EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS088-55311 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HeLa-S3 
Coordinate
chrX:49048220-49049720 
Target genes
Number: 40             
NameEnsembl ID
SLC38A5ENSG00000017483
PORCNENSG00000102312
TBC1D25ENSG00000068354
snoU13ENSG00000239017
RBM3ENSG00000102317
RP11ENSG00000228343
WDR13ENSG00000101940
SUV39H1ENSG00000101945
U6ENSG00000206723
GLOD5ENSG00000171433
AC115617.2ENSG00000233585
GATA1ENSG00000102145
HDAC6ENSG00000094631
ERASENSG00000187682
PCSK1NENSG00000102109
PQBP1ENSG00000102103
TIMM17BENSG00000126768
SLC35A2ENSG00000102100
PIM2ENSG00000102096
AF207550.1ENSG00000184596
OTUD5ENSG00000068308
KCND1ENSG00000102057
GRIPAP1ENSG00000068400
TFE3ENSG00000068323
CCDC120ENSG00000147144
PRAF2ENSG00000243279
U4ENSG00000206936
WDR45ENSG00000196998
GPKOWENSG00000068394
MAGIXENSG00000017621
PLP2ENSG00000102007
PRICKLE3ENSG00000012211
SYPENSG00000237341
CACNA1FENSG00000102001
HSPB1P2ENSG00000230216
CCDC22ENSG00000101997
FOXP3ENSG00000049768
PPP1R3FENSG00000049769
GAGE10ENSG00000215274
GAGE12JENSG00000224659
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chrX:49049379-49049398CAGCCAGTAGGGGGCATCC+6.14
ZfxMA0146.2chrX:49048893-49048907CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH0XI049188chrX4904479349049057
GH0XI049192chrX4904928149049450
Enhancer Sequence
CTGCAGGGAG ACAAGGCTCG GCTGTGGTAC CCCGCCCATT GCCTTGGCGG CCCTGCGTGC 60
AGGAATGAGC ATGCGGGGAA TGAATCCGTA GGCTCCGCAA GGTGGGGGTT TCTGAAACCC 120
AGACTCTCTG AGTCCCAGTG CGAGAACGTC GATGTGCAGA AAAATCACCT CTGGCGGGGT 180
GGGCGTGTTA GAAGAATTTG GAGCCCTGGG GATGCTGCGA TCTATCAGTA TTACATATAC 240
AATTATTTAC ATATTTGCAC ATATACACAT TATATACACA TTTATGCATG TTTAAAATGT 300
AAATTTGTAA TATATTCATA GTAAAATGTA AGGATACAAA CTTATTAAAT ATAGCTATAC 360
CACTAACATG CATCTAAATA AATGTAGATA AAATATATGT ATAAGTGCAC ATGTATAAGA 420
TATATGAAAC TTGCATAATT TTTTTTTTGA GATGGAGTTT CGCTCTTGTT GCCCAGGCGG 480
GAGTGCAATG GCACGATCTC GGCTCACCAC AACCTTCGCC TCCCGGGTTC AAGCAATTCT 540
CCTGCCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGATT ACAGGCATGC ACCACCACAC CAGCTAATTT 600
TGTATTTTTA GTAGAGATGG GGTTTCTCCA TGTTGGTCAG GCTGGTCTTG AACTCCCGAC 660
CTCAGGTGAT CTGCCCGCCT CGGCCTCCCA TAGTGCTGGG ATTACTGGCG TGAGCTACCG 720
CACCCGGCCA CATAAAGTAA TTTTAAGACA TAAAACACTT TCTGTACCTT TCCTTATATG 780
CCAAGCCCTC TTCTAAGAGC TTTACATGTT ATAAGCTCAC TTAAAATTCA GTTTTGGGCA 840
GGAAATACTA TCTCCATTTT ACAGTTGAGG AAACTGAGGC CCTAGAGGCT AAGTTACCTG 900
AAGTCTCACA TCCAGCAAGT GACAGGAAAG AAAAGTTGTA ATCTTAGCAT CTGTAACCCT 960
TGTATACGAC TTACCTTGTG CCAGGCCCTT TTCTGAGCAC TCCGTATTCT TAGTTCAATA 1020
AATACTCAAC TTTGGAGCAG GACCTATTAT TAGTCTTCGA TTATGCATGC TCAACTGAAC 1080
CTTGAGAGGC TGTGACTAGT TTCAGGTCAG GGAGCTTGCA AGAGGTAGAG CTGGGATTTG 1140
AGCGCAGACA GTCTGACTCC AGCCAGTAGG GGGCATCCAA GTGGGGAAAC ATTTCAAGTT 1200
TTTCCTTCAT TTTGCACATG AGGAAACTGA GGTCCCAAGA GGGTGCTGAG TTGCTTATTT 1260
TACATGTCTA GGCTGGGTCT GGGATCCAGG TCTCCCAAAC CTGTCATGTT CCCCCTTTGG 1320
GGACAGTCTG TGGTGTCACA GTGGTTACAA TTGCTAGCTC ATCCTTCAAC GTTGTTGTTG 1380
GCACGCGTTC TTCAGGGACA CCCCTTGGAT CTCCCCTGAC TCTCCTCTTA TTCTCCCACT 1440
CCACCACTCC CCATGCCGGA CTGTACTGTT TTCCACTCTC CCTCCTCCAG CCAGCACCCA 1500