EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS088-03902 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HeLa-S3 
Coordinate
chr1:156505040-156506970 
Target genes
Number: 49             
NameEnsembl ID
RIT1ENSG00000143622
SNORA42ENSG00000207475
SCARNA4ENSG00000252808
KIAA0907ENSG00000132680
ARHGEF2ENSG00000116584
SSR2ENSG00000163479
UBQLN4ENSG00000160803
LAMTOR2ENSG00000116586
AL355388.1ENSG00000222611
MEX3AENSG00000254726
LMNAENSG00000160789
SEMA4AENSG00000196189
SLC25A44ENSG00000160785
RP11ENSG00000260238
PMF1ENSG00000160783
BGLAPENSG00000242252
PAQR6ENSG00000160781
SMG5ENSG00000198952
TMEM79ENSG00000163472
C1orf85ENSG00000198715
VHLLENSG00000189030
AL589685.1ENSG00000228155
C1orf182ENSG00000163467
CCT3ENSG00000163468
RHBGENSG00000132677
C1orf61ENSG00000125462
YENSG00000206651
MEF2DENSG00000116604
IQGAP3ENSG00000183856
TTC24ENSG00000187862
APOA1BPENSG00000163382
GPATCH4ENSG00000160818
HAPLN2ENSG00000132702
BCANENSG00000132692
NESENSG00000132688
CRABP2ENSG00000143320
RRNAD1ENSG00000143303
ISG20L2ENSG00000143319
MRPL24ENSG00000143314
PRCCENSG00000143294
HDGFENSG00000143321
NTRK1ENSG00000198400
SH2D2AENSG00000027869
INSRRENSG00000027644
PEAR1ENSG00000187800
LRRC71ENSG00000160838
MIR765ENSG00000211581
ARHGEF11ENSG00000132694
ETV3ENSG00000117036
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156506865-156506883CCTCCCTGCCTTCCTCCC-7.12
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:156505105-156505116CTTGAGTGCCT-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:156506268-156506289GGAGAAGGGGAGAGAGGATGG+6.37
ZNF263MA0528.1chr1:156506861-156506882TCTCCCTCCCTGCCTTCCTCC-7.1
Enhancer Sequence
TGGGGACAAA GAAACAGGTG CGCGTGGCTG TGCCTCTGCC CATCTCTCTC TGCCAGAGAT 60
AAGAGCTTGA GTGCCTGGCT GTCTCTTCTC CCCCAGGCTC AGCCACTCCA GAGTAGAGCT 120
CAAGCACTGT CCCTCCACTA GCCATAGCCA GCTCCCTGCT GCCTTCCTCC AAACGTCTCT 180
GGGCCTTGTC CCTTCCTCCT GCCTTATGTC AGTAGTCAGG ACCAGGGCCC TATCATCTAC 240
TAAATCTCTC ACACAGCCTC CAACCTGGCT CGAGAACCTC TTCTTTGAGA CTCTCTGGGT 300
CCCCTGCAGA GCACCCCAGC TCACCATAGC CATCCCCCAT CCCCCAGAGG CACCATTAAC 360
CTAAAGCTTG GGTATCTGAC ACTCACAGCC AAAACCCTGT CCTAGGACAG CCTAGGTGGC 420
TCCGAGGTAG TCAACCTTGT CAGCTGTCAC AGAGCATCTG TGAGTGGCCT AGTCTGGGCT 480
AGAGGTAGGG CCCCAAGGAG ATCAGTGAGC CGGGAGGAGA AGCTCCAGTT TGGACTCCAC 540
CACCAACCAG AGATATTATC TTAGACTATT TCCTTCTCCT TTGTAAGTCT GTCCCCTGGT 600
CTAGAAAATG GGAATGATCA TTCTTGCCTT CTCTTCTCAC AGGGCTTTTT GAGGATCAAG 660
TGAAATTATG TCTGCGAGAG TAACGTATAA TGGTAGAGTA CTATTCAAAT GTGCTAGACT 720
GTATTATCAT TATTATTCCT ATTATGGATG TGCCACCTAC AAATGTAATT AAATTCATTT 780
AAAAGCAATT TCCACTCCTA GGGTACCAGA GACAGAAGTT TACAGCTCAT TGTGTACTTT 840
ACTTTCTTAA GCCTAGAACA ATCTTTTCTT ACTCCTAATT GTAAACTCTT AATCCGGTTC 900
TCCAGGTTTG GGGAGCAGGG TTATAAACTC TGTGGGTTCC CCCTTTCAAC ATCCTCATCT 960
TGCCCTGGGC ATTCCAGCCT GGGCAATGGA GTGAGACCCT GTCTTAAAAA TAATAATAAT 1020
AAAAAATAAA GAAAAACAAA CAAAAAAAGA ATGAAAGCCT GTCATTTTCG ACAACATAGA 1080
TGAACGTAGA GGTTCGTGTT AAGTGACATA CATAAGCCAA ACACAGAAGG ACAAATACTG 1140
CATAATCTCA CTCATATGTG GAATCTTAAA AAGGTGATTT CACAGGAGTA GAGAGTAGAA 1200
TGGTGGTTAC CGGAGTCTGG GGAGGGTAGG AGAAGGGGAG AGAGGATGGG GAGAGGTTGG 1260
TCAATGGGTA CAAAGTTACA TCCAGGTAGA AAGAATAAGT TCTGGTGCTC TATTGCACAG 1320
AAGGTGACTA TAGTTGATAA TAATGTGTTG TATATCTCAA AATAGCTAGA AGGATTTTGA 1380
ATGTTCTCAC CAAAAAGAAA TAAATGTTTG AGGTAATAGA TATGCTAATT ACCCTGATTT 1440
GATCATTCAT TGCACAATGT ATACACGTAT CAAAACATCA CACTATACCC TATGAATATG 1500
TACAATTATC ATGTGTCAAA AATAAATGTA GAAAACCAAA CGTATTGACT AAATTTTAAG 1560
AAAAGAGAGA ACTATAAAGT ACTTTATGGG CTTAAAATAT TTATTTTTGA TATTGGGAAC 1620
TGAAGAGTCC CATTTTCTCC TCATTTGCTC TTAGCTAATA AAGTGTCCCT GAGATCATTT 1680
TAGGGTCCCT CCTCTGGTTC CACTGACATC CTACCAGGCC ACACACAGAC TTGCACGCCG 1740
TCTCTCAGCT CAGCTCTCTA GCAGGAGCTT CGAGCATTCC CCACATCTCT TCAGGAACCC 1800
CTCTGAGTAC CCCTGGCTCC ATCTCCCTCC CTGCCTTCCT CCCTGCAGGA CTATCACCCT 1860
GCTCTGCTCC CCATGGTGGC CTGGCCCTCT TGAAATCCCA TGCGTAGGCT GGGGTGGGGC 1920
TGTTGCACAT 1930