EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS088-01252 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HeLa-S3 
Coordinate
chr1:28246320-28250700 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:28248989-28249005CTTTATTTACTTAATC-6.84
Foxd3MA0041.1chr1:28247676-28247688AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:28247680-28247692AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:28247684-28247696AAACAAACAAAC-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:28247128-28247143GAGGTCAGAAGTTCA+6.38
Nr2f6MA0677.1chr1:28248973-28248987AGGGTCAAAGGTCC+6.16
POU4F2MA0683.1chr1:28248147-28248163TTAATTAAATATGCTT-6.34
RARAMA0729.1chr1:28247128-28247146GAGGTCAGAAGTTCAAGA+6.88
RxraMA0512.2chr1:28248973-28248987AGGGTCAAAGGTCC+6.22
TFAP2AMA0003.3chr1:28246578-28246589AGCCTCAGGCA+6.32
ZfxMA0146.2chr1:28247849-28247863GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12824855428248604
chr12824637728246700
Enhancer Sequence
CAGGCGTGAG CCACCATGCT CGCCCAACTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGAGGGAGT 60
CTCCTTCTGT CGAGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGCATAAT CTCAGCTCAC TGCAACCTCT 120
CTCTCCTGGA TGCAAGCAAT TATCCTGGCC CAGTCTCCCA AGTAGTTGGG ATTACAGGTG 180
GCTGCCACCA CGCCCGGCTA ATTTTTTGTA TTTTTAGTAG ACACGGGGTT CCACCACATT 240
GGCTGGTCTC ACACCCCCAG CCTCAGGCAA TCCACCCGCT TTGGCCTCCC AAAGTGCTGG 300
GATTACAGGT GTGACCCACC ACACCTGGCC TGGGGTGATT TTTTAAAATA GTTTTCAATG 360
TTAAACACAT GTGATTTTCC AAAAATTTTT TTGGTCTAAG GTAATTTTAC TAGATGGAGT 420
TTTAGCTGTT TTCAGTTTTA AATTACACTG ATTATTTCTA CCAGTAATAC TCATTATGAA 480
TGGATAATAC TGATAGAATT ACTTTCAATA TCAGAGAGTG GAGCAGAACA TTTCATTCAC 540
AACTACATTT GTTCCTCAGT ATACAGAAGG GATCAGTTCC AGGACCCCCA GTATACCAAA 600
ATCTGCCCAT ACTCAAGTCC CATAGTTGGC CCTGTGGAAC CTGCTAATAT GCAAAGTCAG 660
CCCTCCTATA CTAGGTTTCG TGTTCTGAAA ATACTATATT TTCAATCTGC AATTGGTTGA 720
AAAAAATCCG TAAAAGTGGG CTGGGGCTGG GAATGGTGGC TCATGCCTAT AATCCCAGCA 780
CTTTGGGAGG CTGAGATAGG TGCATCATGA GGTCAGAAGT TCAAGACCAG CCTGGCCAAC 840
ATGGTGAAAC CTCGTCTCTA CTAAAAATAC AAAAAATTAG CCAGACGTGG TGGTGGACAC 900
CTGTAATCCC AGCTACTCCG GAGGCTGAGG CAGGAGAATT GCTTGAACCC AGGAGGCAGA 960
GGTTGCAGTG AGCAGAGATC CTGTCATTAC ACTCCAGCCT GGGCAACAGA GCAAGACTCT 1020
GTCTCAAAAA AAAAAAAAAA AGATAATAAT AATAATAATA AGTGGGCCAG GCGCGATGGC 1080
TCGTGCCTGT AATCCCAGCA TTTTGGGAAG CTGAGGCTGG CGGATCACTT GGGGTCAGGG 1140
GCTTGAAACC AGCCTGGCCA ACATGGTGAA ACCCTGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAAGAT 1200
TAGCCGGGCG TGGTGGTGGG CGCCTGTAAT CCCAGCTACT TTGGAGGCTG AGGCAGGAGA 1260
ATTGCTTGAA CCCAGGAGGC AGAGGTTGCA GTGAGCTGAG ATTTCGCCAC CGTACTCCAG 1320
CCTGGGTGAC AGAGAGAGAC TCCATCTCAA AAACACAAAC AAACAAACAA ACAAACAAAA 1380
CCCATATAAG TGGACCTGTG CAGTTCAAAC CTGTGTTGTT CAAGGGTCAA CTTATTGTTC 1440
AATGCTAAAT TTATTAAACT CTAATAGCTA ATAAAACTTG AAATCAAGGC CGGGCGCGGT 1500
GGCTCACGCC TGTAATCCCA GCACTTTGGG AGGCCGAGGC GGGTGGATCA TGAGGTCAGG 1560
AGATCGAGAC CATCCTGGCT AACAAGGTGA AACCCCGTCT CTACTAAAAA TACAAAAAAT 1620
TAGCCGGGCG CGGTGGCGGG CGCCTGTAGT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA 1680
ATGGCGTGAA CCCGGGAAGC GGAGCTTGCA GTGAGCCGAG ATTGCGCCAC TGCAGTCCGC 1740
AGTCCGGCCT GGGCGACAGA GCGAGACTCC GTCTCAAAAA AAAAAAAAGA AATCAAACCT 1800
TTGGGTATTT AAACATTGTT TACACATTTA ATTAAATATG CTTAAAATTT TAAAGTGCAA 1860
TTAAAGTTTT AGGATGGCTG ATTCTTATAA ATACTTCAGA TATCTTAAAG AGCAGACAAA 1920
ACATACAGAA ACAATGGTTT ACTGGGAAGC TGGTGAGGTT TAAGCTTCAG GGCCCCTCAC 1980
TTGCACAGCC TCTTCCAAGG GTCTACATTC ATACTTACTT TTGTATCTTA CTTTGCATTC 2040
TTTTTCTTAA AGAAAGCCAC CCAAATTATG TAAGCTTCTG GCCACACAAA ATCTAGATCC 2100
TCATGTCCCA TACTTCTTTG GATCCTTGCT TTATTTATTT TGTTATCCTC CTAAGGCTTC 2160
TGTACCATTA TTTATTTATT TATTTTGAGA CAGAATATCA CTCAGTTACC CAGGCTGGAG 2220
GTGCAGTGGC AGAATCTCAG CTCACTGCAG CCTCAGCTTC GCAGTCTCAA GCCATCCTCC 2280
CACCTCAACC TCCCAAGTAG TTAGGACAAC AGGTGTGCAC CACCATGCCC AGCTAATTTT 2340
TATAACTTTT TTGTAGAGAT GGGATTTCAC CATGTTGCCC AGGGTGGTCT GGGACTTCTG 2400
GGCTCAAGCA ATCCGCCCAC CTTGGCCTCC CAAAGGGCTG GAATTACAGG CGTGAGCCAC 2460
CACGCCTGTC TGAAAATACT TATTTTTTAA GGTTAGACGT TTACATTTCT TTTTCCAGTT 2520
CAACATAGCA TGTTGCTATA CTTTATATTT GTCACAATGA CAGATGAATT GTGGGTGTTT 2580
TCTAAGATCT TGGAGTAAAG ATCATTACAC TGGAAAAGGC ATGGGATCTG GGTGTGCCTC 2640
TGGCAAAAAG GGTAGGGTCA AAGGTCCTGC TTTATTTACT TAATCTTCAT GATCACCAAA 2700
TGAGGGAAGC AGTATGTCAT CCGCATTTTA CAGGTAAGGA AACTGCCCCC CAACCTCTTC 2760
CACATACAGC CACAAGTAGA AAATAATGTT TGCATGGTAC ATTGGATTAA ACACAAGACA 2820
CTGGCTGGGG CCAAAGGTAC AAGGTGACCA TTAGTCCTGG TTTGCCCAGG ACTTCCCCAG 2880
TTTTGTTTTG TTTTTTTTTT TGAGACAGAG TCTTGCTCTG TTGCCCAGGC TGGAGTGCAG 2940
TGGCGCCATC TTGGCTCAGT GTAAGCACCG CCTCCCAGGT TCACACCATC CTCCTTCCTC 3000
AGCCTCCTGA GTAGCTGGGA CTATAGGTGC CCGCCACCAC GCCCGGCTAA TTTTTTGTAT 3060
TTTTAGTAGA GACAGGGTTT CACCGTGTTA GCCAGGATGG TCTCGATCTC CTGACCTTGT 3120
GATCCGCCCA CCTCAGCCTC CCAAAGTGCT GGGATTACAG GCGTGAGCCA CAGTGCCCAG 3180
CCAACTTTCC CAGTTTTTAA GTGAAAGTCC CAAGTCCCAT ATTCCAGAAG CCTCCTCACC 3240
ACCCAGTCCC AGTTGAACTA AGACGGTTAG TTACCCTGGT CGGGGGTTTC TGGCTGACCT 3300
ATGGATGAAT GTCTTACTGT TCCTGTAACC TTTGGGTGCT GTAATGGTGT GCCTGACCAC 3360
TCTGGTGAGA CTGTCATCAG CCTAAGGTCA CAGAGCTAGT AGAGGGAGGA GCTGGAGTTG 3420
AACCCAGTTC TGTGTGACTC CTGAGCCCAA CTCTTTTTAG AGACGAGGTT TTGCTGTGTT 3480
GCCTAGGCTG GTCTTGACAC CTGGCCTCAA GTGATCTGCC AGCCTTGGCC TCCCAGAGTG 3540
CTAGGATTAC AGGTGTGAGC CACTGTGCCC AGCCACTATG TATAATTTTA AAGAGTACTC 3600
TAGGAAGAGG TGTACCCAGG AGGACAGATG GTAAGAGAGA CACCTACAAA GAAGTGACAG 3660
TGCCCAATCT AAATGTCATG CTAAGAACTT AGGATTTTTT TTACCATTTG ACCCAGCCAT 3720
CCCATTACTG GGTATATACC CAAAGGATTA TAAATCATAC TGCTATAAAG ACACATGCAC 3780
ACGTATGTTT ATTGCGGCAC TATTCACAGT AGCAAAGACT TGGAACCAAC CCAGATGTCC 3840
AACAATGATA GACTGGATTA AGAAAATGTG GCATATATAC ACCATGGAAT ACTGTGCAGC 3900
CATAAAAAAT GATGAGTTCA TGTCCTTTGT AGGGACATGG ATGAAGCTGG AAACCATCAT 3960
TCTCAGCAAA CTTGCAAGGA CAAAAAAACC AAACACTGCA TGTTCTCACT CATAGGTGGG 4020
ACTTGAACAA TGAGAACACA TGGACACAGG AAGGGGTACA TCACACACCG GGGACTGTTG 4080
TGGGGTGAGG GGAGGTGGGA GGGATAGTAT TAGGAGATAT ACCTAATGCT AAATGATGAG 4140
TTAATGGGTG CAGCACACCA ACATGGCACA TGTATACATA TGTAACAAAC CTGCACGTTG 4200
TGCACATGTA CCCTAAAACT TAAAGTATAA AAAAAAAAAC TATATGGTCT TAGAGAGTCA 4260
AGTTAAATAA ATTTGAAAAA ACTGCATTAT TAAAGATTCA CTATTCATTT TTGCATAAGA 4320
GCTATAAGAT GTTTATGCAA AATATAGCAA TAATTTGTTT AATGCATAAT ATCTTTGTTC 4380