EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS088-43105 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HeLa-S3 
Coordinate
chr5:132226690-132227850 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs56398801chr5132227750hg19
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:132226712-132226723TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr5:132226964-132226975TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr5:132226693-132226706AAATTAATTAATA+6.37
Lhx3MA0135.1chr5:132226706-132226719AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:132226705-132226718AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr5:132226709-132226722TAATTAATTAAAT+6
PHOX2AMA0713.1chr5:132226713-132226724TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr5:132226695-132226705ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:132226707-132226717ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:132226695-132226705ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:132226707-132226717ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr5:132226713-132226724TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr5:132226713-132226724TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr5:132226713-132226724TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
AATAAATTAA TTAATAAATT AATTAATTAA ATTAAATAAT AATTTAAAAA AGCAATAGCA 60
GGTTTCAAGA AGCAAGCACA GAGGCCTCAA ATCCTACAGT TAAAGGATGG GAAATGGAGA 120
AAAACCATCA GCAGGCAGAT GGAGAACTGG AGCAATAAAG CAGGCCAATA TAAAAGTCAA 180
GGTCCTAAGC ACCTTGTGCT AACACTAAAC TACTAAAGAA AGAGGTTGTT CAGCTAGAGA 240
AAAAGCTTTC TGTGTATTTT AATTTGAGAA GTTCTTAATT AAAATAATCT CAATTTAAAA 300
AATTTTAATT TTACCAGTTA ATAAATATAA TAGCTTTAAG GAGTCTTATT TTTCAACTCT 360
CAAACCTTTG CTTACTAAAT AATAGGTATT TTCTGATTTA AGTAAATTTG CTCCTGATCA 420
GAACAGTTTA GAAAGCAAAC AACCTGGTAA ACAAATTGAG GTTGAGTGAC TATTAAAGTA 480
CAGCCTTGAA AAAGCTCCTT TGATCCAAAT CTCCAACTAT AAACATGAAG AATACTCCCC 540
TGCATTGTGA GTATCCTAGG AATAATAATT AGAAATAATT TCAGTGCTAA CTTAGCTAAA 600
GATTTCTTTT TCTATTTCAT GAATCAAAGT CAAATGATTG CTTTGTCACT TTACGTAATA 660
TAACTTGTTT GTAAAGTATA ATTCTGAGAA ACTCAAAGCC TATTTCAAAC AATATACAAC 720
AACTCAATCT TAGCAACTAG AACCACTTAG TTCTTATTTT AAAAGCTTCC ATAACCAACT 780
TTTCCAATGA CTGGTTTCTA TCTTTTTTTT TTTTTTTTAA ATTTTAAAGT TCTTTTACAG 840
ACAGGGTCTC ACCACATTGC CCAGGCTGGA CTCAAATTCC TCAAATGATC CTTCCATCTT 900
AGCCTCCCAA ATAGCTGGGA CTACAGGTAT GAGCCACTGT ACCCAAGGGT TTTTCTTTCA 960
ATATGTATGT GACCAGCTGA CTTACCACCT TCACAGTCTT ATATCACTGT ATTCATTTAT 1020
CAGGATTATT ACATATAGAG GGTAAAAGAC ATAGGCCTAT ATATTTACTG AGATGTTACA 1080
ATAATTTCAA AGCACAGTGT CACCCTGGAA AAGTCACATG GCAAGTTGAA TGATTTTCAA 1140
AAGCCCCAGG CCCCCAACAC 1160