EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-24220 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr19:44255700-44258800 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr19:44257542-44257554TTCTGTTTACTG-6.02
JUN(var.2)MA0489.1chr19:44257365-44257379GGAAAATGACTCAT+6.76
KLF16MA0741.1chr19:44258732-44258743GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr19:44258733-44258743GGGGCGGGGC-6.02
SP1MA0079.4chr19:44258731-44258746CGGGGGCGGGGCCTG-6.11
SP4MA0685.1chr19:44258729-44258746GGCGGGGGCGGGGCCTG-6.26
ZfxMA0146.2chr19:44258732-44258746GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02767chr19:44256100-44260167Astrocytes
SE_09619chr19:44255368-44262466CD14
SE_10575chr19:44256833-44260060CD19_Primary
SE_11483chr19:44255253-44262275CD20
SE_13735chr19:44255931-44257680CD34_Primary_RO01536
SE_13735chr19:44257681-44261073CD34_Primary_RO01536
SE_14657chr19:44256014-44261046CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18182chr19:44255605-44260321CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18680chr19:44255276-44260362CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19217chr19:44256242-44260273CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20985chr19:44256876-44261109CD8_Memory_7pool
SE_23510chr19:44257834-44261164Colon_Crypt_1
SE_23897chr19:44258182-44260089Colon_Crypt_2
SE_27247chr19:44256975-44262719Esophagus
SE_31804chr19:44257590-44260338Gastric
SE_32542chr19:44255365-44264271GM12878
SE_33868chr19:44256868-44261203HCC1954
SE_34298chr19:44255426-44256716HCT-116
SE_34298chr19:44256799-44272203HCT-116
SE_34813chr19:44256968-44262677HeLa
SE_36558chr19:44255760-44264581HMEC
SE_37675chr19:44254852-44262981HSMMtube
SE_39921chr19:44256960-44261248K562
SE_50403chr19:44256946-44260066Sigmoid_Colon
SE_53073chr19:44256976-44257621Small_Intestine
SE_53073chr19:44257665-44260035Small_Intestine
SE_53761chr19:44256508-44260208Spleen
SE_56117chr19:44257406-44262941u87
SE_59025chr19:44248893-44290143Ly3
SE_60730chr19:44257018-44289948DHL6
SE_62525chr19:44242576-44303622Tonsil
SE_64692chr19:44256932-44264220NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr194425584344256372
chr194425638044256453
Enhancer Sequence
TACATGGCTA TCCAGAACAA ACTTCTCATC CTTGTTTGCA GTTAGGTGTG GCCATGTGAG 60
TAAGTACTTT CTGGCTATGG TATGACACTA GAAGTGTGGC TTGGCAGCTT CCAGAAACTT 120
CCCTTCACAG ACTCTGGCAC ATGCCTTCTG CCCCTTCCTC CCAGTGACAG GAATGTGGGT 180
GTGGAGGTTG GAGCTCAAGC AGCTATCCTG GGCTGTAAGG CAATTTAATG GAAGGTACAA 240
TAAAACAAGA CACAAGGTTG GGGGGTTCCA CGTTAACCTT GAATTGCCTA CTTCGAGAGG 300
CAGTGAAAAA CAAATACACA TCTATCTCTT ACTTGCAGCC AAAACTATTC CCAACTATTA 360
AAATGCTCCA ACATAAATAA ACTCACAGGG GCAAGTTCAC ATAAAAATAG GATATTCTCC 420
TTACCAAAAT GCAGCAAGGC ATTTGCTTAC AAACCAGCAA TGTGATCCTC AGTCCAACAG 480
CTACTCTTGA TTAGTCATTA CTAGTGTATG TCATGGTGGG GCTCCAGCCA CTTACTAGTG 540
TATGTCATGG TGAGGTTCCA ACACTCAAGG GCCTATTTTC ACCTGGTATC CCACTACATT 600
TCAGTGTCTG TCTGTCTTCC GTTCCTGACG GTCTGCCTTC CCTCACAGTG AATTTCATTT 660
CAAGGTGTCT CCAGTGTTTA TTCTATTTGA GATGTTATAT AATGTCTGGC TACCTATGCA 720
ACCCACTCTC CACCATTTCA GTATCTGTTT ACAGGTCCTT AGAGAGTTTT CCCAGCTGTT 780
CACACATCAG TCTAGGGTGG TATTTGACTA CTTAACTGTT TGTAGAACTC AGTGGGGCTA 840
TCTGCTCAAG CTCAGAAGTC AGGTTGACAA AGTGTGGCCT AGGGGCCAAA TCTGGTCTGC 900
TTTCTGTTTT TGTAAATAGA AAGTTTTATC GGAACATGGC CACATCCATC AATTTAGAAA 960
CTGTCTGTGG CTGCCTTCTT GATGCAATGG CAGAGCTGAG ACAGACAATA CAGTCTGCAG 1020
GGCCTAAAAT AATTATTCTC TGGCCTTAAC AGAAAGTTTT ACTGAATGGC CGAGTATGGT 1080
GGCTCACACC TGTAATCCCG ACACTTTGGG AGGCCGAGAC AGGAGGACTG CTTCAGCCCA 1140
GGAGTTCGAG ACCAGCTTGG GCAACATAGC AAGATCCTGT CTCTATATAA CATTTAAAAA 1200
AGAAAAAAGT AGCTGGGCGT GGTGACATGC ACCTGTAGTC CCAGCTACTT GGGAGGCTGA 1260
GGTGGTGGGA TCACTTGAGC CTGGGAGGTC AAGGCTGCCA TGATCATGCT GCACCACTGC 1320
ACTCTAGCCT GGGTAACAAA GCAAGACCCT GTCTAAAAAA AAAAAAAAGC AGAACCCTGT 1380
CTCAAAAAAA CAGTTTGCTG ACCCTTGCTT AGCTTGGAAG TATCTGTTAA ATCCCTCCAT 1440
GAATCCTCCC CTGCCCCACC TCATAATGAC ATAAACAGGT CCCTCCGAGA CTCTCCAGAA 1500
TGGAAGGGTC TGTTTACAAG ATGCAGTCAT AATTTTGCTA GCCAGACAAG TGGCTTGTCT 1560
AGCTCCTCTC CTACTGTGCT ACATGACCTC TCCCAGAGCC ACAAGCCAGG CTGAAGACTG 1620
CTTTCCTAGA CAGAGGAGGA CAAGGGCCTG TTTACAGCTG CTTAGGGAAA ATGACTCATT 1680
CCATACCGAA ATGACTGCTT AGTCTGGGAT GGAGATTCTC CCCAGAATCT GAGACTCCTC 1740
CCTCACTTGC AATTAAGTGT CTTTACACAT TATTCTGAAA TCTACCCAGT GCTTAAGTAC 1800
TTGTCTTCAT GCCTCAATTG GGATACTGCC CAGCCCTGAG GTTTCTGTTT ACTGGCCTAT 1860
GAGGATGCCC TTTCCTGTGC AAAGTAAGCG CCCCTGTGTG AATGCTTTTC TTTTTTTTTT 1920
TTTTTTTTTT TTGAGACGGT CTTGCTCTGT TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCACGATCT 1980
CAGCTGGCTG CGGCCTCTGC CTCCCGGGTT CAGGCAATTC TCCTGCCTCA GCCTCCCAAG 2040
TAGGTGGGAT TACAGGTGCA TACCACCAGG CCGGGCTAAG TTTTGCATTT TCAGTAGAGA 2100
CGGGGTTTCG CCATGTTGGC CAGGCTGGTA TCGAACTCCT GGCCTCAAGT GATTCGCCAG 2160
CCTCGGTCTC CCAAAGTGAT CGGATTCCCC GGGTAAGCCA CCGCACCTGG CCTCCCTGTG 2220
CCCTTTATTC TGGGAGCTTC CACAGTATCT GAATGTGGGG AGTTCCTTGG AACTTAAAAG 2280
CCCACCTAAA CCAGGTGTGG AGGATACAGT GAGCCGAGAT CGTGCCACTG CACTCCAGCC 2340
TGGGCGACAG AGCGAGACTC TTGTCTCAAA GAAAAAAAAA AAAAACCCCA CCCACATGCA 2400
AGCTGGGGAC TTCCAATGCT GTTTCCGGGC TCCTTTGGGG ATTACCCCCA AACTTAGGAA 2460
AGCTGGTCTA TTTAAGTGTC TGCTGATGGA CTTCTAGGGT GACTTCCCGA AAATTAACAA 2520
ATCGAATTTA CATATTTTTG GGGAGTGTCT CCTCAGTATT TAGGCATCGC TTCACACACT 2580
CCCTTCGGGG ATCTCCCAGA ACCTCACTAT TTGCAAATAT TTGGGGAGAC TCTCCCGATT 2640
CCTGAGTATG TAAGCCCACT TCGTGGGGCA CTCCCCAGCC CAGAACTGTA GTCGATTTGC 2700
ACATTTTCCT AAGGACTCCC TAGGATTTAA ACTTCTCTCT ACGGGGTTCT AGAAGGGAGC 2760
CTCCCCCGGA TTTAGGCATT GCTTTACAAA GCTTCCCTCG GGGAACCCAA CTCAAGTTTC 2820
TCGTTACACG TTATTGGGGC GGCCTCCCCA GTACTTGACG GGCAGTTTGC AGGCTGTACT 2880
TGGATCTCGC AGAGCATAAG TTTCTCATTT ACACGTTATT TCCGTCCCCC GCCCCCATTC 2940
CTGCCAACCC AGTATCGAAT TGACGGTCGC CGGCCCCCTA CTCAGTGCCG CACCCCCGCC 3000
GGACGTCCCA GCGACCTTTC AATGGCCAAG GCGGGGGCGG GGCCTGCCGG AGCGCCCCGC 3060
CCGCCGCCGG TGCGCTAGCC TCGCGCGGGC TCGCGGCCCC 3100