459-39627010HMEC
SE_36947chr1:39622990-39632657HSMMtube
SE_37973chr1:39623508-39626483HUVEC
SE_42256chr1:39623665-39625283Lung
SE_42256chr1:39625384-39626180Lung
SE_45768chr1:39623568-39627263Osteoblasts
SE_47164chr1:39622875-39627546Panc1
SE_51765chr1:39623560-39625373Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53123chr1:39623552-39625824Small_Intestine
SE_54583chr1:39623552-39625585Stomach_Smooth_Muscle
SE_63563chr1:39623442-39625404HSMM
SE_64261chr1:39623623-39625416NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr13962394539625358
chr13962649939626706
chr13962634439626656
chr13962377339626200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039157chr13962297839627255
Enhancer Sequence
TCCCTAGGTC ACCCAATGGC ATCTTGTGAG CCAGGTTGTC TGAAAAACTT CAAATCTTGG 60
TGGCAGTGTG GTGGGTGTAT CTCCCATATG AGGGATTGTT CCAGGGATCT GACTCAATTG 120
ACAGCTCCTG AATTTCTAAT ATGCCAAGGC TTTTGTGGTA AGATGAGCAA GAATTTTTCA 180
AGCTCAGATT TGGGGAACAT AGCTTCTTGC CATGCTATCT CATTGGCATG ATGTGTGACT 240
TTTGGGCAGA TTACTTAACC TCTGTCTATT TACTTTTTCT TTTTTTGAGA CAGGGCCTCA 300
CTTTGTCACC AAGGCTAGAG TGCAGTGGTG TGATCTTGGC TCACTGCAGC CTCAACTTCC 360
CAGGTTCAAG CGATCCTTCA TCCTCAGCTC CCCAAGTAGC TGGGACTGCA GGAACGTACC 420
ACCACACCCA GCTAATTTTT TGGAGTTTTT GTAGAGACGG GGTTTTGCCA TGTTGCTCAG 480
GCTGGACTTC TGTCTGTTTT CTCATCTGAT AATGAAAAGT TGCAATTATT TTCACAAGAT 540
ACTTTCAAAG ATGAGTCTAA TAATGCAGAT GAGCCATTTT GAGTTCCTTA CAACAAAGAT 600
GCTGTGGAAA TTTCAGGATT TTCCCCCTTT AGTTATAATA TGGGTAGCTT ATCCTAAGAA 660
CCTGTGACTA TTGGGATGGT CATCTTTTTG AGGCCAGCAG TAGAAAGAAA TTTGCAGTAG 720
TGACTGACAC ATTAAAGCAA CCCCGAAACA AATCAGAGTG AAATAGTGTC CTGGAGTTGG 780
GGATATGTGG GTGATATCTG GGCTGCATTT TCTCTCTAGG TATCCATGGA GAGGGTCCTG 840
TCTCCCTGAA TGGTTGTGCT TTCAACAGTT AGGGAATGAG CTTGACAGTT TCTGCTTCTT 900
CCCTCCCCTT GCCTTGAACT GCCTTGATAT GCAGTGCCTC CTCTGTTGTG TGGCTGTATT 960
CCAGTCCGTA AACATGACTG CTGTAAGGAG AGTACAGAGT ATTGTTTATT TTGTAAAACT 1020
TGTCTCATTG CCATGTAATA TTTGCTCAAG AGCTCCTGTT GTGGTGATAT TCTTGTGGTG 1080
AGCATGGCCC TTTAAAGATT TTGTTCTCAA ATGTTAAATG AGCCCCTGAC TGGTGTCCTG 1140
AAAAGCATTT AAGCTTCTCT CCCTAGAGTT TAAGCAAGAG GAGCAGTAAT CCCAGTGGAG 1200
CCTGGGCTGG GGTCTAGAGA GAAGGTGGCA GATGAGGTGG CAGATGACAG GCAGGGGCGG 1260
TTGTGGTCCC GTAGCTCATT TGCACAAAGG AGGGGCTGGC CTCTCCTGGG GAGGTATTTC 1320
CGCTCACTGG AACAAATGAG GGCGCTCAAA AGGCTGTAAT GTAATGAGGC TTCTCTGGTG 1380
ACGTCACTTG TAAATGTGGT CAAAGTCCAG TTCTTGGGGG CTAGTAGAAG CGGGAGTAGA 1440
GATCATTCGG TTTGCATGCT TTCACTTCTC AGCTGTCACT GTGCCATGGT GCCTACTTTC 1500
AGCCAGTGAA CCAACTCAAC TGGGCCGGGC ATGAACGCTT ACAAGTATCA GAAGTTCCTG 1560
GAGGGACTCA ACAACCTTAG AGGTATTACA AGGCTTCAGG CTCCCTACCC TTTGTCCTTG 1620
CTGATCGTGT GAGCACTTAT TATGGTGTGT ATTGTATAGG GTCTGTAAAA CCCTCCTGCT 1680
CTGAGCTGGC CCTATTTTTT ATGCGTTTAG GCAATTAAAC AGAAGGGATA GAGTTTGTAA 1740
ATGCAATCCT AAGTGAGTAG GAGAGAATCT CCTTAGGTAC TTCAGCAACA GCCTGTTGTC 1800
TTGCTTGAAC GGACAAGTAA GAAATGTCCC CTGTATTCTT GAGCTCAGAG GGCTCAGGGC 1860
ACTCCCTGTT TTCTTTGAGG TGGCCAGACA GTGTGGGTGG AGGGCTCTTG CCATAGGGCC 1920
CTGCAGCCTC ACCTAGGTGT AGTTATGTTT CTTGGGCCAG GTTTTCCAGT TGCTTGTGTC 1980
TACAGTGAGT CAGAGTCCCA TTTGGAGAGA ACTGGAGTTG GGAGTGGGGA GGAGGGTGGA 2040
GGGAGGAATG CAGGTTGATG GGCTATTTGT AAGCCCATTG TAAAGTAAGC CTTTGTAAAG 2100
AGTAAAACAA TGACTTTGAA AGAGGAAGCT TTTTATTAAA GTTTTAAAGG AAATAGTGTT 2160
TTCTTTGCAT CATGGGCAAA TTCTTCACTG ACCAGACATG AGAAGAATGT ACTCAGATGT 2220
GATGTAGGAC TCTTTTTGGA TATTAAAGAG AAAAATGAAT GAAATCTTTT TACTTTCCCT 2280
TCTCTAATTA ATAAGTGGTT TTATTTCCAT TTGCAGAGGA GGGTGCTTAA ACCATTTTTC 2340
TTTCATCAGT AGTTAGGATT CTGGACCCAG AGCAACCATG GGGTGTGGAG AGAGTGGGAG 2400
GGGGTAGAGG GAGGAAAGGA GTAAACTGGG TTTTTTCAGG GATGAGGAAA GTGGCAGACA 2460
GGGTGTGGGC AGGAGATCTG TACTCCCTTC TTGCCAGGGT ATGTAGATGT TTTACTTTCT 2520
TTCACTATCT GTTGAAGAAC TCTGGTTCTA AGAAATATAT ATGGAGAGCT TTGTATGCTA 2580
TAAAGGGATA TACAGGTCGG GCATGGTGGC TCGCACTCGT AATCCCAACA CTTTGGGAGG 2640
CTGAGATGGG AGGATCGCTT GAACCCAGGA GTTCTAGACC AGCCTGGGCA ACATAATGAG 2700
ACCCCCATCT CTACAGAAAT GTTAAAAAAT TAGCTGGGCA TGGTGATATG CACCTGTACC 2760
CTTAACTACT TGGGAAGCTG AGGTGGAAGG ATCACTCTGA GTTCATCTTA GAGGTACAGA 2820
ACCCAAATAA CACAGCAAAG AGCCCCAGAG TCTGGAGTGA GAAGAGTGCT GCTCTCTGGT 2880
GCTAGAGACC ATGTGAAGAA GGGAAGAATA CCCACATCTG ACTAAGCATA TGTGTAAATG 2940
CACCTTCCTC TCTGAGACAA AGAGCTGTAG TATGGGGCTT TAGAGTGAAG GTAATAGATC 3000
TTTTCTCTCC ACACTACTAC TCACCTTGAA TGGAGTTCTG TTTTCTAATC TTTCATTCAC 3060
TATTGTTTGC TTCATTCACT TATATACACT GTATAATAGT CTTTATAGCA TAAAACATAC 3120
AATATATAGC AGTTTCTCTT GTTGACCCAA AGAAAGGATC AGATTTAAAC TCTTCTTTGC 3180
TCCTGCAACC TGAGTCTTTT TCAGGTGGGA GAAGTTCCTG GAAAGAGGAC ATGTAGTTTT 3240
TTTGGTTTAG TCCTTATCAT TTTTTGGAAT GTTGCTATAG GTCTTAGACA ACTATTCCCC 3300
CAATTCTGGG CTGCCAGGCA GAGAGTTAGA TACAAACCAT TGCCTTTGTC AAATCCTCCT 3360
GTGGGTTGAG TTTCACCCAC TGTGCCCCCT GATTAAGGTG AATGGTTACT TCCCTTCTTC 3420
TTTTCACTTA ATATCTTTGT GTATTCCAGA AGGGCTGATG GAAAGAGGTA ATTGGCTCCC 3480
CTCTTCATTT AGTTACTGAC TGTTGCTTTT CTTGGCATGG TTCAGCTTGT AGACATTCCT 3540
CCATCTAGTG GGTAACTGTT GAAGGGAATC CAGTGGGAGA ATAGAGACAT TGTACAAGTT 3600
TTTGAAGTTC TGATCCCCAA ATTCCTATGA ATTTTTGGTG TTTTGATCCA GAATTGGGGT 3660
GCAATATTTT CCACTGCTCG TGCTTTTTCT GGAGGGCTTT AACTTATATT TCTCAAGCCT 3720
GTCAAAAACC TTAGTTATTG GGGTGATTTC TGGCCAGATG GACCTCTCTC ATGGGTATGA 3780
CAGGCTGAAC TATTGGCCCG AGTCCTGATT TTTGGCAGAG TCCAGACCTG TGCCATGACT 3840
GGGATAAGTA GGTAATTAGG GATTAATTAG GGAAGCAGAG AGGTAGGTGA AGTAGAGTGG 3900
TGAGAAAGTG GTTCACTAGC CTTTACTAAG AAAAATTTAT GATAGGACTA TGAGATAACT 3960
GACTTTTAAA ACAGAAATAT AATGGCCAGG TGCAGTGTCT CATGACTGTA ATCCCAGTGC 4020
TTTGGGAAGC 4030