EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS082-00214 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HCASMC 
Coordinate
chr1:12512570-12516050 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr1:12515004-12515015CTCTGTGGTTT+6.14
Sox3MA0514.1chr1:12513684-12513694AAAACAAAGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00009chr1:12506389-12526105Adipose_Nuclei
SE_01743chr1:12511532-12515011Aorta
SE_03005chr1:12513269-12513663Bladder
SE_03005chr1:12513943-12515024Bladder
SE_15065chr1:12506299-12515319CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20910chr1:12506384-12515111CD8_Memory_7pool
SE_26086chr1:12513098-12515726Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26716chr1:12506659-12513255Esophagus
SE_26716chr1:12513330-12515524Esophagus
SE_28215chr1:12513081-12514952Fetal_Intestine
SE_29231chr1:12512885-12515007Fetal_Intestine_Large
SE_29871chr1:12514499-12515348Fetal_Muscle
SE_33776chr1:12506505-12516452HCC1954
SE_37319chr1:12513768-12518184HSMMtube
SE_39882chr1:12512832-12515652K562
SE_41209chr1:12512181-12515171Left_Ventricle
SE_42647chr1:12511538-12515195Lung
SE_45864chr1:12513386-12516437Osteoblasts
SE_49026chr1:12513381-12515085Right_Atrium
SE_50544chr1:12513372-12515427Sigmoid_Colon
SE_51539chr1:12512592-12515650Skeletal_Muscle
SE_52815chr1:12513220-12515041Small_Intestine
SE_54847chr1:12512158-12515661Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr11251340412513748
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I012452chr11251265812518656
Enhancer Sequence
TGTCTTTGAG GGAGAAATAA TGGCTGGGCA GGACTTACCT TCCCACTGAG GTGGGGAATG 60
GGGTAGAATT AAGGATGCCT AACTAAATGC CTCCATAGTA AAAGGAGGCC ACATGCTTTA 120
TGGTAGCCTG GATTCAATCC TCAGAGTGCA GTGAACTGGC CCAGGGCCCT GCCTTTACCA 180
CTGTATCCAT CATTTGGCTG GCTTTGGTTT AGTTTCTGTA AAACGTCTTT CCCAGTAAAA 240
TCTGATTAAC TACTCATCAA TACAGGTTTG GTTGGATCAT AGATTTCAAC ATCTACTCAA 300
GTTTTCTGGG TTCTCAAAGC TGTATTTCTA GGGGTGAAGA CTTTTGTAAT GGTTGACTGT 360
TAACAAGTGG CAAAGGACAA GTCCAGTTGG CTTGCATAAG CAATTTTTTA TGGACAGAGA 420
AACAGGAATT CAGACAGAAG TCCTACAGTA AGTTGAGATA GGTGTAGGTA CCTTTCCATG 480
GCAAAGGTCT TCATCTTACG GAAGAATCCA GCATTAGAGG GAAGAGTGAT CTCTTAGGTC 540
ATCTCATCCC ATCCTCCTTG GGTCAATACA TTGTCTTTGT ATAGAGAACA CCCAGGACCC 600
AGTTGGTGCT GGGGAGCTGA GGCTGCCACA GCAGACTTAG TTGGAAATTA AGCTTTTGGC 660
ATAGGCTCAC TCATCAACTT TGGATATTAA TTGATGGGAG TAGAAGAAGA GGGAGTGATA 720
TTGGGTATTC TGCCTAGATT ATTCTCCCAT ATTCTCTTGG TGGGGGAGTA TTATAGGATT 780
TTTAACTTCC TCCTAGTTAG CTGCCAGAGA TAGGTAAAGA GCACTTTACC CTATCTGTCT 840
TCCAAGAAAG AGAATGTAAG CTCTTAGAAA GAATATAAGA GCTTGAGAGA AACAGGAAAG 900
ACCTGAATAA GACCCTGAAT TGGCTGCGGT GCTCCTGGGT CTCTTCAGGT GGAGATGTGT 960
CCCCTGGAGA CACACAGGAC ATGGGCACGC GTCACTTAAC TGTGGTTCTC ACAGCGTCTG 1020
GGGCACCAGA GAGACACGTT TTTGTCTGGA ACCTGAAGAA CGCTGGCAGC CTACATAATT 1080
CTAAACATAG CAGGCACTCT TATTGATTCT TTCCAAAACA AAGGTCACAT TTCCTTTCTG 1140
TGTAGTTTGT GTCCTGGGTT CCTGCTGACT GTTTTGTGTA TACGATTGTT ACCTTCTCAA 1200
AGAGACTGTC AGTTCTTGAG GGCAGGGTTC AAGGCTGCTG TTTGTTTGTG TTCTTCAGCA 1260
GTACCTAAAT CTGTCCTGGG CTCAGAGGAA GTATTTAGTA AAGACATTCT ACCTTGGGTT 1320
GTAGGTCACA CAGTGCCAGA GCTGGAAAGG ATTTTGGAAA TCGTAGAGTC CAACACTCTA 1380
ATTTTGTAAG TGGTACCACT CCAAAAACTT ACTTGGGAGG CTGGTGTTTA TCTGCTGGAA 1440
AGAGAGGATT TTATTATGTT AAACTATAGT GCAAATGACC ATAATTCTAA ACCTTTGACA 1500
GGCTTCCCTC AAACGCTGCA GGCATGTTCC TCCTTGGACT AGTAGCAGAG TAATAAGAAC 1560
AGTAAGAATG CTAACTAGAT ACCAGGCCCC CGAGCCATTG TCATGAATGC TTCCAGCCAC 1620
ATGACAAAGT AGGTACTCTG GCTATTCTCC AGATGCAGAG GAGGCTCAGA GGTAGGTGAC 1680
CTCGCTCAGG GTCATGTAGT TACCAGAATG GTCGAGGGAG GACTGAAGTT TGGTCAGATG 1740
CCCCAGCTTG TGGCCCTTCT CCTATACTGT GGTAACTCTC AGATGGGGTC TCTGACTGAA 1800
GCCACTCCTT AGTGATTCAC GGTGCTAGCT TTGCAGCGTC GTGTGGTGTT TCCAGTTGTC 1860
CTAAAGGAAG TTATTAATTT TCATTAACTT TAATTCTCTC ATTAGACAGG CAGTGATATG 1920
GAAGGCAAGG CAGAAAGCAA ACAAATAATG ATAGGGGTTA CATCTCCAGA AAGGTCAGGA 1980
ATCACTGCCC TAGGTTGTAA AATATTTGGA CTGAGTAAAA GGCATGAGTC TTCCCATAGC 2040
TTCTTCCAGG AACTGTTGCT TTACATGGAA TTGCTGCTGT GTTCACTAGT CCCTCTTCTG 2100
TGCCCAGAAC TCACTGTCAC ATGTGTCAAG AATCCTCATG ACTGAGGTTT CCAGGGCAGA 2160
TCTGATCTGT GTAACACGCA CCCTAACCCC CTTGCCAAAG GAGAATGAAA TAGGCCCCTA 2220
GATGGCCACC CAGTTCCTGG GCCTTCCAGG CAGGCAGCTT GCCTTGAGGC TTTCCCCTGA 2280
GCCTTGTATC TAAGGAACAT TCCTGTGAGT TTTCTAAGAG GTTAGTCCTG GGTCATTGGC 2340
ACTTAAACCA CTTGTTTTGG TAGATCCTTC CTGAGAAGGT TAATTATATA TTTGATATCC 2400
TTCTCTTTTT ATGCCTGAAT GATGAGGATA AGTACTCTGT GGTTTATTAA CTGTCACTTT 2460
AAACCTTTTC AGATTGTCTT GTGACAAAAC AGAGTTTTAT GTCCTTTTTA TCCCAGCTTT 2520
GATGGATGAG ACAGCTTTTC TGGTTAAAGT ATGCCAGGAT AAATAAAATC TCTGAATTGT 2580
GGAAAGGGTG GGTTTGCATT TGAAATCATG AGTTCAAGTC TGCCACCTCC TATGAACGGT 2640
GACCTAACCT GTTAATCTTT CCATCGATTT CGTTTTTGGC TTTTGACAAA TGGAGCTTGG 2700
CACCTCATAG GTACTCAGTA ATTATTGAAT AAATGAAAGA CAGCATTACT GGAGGGAGTT 2760
TGATGTCTCC AAATATTTGA TACCAAACCC TAAAGCAACA ATCTGACACA TTTCCTGTTT 2820
TGAATTCCAC TAATTCTTAG AGCAAAGAGC CTATGTTCTT ACCATGATAC AGTCCTGAAG 2880
CTCACTTCTC CCTCAAGACT ATTTTGTTAT ACCTCTGATT TTTTCAGTAA ATTTGGAGTA 2940
GTATTCTGGA AAGTGAATGT CATTAAAGAT TTTTAGTAGT TGCTTTGCAA AGCCTAGTGT 3000
CCTCCATTGT ATGCATCCCC CAATTGGTAT GTGTCCAGTC CTTTTGAGAA CCACTCAACC 3060
TGGGGCAGAC AGTATAGGTA ACTGCATTTA AAATATTTAA ATTTATTTAT ATTTAAATTA 3120
TTGGCCAGGC ACAGTGGCTC ACGCCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC TAGGTGGGCA 3180
GATCACTTGA GGTCAGGAGT TCGAGACTAG CCTGACCAAC ATGGTGAAAC CCCATCTCTG 3240
CTAAAAATAC AAAAATTAGC CAGGTGTGGT GGTACACACC TGTAGTCTCA GCTACTCGGG 3300
AGCCTGAGGC AGGAGAATCA CTTGAGCCTG GGAGGCGGAG GTTGTGATGA GATGAGATCA 3360
CACCACTACA GACCAGCATG GGCTTATCTA ATTGTATTTA ATTTAAATTT ATTTAAAGTA 3420
ATTCAAATAG TAAAAATAGT GCCAAGACTT TAAAACTCTT CTCCTGCTTT TAACTCCTTC 3480