EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-40515 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr6:26173500-26176750 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs17598658chr626175866hg19
rs79267062chr626176010hg19
rs72834698chr626176517hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HLTFMA0109.1chr6:26175339-26175349ATATAAGGTT-6.02
NKX2-5MA0063.2chr6:26174677-26174687ACCACTTGAG+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr6:26173848-26173861GTTAAGTGTTTAT-6.08
Nr5a2MA0505.1chr6:26174189-26174204GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RELAMA0107.1chr6:26176219-26176229GGGAATTTCC+6.02
ZNF263MA0528.1chr6:26174484-26174505TTCTTCTTTCTCTCTTCCTTC-6.17
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_12258chr6:26170126-26174148CD3
SE_15406chr6:26170232-26174130CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16410chr6:26169818-26173905CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17748chr6:26169679-26175030CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_20332chr6:26169424-26174488CD56
SE_21497chr6:26170679-26173958CD8_Naive_7pool
SE_21986chr6:26169898-26174317CD8_Naive_8pool
SE_22908chr6:26169277-26174695CD8_primiary
SE_26174chr6:26170640-26174359Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27280chr6:26171109-26173883Esophagus
SE_28057chr6:26171011-26174124Fetal_Intestine
SE_29032chr6:26170881-26174023Fetal_Intestine_Large
SE_29729chr6:26170976-26174103Fetal_Muscle
SE_40402chr6:26171125-26174414K562
SE_42987chr6:26171339-26173866Lung
SE_50620chr6:26171127-26173936Sigmoid_Colon
SE_52776chr6:26171093-26173968Small_Intestine
SE_53423chr6:26171175-26174177Spleen
SE_61788chr6:26155157-26176422Toledo
SE_62340chr6:26155053-26176655Tonsil
SE_65079chr6:26171576-26174025NHEK
SE_66906chr6:26171236-26174194H2171
SE_67155chr6:26169999-26173929MM1S
SE_67973chr6:26087132-26287126TC32
SE_68399chr6:26087114-26175354TC71
SE_68400chr6:26087114-26175354TC71
SE_68401chr6:26087114-26175354TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr62617380026173857
chr62617556126176332
chr62617405826174124
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH06I026175chr62617524126176422
Enhancer Sequence
GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCGT GAGCCACAAC GCCTGGCCTA TGCCCACTAA 60
TTCCAATTCT TATTTGATCT AATTGTTTAT AGATTCTTGT GAACTTTTAC CTTGACAATT 120
ATGTTATTTT CAAAGATAAT CATCTTTTCC TATTGAATCC TTGCTCTTCT GACTGCCTGT 180
TCCTATCTCA TGGTATTGGC CAAACCCTGT GATGCCGTGT TGAATAGGAG TACTTTCTCA 240
CCACACTTGT CTTCCTTCCG CCTCTATGGG AATCCTTCCA AAACGGCACC ATTAAGTGTT 300
ATACTCGCTG TAGCTCCTCC TTATGAAGTT CTCTTCTCAT TGTAGTCTGT TAAGTGTTTA 360
TGATTAAAGA GTGTTATATT TTGTTAAATG CTTTCGCAGT ATCTTTGGAG ATGATCATGT 420
TTTTTCTTTA TTAATCTCTT TTTTATTTTA TTTATTTTAT TTTATTTTAT TTTATTTTTT 480
ATTATTTTAG TTTTTATTTT GAGATGGAAT CTCACTCTGT CTCCCAGGCT GGAGTGCAGT 540
GCCCTGATCT AAGCTCATTA CAACCTCTAC CTCCCAGGTT CAAGCGATTC TTCTGCCTCA 600
CTTTCCCAAG TAACAGGGAC TACAGGTGCG TGCCACCACA TCTGGCTAAG TTTTGTATTA 660
TCAGAAGAAG ATAGGCCGCC ATTGGCCAGG CTGGCCTTGA ACTCCTGACA TTAAGTGATC 720
CACCTGCCTC AGCCTCCTAA AGTGCTAGGA ATACAGGCGT GAGCCACTGC TCTGGGCCTT 780
CCTTTATTAA TTTCTTAAAC TGGCAGATTT AGAATACTAA ACTTCCTTCT ATTCTTAGAA 840
TAAACCCTAT ATAATCAGCT ATTTATTTAA ATAACATGGT CTCTGCAATT TCTCCTGGTT 900
TCCATTTTTT CTCATAATAG GCATTTTTTT CTAAAAAACA AAAATGAATG TTCATTAGTG 960
AGACAAAACT ATAATTTTGT TTTTTTCTTC TTTCTCTCTT CCTTCCTTTT TAAAATTTGT 1020
ATTCTCCAGT TTTGCTAATA ATGTTATACA ATTTTACAAG AAAAAAGTGA GTAGGAGAGC 1080
TGTTTTTCTA TAGTAACAGA TTCTGTGAAA TAGGTATCAT GCCAAGTGAG GTGGCACGTC 1140
CCTGTAGTCC CAGCTACTCA GGAGGTGAAG CAGAAGGACC ACTTGAGCCC AGGAATTGGA 1200
GACTGTAGTG TGCTGCCATC ATGCCTGTGT ATAGCTTCTG CGCTACAGCC TAGGCAACGT 1260
AGCGAGAACC ATCTCAGAAA AAAAAAAAAA AAAAAAGAGA TAATCTATTC CTCATAAATT 1320
CACTAAAACT TGGAATATCT GACCGGACTT GGCAGCATTT GGGTGGAAGG ACGTAGAAAA 1380
TATTTTTTAA CTGCCTACCT TATTTTCATA ATCATAATTT GTTTAGTCAG CTTGTCTATT 1440
TTCTTCTTTT TCTTGAAAAT TATTTTCCAC TGAGTTTAAT TTTTTGTAAA AGTTACACAG 1500
CATTCTCTTG TCATTCTTTA TATCTCCCTT TTTGTAGTTA TGTTCCTTAA TTTCTGTAAC 1560
TTTCTGAAAC CAGGGTTAAT TTGTTTTGAA ATTGTCCAAC GTGTGCTTTG AAAAAAAGAA 1620
GGGATGTTTT CTGTGTCAAA TGAAGGTAAT CATAGATCAA ATTTGCTTAT TGTCTTGTTC 1680
AAATCCTAGA AAACCATTAG CATTTTTCTT TGCTTGTAAT ATGAGAATCT AACACTCATA 1740
CAGAATATTG AAAGGTTACC CTACAATTGT AAATTTGAAA TTCTCCTTCT AATTCTGTCA 1800
GTTATTTATT GACATAGTAG TGGTTCTGTA GTCAAGTGCA TATAAGGTTT TGAATGTTAC 1860
ATCTTATTTT TGGATTTTTA TTTTATCATT ATGGAGTATA GCAAAGTTCT ATTTTGTTCT 1920
TTTTCAAATG TACTTGGTTT TGATTATCCC TTGGTCCTTG ATTGTTTTAT TATTCTATTT 1980
TTTATTTCAT TAAACTTTCA GTAAATAGTG ATTTTTATAG TCTGTATCTA ATCATTTCAA 2040
TATCTGAAAT CCTTTGTTTG CCTAGGGATC TAGGAGGAAA TAGAAGGCTC TTTGCTTATA 2100
AGCCAAACTC TCCATAGTGT CTGTTTTTCT TCGATTTTGT GACATTTGTT ATGAACTTAT 2160
ATTTAAACAT CCTAAGTTCC TGACAGAGTG TCTGGCATAT AATAGGTGTT CAGTAAATGA 2220
TTGCTCCATA AATAGATAAT GTGTGTAGAT GTAGAGAACT TGGGTTCAAG ATACTTTCTT 2280
CCTGTAGGGA TTTGTTTTGT CTTCATCAGG CACAAGGGGG CACTATAAGC CCGAGTCAGT 2340
TTAATTTCAG GCCTTCTTCA CTGGAACTCA AGACTTCATT TATACTTAGG GTTAAATCTT 2400
TGGGGCCAAT TTTCTCCATC CACCTCCTCA GAGTCAGAGT CCTGTAGAGA CAAACAAGGT 2460
TTTATCCCAG AGATGTTTAC GAGTTTTTTT CTTCTTTTTT CCTTTTTTTT CTCCAGTCTA 2520
CCCCTTTTTC AAACCATTCT GGCTTTATGC TATGTCTTCA CTTTTGTTTA AGAGCCTAGA 2580
ATTCTATTCC CCAGGGGGCA GACTTTTAAT TCCCAGAGCT CATAATCCTG ATTAATGGTA 2640
TTTGCCCCCA GAGAACCAAA GATGTCCTAT TTGTCACCCT AGTTTCAGCT TCTAAATTTT 2700
ATTGTTCTGG ATGGTTTCTG GGAATTTCCC TTGTGGGTTT TTTTTTTTTG CTTTTTTTTT 2760
CTTTGGGATG TGTGTGTGTT TGAGACAAGA GTCTTGAGCT GTCGCCCAAG CTGGACTGCA 2820
GTGGCATGAT CTCGGCTCAC TGCAACCTCC ACTTCCCAGG TTCAAGCGAT TCTCCTGCCT 2880
CAGCCTCCTG AGTAGCTTGG ATTACAGGCG CGCACCACCA TGCTCAGCTA ATTTTTGTAT 2940
TTTTAGTAGA GATGGGGTTT CACCATGTTG GCCAAGCTGG TCTCCAACTC CTGACCTTGA 3000
GTGATTCACC CGCCTTGACT TCCCAAAGTT CTGGGATTAC AGGCATGAGC CACCGAGCCT 3060
GGCCCCTTGT GTTTTTTTGT TAATTGAGTA ACTAAGTACT AGTTTGTTGG TTGTAGTTTC 3120
TCTAGTTCAT AGGTGTATTG CTTCAATAGA GTTTTCCAGA ATATCTTCTT TTCCACATTG 3180
CAGATAAGAG TCCTTACAGT GTCCCTCTCT ATCCCTATGA ACACCTTTGC TTTAATATTT 3240
TCTCTGATAT 3250