EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS088-02506 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HeLa-S3 
Coordinate
chr1:68230700-68234320 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF1MA0154.3chr1:68232613-68232627ATTCCCAAGGGAGA+6.01
MAFFMA0495.3chr1:68234022-68234037ATGCTGCCTCAGCAG+6.21
MAFFMA0495.3chr1:68234022-68234037ATGCTGCCTCAGCAG-6.28
MNX1MA0707.1chr1:68231184-68231194GGTAATTAAA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01639chr1:68231788-68233341Aorta
SE_02387chr1:68231252-68233181Astrocytes
SE_26044chr1:68230798-68232693Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27197chr1:68231897-68233185Esophagus
SE_27725chr1:68228443-68233742Fetal_Intestine
SE_28951chr1:68228594-68234008Fetal_Intestine_Large
SE_35889chr1:68231129-68232944HMEC
SE_37082chr1:68231110-68233128HSMMtube
SE_38054chr1:68231498-68233410HUVEC
SE_45739chr1:68230855-68233520Osteoblasts
SE_51814chr1:68231429-68232933Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52904chr1:68231876-68233183Small_Intestine
SE_63615chr1:68231217-68233012HSMM
SE_64410chr1:68231252-68233084NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr16823180268232715
chr16823276768233209
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I067763chr16822885268233518
Enhancer Sequence
AATTATTTCC TTGCATGAGA TGAAAAATTA GACAAAATAT ATAAGAATAC ATAAAAATTA 60
AAGTAGACAA AATATATAAG AATATTATCA ATAGTCATTA GATGCCCCTG TCAAGCACTG 120
AAAAAATAAC TTATAATAAT CTATAAAATG TATGCACACT CTTTTCTTTT CACATCCTTC 180
TAAGGGAAAC AGCCCCCAGT AGGCGATTAA GCTGATGCAC GAGTAACGAT CTCTTAACAA 240
TGCCATGCCA TCAAATACTG AAGTACAGTT CAGTGTTTCT AAGAGCAGAG AAAGAAAAAA 300
AACATTAAAA TTATTACTAA TATAAACACT ATGATTGTAT ATTGCACTTG AGGGATGAAG 360
ATCTAGAACA ATGAAGATGA TAAACATATT TACCTACAGA CAAAAGATGG TAGATAAGAT 420
TTTTATTATA AAGGCTTTGT TTATAAAGGG AACACATTAG AAGCTAAGTA ATTGGGTCAG 480
ATTTGGTAAT TAAAAGCAGC TGAATAATCA ACAAACGCTT AACAAAGGTG TTAGAACAAG 540
ATCATATTTT AACAGAAGAT GAAATACATA GAAAGGTTTG TATATTTCAA CCCTTATTCT 600
TCTGCCTGTT TTGCATTTTT CTTTTAAAAA TACACAAAAA GTATAGGAAG CAGTAGTGAA 660
ATAACTACTA CCTAGTCAAC CTGTGACTGA ATCTGGCAGT TGTTAGTAGC AGGTGTAAAT 720
GAAACGATGC GAATAAACTA GCAGGACTAA ATCAAAAAGA TTTCAATGTG GGTGACATAG 780
CTAAAGTCTA TAATTTAGGA TCTCTAATAC ATATCCAGTT TGTGGTTGAA AATTCCTGCT 840
TTCTAGTGGG CTTTACGTCT GCCACAACCC CAAGGAGTGA AAGGAAACTC AAGACTAACA 900
ATGATTTGTT GTAACTAGAC GTAGTGGTGA AAATCTGGCC AAAAAAAAGT CCACTATAAA 960
TGTAACAGCT GTGAGCCTTA AGCCTGGTGG CATTTAAACC ATTTTATTCT TTATAGCTAT 1020
AAGAGTATTC AACCCTAAGT TTACAATAAT ATCTCAAGGC AAAAACTCAA ACAAAACAAG 1080
GCACACACGC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACCCCTAAAC 1140
AATGCCCTCA TAGACAAGCC CCTTTCAAAG TCCCACCTAA TTACAGGCTG ACAATCTTTC 1200
CAAATTATCA ATCAGAACAA TAAAAATGCC CTTGAGGGCT CATTTTAAAC AATTCTCTGG 1260
TCCTCCTCTA GGGGGCGAAG TTGGCTCGCA TTTCACCGAA AGGGGAAATT ATTTTCAAAC 1320
CCTGATTTTC GCACAGTGCT AGAAAGATAT TCACATACAA AGGGGTCTTT CCGCGCTCCT 1380
GCTTCTTCTC AATACATTTC ACTTCGGCTG ATGAGCAAAG CAGCCCAGCC CTTCGGCACA 1440
GTAAGAGGGA GGGAATGTGA TTACGGCGGA GCATAAGCAG GGCTTAATCA GCACAACCCT 1500
GAAGGCCGGC CAGCTCATTC TCCTCAAACT TGAGATCACA GCTATGGTTT TGCCAAAGAT 1560
GATACACTTT CAAGAATATA TGTTGGTGTT TTTTTTTTTT TTTTCCAGGA GAATTTTCCA 1620
CTGGGGAAAT TCTGAAGCCA GGTGAAGCCT CACACGGGGC TCCCTCCCAC CCGGTCTCCT 1680
CTGTAGGGCC TCCCTCTGAG AAACCACAAA GCAAGCTGCT GGAGGTCTGA GTGCCTGCCC 1740
TCCCTTCCTG CACAAACGGG GCCCTTTCTA CCCTGAGGAT GGCATCTGGT GGTCAGGAAG 1800
ATGCCTGGAC AGCAGTTCCT CGCTGGGCCT CGCTTCCCCC TCACGGAAAG GGTTAGGTGT 1860
CCTCTTAGGG AATGCAGGTC TAGCTACAGA AGGGGCATAC ACAGGCAATG CCTATTCCCA 1920
AGGGAGAATC AAATGTGAGT TTTAGCACCC TAGCAACCAT ACAAGGCAGA AGGCTCAGAG 1980
TGTGTGTGTC CCTGACCCAT GGATAGATCG TTTTTGTGGG TTCTAAGCCT TATACAATTT 2040
TGGGGGTCCT CTTTAGAAAA ATCATACAAA ATTAGGAATA TCACATTAGC TACAGGGCAT 2100
TGGAATGGGA TGTTGCCAGT GAAAGATCCT GAACCTTAGG GCTCTTTAAC TGCTGGGCCA 2160
TGCAGTTATC TTGTCCAGCC TGCCACCACT GGACTCTCCC CTGCAGTAAA ACCCCATGTC 2220
ACGTGTGCTG GCTCTGGGTC TCTTCTTGGC CTCTTGAACA TGGTGCCATC TCTAATGAGA 2280
CTGACAGGGG TTCAGCACGA CAGGGCCTGA GCTCCTCCCG CTTAGGACTG TCCATTGCCT 2340
GGAGACAGAT ACCGAGGTGG AGCTATTGAA AGAAACACTT GCGCTGCCCT GTGAAAGGGA 2400
ACAAACTCCT CTGCCACGGG TCAGCTCTCC ACACCTACCT GACCAAGTCT CAGTAACCAG 2460
TTTGGGTCAT CTCACTAGTT CAGACTCTGC CTCCTCCTCC TTTTCCACCC ATGGGAAGGT 2520
TATGCAACCC TCCTTCCAGA CCTCCTTGGG CTGCACAAAG GTGCCAACTA TACTAGTCTT 2580
TACTGAAAGA CAGCAAAATA AAGTGACCTC AATTGAGAGC ATTTATCTAA ACATAGTTTG 2640
TTTGCATATT TTCAGTCCTT GTAAAAATAA TACACAATTT TCTCCTTATC TGATGGCAAT 2700
ATCACTTACC TAAATCTTAA CAATAAAATG AGGCAAGGCC TAAAAAAATA GAAAGTTAAG 2760
TTTAGTTGAT GTAGCTTGTT TTCACATGTG CTACAGTTTG GAATTTATAA GCAAACCAGA 2820
TATAAATTTT CTTCTTTTTG AACAAAACAG TAAGAACAAC TTCTTACATA TAGAAATGTC 2880
TTCATAAAAT CCATTTATCA CAAAAAACAG TGTTCTGCAA ATTTGATTTA AAAGCTTTTT 2940
TTGGAGATGG GCTCTTGCTA CGTTGCGGAG GCTGGACTCG AATTCTTAGG CTCAAGGGAA 3000
TCCTTGGCTT CAGCCTACCA ATGAGCTGGG ACTATAGGCA CATGCCACTG TGCTTGGTCT 3060
TCTGCAAATT CTTATTTGTA AAACGGAATG TGCTGGGAAA ATAACAGCCA CCATTATTTG 3120
CATCCTGTGA ACCACACATA GTCTAAACAT TTCATATAGA CTATTTCACT TAATCACCTC 3180
AATAACCCTA TGCAGTATTA TCCCTATTTT ATTGATGCAG AAATTGAGGC TTTAAGAGGT 3240
AAGCGACTTG TCCAAGGTTA CAAAGGTATT TTGTATAGAT TTGAGGCTGG GCAGGTTGAG 3300
CCTTATTGTT AGTCCCTGTG CCATGCTGCC TCAGCAGCCA AAAATCACTT TTGATACTAT 3360
AAAGAACTAG TGAGTTTCAC AAGATAGTTA TTTTTTAAAA GCAGATCATT GCACATATTT 3420
AGATTTTTTC CCAAATTCCT ATTTGATTAA AAAAAAACAG GCTGAGGAAT GGGGCTAGTT 3480
TTTTCCAAGG CTTTAAAGGT TTTTAGAAAT CATCATAATA GTTAAATGCA AACAATGTAA 3540
TAGCTACCAT TTATTGAACA TGTATTATGT GATGGGCCAC TGGCTAAGTT CACTATGTGC 3600
AGTGTTTCCT TTAATATAGC 3620