EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS083-02641 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HCC1954 
Coordinate
chr8:129187460-129190780 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12156002chr8129190544hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL1MA0647.1chr8:129189475-129189487AAAACCGGTTTT+7.22
GRHL1MA0647.1chr8:129189475-129189487AAAACCGGTTTT-7.22
NFIL3MA0025.1chr8:129187559-129187570ATGTTACATAA-6.32
NKX2-3MA0672.1chr8:129189853-129189863ACCACTTGAA+6.02
POU2F2MA0507.1chr8:129188386-129188399GTGATTTGCATAT+6.04
RARA(var.2)MA0730.1chr8:129189735-129189752TGCCCTTCTCTTGACCT-6.15
RUNX1MA0002.2chr8:129187939-129187950AAACCACAAAC-6.02
Stat6MA0520.1chr8:129188629-129188644AGTTCTTTGGAAATA-6
TFCP2MA0145.3chr8:129189476-129189486AAACCGGTTT+6.02
TFCP2MA0145.3chr8:129189476-129189486AAACCGGTTT-6.02
ZNF143MA0088.2chr8:129188402-129188418TACCCAGAATGCTCTG+6.11
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02537chr8:129187474-129189091Astrocytes
SE_02537chr8:129189192-129190889Astrocytes
SE_33773chr8:129187210-129192590HCC1954
SE_36562chr8:129187467-129192797HMEC
SE_37307chr8:129186886-129191765HSMMtube
SE_38266chr8:129183737-129191681HUVEC
SE_43415chr8:129187229-129191727MCF-7
SE_44676chr8:129187272-129191751NHDF-Ad
SE_45777chr8:129182257-129199016Osteoblasts
SE_51829chr8:129187255-129191736Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_55974chr8:129178843-129193082u87
SE_58836chr8:129158962-129219148Ly3
SE_61061chr8:129159080-129218964HBL1
SE_63618chr8:129187184-129191750HSMM
SE_64660chr8:129187252-129192316NHEK
SE_67602chr8:129178843-129193082u87
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH08I128171chr8129183988129193270
Enhancer Sequence
AGATAACTTA TAAATGCCTT TGTAGGAATC ATAGCCATAG CTTTAAGTAT AATCTTGGGT 60
TCAGCTCTTT TGTCCCATGA CGAAGAAGTG ACTTGTCTGA TGTTACATAA TGAGAGTTAT 120
CAGATTGTAA AGGAGAACTA AGGCTGCTGA TATCTATGAC ACTACATTAT ATTGCCTCCA 180
TGAATAAAAT GTTAATGTCA CCCAATCAGT TCATAACCAA AACCATAGTG GGATCGGCTC 240
TGAGCTCACA GTTACTGTGA TTCTATCTTC TGTTCCACCT ACCTCTATCT CCTCCCTAAT 300
TCTAGAGTTT AAAGGGCAGT AAACTCAATT TTGAACATCC TGCCTTTGGT CTCCCTCAGT 360
TGGCTGTCTG ATCTTTTGTG CACCTGTCAG TTTTCCAAAA AGACACACTC AACCTCACCC 420
TAGAATCTTC ATTGGAAAGC CCTTTCACTT GCTACTCTAT ATGTCTGTTT TGGTAGACAA 480
AACCACAAAC CCAGATAGGC AATTAGGGAT TAAGGGCAAC AGTGGTTTGG GATTATTTCA 540
GCTAATTGCT ATCCTATGTG AAAGAGTGCA TCATCTCTGA CAGCTGGCAT GAGTAATCGT 600
CACTGTTTTA GCAGTAAGTT TATACCTTCT GTGTGATAGG GACTGCCAAT GCTGTTTTGA 660
CTGGTTTATC ATCAGAGTGG TGAATGTGAA AAGCTATTGT ATGTATCCCA TTGGTTGTTG 720
TGACAATTAA ATACAACAAA GCCATCACAT TCTTACTATC TGCCTGTTTA TAATATGCAT 780
TTGATTTAGC TTGACTGTTT TTACTTTTTA GACTCTGTGT ATCTCCGACC CTTGCGAACA 840
TCGCACCCTG TGCCATTATT TTCTGCTGTT AATGGCAGAT TGGCTACGAT GCCTTCCTTT 900
CTTCTGTATT GGGGTGGAGG AGTGATGTGA TTTGCATATA GTTACCCAGA ATGCTCTGCC 960
AATGGTCAGT TCTCTGCTGG CTGGGAGACT GAGCTCAGGA ACAAGCTGCA AGGTGTAAAT 1020
GGGCTTTTGG GTATGCTGAT TTATGTTCTA ATTTATACTC ATGTGACAAG GATTGAACCC 1080
TGACTATCTT AGCTGGGGTG GAAAAGGTCC CTGGACAGGG GCAGGGCGGG GAATTTGATG 1140
TCCACATATA TCCACTTTTA GAGTTTTAGA GTTCTTTGGA AATAGGGATT TTTTTTCTTT 1200
TTTTGGTCTG TCTCAGACTG CCAAGTAGAA GCCCAGAGAA GGAGGAAGTT AATTCACATT 1260
CTTAATTTTT TCTAAGGGCA AAAAAAAAAA AAAAATGCAC CAGCTCATTT TCCATCTCTG 1320
CTTGGGTCAT CAGTGTGCAT TGTGAGCCTG TACAAAGGCC TTAGACGGGG AATGCTGCCG 1380
AGAGCATCAC CTTTTATGTC TTCTTTTATA TGAAATGTGC CACTTCCCCA CTAACCCTGG 1440
CTCTGGGCTC TGCCTCTGCT CTCCTGATGG TGTGTTTATG GTGGATTCAG CATTCTGGGC 1500
CACACAAGGA AGCTGCAGGG GGTGTCCAAG TTCACATGTC CCCGCATTCC AGGCGAATGT 1560
TTCTGACATT GAGCAATGAT ATGGCTCTGC CAGGTTTAGG TCTGTCTGAT TGGAATGCAA 1620
CCCGAAAGGA AAGTCCCGGA ATGATTCAAA CACTCACCTC CCCACAACCC CTTCTTGGTT 1680
TTTTTTTTTT TTTTAATTCC TTTTTAATTC TCCAGTGACA AACTCAGCCC AGCACTCTCG 1740
CTGACCGCAT GGCACTTGTT GGTGCTGATA AGTGCAACTT CCCAAGAGAT AGGAATGCAA 1800
ATCGTAATAT TTTGTTGAGT CATGTGTACT CTGCGGCTGT TTCCCAAACA TTGCATCAGA 1860
CCTGTAATTG GCAGCTCCCA GTACTCTGCT GGATGACACC AAATGTCCAG GAAAAGCTCA 1920
GTCCATTTCT CGAAAAATGT AGTCTCACTC TCTCCATCTG CCTAGTTGTA ACATCCTGTT 1980
CCTAAGGAAG TAGAATCCCT TGGGGTAGCA AGGGCAAAAC CGGTTTTGCG GATAAGTTTG 2040
AAAAATATGG CTGTTGGCCT TTCCCACCCA CTCTGGTCTC TTAGCAACAA GACAGCTGAT 2100
GGTATCCACT AGGGGGAAAA AAAAAACAAA AACACAAAAC AAAACAAAAC AAAACAAAAA 2160
TCATAGAACA TGTGGGGGAG CCTGTCTGAA TTGTTGCCTA CAGCCTGATT TATTTAAACC 2220
TCCACTACAT TCTTGGATGT GAAGACCTAG GAGTCAAGTC ATGGGAGCTT TCTCTTGCCC 2280
TTCTCTTGAC CTCTATGAGG CAGATAGAGG AAAATCTCAG AATGAGAGGA ACTTTCTTCC 2340
TCTTCAAGAG TCTGCGTTAT CCGAGATGGC CATTTCCTTT GACCTCAGGA GTAACCACTT 2400
GAAAACTTGG ACACATTTAT AGAAAATTTG GGCTCCTGGG ATGCAGTGCT GGGAAAAGCA 2460
CAGGGCTGAG GGGCTGGAGC TTGGGGTACC AATGGTGACA GTCTCTCCCT CCCTGTGGGA 2520
GTACTGGCAG GAAATCCACT GTGCCCTTGT CCCCACCGAG GGTTGATTTT CTCCACTGCA 2580
AAGTAAGGAG ATTGAATTAG ATCTCAGTCT TCTCTTAAGG TACCTTTCAC ACTGAGCCTA 2640
TGGGAGTGGT GGTATGTGCA TGTATGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTATA TATGGTGTGT 2700
ATGTATTTAT GTAAACTTTA TATCATGTTT CAATCCAATT CTCTCTCTCT CTCTCTCCAC 2760
AGAGCTAAGT GGTACCACAA GAATTCAAAC CTAGATCTAG CCAAGTTTGA AATCCTTGTT 2820
CTCAGCTCCT ACCCTATGCT GTTATGATCT ACACAGAGAG GCACCACATA GCTAGTATTT 2880
TATGTTATAC CTGGTGAACT TTCTATCTAT GCTTATCAAT TCATAGGAGT AGAATTGGGA 2940
ATGTTGGCGT TTAGAACATG ATACCCCAAA GTATGGCACC ATGGCCTGCT AAGTACTTTG 3000
AGCTGAAGGA CATAGGGAGT TCATAGAAGT GAGATCCTTT TGAACTTCTG CTCCCACTCC 3060
TCTTTTTTGC CTAGAACCAG CGACAGAAAC TAGAAATGCT ACACTAACTT TCTCCCACCT 3120
TACTGTGGAG GAGGAGCTGG CCAAAAAGGA ATTCTCTGCC CTACCTTATT GGATAGTAGG 3180
TCATCAGACT CTCATTTCGG AGGAATCCTA CCCCAAACCT GGGAGGAAGA AATGCCACCC 3240
AGAGAAGCCG AGAAGAATAG GAACAGACAG ATCATGCTGA GATCCCCTCT GTTACCATTA 3300
GATCATATCC TCTTGCCTGA 3320