EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-35125 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr3:129542200-129544810 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:129543966-129543985GGGCACCACCTGGTGGTCA-6.97
Foxd3MA0041.1chr3:129542470-129542482AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:129542474-129542486AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:129542478-129542490AAACAAACAAAC-6.32
NFAT5MA0606.1chr3:129543683-129543693AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr3:129543683-129543693AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr3:129543683-129543693AATGGAAAAT-6.02
PHOX2AMA0713.1chr3:129543886-129543897TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr3:129543886-129543897TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:129543886-129543897TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:129543886-129543897TAATTAAATTA-6.62
RREB1MA0073.1chr3:129544374-129544394TGGGGGTGGGTGGTAGGGGG-7.69
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr3129542565129542922
chr3129543558129543741
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH03I129823chr3129542344129542397
GH03I129824chr3129543558129543741
GH03I129825chr3129543881129543990
Enhancer Sequence
TATTTAAAAT TTTGTTTAGG AACATATTCC CAAAGTTGAT ATATATACAA AGTGAGAGAC 60
ACCTATTAAC GCATAATGTA TATTAATTGT GACCCTGAAG TACAAAAGTT CAAAAATAAA 120
ATCTAGCCTG CTCACATTGA CCAACAGGAT CATAGGCTAT GATAACATCA AAATAAGTCA 180
ATTTTTAACA AACACCGACT TAGTTCAACA TTGGGCTAAC TTGCCAAAGT TGTCTTTCTT 240
GAGAAAAAAT GCTGTACTGA GATCCCTGAA AAACAAACAA ACAAACAAAC AAAAAAACAG 300
TCTGCAATAG TAATTACCTT ACACAAAACA CAATCTTGGC CTATCCCTCC GTCTATCTAT 360
CTATGACTCT TTGGAAGCAA GACCTTATAT TAGCGTTCTG GATAAACCAA AGAGTAGTGG 420
ACTTTGGATA CTAAAATTCT CCTCCTCTAC TCCTAAGATT CAAAGCTATT GATAAAGTAC 480
CCAAATCTCT GATGAATAAA AGAGAAAAGC AGAAATTAGG TCACATACTA TATATGTTTA 540
GGAGTCTGAT TACCCTAAAG CCTGGACCAT TTTGTTGTAT AAAGGAAAAA GAGGTTAAAG 600
AGTGAACTCT ACTTTCCATT ACGTTGAGCC TTCATCATAA AAGGCTCTGA ACAGAAAGAA 660
AGTAACTCAG ACTTAAAAAA CAAACAAATG AACTTTGGCT GGGCGCGGTG GCTCATGCCT 720
GTAATCCCAG CACTTTGAGA GGCTGAGGCA GGTGGATCAC TTGAGGTCAG GAGTTTGAGA 780
CCAGCGTGGC CAAAATGGTA AAACCCTGTC TCTACTAAAA ATACAAAAAT TAGCTGGGTA 840
TGGTGGTGTG TGCCTGTAAT CCCAGCTATT CTGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATTGCTTGAA 900
ACTGGGAGGT GGAGGTTGCA GTGAGCAGAG ATCATGCCGC TGCACTCCAG CCTGGGTGAC 960
AGAGCGTGAC TCTGTGTCAA AAAAAACCAA CCAACCAAAC AAACAGAAAC AAACTTTAAG 1020
AAGCATCCCT ATGATATTAC ACTTTGCATA ACAAATTTAC CAAGGTTAGG AACAGTTAGC 1080
TTATCTGTAC CTTCACTTCT ACTCTTACAA GAACTATATT TGATGCCCAC ATGAGATCAT 1140
TAAGGATAAT CAAAATATCT TTGGGGCCAA TGAATACATA TTTATATTAA AGGAAACTCA 1200
GTATTGGGGG AAAGGACATA GCCATAAACA TTCTGGCTTT CAGAGGTAGG GTCAATAAAC 1260
CTGTAAGTTA CTTGCTTTGG CAATCAAGTT TTGCTACGTA AAGTATCTTT AAGGGAGAAC 1320
AATGAGAAAG CCAAAATACA TCTTCATTTC TAACTTATGC CCACTGTTCC AGTTCCGTAT 1380
TATTAAAGGC CTATAAGACA TTCTCTTCAT AGTAGGTGTC AGCCACCCAA CTGAAACTAA 1440
ATGGTTTTCC TTAAAAAATA CAATTTTTCA ACTGTTTAGT GGAAATGGAA AATATTTTCT 1500
GATTCTCCCA AGCAAACTTC AGATTTTAAA ATTTTTTATT CTAACATTGT TATCAAATCC 1560
TACCTGTTCT TCTATTGTCC ATTCCACTTC CACAGTTATC AATTCAGCTC AATATTTATA 1620
AGAGCACTAT CACTATTTAA TAGTCACTGT GCTCAAGCTA GCCCACATCC TAATGACTTC 1680
CTGTACTAAT TAAATTATCA CCCCGGGGTT AATCAATGTC CTGTCAGGCA TCCATCCCCT 1740
CACTTCCACC TACCAATCCT CACCTAGGGC ACCACCTGGT GGTCAACAAA ATGAATTATC 1800
CTTTTCCCCG CTTCATTTCT TCCCCACTGG GAGAACAGTA CACCTGCATT ACTAGTTTTG 1860
CTTACAGTTC AACTAATTCA AACTTAGAAA TCTTTTTATT TGAACACATA CATCTCCCTC 1920
AAACTTCTTC CACTTTTCTC TATCTTCCAG GTACAGCCAG GCATTACAAA AATTTCCCTT 1980
TCCTTCTGCC TATAAGTAAT CCAAAAAGCT TCCCTCATTG CAGCCTAATA TACACTGCTT 2040
TTCCTAAATC TGGCTATAAA TAAGAAGATG ATATAGTGAG CTCTGAAGTG ATATTAACCT 2100
TAATAGAGAA CCTGAATCCA TAACTTCCAA ACTTTCCCTT TAGAAGCTCC GAAGTTTACA 2160
TCTATCTTTT TTGGTGGGGG TGGGTGGTAG GGGGTTGAGA CAGGGTCTTG CTTTGTTGCC 2220
CAGCCTGGAG TGCAGCAATA AAAAGGAACA AACTATCAAC ACATTCAACA ACAGTTGAAT 2280
CAACAACAGT TGAAAAGTAT TACACTAAAT GAAAGAAGTC AAACACAAAA GACTGCATGA 2340
TCTAATTTTT TAGGAAATTC TAGAAAAGGC AAAACTATAG CAATAGAAAG CAGATCAGCG 2400
GCTACCAGAG GCCACCGGTT GGGTAAGAGG GACTGACTGC AGCCAAGGGG CATGAGAAAT 2460
CATTATTTGG GGGTAATGGG AATGTTCTAT ATAATGACTG TGTTACTATA AAACTACACA 2520
TTTTTCAAAA CTAGTCAAGA TGTACACTTA AAACTGGTGG ATTTTACTGT AAGCATATGC 2580
TAATAAAGTT GACAAAGCAT TAAAGAAACA 2610