Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS091-32309 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | HepG2 |
Coordinate | chr21:45393950-45395850 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
Foxd3 | MA0041.1 | chr21:45395612-45395624 | GTTTGTTTGTTT | + | 6.32 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45394468-45394488 | GGGTGGTGTGTGTGTGGTGT | - | 6.11 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45394472-45394492 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45395031-45395051 | GGTGTGCTGGTGTGTGGTGG | - | 6.39 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45394363-45394383 | TGGGTGGGTTTGGTGTGTGG | - | 6.82 | SREBF1 | MA0595.1 | chr21:45394184-45394194 | GTGGGGTGAT | - | 6.02 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 4 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_03672 | chr21:45394858-45395433 | Brain_Angular_Gyrus | SE_05128 | chr21:45394247-45395919 | Brain_Cingulate_Gyrus | SE_06203 | chr21:45394331-45396046 | Brain_Hippocampus_Middle | SE_08184 | chr21:45394249-45395943 | Brain_Inferior_Temporal_Lobe |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 2 | Chromosome | Start | End |
chr21 | 45394155 | 45394780 | chr21 | 45395400 | 45395517 |
|
| Number: 2 | ID | Chromosome | Start | End |
GH21I043975 | chr21 | 45394155 | 45394780 | GH21I043974 | chr21 | 45394869 | 45395850 |
|
Enhancer Sequence | TGTGTTCATG TGGGATGTGT ATGTGTGGTG TGTATTATGT ATGTAGTATA TGTGATGTGT 60 GCATGTGTGG TGTACGTATG TGCATTGTGT GTAAATTATG TGTGTGTTGT ATATGGGTGT 120 GGTATTTGCA GTATAGTGTG CATATAAATT ATCTATGTGT GTATAAATTA TATGTGTGTA 180 TAAATTATAT GTGTGTGGTA TGTGTGTAAA AATTTGTATA AATTATATAT TCGTGTGGGG 240 TGATGTATGT GGTGTGTGTA TAGTGTGGCG TGTGTATAAA TTACATATGT GTATGGTGTG 300 TGTGATGTGT GTGTGGTGTG TGAGGTATGG TGTGTGTAAA TTATATTTGT GGTGTGTGTT 360 GAACTGTGTG TGGTATGTGT GTATAAATTA TAAATGTGCA TGTGTGTGCA AAATGGGTGG 420 GTTTGGTGTG TGGGGTATGT GTGGTATAGT GTGTCATGTG GTGTGTGTGT AAATTATATG 480 TGTGTGGTGT GTGTGTAGTG TGTGTATATA AATCGTGAGG GTGGTGTGTG TGTGGTGTGT 540 GTGTATAAAT TATGTGTTTG ATATGTGTGG TGTGGTGTGT ATAAATTATA AATGTGTGTG 600 TGGTGTGTGT ATATGAATCA GGGTTGGTGT GTGTGGTGTG TATAAATTGT ATGTGTTTGA 660 TGTGTGTGGT GTGTACGACA TGGGGCTGTG TGTGTCAGGG ACCACAGCCA GCCAGTGTGG 720 GCCTCTGGGC AGGCCCCTCC CCTCACTGTA GACAAAGAAG CCTCTGCGCC TCGGTTGTTC 780 CTCACATGGC GTCTGTGGCA AATCCTCCCC ATGCCAGTTG AACCTGGGGC CAATGTGAAG 840 CTGCTTTTAT TTACTGGGAC GTGATGTTGT CTTCATAGCC ATCTGCTCAC CAGCATGCGG 900 CAGAGGCTTG TGAACACTGC ATGTGTGCTG GTGTGTGCTG TGTGCTGTTG TGTACTGGCG 960 TTTGCTGATG TGTGTGTTGT GCACTCGCAT GTGATGTGTA TGTGCTGGCA TGTTGCATGT 1020 GCTGGCATGT GCCAGTGTGT GCACTGGTGT GTAGTGTGTG CTGGCATGTG GTATGTGTCG 1080 AGGTGTGCTG GTGTGTGGTG GGTGCTGGTG TATGGCATGT GCTAACGTGT GGTGTGTTCT 1140 GGTGTGTGCT GGTGTGTGGT AATGTTTTGG TGTGTGCTGG TGTGTGGTGT GTTCTGGTGT 1200 GTGCTGGCGT GTGGTATGTT TTGGTGTGTG CTGGCATGTA GTGTGCTGGC GTGTGCTGGC 1260 GTGTGGTATG TTCTGGTGTG TGCTGGCATG TGTGTGGCAT GTGCTGGCAT GTGTCGGTGT 1320 GTGCACTGGT GTGTGGTGGG TGCTGGTGTA TGACGCATGC TGGCGTGTGC TTGTGTTGCA 1380 ACGAGACTCA GCTTTCACTT CTGATGGGGT GAGGATCCAT AGGTGGAATC CTCATACACC 1440 AAAGCTTTGG GTTCCTCAGT TCCTAGACAG AAGTGTGAGG CGCGTGACCC TAGAGCGTGG 1500 AGACCTGCCT GGCTGTGGAA ACCTCACCCA TGGGCCCCGC AGCTCAAGCC TGGTCTTTCC 1560 TGCTCTGAGG TGCGTCGTCG CCCCCTCCTG GGCGCTGGGA GCACTGCGGT TGCCCGTGGA 1620 CAGCAGGTTC CTACCTGTGT ATCTTAATTT TGGGTTTTTT TTGTTTGTTT GTTTTCGTTT 1680 TTGTTTTTGG CTTACAACGC AGCGATTTGC TTCTCCCTCA TAAAGGTCCA CGATGAGCCC 1740 AGACAGTGCT CGGGGCAGCC CAGCTGTCCC CACCTGGTGG CACGGGGCCG CCCTTCCTTA 1800 GCAAAGTGAT TCTCTGACGG CCGTCGCAGG GAAGAGGCAG CATTGAGCAC CCGCTGTTAA 1860 GATGCTCCCT TACGGAAGCG ACTTGTGGGA GGCAGGGATG 1900
|