EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS092-00070 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HFF 
Coordinate
chr1:2201380-2207010 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4648819chr12204790hg19
rs12045693chr12205581hg19
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GLI2MA0734.2chr1:2205823-2205838CGACCACCCATGACG+6.66
Klf1MA0493.1chr1:2206850-2206861TGGGTGTGGCC-6.62
MYBMA0100.3chr1:2206125-2206135GACAGTTGGT-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:2203545-2203560CGGGTCAAAAGGTCA+7.44
RARAMA0729.1chr1:2202086-2202104AAGGTGAAAAGTTCAGGC+6.61
RARAMA0729.1chr1:2203545-2203563CGGGTCAAAAGGTCACTG+6.66
RREB1MA0073.1chr1:2205304-2205324CTTGGGTGGTTGTGGTGGGG-6.16
TFAP2CMA0524.2chr1:2202307-2202319TGCCCCAGGGCA-6.44
TFAP2CMA0524.2chr1:2202307-2202319TGCCCCAGGGCA+7.22
ZEB1MA0103.3chr1:2201651-2201662GGGCAGGTGGG-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:2202164-2202185CCCTCCCGCTTCCCTTCCTCT-6.28
ZNF263MA0528.1chr1:2204648-2204669TCTCCCGGCCCCTCCTCCTTC-7.27
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11303chr1:2205480-2208750CD20
SE_17322chr1:2201358-2202641CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17322chr1:2202905-2205200CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17322chr1:2205669-2208727CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18345chr1:2201742-2202650CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19191chr1:2201651-2202804CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19191chr1:2205658-2207017CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_31962chr1:2201550-2203069Gastric
SE_31962chr1:2205985-2208669Gastric
SE_41586chr1:2201365-2203621LNCaP
SE_41586chr1:2204609-2205679LNCaP
SE_41586chr1:2205875-2206796LNCaP
SE_46124chr1:2201321-2202610Osteoblasts
SE_46124chr1:2205845-2207065Osteoblasts
SE_68719chr1:2201457-2203804H9
SE_68719chr1:2204755-2208710H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr122025372203842
chr122015842202424
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I002270chr122014392203406
GH01I002272chr122034392204040
GH01I002273chr122042972211950
Enhancer Sequence
TGGGTCTGGC GGGTCTCGTG GTGCCTGTGG CTGGCGTGGG TCTGGCGGGT CTGGTGGTGC 60
CTGTGGCTGG CGTGGGTCTG GCGGGTCTGG CATGTTTGGT GGTGCCTGCC ATCAGGCTGC 120
CGATGGATGA GCCTGCCTGT CCCCCACGGA TTGGAGTTTT GCCCAGGGGT GCTGTGCCCT 180
GGTCATTGTC CCCTACAGCC AGGCAGTAAA GTGTGGCCAG CACCTTGCTG CAAGAGAGGG 240
ACAGAGGTCA TCTGTCTACG AGCTAGAGCA AGGGCAGGTG GGCCCACTGG CTGGCGCTGC 300
GTCTGGGTTC GGTCCTGGAC CTGCTGCGTG TTATCCTCCC TGCGGGCCTG GCATGGGAGT 360
AGGGGCTGAG AGATGCTGGT GACACCACTC TGACGCCACG GCCTGAGGCA GCCGTTGGAC 420
AGTGCCCATC TTGAATGCAG CCCTGGTGAC CTGAAGCCCC TGCGTTGGTC CCTCACAGGC 480
CAGGGGGTGT GGCCACAGGG CCTGGGCTTT GTCCCGTTTA CGAGAGGTCA GGCGGTCACA 540
GGGTAATGGG AGGCCTGTGG TTCCTGGGCT GCCATCTGGC GATTGTAAAA CGGGCAGTGT 600
GCAGTGTTGA GGGGGCGCTG GGGAAACAAG CTGCCGGCTG AGGAGGCCGC ACTCCCCGTG 660
CCTCCCGGGC AGACACCTCA CGGCCTTTCT CTGGGTGTCT GAACCCAAGG TGAAAAGTTC 720
AGGCTGTCCC TGCTCTCCAG AGGGGCTGGA GGTGGGGCGG GAGCAGAGAC TGGACCTGGC 780
CAGCCCCTCC CGCTTCCCTT CCTCTGGGCC CCTGGACTCT GGGGGCGAGG GCAGGGCTGT 840
TTGGCTGTTG GACATCCTTG CTGTCCCTTT GCTGGACTCT CCAGAGGACC AGCATGGAGG 900
TGCACAAGTT CACATTTGTC CCTCTCCTGC CCCAGGGCAC CTGGCCCTGT CCCGGGCCAC 960
CCCAGGCTGG ACCAGCTGCC CATGTCACCA GGCCAGGCGC TTTCCCTGTG AATGAGCCGA 1020
TGGCCGCAAG TGCCTGGCCT CAGGCCTGGG CTGTGGGGAT GACTGAGGCC CAGTGAGGAG 1080
TGGGCTGGGG CCTGGTGTGA CCTGCACGGT CTGTGGGGGT TGGAGGGATG CGCGACTTGG 1140
GCCCACCCCA GAACTTGGGG TTTCCTGATG GGTGTTGGGG TGCACACAAG CCTGGGCTCC 1200
TTTGTGATTG GCGACCCCAG GGTCCCGGGA CAGTCCCTGA GAAGCACAGA GGCCTGGACA 1260
CTCCCACCTC CCAGTCAGGC CCTGCCACAT CCTCCCTGAT GGCTCCAGGG GCTTTTGTTC 1320
ACTGAAGAAC ACTTGCTGTC CTCCCCTCAG AAGAGTCTGC TCGGTGGGGG AGCCGCAGGG 1380
GGCTGCTCCC TGTCCAGGCC AGAGAAACCA GGCAGCCTCT CCCGCCGGGA GAGGTCCCCC 1440
ACAGGAGCCT GTTATGGAGC CGCGTGGCGC CTGGGCTGGT GTCACCCCTG GGAGCCCCCT 1500
TTTAAAGAAG ACTCATTCAA TGTCCCTCTC TCAGACGGCC TCCAGCGTGG CGATTAAGCG 1560
CTCAGATGCT GGCAGGTTCC GCGGAGTGCC CGGCTGCCCT CGGCAGGGGC TTTGTGTTGG 1620
CTGCCCTGCC CCGGGCTGAC CCCAGACGCT CGCCTTTTGT GCTACGCTGC TCTCGCCCCT 1680
CGGGAACCTT TGTCCCATTG AGCCCCGCCA TTGCCTGGGG CCCCTTGCCT GTCCCTGCGG 1740
GCCCGCCCCA GGGCGGGGAT TGTGGCCCTG GTCCCCTGGG GGGGGGTAGG GGGCTTTTGG 1800
TGGCCTAAGG GGACCCTCTG AGCACTCATG CAGGCCTCCC CCCAACCTCA CGTCCAGGTC 1860
TGTTGCCGAG GGGCCAGGAG ATTCTGACAT TGTGCGATGG CCCCAGAGGT TGACATCCTG 1920
GGGAGGATTG GCTGGTGATG CTTCCAGAAA GTGGTTTTTG AAGATGCATC TGGTCCTGGC 1980
CCGTGGATGG CTGGCGGGAC TGGGAGAGAC ACTCCGGGCC ACTGGCTGCT TTCTCGCAGC 2040
TGTTCTCCTC TGGGAGGACT TGCCCCTGTG GGCAGGTGCA GGGGCACTGA GCGGAGGGGC 2100
TTGGGGGCCC CTGCCCGCCC CAGGCCACCT TGCTCTCTCT CCAGGCCTGC GTCCTGCAAA 2160
GAGGCCGGGT CAAAAGGTCA CTGCCCCGAT TTTTATTGCT GTCTCTTACG TTCTCACGAC 2220
CTCTTGCCCT CTGCACAGAT GGGCGGGGCT GGAGCTTCCA CGAGGGCCGG CCTTTCCGGG 2280
GATTAAAAAC CCACTGAAAG GTCTGAGCCT AGCTACCAAG CTTAAATGTC TTAGTAGCTT 2340
AAAAATGGTG TTAAAAATTA AGCAAAACAC ACATAGACTT CCAGGTTTAG CATAAATAGA 2400
AACCAGAGGT GTTGAGACCG TGCTGCCCCC TCAAACCAGC GCAGTGGAAA GAGGGGCAGA 2460
GCCCTCCACA GGAGCCCTCC GCTGGGGGGT TGGGGAGACG GCCCTGGCCC AGCGTCTGCA 2520
GCTCCCAGCG GCACTGAATG GCAGTGGCCG TCCCTGTGGT CTGGGGGCCT CCTTCCCCCA 2580
CAGGCTACAC AAGCCCTGGT CCTGCCAAGG CTCGGGGAAG CCCTTTGTGA CTTTAGAAAA 2640
ATAATAATGG AGGGTGAACT GGTTCCTATT TTTGCATTGT AATTGATTGC CAAGAACCCC 2700
TGAAATTAAA TACAACCATG TATTTTAAAT GGTGTCCTTA ATGTAGAATG TTTTTATCAA 2760
AACCAAAACT CCCTGTTGAG GCCTTAGTGT TCTGTCAATA GCGTGTTGGA GTCTGGTTCC 2820
CGTCTCCCCT GCCCCGGCCT ATGTGTGCTG ACCCTGGGAC CGGTGAGGCA GTTCTCACCA 2880
CGCCCCGAGC CTCCCCCTCC CACGCCCCGA GCCTCGCCCT CCCACGCCCC TCCTGCCCCC 2940
GAGGCTCGCT GGCGTCTGTG CTTCTTCCAG GCGGAGGGGG AGGTGGTAGG CACCTTGGGT 3000
CTTAAATCAG AGAAACTGTC CCAGCAGTAG TAAAAGTCAT CAGCTGGCCC CAAAGAGCCC 3060
CTGGAAACAC AGGCTGTACC CCGCCTCCAT GGAGACATTT GGTGCCACCT GCGTTCAGTG 3120
CAGATGCCAC ACGGCTCTTC CTGAGATGGC TTCCGAGGCC ATTTGGCCCT TCATCTCGGG 3180
AACAGACCAA GGGGGTGTTT TCGGCCGTCT GAGACCCACC TGGGGGTGTC TGGGCCTTGG 3240
CCATGCTGCC TTCTCCAAGC CCCATGCTTC TCCCGGCCCC TCCTCCTTCC CACTGGCGCC 3300
GGAGACCTTT GGTAGTGGGT GTGGAAAGAC AGCAGCTGTG GGGTCCCTGT CCTGGCCGGC 3360
CACTCCTCCT TCCCGCCAGT GCCGGAGACC CTCGGAAGTG TATGTGGAAG GACAGCAGCT 3420
GTGGGGTCCC TATCCTGGTC AGAGGGTGGC ATTCCTCCCA CAGTCCTGGG AGCCACAGGG 3480
CTGAGATGGG ACTTCTCAGC TTGGCATGGG GAGGGCAGGA CGGGGTGGCT GCCATGCCTC 3540
ATTCTGTCTG TGATGGAAAC GGGAGGGCCT GGCCCTGCCT CTGTTACTGA GCTTGAGCCA 3600
GGGACACCCG TGACCCTGCC TGGGGCGGTC CTCCCCAGCC TTGTGAGCCA GGGCAGAGGT 3660
GCAGGTTGGG TGGCTGACCT GGTGGGGGGT AAGAACATCC ACGGAGAAGT GTGACGAGTG 3720
TGCGACCAGA GTGTGGACCC AGCCAGGAGG CCTGACCGTG ACTGCAGCCT CCCCCAGCAT 3780
TGCACCAAAG TGTGCTCGTG CAGGACCTCG AAGATGCCCC GTGGGCAGCG TTCGGGCTGA 3840
GGCTGCAGGG GGCCTTGGGA GCACGGTGGC CCTCCTGTCT GTTCTGTGGA CCGGGTGCGG 3900
ATGGGCCGTG CAGGCAGACG TGCTCTTGGG TGGTTGTGGT GGGGATGCCT CTCCGCCCAC 3960
CACCCTCTCA CTCACTGCCC TGGCTGGAAG GTGACGGCAT CTCCCTGACC GGCAGCGCCA 4020
GGATGGCAGC CCCACAACAG TGTCCTGGTC GCCCCAGAGG CATGCTGAGC GCCCATGCGT 4080
GTGCGCAGGT CCTACGGGCC GTGTCCAGAC CCAGCCCCGG GGTCAGGTGA CACCTGTAGT 4140
TGGGTGAGCG CTCACACAGG CACCTCCAGG TAAGGGGGAT TGAGGAAGGT AGCGCTTTGT 4200
CAATGGCACT GGTTTTGCTC CGAGGCTGGA CTCCTTTTCC CTTTGAGGAG CTCTGCTCAT 4260
GTGCTTTGCC TGCTTTCCCA TGGCAGGCTT TTTATTGGTT AAATAAAGAC ACAAACTTTT 4320
CATCAGTCTT TGCAAATACT TGGTTCCGGC AAGTTCTTGG CCCTTCCCAG GCTTGGGGCT 4380
GCCGGCTCAC GGTTCTTCTC TCTGCATTTC AGCCAGGCCC CCATATGCTG GGTTTGCAGG 4440
TCACGACCAC CCATGACGGC TGTGCTGCGT GGGGTGCAGT TCCCCGTGGG CGCCGAGGGT 4500
GGTGTGGGGC TGCCTCTCGC TCGCTCCACC AGCCACCCGA GGGCCCGTGT CCTGGTCGTG 4560
GCCGCGTGTG CTCTGCTGTG TGGGTGGTCA GTCCTCCCCA GGGGCCACCT GGATGGTGTC 4620
CACTCCTGCC CCATGGCAGG AAGTCCCAGC GGCACCTGGC CACGTCCCTC TAACATGTTT 4680
CTGGAAGTGG GATTCTAGGC TGGAGCCTCA TAGCGGGCAG ATACTGCCCC CTGGCCATGA 4740
GCCATGACAG TTGGTTGATG GGACTTGAAG GGGCCTCTGG ACAGTGTGGC TGCAGCCCTG 4800
GACCCTAGGA GAATAGCAGC CGTGATGGGG GGCAGGGACC CCACTTTCTG GGTGGGAGTG 4860
AGGAGGGCCG GCTGCTGCCC CTTGCTGCAG TCATCTTCAG TCACTTTCCC GGCCGCCACG 4920
GCCCCCTCCT GGCTTCTTGC TCTCAGCAGA GGGGACAAGA CCCTTGTGAG GGTGGGCACA 4980
GGCACTCCAA TTGTTTGGGG CCTTCGCTGT CCCTTGCTGT CTGTGCTGGT CTTTCCAGGC 5040
ATCCCCAGGC CGTGTGTGTC AGCAGGTGGA GGCTGGGCAC CTCTCACCCA CCCAAGCTGA 5100
AGCGGCCTCA CAGGGGGTGG CACCAGGTGT TTCTCCAGCT GAACAAGCTC GCCCTGGAAC 5160
CCCCACCCTG AAAGGGCTAC TGCCCCCATG AGAGGAGCTT CTAGAGATGG TGGCCAGCCT 5220
TGGGGGCCCG GTGGAGATGT GTTCGCGGGG TCCTGGTCTG ATTCTGTCTT GGAAGGAACA 5280
TCGGGCCCCT GAGAGGTCAG AGCAGTGGCC GGCCCACGGC TCCGCTCAGG CGCCACGGCG 5340
GCTCCTTTCT GTTTCTTGTA GTCACTGAGT TCGAGGTTCC CACAGGGAGG AGGCTTCCTG 5400
TGGCTCCGCC GTCAGGGAGC AGTGGGGCTG CCCCAGCCTC TGGGGGCTTT TTAGGTGCTC 5460
TGAGGCGATC TGGGTGTGGC CTGGCCGGTG TGGGCAGCTT TGCCCTTCGT CTGAGACCCC 5520
GAGCCCTGGG GCAGGATGAG GGGTGTGGGG AGAGTTTGCT TTTTCCAGAG ACGTTTATCT 5580
GTTTTTTTTT TAGACGGAGT CTCGCTCTGT CGCCCAGGCT GGAGTGCAGT 5630