| Tag | Content |
|---|
EnhancerAtlas ID | HS091-29626 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | HepG2 |
Coordinate | chr2:242806060-242806880 |
Target genes | | Number: 22 | Name | Ensembl ID |
|
TF binding sites/motifs | | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
| RREB1 | MA0073.1 | chr2:242806805-242806825 | GTGGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.01 | | RREB1 | MA0073.1 | chr2:242806714-242806734 | GTTGTGTGTGTGGTTTGTGT | - | 6.04 | | STAT3 | MA0144.2 | chr2:242806125-242806136 | TTTCCCAGAAG | - | 6.62 |
|
| | Number of super-enhancer constituents: 5 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
| SE_16813 | chr2:242804774-242807365 | CD4_Naive_Primary_8pool | | SE_19848 | chr2:242804803-242806846 | CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17 | | SE_31321 | chr2:242805150-242806976 | Fetal_Thymus | | SE_63045 | chr2:242784661-242825831 | Tonsil | | SE_68198 | chr2:242742569-242806446 | TC32 |
|
Enhancer Sequence | GGAACAGGAA ATGGTTAATA GTGTTTGCAA ATAAAAACTC TCTGTTCTAT CCTGTTTTCG 60
AAACATTTCC CAGAAGTTAA AAAATAACAC CCAATTTATC TGCCCAATTT AAGAATAAAC 120
TTTTTAAAAA TTGAATGAGA TATTTCCACA ATTTATTATA CACACAAAAA AATCGTTGGG 180
CTGTTTGTTA AGGGGGGGTG GCAGGTGATT TCTAGCCACC CCCCCCGCTG TTTTCTAAAC 240
TTTCTAGAAT GTGGTTAGTA GTTTAGATGT CAATTTATGT TCTAAATCTC CCAGTGTGTA 300
CATGTATATG TGTGTGTGTA GGTGTGTGTG TTTATGTGTA CTGTATGTGG TATGTGTATT 360
GTGTGTGTTG GTGTGTATCT CTGTTCATGT ATATTGTGTG TTGTATGTAG TATGTGTTAT 420
GTGTGTTGTG TGTAGTGTAC GTGGTGTTTG GTGTGTGTAG TGTGTGTGGT GTGTGTGTAG 480
TGTGTGTGGT TGTAGTGTGT GTTGTGTGTG TAGCATGTGT GCTGTGTGTA CTGTGTGTGT 540
TTGTGTGTGA TATGTGTGTG CTGTGTGTGG TGTGTGGTGT GTGTGTAGTG TATGTGGTGT 600
ATGTTGTGTG TGAGCTGTGT GTGATGTGTG TAGAGTGTGG TGTGTGTGTA GTGTGTTGTG 660
TGTGTGGTTT GTGTGATGTG TTGTGTGTAG TGTGTGTGGT ATGTGTGCTG TGTTGTGTGT 720
GAGCTGTGTG TGATGTGCAT AATGTGTGGT GTGTGTGGTG TGTGGTGTAG TGTGTGGTGT 780
GTGTGGTGTG TGTAGTGTGC ATTTGTGTGG TGTGTGTGGT 820
|
