| Tag | Content |
|---|
EnhancerAtlas ID | HS091-22866 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | HepG2 |
Coordinate | chr19:3243650-3246150 |
Target genes | |
TF binding sites/motifs | | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
| REST | MA0138.2 | chr19:3244190-3244211 | TTCAGCACCAGGGACAGCGTC | + | 9.61 | | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3245297-3245317 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3244923-3244943 | CGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.35 | | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3245398-3245418 | CGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.35 |
|
| | Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | | Number of disease enhancers: 1 | Chromosome | Start | End |
|
| | Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
| GH19I003244 | chr19 | 3244121 | 3244270 |
|
Enhancer Sequence | AACCACACAC CACAGACACG GTGGCTTAAA CAACAGAAAT TTATTTTTGC TCAGTTCTGG 60
AGGCCAGAAG TTCGAAATCA AGGTGTTGGC AGGGCTGGTT CCTTCTGAGG CTGTGAGGGA 120
GCGTTTATTC CAGGCCGTTC CCCTGTAGCG TTCCTTGTCT TGTAAAGGCA TCGTCCCATC 180
TCCGCCTGCA TCTTCACGTC CCCCTGCCTG TGCGTGTCTC TGTGTCTATT TTTCCATTTT 240
TTATAAGGGC ACCAGTCTTA TTGGATCAGG GCCCACCCTG ATGACCTCAT GTTGACTAAT 300
TCCATCTGCA ATGACCCCGT TTCCAAATAA AGTCACATTC GGAGGTCCTG GGGATTAGGA 360
CTGCAAATGA TGAATTTGGA GAGGGGGAGA AGCACATTCA GCCCATAACA GGAACTGTGA 420
ATCAAAGCTC TATTTATCCA GGGGTGGGTA AACATTACGC ATTTTCACCA GCTAGAAACG 480
ACAAGCAAAG AGGCCAAGAA GAGGTTGGGC CAAGAGATCA CGGAAGCCAT AAGGAAGATT 540
TTCAGCACCA GGGACAGCGT CAGGGCGGGC TTTTGTGAGC ATGCGTCTGT GTGTGGCGTG 600
TGCATGGGCC TGTGCGTGCG AGTGTGTGTG TGTATGGTAT GCATGCAGTA TGTGTGTGTG 660
CGTAGTGTAT ATGGTGTGCA TGCATTATTG CATTGTGTGT GTAGTGTGTG GTGTGTGCAT 720
CTGTATGTGT GTAGTGTGTG TGGTGTGCAT GCATTGTGTG TATGTGTGTG TAGTGTGTGG 780
TGTGTGCATG CATCTCTGTG TGTAGTGTGT GGTGTGTGCA TGCATCTGTG TGTGCGGTGT 840
GCATGCATCT GTGTGGTGTG CATGCGTCTT GTCTGCGTGT GTGTGTAGTG TGTTTTGCAT 900
GCATTGCGTG TGATGTGTGT GGTATGTGCA TGCATCTATG TGTGGTGCAC ATGTGTCTTG 960
TCTGCGTGTG TGTGCGTGTG TGGTGTGTGT ATGTATCTGT GTGCATAGTG TGTGTTGTGC 1020
ATGCATCGTG TGTGTAGTGT GTGGTGTGTA TGCATCTGTG CATGTGTGTG TGGTGTGTTG 1080
TGCGTGCCTT GTGTGTAGTG TGTGGTGTGT GCATGCATCT ATGCGTGTGT GTATGGTATT 1140
TGCATGCGTC TTGTCTGGTA TATGTGTGCG TATGTGGTGT GTGTATGCAT CTGTGCATGT 1200
GTGTGTGTAG TGTGTGGTGT GTGTATGTGT CTTGTCTGCA TATATGTGTG TGTGGTGTGT 1260
GCATACATCT GTACGTGTGT GTGTGGTGTG TGGTGTGTGC ATGCATCTTG TCTGCGTGTG 1320
TGTGTGCATG TGTGGTGTGT ATATGCATCT GTGCGTGTGT GTGTAGTGTG TGGTGTGTGC 1380
ATGCATCTTG TCCACGTGTG CGTATGTGTT GTGTGTGTAT GCATCTGTGT GTGTGTAGCG 1440
TTTGGTGTGT GCATGCACCT GTGCATGTGT GTGTGTAGTG TGTGGTGTGT GCGTGCATCT 1500
CTGTGTGTGT TGTGCATGTG TCTTTGCGTG TGTGTGTGGT GTGTGTTTGC ATCTGTGCAT 1560
GTGTGGGTGT GTGATGTGTA TATGCATCTG TGCGTGTGTA TGTGGTGTGT GTATGCATCT 1620
CTGTGTGTGT GCGTGTGTGT TTGCATCTGT GTGTGTGTGG TGTGTGTATG CATCTGTGTG 1680
TGTGCGTGTG TTTGTGTGCA TGCATCTGTG TGTGTGTGCG TGTGTGTGTA TGCATCTGTG 1740
TGTGTGTGCG TGTGTGTGTG GTGTGTGGTG TGTGTGTGTG TGGTGTTTCT TTCCCTTTCA 1800
CTGCAGAGCT CCCAGACCCT GGGGCTGATG GCCTTAAATG TTGCTCAGGG CACCTACCCA 1860
CTCCCTAGCC TCCTAGGGCC ACCACCCTCC AAACCCTGCA GACAAGGAGT CCACAGGCAA 1920
AAAAAAAAAA AAGGAACCTA GGAAGAAGGT TTTTTACCCT TATTTTACAT CTGCCTGCAG 1980
CCCAATTTCT TGCCGATCAA ACCTGATTTC TCTCAGGCCT TAGGGCTCGT TGTCTTAGTG 2040
TAGTTCTTTT GAAGAGCTTG GGGAATAAAA TTCGGAAAAC AAACATCAAG AATAGACCAT 2100
CACATACAAC AACGGCAACA GGAAAGATGA GCACATAGAC TCTGTGAAGA GCTCCCCCAA 2160
AGTGACAAGG TGCCCAGCTT CATTAATAGT TCTTGGAAGG TGCATTAAAA TCTCAATGAA 2220
ATACAACTGC ACGCCCACCT TAATGACTAA CATTTAAAAG GTTGGCAAAA ACCAAGCATT 2280
AGTGAAGATG AAGCACTAAT AGAGCCCGAC ATAGGCACAA CCCACTTCAG AAAACGATTT 2340
GAAGGAATCG ATGAAAGTTA AACACACGCC TGTCTTATGC CCAGCACGTC CCTCCTGGGT 2400
ATGCTTTTTG CATTAAAATA TACGGACAAG GCCGGGTGCG GTGGCTTACG CCTATAATCC 2460
CAGCAATTTG GGAGGCCACG GCGGGTGGAT CACTTGAGAT 2500
|
