EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS086-01047 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HEK293 
Coordinate
chr1:156455620-156458050 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:156455632-156455653TTTGACTTTTTTTTTCTTTTT+6.07
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 49             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457206-156457660Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1156456600156457200
chr1156455896156455956
chr1156456267156456663
Enhancer Sequence
CAAGCTAATT TTTTTGACTT TTTTTTTCTT TTTTTTTGTG AGACAGAGTC TCACTCTGTC 60
ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGTGATCTT GGCTCACCGC AACCTCTGCC TCCCGGGTTC 120
AAGCGATTCT CCTGCCTCGG CCTCCCAAGT AGCTGGGATT ACAGGTGTCT GCCACCACAC 180
CTGGCTAACT TTTGTATTTT CAGTACAGAC AGGATTTCAC CATGTTGGAC AGGTTGGTCT 240
CGAACTCCTG ACCTTGTGAT CCACCCACCT CGACCTCGTG CTCCATGGGC CCTGGGCCTC 300
CTACTGGTAC CCTGGGACAA GAGCAACACC AGCCCAGCCA GCCCTGAGTG GCCCAGCAGA 360
CACCTGAGCC CCAAACCAGC TCCAGACACC CCATTCCTCA CCTGTGACCC CAGTGTCTGC 420
CAAGTTCCCA TTGCAAAGGC TCCAGCCCAG GGATTTCAGC TCCCCTGCTT CCCAGTGCAA 480
TCCAAAGACT GTGCTTTCTA GAGCTACAGT GGTGTGGGCT TTGGCAGGGA AGGTAGGGGA 540
GGGCACACAG AGGGCAAGGG GAGGGGGCTA CAAATAGTTG GCTTTTTAAA TGGGATTCTC 600
TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT GTTAAATGCA GGAACTGCTG AGCTCCTCTG 660
GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC TTTACTATCT CCCTCTCACC ACCTTTAGTT 720
CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT CTGTCAGCTG ATGACCAATA CTGCCTCTTC 780
CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT TCTCATGACC CTCAGAAAAG TCATTCTTGC 840
AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA TAACTATGAT TCTGTGCTTC TATTTAACGC 900
CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG AGGGCAGGAA TCACATCTGT CTTTTTCACT 960
ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA AAATGTCTGT TGAAAAGAAG AAAATACTAT 1020
TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT CTTGCAGTCT AACCTCCAAC AGTCTTGCTG 1080
CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA TGGAGCTAGA ACCCTTGCTC TCCCAACTGC 1140
CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC AACCACCCCT GGTATCCCAG TCCTCAACCC 1200
TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG GTGAGACTCT AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC 1260
CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG TTGCTTAGGC AACTGTCGCC TGGCAACCAG 1320
CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC CCACCCCCGC CTCATGCTGG GGGAGCTGGG 1380
ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG GGAAGCAACA GAGATTCACT GAGCATCGTC 1440
TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT AGGCCCCATC TATCCCCACT CCCTACCAAG 1500
GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG CTTCCCAGGC CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC 1560
CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG AGATGCCCCT GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC 1620
CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA GATGCAGTCT ATACTGACCT TTTTTCCTTC 1680
TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA ACATGAACTC 1740
AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA GGCACAAAAT ACCCTAACCT 1800
GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT AGCTAAACTT CCCTCCTACC CAATTAGGGA 1860
GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG CCTAATTACC TAACCAACTG 1920
GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA 1980
CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT 2040
CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC 2100
CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC 2160
TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG 2220
GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA 2280
TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG 2340
GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA 2400
AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC 2430