EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS092-00236 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HFF 
Coordinate
chr1:8962360-8966660 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HES2MA0616.2chr1:8964607-8964617GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:8964607-8964617GGCACGTGCC-6.02
Lhx3MA0135.1chr1:8965058-8965071TATTAATTAATTA-6.25
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Lhx3MA0135.1chr1:8965061-8965074TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965065-8965078TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965069-8965082TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965062-8965075AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965066-8965079AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965070-8965083AATTAATTAATTA-6.78
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POU6F1MA0628.1chr1:8965067-8965077ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965071-8965081ATTAATTAAT+6.02
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TFAP2AMA0003.3chr1:8964140-8964151TGCCTGAGGCA-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:8964466-8964487TCCTCTCCTTTCCTCTCCTCA-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:8964456-8964477CCCTCCCCTCTCCTCTCCTTT-6.33
ZNF263MA0528.1chr1:8964444-8964465TCCCCTCTCCTCCCCTCCCCT-6.49
ZNF263MA0528.1chr1:8964451-8964472TCCTCCCCTCCCCTCTCCTCT-7.48
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_27088chr1:8962399-8963262Esophagus
SE_27088chr1:8963489-8964684Esophagus
SE_27088chr1:8965237-8966346Esophagus
SE_34103chr1:8962245-8964866HCC1954
SE_34103chr1:8965610-8966423HCC1954
SE_34433chr1:8962184-8964511HCT-116
SE_34916chr1:8962041-8965067HeLa
SE_34916chr1:8965216-8966534HeLa
SE_36553chr1:8962470-8964537HMEC
SE_36553chr1:8965481-8966338HMEC
SE_42834chr1:8963483-8964807Lung
SE_46612chr1:8962243-8964865Osteoblasts
SE_46612chr1:8965500-8966434Osteoblasts
SE_47312chr1:8961358-8966536Panc1
SE_56056chr1:8962341-8965238u87
SE_67633chr1:8962341-8965238u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr189623718964927
chr189640538964236
chr189653378966372
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008902chr189624608964905
GH01I008905chr189655548966260
Enhancer Sequence
CCACTGCACC CGGCCTTAAT ACATTTTTGT TGAATGGATG AAGTGCTTCT CCATAAGGGA 60
TGTTTGGGTT CAATTTTCTG GCTCCCACAA ACCCACCTTC TGAGTCTCAG ACCCTCTCCT 120
TGTCCATACC TGTCCATGCG GAGATAGGCG GTGTGGTGTT ACGATAGATA CATACTGGTT 180
TGCATCTGCA GATCCCCGTT CCTAACTCCC ACAGTCCTGT GATAATGTTG GGGCACTTGA 240
GGCCTCAGGA AACAGAACCT CTCCTCTGAA CTTCTCCTGT TCCTCTTTCA CCTGTCCAAC 300
CAGGATTCTA ATCTGATGTG GGTCCAAAGA CCTTCATTCC AGAGAGGGTC CTGCCCCATA 360
CCCTAGAGCA AGACTGTTCA GCCCACCGTC CAGGATGGCT TTGAATGCAG CCCAACACAA 420
ATTCATAAAC TTTCTTAAAA CATTATGAGA TTGTTTCACA ATTTTTTTTT AAAGATCATC 480
AGCTATCATT AGTGCTAGAG TATTTTATAT GTAGCCCAAG ACAATTCTTC TTGTTCCAAT 540
GTGGCCCAGG AAGTCAAAAG ATTGGTCAGC CCTGCCCTAG AGGAAGGAAT GCTGAGAGAG 600
AGGCCAAGAA AAGTCTGAAC AGACAGGCCT TGCCGGGGGT TTAGATCATG AGATTTTTGT 660
CCAATCACAT TTCTACACGG TTATCAGTCG TGCCCATGTA ATGAAGCCTC CATAAAAAAG 720
CCACGAGGAC TGGGTTTGGA GAGGTTCTGG ATGGCTGAAT ACGTGGAGGT TCCTGGAGGG 780
TGGTGAGACC CAGGAGAGCA TGGAAGCTCT GCTTCCCCTA AACTCCACCC TATGCATGGC 840
TTCATCTGTA TCCCTTGTGA ATCCTTTATA ATAAACCACT AAACATAAGT AAGTGTTTTC 900
TTGAGTTCTG TGAGCCATTC CAACATATTA ATCAAACCCA GGCTGGGCAT CGTGCCTCAT 960
ACCTGTAATT CTAGCACTTT GGCAGGCCAA GGCGGGTGGA TTACTTGAGG TCAGGTGTTC 1020
GAGACCAGCC TGGCCAACAT GGTGAAACCC CGTCTCTACT AAAAATACAA AAATTAGCCG 1080
GACATGGTGA CTCACACCTG TAATCCCAGC TACTCAGGAG GCTGAGGCAG GAGAATCGCT 1140
TGAACCCGGG AGGCGGAGGT TGCAGTGAGC CGAGATCCCG CAACTGCACT CCAGCCTGGG 1200
AGACAGAGTG AGACTCCGTC AAAAACAAAA AAACAAAAAG CAAACAAACA AAAAAACAAA 1260
CCCAAAGAGG GGGTCATGGG AACCCCAAAT TGAAGCCAGT GACTCAGAAG TTCCAGAGGC 1320
TCAGACTTGT GACTAGCATT GGGGGAGATA GTCTTGCAGA CTGAGTTCTC AAGCCCTGGG 1380
ATGTGATGCC ATCTCCAGGT AGATAGTGTT GAAATTGAAT TGCAGGACAC CCAGCTGGTG 1440
TCCACCCCCA CACATTTGGT CACAGAAGTC TTCTTCTGTG TTGACTGTTG TGGTGTGAGA 1500
GTAGAGGAAA AATGCAGTTT GGATAGAGTT TTTTTCTGAC ACAGGTGGTG ATCTTCAGGA 1560
ACCCACCTGC ACCTGTGAGA TTCTGAAGAC GTGGACCCAG CCTTCACAGG CATCCAAGTT 1620
ACCTTCCCCA TGAGGACTTG TTTTACAGAT CACAAAAGAC ATCTGCACTT TGTATGGCTC 1680
CAGCAGGATC TCTCTGATCT GTGAGGATTA ATGAGCCAGC CACATCTCTC CCCAGCTTCC 1740
TGGACCAATG GCGCAAACCT AGTTCAGAAA CCCAGCAAGT TGCCTGAGGC ATTAGCCAGG 1800
CATCCGTGGT ATGCAAGTTT TGGCACTGGT TTGCTGTTTG GATGTTTTTC TCCTTCAGGC 1860
GGAAATTTAC AAAGCACTCA TGCTCCAACT ACCATGGCAG AGAGAGGAGG TGAAGCAAAT 1920
TGTAAAAACT TCAACCTCAG TATTGAGTTT CTCCTTGACT TGTGTTGAAG CCAATGATGG 1980
CAAGGGATGT GGATAACCTG GATGTTTTCT CTTGGGATCC ACCCTCTCAC AGGTGTTCCT 2040
CTGAGCACTT TGCAGGATGA GAAGTTGAAT AGGGAGGGGA GAGGTCCCCT CTCCTCCCCT 2100
CCCCTCTCCT CTCCTTTCCT CTCCTCACAG GGTCTCGCTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC 2160
AGTGGTGTGA TCTTGGCTCA CTGCAACCTC CACCTCCTGG GCTCAAGCAA TCCTCTCACC 2220
TTAGCCTTCT GAGGAGCTGG GACTACAGGC ACGTGCCACT ATACATGGCT AATTTTTATA 2280
TTTTTTTTTG GTAGAGACGG AGTTTTGCCA TGTTGTCCAG GCTGGTCTTC AACTCCTGGG 2340
CTCAAGCAAT CTGTCTACTT CGGCCTTACA AAGTGGGTGC TGATTTCTCT GCAGCTTATG 2400
GACACACCAT AAGCTGGGGG CACCCATGGA AGTGCTTTAG CTTGTAATCT CCATCAACAT 2460
CTCCCACAAG ACACCTCCCC AAACTTGATC TGGTTTGGGG AGTCACTGCT GTCTGGAGGA 2520
AAACATCTCT AATTTAGCCC TCGAGATTAC ACATATTAAG TTCAACTAAG TACGAACTCA 2580
AGGTATATTA AATACAATTT CCAAACACAC CAGCCATCAT GAGTGAGAAT CAGCAGAAAC 2640
TATGAATGAC AGACTTAGGC CATCTCAGGT TTTTGGAGTG ATCAGATACA GATTATTTTA 2700
TTAATTAATT AATTAATTAA TTATTTTTGA GATGGAGTCT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG 2760
CAGTGGCATG ATCTTGGCTC ACTGAAACCT CTGCGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCAAGT 2820
AGCTGGGATT ACAGGCGTGC AACACCATGC CCGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTTGAGAT 2880
GGGGTTTTGC CATGTTAGCC AGGCTGGTCT CGAACCCCTG ACCTCAGATG ATCCACCTGC 2940
CTTGGCCTTC CAAAGTGCTG GGGTTGCAGG CATGAGCCAT CCCGCCTGGC CAGATACAGA 3000
TTATTAAGCA TAGAGTTGTA AGGCAAGCGT TCTGGGTCTT TCTCTTTCTC TGTCTCTCTC 3060
TCTTTCTTTT TTTCTCTCTT TTTCTTTCTT TCTTCTTTTG AGACGGAGTC TTGTTCTGTT 3120
GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG CCACGATTCA GGCTCACTGC AACCTTCACC TCCTGGGTTC 3180
AAGTGATTCT CCCACCTCAG CCTCTCGAGT AGCTGGGATT ACAGGCACCC ACCACCACCC 3240
CCAGCTAATT TTTGTATTTT TAGTAGAAAC AGTGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT 3300
CAAACTCCTG ACCTCAAGTG ATCCACCCAC CTCAGCCTCC TAAAGTGCTT GGGATTACAG 3360
GCGTGAGCCA CTGCGCCCCG CCCTGGGTGT CTGTTTCGAT CTTGCTGCTC CTCTGAGCCT 3420
CCTATACAAA GATTCTGGCG CTACTGCACG CCCTGTGTTT GTGTCCTCTA TGTTAAAGTT 3480
CTTTTTCCTG GCTAATGTGG TCCAGACATG TTGGAAGGGA TTCTAAAGTA ACAATCCTGT 3540
GACCACGTGA CTGTGAGAAG AATTCTTTTC TAAAGAAAAG GATCTTCATC ACATACCGAC 3600
CCATCTCTTT CACTACCTTT AATACCACCT CAGATATCTC TCTTTTCATT TCCTGCAGCC 3660
CTTATTGCTT CCGTGGTGTT AGGCCCCTTG GCATTTTGTC ATATTTGTTT TTTTCCATTT 3720
TGTAGCTGAC TGTCTCACCA GTCACTCCTG TCTGGAGGAA AACATTCCCA GTTTAGCCCT 3780
TGAGATTACA CTTATTAAGT TCAACAAAGC ACAGCCTCAT GATACATAAT TTCCAAACAC 3840
ACAAGGAAGC CAGCCATGAT GAATGAGAAA CTATGAACAA CAGACTTAGG CCTCTTTAGG 3900
ATTTTGGAGA AATCAGATAC AGATTATTAA ATAACTACTC ATGGATTTTT TTTTGGGTGG 3960
GGCGGTGCTG CTTTTTGATT TCTTTCTTTT TTTTTTTTTT TGAGATGGAG TCTTGCTCTG 4020
TTGCCCAGGC TGGAGTGCAA TGGTGTGATC TCAGCTCACT GCAACTTCCA CCTCCTGGAT 4080
TCAAGCGATT CTCCTGTCTC AGCCTTCTGA GTAGCTGGGA TTACAGATGC CCACCACCAT 4140
GCCTGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ACAGGGTTTT AACATGTTGG CCAGGCTGGT 4200
CTCAAACTCC TGACCTCAAG TGATCCATGA GCCTCAGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACT 4260
GGCATGAGCC ACTGTGCCCG GCCTTGATTT TTTTTTTTTT 4300