EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-09970 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr12:53524520-53526780 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs71455229chr1253525628hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr12:53526568-53526581TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:53526565-53526578AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:53526564-53526577AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr12:53526569-53526582AATTAATTAATTT-6.92
MafbMA0117.2chr12:53525277-53525289AAAATGCTGACA+6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:53526663-53526678GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
POU6F1MA0628.1chr12:53526566-53526576ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:53526570-53526580ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:53526566-53526576ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:53526570-53526580ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr12:53525907-53525928GGAGAAGGGAGGAAAGGTGGA+6.58
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr125352479753524847
chr125352561053525670
Enhancer Sequence
TAGTATATTC AGATTTGTGC AACCATCACC ACAGTTAGCA CATTTCATCA CTGGCCCCCA 60
AAATCTCATA CCTACTAGTA GTCACTCTCC ATGTCCCGAA AACCTCCCAG CCTTGGGCAA 120
CCACTGATTT ACTTTCTGGA TATTTCTTTT CTTTTTCTTT TTTCTGTTTT TTTTTTTGAG 180
ACAAGGTCTC ATTCTGTCAC CCAGACAGTG GTTTCTGGGT ACAGTGGTGC CATCATAGCT 240
CACTGCGACA TTGAACTCCT CGCACAAGCA ATCCTCCTAC CTCAGTCTCC TGAGTAGCGG 300
AGACCACAGG TGCACACCAC CACACCCAGC TAGATTTTGT ACTTAAAAAA TTATTTTTGT 360
AGAGATGGGG TTTTGCCATG TTGCCAAGCT GGTCTCAAAC TCCTGGGCTC AAGTGATCTG 420
CCCACCTCAG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCATGA GCCACCATGC ATGGCCTATT 480
CTGGATATTT CACATAAATG AAATCAGGCA TCAGTGGTGG GGATGGCTAC AGGCCAGGGC 540
TGCTGACTGA CAAGCTAGGA GAGGGCCCAG TGCCCAGAAT CTTGGTGGGC GCTGCTGAAG 600
CACCGCCTAC ACCATGCCTC TCTCTGCCAC CTCCTTGGAG CGTTTTGAGC AGCTGCACGA 660
GATGTGCCTC CAAGGGGTGC ACTAGTGGCT GCTGGGTATG GCAGGGACCC AGGAGAAGCT 720
GATCAGAGAT TTTGATGAAA AGCAACAGGA AGCAAACAAA ATGCTGACAC AGATGGAGGA 780
GGAACTACAT TATGCACCCG TATCTTTCCA TAACCCCATG ATGTCTAAGC TTCAAGACTA 840
TCAGAAGGAC CTTGCCCAAT TCCATCTGGA GGCAAGAAGT ACACCTTTGC AGCCATGCCT 900
GGGGACCGAG GAGACATGAA ATATGGCACA TATGCTGTAG AGAATGAGCA TATGAATAGG 960
CTACAGTCTC AAAGGGCAAT GCTTCTCCAA GGCACCAAAA GCCTGGGCCG GGCCACCCAA 1020
GAGACTGACC AGATTGGCTC AGAAATCTCA GAAGAGCTGG GGAACCAACG GGACCAGTGA 1080
GAACGTACCA AGAGTACACT GGGAAACGCA AGTGAAAACT TGTTCAAAAG TCGAAAGATT 1140
CTCTCTTCTA AGTCCAGAAA AGTGATAACC AACAAGCTTC TGCTTTCCAT CATCTCACTG 1200
GAGCTAGCCA TCCTGGGAGG CTTGGTTTAC TTTGTGTTCT TTTGCAAGCA TGGGACTTGC 1260
AATAGGGAAG GATTGTGGAC CAGAACTTTG ACCTTGGGAA TGCATGGTGT TAGGGATGTG 1320
GATGGAATAA GCATGTTGCT CCTGTGGGCT AACAGTTCAA GGATGCACTG CGTAGCCAGA 1380
CTGTGGGGGA GAAGGGAGGA AAGGTGGAAA GCCACTTAAC TGTGAAGTGA CAGCAACAAG 1440
ACCAGTATGA TATACCAAGG TAATAATGCT GTTTATGACT TCTTTTTTTG TTGTTGGTTT 1500
TTTGTTTTGT TTTGTTTTGT TTTTGTTTTT GTTTTTGAGA CAGAGTCTCA CTCTGTCGTC 1560
CAGGCTGGAG TGCTATGGCG TGATCTCGGC TCACTGCAAA CTCCACCTTC TGGGTTCACG 1620
CCATTCTCCC GCCTCAGCCT TCAGAGTAAC TGGGACTACG GGTGCCCGCC ACCACGCCTG 1680
GCTAATTTTT TGTATTTTTA GTGGAGACAG GGTTTCACCA TGTTAGCCAG GATAGTCTCG 1740
ATCTCCTGAC CTCGTGATCT GCCCGCCTTG GCCTCCCAAA GTGCTGGGAT TACAGGCATG 1800
AGCCACCGCG CCCGGCCATG ACTTCTTTAA AAATACATAA GCCTGGCCAA CATAGCAAGA 1860
ACTCATCTCT ACCAAAAATA AAAAAAAATT AGCCAGGTGC GGAGGCCACA TCTGTAGTCC 1920
CAGCTACTTA GAAGGCTGAG GCAGGAGAAC TCCTTGAGAC CAGGAGTCTG AGGCTGCAGT 1980
GAGCTATGAT AGTGCCACTG CACTCCAGCC TGGGTGACAG AGTGAGACCT TGTCTCCAAA 2040
AACAAAATTA ATTAATTAAT TTTTAAGAAT ATGCCAAGGC TGGGCGTGGT GGCTCACACC 2100
TGTAATCCCA GCACTTTGGG AGGCCGAGGT GGGAGGATCA CCTGAGGTCA GGAGTTCAAG 2160
ACCAGCCTGG CCAACATGGT GAAACCCTGT CTCTACTAAA AATACCAAAA ATTAGCTGGG 2220
CATGGTGGTG TGCACCCATA ATCCCAGCTA CTCTGGAGGC 2260