EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS084-00378 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HCT116 
Coordinate
chr1:156456010-156460300 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 78             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457206-156457660Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156458577-156459023Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156459107-156459811Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156459756-156461387NHLF
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156456600156457200
chr1156456267156456663
chr1156458442156458923
Enhancer Sequence
CCATTCCTCA CCTGTGACCC CAGTGTCTGC CAAGTTCCCA TTGCAAAGGC TCCAGCCCAG 60
GGATTTCAGC TCCCCTGCTT CCCAGTGCAA TCCAAAGACT GTGCTTTCTA GAGCTACAGT 120
GGTGTGGGCT TTGGCAGGGA AGGTAGGGGA GGGCACACAG AGGGCAAGGG GAGGGGGCTA 180
CAAATAGTTG GCTTTTTAAA TGGGATTCTC TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT 240
GTTAAATGCA GGAACTGCTG AGCTCCTCTG GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC 300
TTTACTATCT CCCTCTCACC ACCTTTAGTT CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT 360
CTGTCAGCTG ATGACCAATA CTGCCTCTTC CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT 420
TCTCATGACC CTCAGAAAAG TCATTCTTGC AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA 480
TAACTATGAT TCTGTGCTTC TATTTAACGC CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG 540
AGGGCAGGAA TCACATCTGT CTTTTTCACT ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA 600
AAATGTCTGT TGAAAAGAAG AAAATACTAT TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT 660
CTTGCAGTCT AACCTCCAAC AGTCTTGCTG CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA 720
TGGAGCTAGA ACCCTTGCTC TCCCAACTGC CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC 780
AACCACCCCT GGTATCCCAG TCCTCAACCC TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG 840
GTGAGACTCT AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG 900
TTGCTTAGGC AACTGTCGCC TGGCAACCAG CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC 960
CCACCCCCGC CTCATGCTGG GGGAGCTGGG ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG 1020
GGAAGCAACA GAGATTCACT GAGCATCGTC TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT 1080
AGGCCCCATC TATCCCCACT CCCTACCAAG GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG 1140
CTTCCCAGGC CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG 1200
AGATGCCCCT GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA 1260
GATGCAGTCT ATACTGACCT TTTTTCCTTC TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT 1320
TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA ACATGAACTC AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG 1380
GGCCTAGGCA GGCACAAAAT ACCCTAACCT GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT 1440
AGCTAAACTT CCCTCCTACC CAATTAGGGA GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT 1500
TAGCCCTCTG CCTAATTACC TAACCAACTG GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT 1560
CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA 1620
CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT 1680
CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA 1740
GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC 1800
CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC 1860
CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA 1920
GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA 1980
GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC 2040
CATATCTGTT CCCATCCTAG TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA ACTACAGGGC ATCTGCTTTC 2100
AAAGCTCCCA TACCAGCACA GGTCAAAAGG GAGCAGATGC CCAGAGAGGG AAACAGGCAC 2160
AAACTCACCA ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC TTCACAAATG GACAGCAGGG 2220
AGGATGCAGG GCAGGAGGCC CCTCTGACAA CACCCTTGAC AAAGAGAGCT GAGGGGACCA 2280
GGGGGAATCA AGAAGGACCC CACTGATAGC CATTTTTCCA ATCCCAGGTA CCGACCCAAT 2340
TAGAACTTGT GGGTTGTGTT TACATGCAAA TGAGCTACAC ATGATGTGCA AAATGTACCG 2400
TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA GGGGGCATGG GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT 2460
GCAACACCTC TGGGTACCTG AGCAATATTC AAACCATTCT CGGGTTTCAG AATGATGCTA 2520
TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT 2580
CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC CATGGAGCTG 2640
CAGGGGAATT CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC TATCCTCTCT TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA 2700
GTACCTACCT GTCCTTCTCC CCTACACCCT TCCACCCATA TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT 2760
CCCAAGGCTC AAAGAAACTA CAGGGCATCT GCTTCCAGAG CTCCCATACC AGCACAGGTC 2820
AAAAGGGAGC AGATGCCCAG AGAAGCTGAG TGAGCAGCCT CGCATCACAG AGCAGTGGGC 2880
CTCAACCTGC TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC CCTTCATCTC 2940
TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT GAGGACTGGA GGGGAAGGCA GGAGGCGCTG 3000
GAGACAGCTG TCATCCCTCC TCCCGCCCCT TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG GGCATGAAAT 3060
AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA GGGGGTGACA ATCCAATCCA CCTGTCACCC CCACAGTCAG 3120
GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT CACTAACGAG GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC AGACACAGAA 3180
GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC AGACACACAG ACACAGGAAA GATGACAGAG AAAAAGAGGC 3240
AGCGAGGCCA GAAGGCATTA TGGGGCAGAG GCAGAGACAG ATAAGGAGAG GGCTAGAGGA 3300
GAGGGAGAGG CAGGAGACCA CAGAGACAAA GATTCAGAGA GAAGCAGGTA GAGAACAAGA 3360
GACAGGTTCA ACAACGGCTT CCAGGACTGA CTCCTGGCCC AGCGCTGGGG GAATAACTCA 3420
ACAGGACACC ATCCCTGCCC TCTGAGAACT TGCAGTGCAG CCAAGAGACA GACAAGGGAG 3480
GGGCAGGTCC CACCCAGGGC AAGGGCAGGG AGAGGCAAGG GGGCCCTTGG GGGCCTGGAC 3540
TGGACCCAGA CACAGCCCCA GAAGGAGCAT CCCAGAGCAG GCAGGCCGGC CCTGAGAGGC 3600
AGCAGAGGTG AGGACCGAGG ACCAAGGACG ACAGCTGCCC AGCTGAATCC CCAGGCCCTG 3660
CCTTATTACC CAGTCTACCC TCAGGTTCAC AACCTTCCTA GTCATTCTCT CTTCCAACTT 3720
CAGCCCTGGG ACCTCCTCCC TAGTACAGAG ACACAGGCTA AGGAGCTCTG GGAGACAGGG 3780
CAGGAAGGTG AAGCCGGTGA TGCCCCCAAA CACCCAGGCA AGATGGTCCA GGATCATTCT 3840
GTGGTTCACA CAGTGAGCTC TTCCTTCACA AAAGAAGTGG GGGGCATTAC CCCTCCGAAG 3900
TCTGAGCCAA GGCAGGAGCC TCACATTGTC CCTCTCCCCA TCCCACACAC AGCCCAATTC 3960
TCACAACCCC TCCTGCGAGG CCTGCTCCCC ACGCCCCTAC TCCTGGGCCC CTCTCGGGTC 4020
TCCTTCTCAT GCTCCGTTCC CTCTGCCCCC TCTCTGTCCC CGCCCCCTCC CACAGCAGCC 4080
TCTTTTCTTC ACCCCAGAAG TGCTTCTAGG GTCTGATCTC AAAGGCAGAG ACCCAGCCCC 4140
AACCCTTCAA AGTTCTGTCT GGCAGGCTCA CTACCCAAAT CCCTGGTTCC CACCGTCTTT 4200
CCCTCCCTCG GGGACTCCCC TCCCCCAGTC CAGCAGCCTC AGGGCTGGGC AGGGGCTATT 4260
TTTAGCCTGG GCACTGAGCT AATTTTAACT 4290