Tag | Content |
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EnhancerAtlas ID | HS091-40404 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | HepG2 |
Coordinate | chr6:20678080-20686730 |
SNPs | Number: 5 | ID | Chromosome | Position | Genome Version |
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TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
Arid3b | MA0601.1 | chr6:20686264-20686275 | ATATTAATTAT | + | 6.02 | BCL6B | MA0731.1 | chr6:20682956-20682973 | TGAATTCCTTTAAAGCA | - | 6.75 | IRF1 | MA0050.2 | chr6:20681283-20681304 | ACCCAGTTTCAGTTTCATCTG | + | 6.35 | IRF1 | MA0050.2 | chr6:20680267-20680288 | CATCACTTTCTCTTTGACTTT | + | 6.41 | IRF1 | MA0050.2 | chr6:20683172-20683193 | TTTTTCTTTCTTTTTTTTTTT | + | 6.59 | IRF1 | MA0050.2 | chr6:20683166-20683187 | CTTTTCTTTTTCTTTCTTTTT | + | 6.5 | IRF8 | MA0652.1 | chr6:20681287-20681301 | AGTTTCAGTTTCAT | - | 6.74 | IRF9 | MA0653.1 | chr6:20681287-20681302 | AGTTTCAGTTTCATC | - | 6.04 | POU2F2 | MA0507.1 | chr6:20684972-20684985 | TTAATTTGCATTT | + | 6.25 | RORA(var.2) | MA0072.1 | chr6:20679604-20679618 | TTGACCTACTTTTT | - | 7.34 | SOX10 | MA0442.2 | chr6:20680042-20680053 | TTCTTTGTTTT | - | 6.62 |
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| Number of super-enhancer constituents: 2 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_33433 | chr6:20685570-20693207 | H2171 | SE_66880 | chr6:20685570-20693207 | H2171 |
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| Number: 2 | ID | Chromosome | Start | End |
GH06I020680 | chr6 | 20680857 | 20681431 | GH06I020685 | chr6 | 20685571 | 20693207 |
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Enhancer Sequence | GAAATCTTCT AATTTAGGTT TTTATTTCTC CTTTCACCCA AAAGCTGCTT AAATTTTTTT 60 ATTTCTAATT TTATTGCAAT GTGATCAGAG TTATTTTTAA TTTTTCTGCT TTAAAGAGCT 120 TCCTGATGTC CTTTATTTGT GATTTATCAT TTTGTGAATG TTCAATGGGT GCTTGAAAAG 180 AAGGTGTATT CTCTTCTCTG TTATTAGGTA GTAACACTGA ATCTAGATTA AGATCTGTGT 240 TGTTTTTTTT TTTTGACTCT ATTTAAGTCT TTGTACTATC ATTGCTTGAG TCTTGTATGG 300 AGAATGTATA GGTCTGTTAT TGTGAATGCA TTTCTTCTTG CAGCCTCAGG TTGGTTTTAT 360 GTTATTTGGT GCATAGGTAT CTATAGATGT TCTAATTTTA TTGTCAGTTG TGTCTCTAAA 420 GTGTTCTTCT TGGGCTGGGC ATGGAAAAAA CAAAAGTGCT TTTCTTTTCA TATTTATTCA 480 ATTTTGGCTT GGATTATTCT TTGTATGTTA CTCCTTTGTC TCTTTTTAAT TTTAGTCATT 540 CTGAATTATT TAGCTTTAGG CATGTTTCTG GTATGTGGAA TAGAATTGGG TGTTGCTTTG 600 TGAACCACAT TTAAAATCTT TTTCTTTTAA TAGGTGAGTT AAGCTTCTTT ACAGTCAGTA 660 AGGCTTCACT TAATGTCCTG GATAGATTCT TGGAAACACA GTTTTAAGTG AAATGAATTA 720 CTATATGTTG TAGGAACTTA ACTCTTGCTC ATATCAATTA ACCTATGGTA AATTGTTTCT 780 TTATACTACA GTTGTTTCGC TTAAACTTGT GGTTTCCAAG AACCTATTGA TGGCATTAAG 840 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TCCCCAGACC TCTCTTGGTT GCATGAAGCT CATCCTGTTT TATTTAGATT CTTCAAGAGG 1740 GGATTATGGA TTCTTGTGTG TTAAAAACTT TTTATATAGC CTTGAAACTT GAAGGATACC 1800 TTGGTTGTTT TTAAAATTCA TTATTCATAC TTTTATTGAA TTTCTAAAAA ATGCTTTTCC 1860 ATTGTTGCAT TATATTTTGT TTTAGACAAC TCTGATGCCA GTTGAATTTA TTTGCCTTCG 1920 TTCATTATTT TATCTTTTAT GCCTAGTAGC CTTGGACACT TTTTCTTTGT TTTTGAAGCC 1980 TAAGGGTTTA TTAGGATGTG TCTTGGAGTT GACTGTTCCA AGTAAATTCT CCCAGGTACT 2040 GGTTGACCCT TTTAATATGC AGATTCAAGT TTTCTTGAAT TACAATCTTA AATATTGTTT 2100 CTATTTATTT TTATTTCTTT TTTAAAATTT TTTTGCTGGG ACTCTAGTTT TATCAACGTT 2160 ATTTTTTTCT TTTTTGCTTT CTGATTCCAT CACTTTCTCT TTGACTTTTA ATTTTTTTTA 2220 ATTTTTATTT TTTTCTGAGA CAAGCTCTTG CTCTGTTGCC CAGGTTGAAG TGTAGTGGCG 2280 TAATCTTGGT TTACTACAGC CTCCACCTCC CAGGTCAAGT GTTTCTTGTG CCTCAGCCTC 2340 CTGAATAGCT AGGATTACAG GTGCCCACCA CCATGCCTGG CTAATTTTTG TGTTTTTAGT 2400 AGAGACGGGG TTTTGCCATG TTGGCCAGGC TGGTCTCGAA CTCCTGGCCT CAAGTGATCT 2460 GCATGCTTCA GCCTCCCAAA GTCCTGGGAT TCCAGGCGTG AGCCACCACA CCCGGTCTAA 2520 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