EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-03133 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr1:159890520-159893220 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6427499chr1159891917hg19
rs2789422chr1159892088hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr1:159892832-159892845AGCAGCTGTTTCT+6.28
Tcf12MA0521.1chr1:159892831-159892842CAGCAGCTGTT-6.32
YY1MA0095.2chr1:159892039-159892051CAACATGGCTGC+6.14
Number of super-enhancer constituents: 46             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02009chr1:159887204-159896462Aorta
SE_02391chr1:159891163-159896016Astrocytes
SE_09609chr1:159888811-159896163CD14
SE_10233chr1:159889294-159896142CD19_Primary
SE_10984chr1:159884833-159896640CD20
SE_11910chr1:159890466-159896330CD3
SE_12862chr1:159890202-159896191CD34_Primary_RO01480
SE_13325chr1:159887045-159896510CD34_Primary_RO01536
SE_14052chr1:159890274-159896187CD34_Primary_RO01549
SE_14513chr1:159890132-159896515CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15769chr1:159891344-159896220CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15949chr1:159891339-159896140CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16460chr1:159890826-159896099CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16913chr1:159890317-159896307CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17500chr1:159889525-159896840CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17880chr1:159889025-159896700CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_19597chr1:159888663-159896506CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20057chr1:159890184-159896627CD56
SE_20849chr1:159889345-159896337CD8_Memory_7pool
SE_21561chr1:159891197-159896204CD8_Naive_7pool
SE_22506chr1:159889745-159896593CD8_primiary
SE_23567chr1:159891451-159896346Colon_Crypt_1
SE_23939chr1:159892115-159896031Colon_Crypt_2
SE_25013chr1:159890918-159896336Colon_Crypt_3
SE_30108chr1:159891067-159896091Fetal_Muscle
SE_31985chr1:159891083-159896707Gastric
SE_34858chr1:159890807-159896516HeLa
SE_36438chr1:159891272-159896570HMEC
SE_38165chr1:159890321-159896029HUVEC
SE_40207chr1:159890880-159896228K562
SE_41182chr1:159890906-159896421Left_Ventricle
SE_42315chr1:159887173-159896572Lung
SE_44957chr1:159891221-159895990NHLF
SE_47692chr1:159891560-159896059Pancreas
SE_48986chr1:159891201-159896458Right_Atrium
SE_49778chr1:159891574-159893172Right_Ventricle
SE_50509chr1:159888888-159896553Sigmoid_Colon
SE_52604chr1:159889149-159896485Small_Intestine
SE_53483chr1:159887801-159896526Spleen
SE_55434chr1:159890662-159896015Thymus
SE_58180chr1:159892507-159896090VACO_9m
SE_59359chr1:159879583-159907614Ly3
SE_63031chr1:159879414-159896447Tonsil
SE_63399chr1:159883649-159916570NCI-H69
SE_64771chr1:159890244-159896649NHEK
SE_65431chr1:159891110-159896368Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1159892447159892988
chr1159891200159891400
Enhancer Sequence
GGAATGTGGA ACAGCTTAGG AAACTGGTTG GATCTACCCT CCCTCAACCT CTGGGTTTTC 60
TTTGCTTTTT TTTTAACCAT CTAGGTTGGT GCAAACCACT GGATTTTAAT TGAGCACCTA 120
CTATCTGTGC TAGGGATTGT GAAAGAGATA GTAGAAGTCC TTGGTCCTCA AGTGCCCACA 180
GTGCCATCAG GGAGACAAAG TGAGTACATA TGAACAGGTA AGGATTGCAC ACAAAGAATA 240
CTAAAGTGCA CAGTTCAGAT CACATGTTGT AGGAGTTAAA AGAAGCAGAC GGGCAGAAGC 300
AGCCTGGGAA GGCTTTCTGG AAGAGGTAGG CTTGAATAGG TCCTTGAGGG ATTTCAGCAA 360
ACAAATCGAA TTTCCTATGA AAAACCAGGC AATAAAAACA AATTCTACTT TCCCCTCTAG 420
GAGCTATGAC AGGCAGAATC ATGCCCCCGC AAAAGGTGTC CATGTCCTAA TTCCCAGAAC 480
CTGTGGATAT TGTTATCTTA TATGACAAAA AGGGACTTCG TAGATGTGAT TAAGATCTCG 540
AAATGGGGAG ATTATCCTGC ATCATCTAAA TGAGCCCAGT GTAATCACAA GGGCCTTACT 600
AACTGAAAGT GGGAGATAGG TGAGTCAGAG TGGGAGAAGT AACAACAACA ACAACAAAAT 660
GGAAGTAGAA GTCAGAGTCA CACAGGGCCA TGAACCAAGC AATGCAGGTG GCCTCCAGAA 720
GCCAGAAAAG GGAAGGAAAT AGATTCACCC AAAAACCCCA GAAGGAACAC AGCTCTGCCA 780
ACACCTGTAT TTTAGCCAGT GAGACCCCTG TTGAGTCTGT AGAACTGTAA GATGCTGTAT 840
TTGTGTTGCT TTAAATCACT AAGCTTGTAG CAATTTGTTA CAGCAGAAAT AGGAAACTAA 900
TACAGGAGCC CTGGGTGATA TTTTTGGGGA AACCTGGAGA AGAGAAGGCA AGACGGGGAA 960
ATACACAGGA GGGTTTCTTT AACTTCGTTG GAGGAGCTTG ATTAGCAAGA ACTGGGTGGT 1020
TTCCCGACCA ATGGCCTGAG TTGGCGGACC TCACTGTGGC AGTGTGTTCC CACCACACTC 1080
ACCACCTGGG TCTGACACTC AGGGGCTGAG CAAGACCCGG GCATGGTATG GATGCCAAGG 1140
GGAGCCAAGA ACCAAGAATG GGCCACAGTC CCCATTTTCT GTCCCATCCC CACCCTGGTT 1200
TGGCTTTTCT CTCTTCTCCA AAACAGAGCT AGCTGTCAGG CTGCTCACGA AAGGGGACCC 1260
CCAGGACAGG CATCTGCGTT CAAGGGGAAG AAAGAGAGCC ACCCCTTCTA ACCACATCTG 1320
GCTCCAGGCC AGGTTGGCCT TCAGGGATGA AGTCACTCCA GCTCCCCCTC TCCCACACAC 1380
CCAGGTTAAA CAATCCCGTC ACCCCCTCTC AATGGACCTT GGGGCTCTGC GAAATACAAG 1440
GGGACCAGCC TGCCTCAAAC CCTCAACACC TCTCGGCCGC AGAGGCTGTG TCTTGGGCCA 1500
GTCCCTCCCG TCCCGACTCC AACATGGCTG CTCCTTTTTA CCCCAGCTTA TCAAGCTGCA 1560
CATTTCCGGC AGATCCTCCC CTAAATCAGT TATTTTTAAA CCTCATTAAG AGCAACCCGC 1620
CCCCTCCACT TCCCCCAGCC CGAAAGCTGG GCCAGATAAA TGTCAGTCTG GGCCCCGACC 1680
CACAGCGCCA GGCACACACA CCATCAGCTT GGGGAAGGCA GGCGGGGTGG GGTGGCTGAG 1740
TTCTGAGGAG AAACCAAGAG AAGCATCCCT GCCCTTCCCA GAGGCCACTC CACCATAGAA 1800
ACCTCTAACC TCTGATGCAC AGGGGAATGG CTGGAAGACA GGTAGGAAGA GGAAGGGGCT 1860
AAGAGCTACT ACCACCAGTA AGCCCCCTTT CCGCAGCCCA GTTCCAGACC TCTCTCCTGG 1920
GAGTGGCTGT GCTCAGGGCT GTTTCCAGGG ACCAAGTGGC CTGAGGCTCG GGGATCACCA 1980
TGGCACAGGT AAAGAAAGGG CAGGAGAATG ATTAACCTAG ACACTGGGGT TAAGAGCAGA 2040
GAGAAAGGCC TGAAGCCAGA CACTTCCAGT GCCCCCCAAC CCCCCAAGGC AGGACAAACT 2100
TGGCCTCCCA GACCCACCAC TGGGTGGAAA GTGGATGCTG AGGAACCCCC TCCACCGCCC 2160
AACGCTGGGG CCTGGACACA GCTGGCAGGG TCACGGCCTC CAGCTGCAGT GTATCTGCTC 2220
CACTCTGGGG CCATTGCCCT CAAGCTCTGA GGTGCCAGAG CCATAGGGCG GGGTCCTGAG 2280
AAGGGGCAGT TCCAACCAGG CCAGGCCTGG TCAGCAGCTG TTTCTCTTCC CCACCCCCAC 2340
GGGCAGGCAG AAGCTGATGG GCTGCGGCTG CTGGAGCTGG GAAGGCCCAC CCTAGGGACA 2400
CCCAGGGGAC CTGCCCCTGC CTTCCCTCAA ACATAAAGAA AACAGTAAGC AAGTTGCCTA 2460
CCAGGGTGAG AAGAGATATG CCCAGCTGGA AGACAGGTGT GGGGGACCCC CAGAGCTGGG 2520
GACCCCAAAG GAAGGTGACA GCTGAACAAC CTGGGGGATG GACTGGCAGG GAGCAACCTA 2580
AACCCTAGCG CTACTGCAGC TGTGAGAACA ACCCTCACCC TCACCCTGGA GTTACAATAG 2640
GCGGGAAACG GGGAGGGGCC ACGCAAGGCA CTCGGCCCCA CCCAGACCCT GGGCTGGAAG 2700