EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-09280 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr12:6943270-6945020 
Target genes
Number: 57             
NameEnsembl ID
CD9ENSG00000010278
RP1ENSG00000256103
PLEKHG6ENSG00000008323
TNFRSF1AENSG00000067182
LTBRENSG00000111321
CD27ENSG00000139193
LOC678655ENSG00000215039
TAPBPLENSG00000139192
VAMP1ENSG00000139190
NCAPD2ENSG00000010292
MRPL51ENSG00000111639
SCARNA10ENSG00000239002
RP5ENSG00000255966
GAPDHENSG00000111640
IFFO1ENSG00000010295
NOP2ENSG00000111641
SCARNA11ENSG00000247853
CHD4ENSG00000111642
ACRBPENSG00000111644
ING4ENSG00000111653
ZNF384ENSG00000126746
COPS7AENSG00000111652
PTMSENSG00000159335
MLF2ENSG00000089693
LAG3ENSG00000089692
AC125494.2ENSG00000244532
CD4ENSG00000010610
GPR162ENSG00000250510
U47924.11ENSG00000256010
LEPREL2ENSG00000110811
GNB3ENSG00000111664
U47924.25ENSG00000237240
CDCA3ENSG00000111665
USP5ENSG00000111667
TPI1ENSG00000111669
RPL13P5ENSG00000240370
LRRC23ENSG00000010626
DSTNP2ENSG00000248593
SPSB2ENSG00000111671
ENO2ENSG00000111674
ATN1ENSG00000111676
C12orf57ENSG00000111678
PTPN6ENSG00000111679
SCARNA12ENSG00000238795
EMG1ENSG00000126749
PHB2ENSG00000215021
U47924.19ENSG00000255896
C1SENSG00000182326
LPCAT3ENSG00000111684
RP3ENSG00000239701
ABC12ENSG00000205885
C1RLENSG00000139178
U6ENSG00000200345
RBP5ENSG00000139194
CLSTN3ENSG00000139182
RP11ENSG00000256967
PEX5ENSG00000139197
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr12:6944765-6944778AAATAATTAATTA-6.71
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Lhx3MA0135.1chr12:6944776-6944789TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:6944780-6944793TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:6944769-6944782AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:6944773-6944786AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:6944777-6944790AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:6944781-6944794AATTAATTAATTA-6.78
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:6944530-6944545GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
POU4F2MA0683.1chr12:6944763-6944779TTAAATAATTAATTAA+6.25
POU6F1MA0628.1chr12:6944770-6944780ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:6944774-6944784ATTAATTAAT+6.02
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POU6F1MA0628.1chr12:6944770-6944780ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:6944774-6944784ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:6944778-6944788ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:6944782-6944792ATTAATTAAT-6.02
ZNF143MA0088.2chr12:6944247-6944263TGGTGCATTCTGGGAA-6.81
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1269435886943681
chr1269441726944325
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH12I006833chr1269430456944328
GH12I006835chr1269449416945110
Enhancer Sequence
TCCCTTGCTC TTGGCCTGCC CCCTTCATTC TGCCTGTCCT GATTATCCAA CCGGGACTGT 60
GCTTACCACT GCCTCTCAGC TGTGGATAAG TTCCGTCTCG TCTTAATTTA GCTGACATAG 120
GTGGATGTTC TTTACAAATG AATTTTGCTA GAAATTGATA GGAAGAACAA AACAAAAAAC 180
ATGAAGGCAT AAAAATGGAT GAGTGTGCAG GTAAGGATTG CTTGGTTAGC CAAGAGTTTA 240
GTTACTGGCT TGGCTGATGG CTCAGCAGAC ACGCAGGCCT TTCTTTCCCT CCTAGTTTAG 300
GTTGAATGAC TCATACTCAC CAGGTTGAGG CTACCATTTT ATGAAGCTTC AACCCTTATC 360
TTAGGTTAGT GCTCATTCAG TAATATACTC ACTGAGTAGC TGCTATACAC TAGAAACTGC 420
TAGGTTCTAG GGAGAGGAAG ATGATTATAG ACTCTGCCCT TTGGGAGCTC AAGTGTAGAG 480
GTGGAAACAG ACAAGGAAAT ACATAATATA AGCAGGTGGT AAGTTTGGTA AAAGAAGTAT 540
GTTTTTGGGC TGGGTATGGT GGCTCATGCC TGTAATCCCA GCAATTTGGG AGGCCGAGGT 600
GGGTGGATCA CCTGAGGCTG GGAGTTCGAG ACCAGCCTGA CCAACATGGA GAAACCCTGT 660
CTCTAATAAA AATACAAAAA AGTTAGCCAG GCGTGGTGGC ACATGCCTGT AATCCCAGGT 720
ACTCGGGAGG CTGAGGCAGG AGAAGCGCCT GAACCCGGGA GGCGGAGGTT GTGGTGAGCT 780
GATCTCGTGC CATTGCACTC CAGCGTGGGC AACAAGAGCG AAACTCCATC TCAAAAAAAA 840
AAAAAAAAAG TATGTCAAAT AGAAGCACTG AAATGCAGTT ATAGAAGGCT TGCTGGAGAG 900
GTGGTATTTG AGCTCAGTCT TAAGGATGAG TTAGTCAGGC GATTGGGGGT GGAATCAGTC 960
TAAGAGGGAG AAGAGCATGG TGCATTCTGG GAACTGCAGT CAAGCACAGG GGTGAGAGCA 1020
GGGCCAGCTC CATAGTCATT ACCTGTGTGA TCTTGGGCAA TTTATTTTAA CATCTCTGAG 1080
CCTAATTTGC TCATCTATAA AATGAGGATA ATAATAGTGT TTTTGTCATA GTGTCGTTGT 1140
GAGGATTAAA TGAGTTAGCA CATGATAAAG CTCTTAGAAC ACAGAATCAT CACTGGCTGG 1200
GTGTGGTGGC TCATGCCTGT AATCCCAGCA CTTTAGGAGG TCAAGGCAGG TGGATCACTT 1260
GAGGTCAGGA GTTCAAGACC AGCCTGGCCA ACATGGTGAA ACCCGGTCTT TACTAAAAAT 1320
ACAAAAAAAT TAGTGGGCAT TGTGGCAGGT GCCAGTAATC CCAACTACTG GGGAGGCTGA 1380
GGCAGGAGAA TCGCTTGGAC CCAGGAGGCG GAGGTCGCAG TGAGCCGAGA TCGCACCATT 1440
GCAGTCCAGC CTGGGCAACA AGATCAAAAC TCCGCCTCGA AAAATAAATT TTTTTAAATA 1500
ATTAATTAAT TAATTAATTA ATTAAAAAAG AACATAGAAT CATCAGGGTG TATGTTACCA 1560
AGAGACAGTA TAGGGAAAGA GGGAGAGAGC CCACACATGA AGGCCGAGGG ACAGTGAGTG 1620
TCTTCTGTGG CCTCCCAAGG AGTTTGGGCT TTATCTGTGT ATGGTAGACA GCTGTTGCAG 1680
GATTTTAGGA CGGTTGACTT TTGCATTCCT GTAGTACCTG GAATCAGGTG CAGGGTCTGG 1740
AGTCACCTGT 1750