EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

HS088-18238

Organism

Homo sapiens

Tissue/cell

HeLa-S3

Coordinate

chr15:42037760-42039750

Target genes

Number: 16
Name	Ensembl ID

INO80	ENSG00000128908
AC012652.1	ENSG00000187446
OIP5	ENSG00000247556
NUSAP1	ENSG00000137804
RP11	ENSG00000259396
NDUFAF1	ENSG00000137806
RTF1	ENSG00000137815
RPAP1	ENSG00000103932
TCEB1P2	ENSG00000259838
TYRO3	ENSG00000092445
MGA	ENSG00000174197
MAPKBP1	ENSG00000137802
JMJD7	ENSG00000168970
PLA2G4B	ENSG00000243708
CTD	ENSG00000260556
EHD4	ENSG00000103966

TF binding sites/motifs

Number: 2

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

IRF1	MA0050.2	chr15:42039312-42039333	TTCTGCTTTTTCTTTTTGTTT	+	6
SOX10	MA0442.2	chr15:42038970-42038981	GTCTTTGTTTT	-	6.14

Enhancer Sequence

TATTTTTAAT AAAAATGTAT TTTTATTTAA AAAAAATATA TATCTATATA TAGAGAGAGA 60
CAGACAGGGT CTTGCCCTGT CATCCTGGTT GGAGTGTAGT GGCATGATCA TGGCTCCCTG 120
CAGCCTCTAC ATCTCAGGCT CAAGTGATCC TCCCATTTCA GTCTCCCGAG TAGCTGGGAT 180
CATAGGCTTG TGCCACCACA CCTGGTTAAT TTTTTTGATT TTCAGTAGAG GCGAGGTCTC 240
GCTGTGTTGT CCAGGCTGGT CTTGAACTCC TGGGCTCAAG CAGTCCTTGC ATCTTGGCCC 300
CACAAAGTGC TGGGATTACA GGCATGAGCC ACTGCATCCT GCCAGGAAAC ACTAACATTT 360
AACAAGTTTT CTAATCTTTT AAAATAAATA GACCTGACTC AGGTAACTGC TACTTAAGGA 420
AGTGTGTGTA ATTTTTTTCT CTATTTATAA AGAGGATCCC CTGTTGGCAC TTTGATATCT 480
GTGCTTTTAA AATTTGATTT TTCTCCTTTT CCTCTTTACC TTCCTTTTCC TTGCACACAG 540
TTAAGTAAAC CATCACATAT TTAATGTGTA TATTAAAGAT TGCTTTCATT CTCTGAATGT 600
TTTTGAATCA CTCTCTAAAA GTTAATTTGA AGAAAAAAGT TGAAAAATTA AGAATGCATT 660
AACATATTTG TTTCTTAATT CACGTAAGAT TAATATGGCT GGGCACAGTG GCTGACGCCT 720
GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCTGAGGAG GATGGATCAC CTGAGGTCAG GAGTTTAAGA 780
CCAGCCTGGC CAACATGGTG AAACCCTGTC TCTACTAAAA ATACAAAAAA AATTAGCCGG 840
ATGTGGTGGT TGCATGCCTG TAATCCTAGG TACTCTGGAG GCTGAGGCAG GAGAATCGCT 900
TGAACCCGGG AGGCGGAGGT TTCAGTGAGC CGAGATCTTG CCATTGCACT CCAGCCTGGG 960
CAACAGAGCG AGACTTCGTC TCAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAGGTAG ATGAATATTT 1020
TTTGTTTAAA TTGCACATGA TTATTTTCAT GAACAGTTTG GTTTTGTGTT TTATTTAATT 1080
TTTAAGAGTA GTCTTGGATT TTCTATATAA TTTTTCATCT AAATGTTATG ACCATGACTT 1140
TCTTTTTGAA ATTTGATATT TTTTTGTGTG GGCAGAGTGC CTGTTTGATA GAGAATCACG 1200
TTAAGCTAAA GTCTTTGTTT TGTTTCATTT GTTTGATTTT TTTTTCTCTT CAGTAGCAGA 1260
CTTTTTAAGT TTTATTTATT AATGTTAAAT AAGCCTACCA ATTTTTATTT ATTAATGTTA 1320
AATAAGCTCA CCAATTTGAA TAGTAATGTT AGACCAGTTT CATTTATGCT TACTATTACC 1380
ATGATTCCTA CCTCTTTATC TCTTTGATCT AAAAAAAAAA ATCTAGATTA CTCATACTGT 1440
TTTTTCCTAT GTCTTTAGTA TTTCGAAATA TGTCTTCCAA TCAGGAAAGG GCATCTTTAA 1500
AGTACTATTA ATGGTTTGAA ATCTCTATTA ATTCACATCT TCTGCATTAA ATTTCTGCTT 1560
TTTCTTTTTG TTTTAAAAAC ATCTTTTGCC TCTTCTAAGC CAGGTTTATT TCCCTGCTTC 1620
TTTGATGTCT CTTAATTTCA TTCCATTTTG GGGGGCTTAA GTAATTTTTT CCTTCTGAAA 1680
AATAATTCCC ACAAACCTTT AAGCTTTGCA TATTTGTTAG TGAATTTTAA AAACCAAAAG 1740
CCCTTTATAA ACCAAGGATT TTTAGTTCTT TATCTTCCTC AGGTGGTATA AGCTTAGAAA 1800
TTGACCCATA ACTCTAGTAA GTGTTATGAG CTTTAATTTT AAAGTTAAAT TGTGCAGAAT 1860
CTGGATTTTA TTTAAAAACA TAAGAGGCCA GGCACATTGG CTCATACCTA TAATCCCAAC 1920
ATTTTAGGAG GCCAAGGCAG GAGGATTGCT TGAGCCCCAG GGGTTCCAGA CCAGCCTGGG 1980
CAACATAGCA 1990