EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-19782 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr17:40812730-40814990 
Target genes
Number: 50             
NameEnsembl ID
ACLYENSG00000131473
NKIRAS2ENSG00000168256
DNAJC7ENSG00000168259
KAT2AENSG00000108773
RAB5CENSG00000108774
AC003104.1ENSG00000236194
STAT5BENSG00000173757
STAT5AENSG00000126561
STAT3ENSG00000168610
PTRFENSG00000177469
ATP6V0A1ENSG00000033627
AC067852.1ENSG00000256929
NAGLUENSG00000108784
HSD17B1ENSG00000108786
COASYENSG00000068120
MLXENSG00000108788
PSMC3IPENSG00000131470
TUBG1ENSG00000131462
FAM134CENSG00000141699
TUBG2ENSG00000037042
PLEKHH3ENSG00000068137
CCR10ENSG00000184451
CNTNAP1ENSG00000108797
CTDENSG00000239671
EZH1ENSG00000108799
HMGN2P42ENSG00000214578
RAMP2ENSG00000131477
VPS25ENSG00000131475
WNK4ENSG00000126562
CCDC56ENSG00000183978
CNTD1ENSG00000176563
BECN1ENSG00000126581
PSME3ENSG00000131467
AOC2ENSG00000131480
AOC3ENSG00000131471
RP11ENSG00000260105
AC100793.2ENSG00000213373
G6PCENSG00000131482
SNORA40ENSG00000212149
AARSD1ENSG00000108825
RUNDC1ENSG00000198863
RPL27ENSG00000131469
IFI35ENSG00000068079
VAT1ENSG00000108828
RND2ENSG00000108830
NBR2ENSG00000198496
NBR1ENSG00000188554
TMEM106AENSG00000184988
ARL4DENSG00000175906
ETV4ENSG00000175832
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr17:40814407-40814422GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr17:40813189-40813204TGACCTTTTGTCCTT-6.82
RARAMA0729.1chr17:40813186-40813204ATTTGACCTTTTGTCCTT-6.79
ZfxMA0146.2chr17:40814383-40814397CAGGCCGAGGCGGG-6.62
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01244chr17:40811049-40812998Adrenal_Gland
SE_34416chr17:40810621-40813652HCT-116
SE_35131chr17:40810496-40814039HeLa
SE_41096chr17:40810817-40813140Left_Ventricle
SE_42725chr17:40810835-40813106Lung
SE_46757chr17:40812627-40813185Ovary
SE_48961chr17:40810781-40813122Right_Atrium
SE_51057chr17:40810895-40813353Sigmoid_Colon
SE_54287chr17:40810870-40813062Spleen
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH17I042660chr174081230240813774
Enhancer Sequence
GTTATGGAGT GGGGGAAGGA ATGGGCAGGG AGGCCGAAGA GTGCTGGGGA CAGGTCAGGA 60
GGTGGCCTGG ATAGGTAATA TGAGGGGAGC AATTCAATTC AAAACCCGTT TATGGAGCAT 120
CAGATGTGGG ATATTGAGGT GAATAAGATA TAATCTTTGT TCTCAAGGAA GTCATAAATC 180
TGAATGGCAC CGGCCCCTTA GGCATGAGTC ATTCAGCTGC TTCTCCAGCT CCAAACCTTC 240
CCAAGGAGCC TCAGCCTGGA TGCATAAGAG GAAGCTTTGA GACATTGGCG TTTTGGGAAT 300
GGAGAATGAA CCAAGCCGAA GTCTCTCCCC CAGATCCTTG GAGACTGCCT CTCCATCTCT 360
CCCCATGCTG GGTGCGATAT GTTCCTGGCT TACAGCTCTT ATAACCCATG TAATTTCCTA 420
AGGGACTAGA GCAATAATAG TATGTTTTGT TAAAATATTT GACCTTTTGT CCTTGGTTTC 480
TGAAACAGCT CCAGAACAGC TCCAGAGTGA TAAAGGTGAA AGACAGTCTT TTGTTATTTA 540
TAACAAGCCC GTTTCTTTTA GTTTAATCTT TCATTTTATT TTAATTAGTT AATTTTACTA 600
ACCACTGTAC TAAGGAGGAA CAAGTGCCTT TCAACCAAAC CTGAGCTTAT GTTAAAGAGG 660
CGATTTTTGG AAAGTCCCAG ATAGCCACTG GATGGGGGGC TGGTTGCCAG GGGAACAAAC 720
CTGGTGCTCT GAGGGTTGGA ATTTACAGGC CCACCCCTCA CCTCTGGGGA AGGGAGAGGG 780
GATGAAGATT GAGTAGAGCA CCAATTGCCA ATGATTTAAT CGGTCATGCC TGTGTAATGA 840
AGCCTCCATA AAAATCCAAA AGGACTGAGT TTGGGGGCTT CCAGGAAGGT GAACAAGAAC 900
ACATCCACAG GCCAGGAGGG TGCAAACCCA ACGCCACAGG GCAGCAACTC CTATGCGCCG 960
GACCCTTCTA GAGCTTCCCC TCGGTATCTC TTCATCTGGC TGTTTATTTG TATCCTTTAA 1020
AATATCCTTT ATAACAAATG GATGAACGTA AGTAAGTGTC TCCTTGAGTT CTGTGAGCTA 1080
CTCTAACAAA TTAATTGAAC CCAAGGAGCA GTCCTGAGAA CCTCGATTTA TAGCTGGTTG 1140
GTCAGAGGCA CAGATAAAAC AACCTGAAGC TTGTGTTGGC ATTGGAAGTG GGAGAGTCTT 1200
GTGGGACTGA GCCTTCACTC TGTGGGATCT GATGCTATCT TCAGGTACAG ATACTCCTCA 1260
ACTTACAATG GGTTTATCAG GATGTAAACA CATCACAAAT TGAAAATATT GACTAGGCAC 1320
AGTGGCTCAT GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCCGA AGCAGGTGGA TCATCCGAGC 1380
CCAGGAGTTC AAAACCAGCC TGGGCAACAT GGTGAAACCC CATCTCTGCA AAATATACAA 1440
ACATTATCCA GGCATGGTGG TACATGCCTA TAGTCCAAGC TACTTGGAGG CTGAGATAGG 1500
AAGATGCCTT GAGCCCAGGA ATTCAAGGCT GCAGTGAGCT ATGATCACAC CACTGCACTG 1560
CAGTCTGGGG GACTGAGTGA GATCCTGTCT CTAAAACCAA AACAAATTTG AGGACAGGTG 1620
CGGTAGCTCA TGCTTGTAAT CCCAACACTT TGGCAGGCCG AGGCGGGCAG ATCACTTGAG 1680
GTCAGGAGTT CAAGACCAGC CTGGCCAACA TGGTGAAACC CCGTATCTAC GAAAAATAAA 1740
AAAATTAGCC AGGCGTGGTG GTACATGCCC GTAGTCCCAG CTACTTGAGA GGCTGAGGCA 1800
GGAGAATGGC TCGAACCTAG GAGGTAGAGG TTGCAGTGAG CCAAGATCGG GCCATTGCAC 1860
TACAGCTTGG GTGACAGAGC AAGACTCCGT CTCAAAAAAA AAAAAAATTG AAAATACCGT 1920
AAGTAGAAAT GCATCAGGTT ATAACCCAAT AAGCCCATCA TGAAGTTGAA AAATTGTAAA 1980
TTGAACCATT GTAATTCAGA TGCTTCTTGA TTTAAGATGG GATTATGTCC TGATAAACCC 2040
ATCATAAAGC CAAAACATCT TAAATTAAAC CATCCTAAGT CAGGGACAGT CTGTAGGTAG 2100
TCCAGAATTG AAGTGAATTA GTGGATACCC AGCTGGCATC TACTGTAGAA TTGACTGCTT 2160
ACCTGATGTG TGTGGTAAGA CCCCACCCAT CTGGTATCAG AATTGTGTTG TGAGAGTGTG 2220
GCAGGAGAAA CTGAGTCTGT TTATTCCTGT ATACACACAG 2260