EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS080-02190 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
H9 
Coordinate
chr1:150539200-150542930 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs72700829chr1150540181hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr1:150540770-150540781GGGCGGGAAGA+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:150540092-150540113GAAGAAGAGGGGGGTGGAGGA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 79             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00755chr1:150531631-150544092Adipose_Nuclei
SE_01227chr1:150539000-150541802Adrenal_Gland
SE_01735chr1:150537832-150541914Aorta
SE_01735chr1:150541930-150543119Aorta
SE_02312chr1:150538694-150543027Astrocytes
SE_03050chr1:150538954-150541795Bladder
SE_03050chr1:150542018-150542463Bladder
SE_03708chr1:150539819-150541671Brain_Angular_Gyrus
SE_04228chr1:150538692-150542114Brain_Anterior_Caudate
SE_07310chr1:150538444-150542117Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07310chr1:150542293-150543121Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08618chr1:150538730-150541912Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09026chr1:150540109-150540693Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_10265chr1:150532493-150542117CD19_Primary
SE_11160chr1:150532177-150553440CD20
SE_11968chr1:150538585-150541907CD3
SE_12974chr1:150539454-150540256CD34_Primary_RO01480
SE_12974chr1:150540269-150540950CD34_Primary_RO01480
SE_13457chr1:150539536-150542072CD34_Primary_RO01536
SE_14155chr1:150539378-150541737CD34_Primary_RO01549
SE_15431chr1:150538918-150542057CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15874chr1:150539289-150541325CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16367chr1:150538875-150541810CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16925chr1:150539285-150541776CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17377chr1:150532162-150553370CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17879chr1:150532111-150553231CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18425chr1:150532151-150553362CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19272chr1:150538655-150541875CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19272chr1:150541910-150543410CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20081chr1:150532355-150543156CD56
SE_20809chr1:150539093-150541834CD8_Memory_7pool
SE_21519chr1:150539174-150541573CD8_Naive_7pool
SE_21978chr1:150538653-150542121CD8_Naive_8pool
SE_22540chr1:150532459-150546461CD8_primiary
SE_23425chr1:150540076-150541750Colon_Crypt_1
SE_24490chr1:150540133-150540547Colon_Crypt_2
SE_25044chr1:150540130-150541468Colon_Crypt_3
SE_26032chr1:150531381-150542256Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27715chr1:150538686-150542465Fetal_Intestine
SE_30770chr1:150538593-150543400Fetal_Muscle
SE_31016chr1:150538591-150541880Fetal_Thymus
SE_31016chr1:150542378-150542911Fetal_Thymus
SE_32586chr1:150533309-150543254GM12878
SE_33016chr1:150539633-150541760H1
SE_33943chr1:150538842-150541855HCC1954
SE_33943chr1:150541926-150543152HCC1954
SE_36042chr1:150538542-150543022HMEC
SE_37389chr1:150531646-150544455HSMMtube
SE_38169chr1:150538408-150543237HUVEC
SE_39064chr1:150538812-150541759IMR90
SE_40964chr1:150530832-150543289Left_Ventricle
SE_42054chr1:150539572-150541428LNCaP
SE_42411chr1:150530284-150543186Lung
SE_43688chr1:150532235-150541859MM1S
SE_46030chr1:150532378-150543410Osteoblasts
SE_47642chr1:150538913-150540578Pancreas
SE_47642chr1:150540671-150541781Pancreas
SE_49753chr1:150540131-150540564Right_Ventricle
SE_49753chr1:150540681-150541760Right_Ventricle
SE_50200chr1:150531037-150543263Sigmoid_Colon
SE_51405chr1:150530419-150544422Skeletal_Muscle
SE_51911chr1:150538607-150543077Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53505chr1:150530243-150543121Spleen
SE_55206chr1:150538746-150541804Thymus
SE_55206chr1:150542149-150542815Thymus
SE_58716chr1:150532377-150553189Ly1
SE_58896chr1:150532323-150553188Ly3
SE_59735chr1:150532367-150553203Ly4
SE_60541chr1:150532429-150553188DHL6
SE_61243chr1:150532496-150553036HBL1
SE_61580chr1:150532299-150553306Toledo
SE_62270chr1:150532150-150553368Tonsil
SE_63690chr1:150538668-150543114HSMM
SE_64390chr1:150539574-150543233NHEK
SE_65428chr1:150539386-150541513Pancreatic_islets
SE_67307chr1:150532235-150541859MM1S
SE_67962chr1:150539806-150541743u87
SE_68344chr1:150532799-150553352TC32
SE_69013chr1:150538863-150542064H9
Enhancer Sequence
CCATATTGAT GCGGAACTTA GCATGAACAC CAGATCAACA TAGCGCACTA TAGCCCTGAA 60
CTCCAGGGCT CAAGTGATTC TTCTGCCTTA GCCTCCAGAA TATCTGGGAC TACAAGCGCG 120
TGCAACTGCG CCTGGCCAAT TTTCCTGGGT CCAGGAAATG ACAGTATTCC TGGTCTTTGT 180
TTAAGGTACA CTGTCTTGCA AACATAGGCT TATGTATAAT GGTAAGCCAC AAGCATTTAC 240
TAAGTTTTTT TTTGAGACAT AGTCTCACTG GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCACGATCTA 300
GGATCACTGC AACCTCTGCA TCCCAGGTTC AAGCAATTCT CATGCCTCAG CCTCCTAAGT 360
AGCTGGGACC ACAGGTGCAC ACCACCACCC CCATTTTTAG TAGAGAGAGT TTTGCCATGT 420
TGGTCAGGCT GGTCTCAAAC TCCTGACCTC AGGTGATCCA CCCGCCTTGG CCTCTCAAAG 480
TGCTGGGATT ACAGGCATGA GCCACCGCGA CTGGTCAAAT TTTTCTTTCA TACAGTAGCA 540
CTGATACATC TTTCATGGTT CATGATGGGG AAAGGAAGAT ACAGCGACTT CCATCCTGTT 600
TCATACCTGA CCCCAACTAC CCAGCTTTGA AGTGGGGCAA GGGGCAAGGA AGCAGGTAGC 660
CCAGCACTCC TCCCCGCCAT CACCAGGCTC CTCTGCAGAG CTGTTGTTCC TTAAAGCTGA 720
CAACAAGCCA CCTCATTTCA AAACACACAC ACACAACCTC ATTTTGACAC AAAGTTGTTT 780
CCCTCTTTCT GTTTCTCTGC TTTGCCTCAT GAGGGATTTC TGAGAAATGA AAAAAAGTCA 840
CCTCCCACAG CCGCAGCCTG CAGTTTTGTT TTTTGGTTTT GTTTTTACAG ATGAAGAAGA 900
GGGGGGTGGA GGAAAGGAGT ATACCGCTTA AGCATCTAGT ATTAATCCAA AACTCTGCAA 960
AGTAAGAGAA ATGCTCTTCC CATAGCCCTT CACCTGAGGT GTGTGCCCCA CTTTCCTTAG 1020
ATTTGGGCTC TCATGCAAAA GGAAATAAAC AAGGTATCCT CCCCTCAGGA AAGTTCAGTA 1080
ACAAAGCAGT GAAACCGAAC AGCTGCTCCC TTGCAGCAGG CCAGCTGTCT CCCCTCCCCC 1140
CATTTCCACC AAGGGCCGGA GACGGTGGGA ACTGCTCCAG GCAACCTAAA GGATGGCGTT 1200
GTGAGCTGAG AAAGGCAGGC CTGATAGATC TGGGCATAGG AGCTTCAGGA ATAAAATGCA 1260
TGTGAATGCG GTGTTTCCCA GGGAGAATTA ACCGCATTCT CGCCTTCAAA TCTGAATACC 1320
TGAGAGTCAT AACCAGCCCA GTAGGGTAGA CTATGAAATG TATAGCAAAA TTTTCAAAAC 1380
CAGCTCCTCC TACCAGACAA GAAAATTAAC ATTTTTTAGG GCACAGAACT GAAAGCATTT 1440
TTACTGAAAT CTAATCCAGG ATGAAACCTA ACAGTTAAAC ATTCTTTTCC TTCTCTGCTT 1500
CTTTGGCTCT CTATCCCAGC ACACCTTGTC CCAGGCTAAC TTGAGTAAAC ATACACATGT 1560
GACCACATGA GGGCGGGAAG AACACCAAGT GGGGGTGGTG AAATTCTGAA TGGAATGCAG 1620
CCCCAGCTAG TTAGGGGGCC CCGGGCTGAG ACCTCTGGCA CTGGCAGTAG ACTTATACAG 1680
GCAAAGAAGC CAAAACAATG AGCTCATGGG CAAGAATGCA GCCTGTGGGG AAGTCTGGGC 1740
AGCTAGAGCA AACTGGTTTT TTGAATCAGG ATGGGAATAG CAATAGTTGA GTCTCCCACG 1800
GGAACAGGAT CAGGGAGAGT GGAAGCCACC ATTCAGTATC TTAGGGTTCC AGTTAAATAA 1860
CTTTTGGAAG CTCTTATTAA AATTCTGTTC TGCAGACAGC ATAGTGCTCT TAGGCAAAAC 1920
CTTGGTTCCT TTCCCTGACT ATGTAAAACC TAGAGGGTGA AGGACCAGTG AGGCTCCAGT 1980
GACCTACCTT AGGTGATGCT CTTAAAAGAG CAACTTTATT CAAACCAGGC CTGCCAATGC 2040
CAACTCCTTC AGTCTAGATC CAAAGATGGC TATGATCCTG AGATTGTGTG TTTAGGGTCA 2100
CCACTTTAAC ATGATACAGG AAGCAATTGA GTCTTTTCTA CTTCCTAAAC ACAGTCCATC 2160
CAGTTGTGTG TCATTTATAC CCAGTCCAGA CTTATTTAGA CCAAAGAGCC TTTTTTTCCT 2220
ATCAGTGTTT TCCAAATTTT ATCTTAAGAG GCAGGGTCTT GTTATGTTGC CCATGCTGGA 2280
GAGCAGTGGC TATTCACAGG TGCAATTCTA CTACTGAGGA GCACAGGAGT TTTAACCAGC 2340
TCTATTTCCA ACCTAGGCAG GTTCACCCCT ACTTGGGCAA CCTGATGGTC CCCCACTCCC 2400
AGGAAGTCAC CATATTGATG CAGAACTTAG CGTGAACACC AGATCAACGT AGCACACTAT 2460
AGCCCTGAAC TCCGGGGCTC AAGTGATTCT TCTGCCTTAG CCTCCAGAAT ATCTGGGACT 2520
ATAGGTACGT ACAACTGTGC CTGGCCAAAT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG AGATGGAGTC 2580
TCGCTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGTGATCAT GACTCACTGC AGCCTCTGCC 2640
TCCCGGGTTC AAGTGATTCT GGTGCCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGACT ACAGGAATAA 2700
GCCACCACGC CCAGCTAATT TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC GCCATGTTGG 2760
CCAGGCTATC CTCGAACTCC TGACCTCAGG TGATCTGCTT GCCTCGGCCT CCCAAAGTGC 2820
TGGGATTACA GGCATGAGCC GCCACGCCTG GCTCTAATAT TTTTATATAA GGCCTGAGAT 2880
GGGAAAAACT GAAGTCATAC AGTATTCACT GACCAAGAGC GGCGAGCAGA GAAAGAAGGC 2940
AGGGAAGGAA GATGGAATAA GAAAATTACC TACACAGTCC ATCCCTGCTT CTCCCATCTC 3000
CATACACCCA GAGGGTCTTT CCCAATTCCA TGCTTTGGTA CGTGTTTCTT ACTCATCTTT 3060
TTTTTTGAGT CTCGTTCTGT TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCATGATCT CGGATCACTG 3120
CAGCCTCCAC CTCCCGGGCT CAAGTGATTC TCCGGCCTCA GCCCCCCAAG AAGCTAGGAT 3180
TACAGGTGTG CACCATCACG CTCATCAAAT TTTTGTGTTT TTAGTAGAGA TGGGGTTTTA 3240
CCATGTTGGC CACACTGGTG ACCTCGGGTG ATCTACCCAC CTCAGCCTCT CCAAGTGCTG 3300
GGATTACAGG TATGAGCCAC CGTGCCCAGC CTCGTTACTC ATGTTTTAAG GTCCAACCTC 3360
ACATTTCTTA TGAAGCCTTC TTTACCACCC TCTACGTCTA GAAGTTGTCA CCCTGCTTTT 3420
TCCCAACCCT ACAATGCTTT GTACAGTGCC TTCTAATTAT TTCTGTCCAT GTCTATGACT 3480
CTTACTAGAT TGTAAACTTT GTGTGTGTGT GTGTTTCTTT TTTTGTTAAG ATAGGGTCTC 3540
ACTCTGTTGC CTGGGCTGGA GTGCAGTGGC ACAATTTCAG CTCACTGCAA CCTCGACTTC 3600
GTAAGCTCAA GCGTTTCTCC CACCTCAGCC TCCCCAGTGG CTGGGACCAC AGGCACGTGC 3660
TACTATGCCA AGCTAATTTT TTTTATGTTT TATAGAGATG GAGTTTCACC ATATTGCCTG 3720
GGCTGGTCTC 3730