EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS091-00804 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HepG2 
Coordinate
chr1:23868620-23874800 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:23869253-23869265GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23869553-23869565GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23869557-23869569GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23868960-23868972GTATGTTTGTTT+6.37
HNF1AMA0046.2chr1:23873912-23873927AGTTAATCATTAGCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr1:23873912-23873927AGTTAATCATTAGCC+6.3
HNF1BMA0153.2chr1:23873913-23873926GTTAATCATTAGC+6.17
HNF1BMA0153.2chr1:23873913-23873926GTTAATCATTAGC-6.32
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:23872041-23872052AGCCACTCAAG+6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:23868711-23868726TGAACTCCTGACCTT-6.04
Nr5a2MA0505.1chr1:23870573-23870588GAGTTCAAGGCCAGT+7.4
RFX1MA0509.2chr1:23871770-23871786GGTTTCCATGGTTACA-6.18
RFX1MA0509.2chr1:23871770-23871786GGTTTCCATGGTTACA+6.21
RFX2MA0600.2chr1:23871770-23871786GGTTTCCATGGTTACA+6.26
RFX2MA0600.2chr1:23871770-23871786GGTTTCCATGGTTACA-6.31
ZNF263MA0528.1chr1:23870201-23870222TCCCACTCCCTCCCCTCCATC-6.17
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_05716chr1:23871014-23872275Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06239chr1:23870894-23872453Brain_Hippocampus_Middle
SE_08579chr1:23870617-23872379Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23281chr1:23871742-23872672Colon_Crypt_1
SE_23281chr1:23873073-23874061Colon_Crypt_1
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SE_24936chr1:23873133-23874408Colon_Crypt_3
SE_27884chr1:23872972-23874679Fetal_Intestine
SE_28880chr1:23872979-23874737Fetal_Intestine_Large
SE_34689chr1:23871375-23872198HeLa
SE_38016chr1:23874093-23875784HUVEC
SE_42328chr1:23873149-23873969Lung
SE_50077chr1:23871391-23872802Sigmoid_Colon
SE_50077chr1:23872971-23874587Sigmoid_Colon
SE_52549chr1:23873194-23874582Small_Intestine
SE_58372chr1:23873313-23964782Ly1
SE_66590chr1:23871745-23872404Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12387052223870897
chr12387106223871820
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I023545chr12387174323872719
GH01I023546chr12387309123874412
GH01I023544chr12387108123871691
Enhancer Sequence
TCCACCGCCA CGCCCAGCTA ATTTTTGTGG TTTTTTTTTT TTCTTTCTTT TTAGTAGAAA 60
CAGGGTTTCA CCATGTTGGC CAGGCTGGTC TTGAACTCCT GACCTTAAGT GATCCACCTG 120
CCTCAACCTC CCAACATGCT GAGATTACAG GCGTGAGCCA CCACACCCAG CCCAGATCTC 180
TTTTGAAATA AGCAAGACAT TCAGTTTTGA AATCGAGGTG GTTTTGGTGT TGGCCACAGT 240
TGGGGTGGTG GTAGATTATG CCAGCCATCT TTTGGAAGCT GACCCTGAGC CCTGCACCCC 300
ACCTCTTGTT AGGAATCTCA ATCTATCATT GTTTTTGTTT GTATGTTTGT TTGAGGCGGA 360
GTCTTGCTCT GTCACCCAGG CTTGAGTTCA GTGGCGCGAT CTCAGCTCAC TGCAAGCTCC 420
GCCTCCCAGG TTCACGCCAT TCTCCTGCCT CAGCCTCCCG AGTAGCTGGA ACTACAGGTG 480
CCCGCCACCA TGCCCAGCTA ATTTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACGGGGTT TCACCGTGTT 540
AGCCAGGATG GTCTCGATCT CCTGACTCGT GATCTGCCCG CCTCAGCCTC CCAAAGTGCT 600
GGGATTACAG GCGTGAGACA CCGCGCCCGG CCCGTTTGTT TGTTTTTGTA GAGAAGGGGT 660
TTCACCATGT TGCCCAGACT GGTCTTGAAC TGGAATCAAG TGATCTGCCT TGGCCTCCCA 720
AGGCGCTGGG ATCACAGGGG TGAGCAACCA CACCGGCCCT CTATAATCGT TTTGCAATTG 780
TAATTACAGT TGTTTTAATG TTCTTCCTCC CCACCCCACC CCCAGATTTA AGCTTCTCCT 840
TGTCTTTTTA ATTTTCACAC CCCAATATCC AGCATAGTAC CCACTGCAGA GTACAAGCAC 900
AAGAATTGCT TATTGAACTA AACTCAACAA AAGGTTTGTT TGTTTGTTTT GAGATGGAGT 960
CTTGCTCTGT CGCCCACTGG AATGCAGTGG CCCAATCTTG GCTCACTGCA ACCTCCGCCT 1020
CCCACAGGTT CAAGTGATTC TCCTGCTGCA GCCTCCCGAG TAGCTGGGAT TACAGTCACG 1080
CACCACCACA CCTGGCTAAT TTTGTATTTT TAGTAGAGAT GGGGTTTCTC CATGTTGGTC 1140
AGGCTGGTCT CAAACTCCCA ATCTCAGGTG ATCTGCCCAC CTCGGCCTCC CAAAGTGCTG 1200
GGATTACAGG CATGAGCCAC TGCGCCTGGC TAATTTGTAT TTTTAGTAGA GACAGTTTCA 1260
CCACATTGGC CAGGCTGGTC TCCAACTCCT GACCTCAGGT GATCCGCCTG CCTCGGCCTT 1320
CCAAAGTGCT GGGATTACAG GCGTGAGCCA TGCGGCCTGG CCAATGAAAG GTTTTTTGGA 1380
ATAGGTGCAA GATCACTCAC AATCCCCTTC CAAGAGACTT TCCAAGAAAG TCTCTGGCCA 1440
CTGTCAGAGT CCCTCTGTAA CTCTGCTTGG GGGGAAATGG TGAGTTGGGG GCCTTATGAG 1500
GCCAAAGAGG TAGTCACAGG AGCCAGAATT CTCACGTACC TCCTCCAGGC TCATGAAGAG 1560
AGGCACAACT CACTTTTTTC CTCCCACTCC CTCCCCTCCA TCTCTCCCTA TTCTCTCTCT 1620
TTCCTTTATT TCTCTTTTTT TAGAGATAAG AGTCTTGCTA TGTTGCCCAG GCTGGTCTTG 1680
AACTCCTATA TTCAAGCAAT CCTCCCACCT CAGCCTCCCA AAATGCTGGG ATTACAAGAG 1740
TGAGCCACCA TACCTAGCCT ATAATTCACT TTCTAACCCA CCTCCCCGCC CACTGCTCTC 1800
CCCCACGCCC TGCCCTATAC ACTGCCCCAC CCCTGTGATT ATTCCTCCCC AAACAAGCAG 1860
ATCAAAAGTG ATGCTAAGAA GTCGGGCACA GTGGCTCACT CCTATAATCC CTGCACTTTG 1920
AGAGGCCAAG GCGGGAGGAT GGCTTGAGTC CAGGAGTTCA AGGCCAGTCT AGGCTACCTG 1980
GCGAGACTCT GTCTTTACAA AAATATTTAA AAATTAGCTG GGCGTAGTGG TATATGCCTG 2040
TAGTCACAGC TCCTCAAGAG GCTGAGACTG GAGGATCTCT TGAGCCCAGG AGGTCATGGC 2100
TGCAATGAGC TGTGATTGTG TCACTGCATT CCAGCCTGGA TGACAGAGGG AAACCCTGTC 2160
TAAAAAAAAA AAAAAAAAAG CTAATAGTTG CAAAGCAAGC ACATTCATGC CCGATCTGCT 2220
TAATTATCAC AACAGCCCTA TGAGGAAGCC ACCATTAGCC CCACAGAACA GATGAAGGAA 2280
CTGAGCCCAG GAGTAGTTCG ATGATTATGC CTGAAGGACA GCTTGTGTGT CAGGGCCCTG 2340
AATTTTATTT ACTATGTGTG GGTCACCTTT CTGAAGGCTC ATAAACTTCC ACGCATATGA 2400
TCCTCATATC ATCCCCATGA GATGTGTAAT ATCATCACCC CCATTTTATA GATGAAGAAA 2460
CTGAGACTCT GAGCATTTAC GTAACTTACC CAAGGCCACA GGGCTGGTGA CAGTAGAGGT 2520
GGTTTTGAGC CAGGGCTGTC CAGGTACACC CTCTCAACCA CTTTGTCATC CTTCCTCTGG 2580
ATATTCTCTG GACACCTTGG CTTTAGCATG TGCAAGTAGG ACGACACCCC CCTCACCAAG 2640
AGGTAGTAAG GATTAGATCT AATATGTGTG TGTATCTGGA TCACAGTAAA TACCCAGGAA 2700
AAGAGGTCAT CATTTTTGTT CCTCTCTGAC AATTGCAGCA ACTGGCCGCC AGAGGGGAGT 2760
CATGCACTGA AGACCTAAGC CCTTCCCAGG TGACTGGTTG ACCATTCAAC GGTTAAGAAT 2820
TGTGCTGGGC CCTTTTATCT CTGTGCCCAA ATGTGGGATC AAGGACAGAT CTCACCAGTA 2880
CGGAACTACA AGGATCTTTT GACTCTTGCA AAAGAAATAC AGCTTAGGCC TTAAAACCCA 2940
TCTAAGGCCC CTTTACCAAC ACCAATTCTA GGACTGGGAG GGTGGGGGAG ATCCCTGTGG 3000
AGGGAGGCCC AGCTGTGTCC CATTTGGTGG TGGCAGTGCT GGGGGAGCAG CAATTATCAG 3060
TAATTCCTCT CCTGCTGGAG GCTGGGCTCC TGGAGCCACA GCTGCAAGGT GGGAGGTGGC 3120
AAGGAGGATT TTGGAATTGT CTCCCTAAGG GGTTTCCATG GTTACAGATG GATACAGGCA 3180
GCCCACTAGG CTGGGTCCTT TCTCCATATT GTCTCCTGGG GAGACAATGG GCTTTGGGGA 3240
TGGGGCGGCA TGCCACGCAG ATCATTTCTA GAGCAGGGAC CATGAGTGCC TGCTCTGTGA 3300
ACCCCTGGAC CCCAGCTGCT GGGACAGAGG GAGTTGGGCA CAGGGATCAG CCTTGGTAAC 3360
CGACTGCTTG CTTTGGGGTA CAACACTACT GCTACAGCAA CTCAAGAGAG GCTGTCCGCT 3420
GAGCCACTCA AGCAAATCTG AGGCTCCAAA ACAGCCAAAC TGCAGAGGCC TCCAGGTATT 3480
TAAAAAGCAT GCATTTTGGA GTCAGATAGT CATGTCATGA TTCTGTCCCT TGCTAGCTGT 3540
GTGACTTGGG CAAGTTATTT TACCTTCCTG AGTCCCCGTG TCCTTATCGC GAAAGTGGGA 3600
CAACACCCAC TTTATAAAAT TGGTGTGAGG AAGCAATAAG CACAAAGCCT AGTGCCAAGA 3660
AAATGCTCAG AGAGTTCCTA AGCTCAGGTG GGTTGATGGG GTCCTGGGAT GTGGGACTGG 3720
CTCTGTACCC ACTCTGTGGC CTTAGACAAG GCCCTTCTTA TTTCTGGGTC TCAGCTGCTC 3780
CATCTATGAC TTGGAGACTT TGAAAGGCTT ATAAAGGATG AAAGCTACTC AGGAGGCTGA 3840
GGTGGGAGGA TCCCTTGAGT CCTGGATCCA AGACCCGCTT GGGCAACATA GTGAGACCCG 3900
CCCTGCCTCG AAAGAAAAGG AAGTACCTGG CCAGGCGCGG TGGCTCATGT CTGTAATCCC 3960
AGCACTTTGG GAGACCGAGG TGGGCAGATC ACGAGGTCAA GAGTTTGAGA CTAGCCTGGC 4020
CAATGTGGTG AAACCCTAAC TAAAAATACA AAAAACATTA CCGGGCATGG CCAGGCGTGG 4080
TGGCTCACAC CTGTAATCCC AGCACCTTGG GAGGCCAAGG CAGGCAGATC ACAAGGTCAG 4140
GAGATCGAGA CCATCCTGGC TAACACGGTG AAATCCCGTC TGTACTAAAA ATACAAAAAA 4200
AAATAGCCAG GCGTGGTGGC AGGTGCCTGT AGTCCCAGCT ACTCGGGAGG CTGAGGCAGG 4260
AGAATGGTGT GAACCCGGGA GGCAGAGCTT GCAGTGAGTT GAGATTCCGC CACTACACTC 4320
CAGCCTAGGC AACAGAGAGA GACTCCGTTT AAAAAATAAA TAAATAAATT TCCTGGGCGT 4380
GGTGGCGGGT GCCTATAGTC CCAGCTACTC CGGATGCTGA GGCAGGAGAA TTGCTTGAAC 4440
CTGGGAGGTA GAGGTTGGAG TGAGCTGAGA TCACGCCACT GCAGTCTAGC CTGGTGACAG 4500
AGCAAGACTC TGTCTCAAAA AAAAAAAAAA AGAAAAGAAA AGTACTTGGC CGAGCACAGT 4560
GGCTCATACC TGTAATCCAA GCACTGTAGG AGGCTGAGGC AGGAGGATCA CAAGGTCAGG 4620
AGCTCAAGAC CAGCCTGGGT AACACAGCAA GACCTCCCAA TCTCTACACA TTTTTTTTTT 4680
TAAAGTAGCT GGGTATGGTG GTGTGCACCT GCAGTCTCAG ACTTAGGAGG CTGAGGTGGG 4740
AGGATCTCTT GAGCCCAGGG GTTTGAAGCT ACAGTAAGCT ATGACTGCAC CACTGCACTC 4800
CAGCCTGGGT GACAGATTGA GACCCTGTCT CAGAAAGAAA AGAGGGGAGG GAACGGGAGG 4860
TGAGGGGAGA AAAGAAAAGT GCGAGCTTGG GAAAACAGAA ATCAAAACAC TAACACAACA 4920
ACCCCATCTT CCAGGACTTA AATCCAGTTG GAATATGCAA CATGTGATCA CAGGGGCATG 4980
TGGTATTTGT GTAAGTAGAC TCTGTGCTGT GGCAATTAAG GGAGATTTTT CTGAGGGAGG 5040
CAGGACTTAA GTTAGGCCTT CGAGAGTCTC AGAATCAGGA AAATATTCCA GAAAAATCTC 5100
CCACGCTATG CCAAGGAGAA ACAGAATCCC AGAAGGGCGA AGGGACTCAG TTCTCTGCCA 5160
CTCAGTTTCA AATCCTTCCT AGTCACTGCC TTTTCCCCAA GGAAGGGTGT GTGTACGTGG 5220
GGAGGAAAGG AAGGAGTAAG CAAAAACCAT TGTCATTTAT GTCCAATTTA TGGGACACCT 5280
TTACATGAGT CAAGTTAATC ATTAGCCCCA TTTTATAGAT AAGTAAACTA AGGATTGCTC 5340
TAATTTTTAT CCAACTGATT TGGCGAAACA ACGTACATGG CCCAAGAATA AACTTTGTCT 5400
CCAGTATGGA ATACAAAACT TCCCCAAGGG AAATGTAAAA CAATTCCTTC ATGTTTAAAT 5460
CATCAGCAGA GAAAATCAAA TCGTTTACAT GTCTATTACT TGTCCTTCTA TTAAGAGGCA 5520
CTTAGCACAG AGCCTCGAAC ATGGTAAGTG TTAAGTAAAT GAAAGTTGTT GTCACTGTCA 5580
CTGCTATTAT TAAATGTATT ACTACATATT CAATGCTGGG GATACAGAGG TCAATAAAAC 5640
TCTCTCCCTG TAGTCCCAGC TACTCTGGAG GCTGACATGA GAGGATCGAC TGAGCCCTGT 5700
TGGTGGAGGT TGCAGTGAGC CGAGATGGTG TCACTGCACT ACAGCCTGGA TGACAGAGAG 5760
AGACCCTGTC TTAAAAATAA TGATAATAAT AATAAAAATA ACTCCCTTCT GTCTTTGAGA 5820
AATTCAGCCT AGTGAGAGAA AACGGGCTGC AAAAAAAATG ATCTCTTACT TCCTGGACAC 5880
ACATATACCA TCTCGTTAAA TTCTCCAAAC AACCTTGTGA GGAAGGTTTT TTCTTTCTCT 5940
CATTTTAGAA ATAAGGAAAC TGAGGTTCAG TGGGCTTCAT TGACTTGCCC AGACATTGTA 6000
AAATATGAAT AAAATATGAA ATAAAATAGT GTTAGAAGAC AAACACCTTT ATTGGATTAA 6060
CAGATACATC AAAAAGCAAT AAAGTCTATT AATTACGTAA GGCACATAGA CCATAGCCCA 6120
TTTTATTTAT TATTATTATT ATTTTTTGAG ACAAGAGTCT CACTCTGTCG CCCAGGCTGG 6180