Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS076-27625 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | H1 |
Coordinate | chr19:3243960-3245440 |
Target genes | Number: 17 | Name | Ensembl ID |
|
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
REST | MA0138.2 | chr19:3244190-3244211 | TTCAGCACCAGGGACAGCGTC | + | 9.61 | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3245297-3245317 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3244923-3244943 | CGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.35 | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3245398-3245418 | CGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.35 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 1 | Chromosome | Start | End |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH19I003244 | chr19 | 3244121 | 3244270 |
|
Enhancer Sequence | ATGACCCCGT TTCCAAATAA AGTCACATTC GGAGGTCCTG GGGATTAGGA CTGCAAATGA 60 TGAATTTGGA GAGGGGGAGA AGCACATTCA GCCCATAACA GGAACTGTGA ATCAAAGCTC 120 TATTTATCCA GGGGTGGGTA AACATTACGC ATTTTCACCA GCTAGAAACG ACAAGCAAAG 180 AGGCCAAGAA GAGGTTGGGC CAAGAGATCA CGGAAGCCAT AAGGAAGATT TTCAGCACCA 240 GGGACAGCGT CAGGGCGGGC TTTTGTGAGC ATGCGTCTGT GTGTGGCGTG TGCATGGGCC 300 TGTGCGTGCG AGTGTGTGTG TGTATGGTAT GCATGCAGTA TGTGTGTGTG CGTAGTGTAT 360 ATGGTGTGCA TGCATTATTG CATTGTGTGT GTAGTGTGTG GTGTGTGCAT CTGTATGTGT 420 GTAGTGTGTG TGGTGTGCAT GCATTGTGTG TATGTGTGTG TAGTGTGTGG TGTGTGCATG 480 CATCTCTGTG TGTAGTGTGT GGTGTGTGCA TGCATCTGTG TGTGCGGTGT GCATGCATCT 540 GTGTGGTGTG CATGCGTCTT GTCTGCGTGT GTGTGTAGTG TGTTTTGCAT GCATTGCGTG 600 TGATGTGTGT GGTATGTGCA TGCATCTATG TGTGGTGCAC ATGTGTCTTG TCTGCGTGTG 660 TGTGCGTGTG TGGTGTGTGT ATGTATCTGT GTGCATAGTG TGTGTTGTGC ATGCATCGTG 720 TGTGTAGTGT GTGGTGTGTA TGCATCTGTG CATGTGTGTG TGGTGTGTTG TGCGTGCCTT 780 GTGTGTAGTG TGTGGTGTGT GCATGCATCT ATGCGTGTGT GTATGGTATT TGCATGCGTC 840 TTGTCTGGTA TATGTGTGCG TATGTGGTGT GTGTATGCAT CTGTGCATGT GTGTGTGTAG 900 TGTGTGGTGT GTGTATGTGT CTTGTCTGCA TATATGTGTG TGTGGTGTGT GCATACATCT 960 GTACGTGTGT GTGTGGTGTG TGGTGTGTGC ATGCATCTTG TCTGCGTGTG TGTGTGCATG 1020 TGTGGTGTGT ATATGCATCT GTGCGTGTGT GTGTAGTGTG TGGTGTGTGC ATGCATCTTG 1080 TCCACGTGTG CGTATGTGTT GTGTGTGTAT GCATCTGTGT GTGTGTAGCG TTTGGTGTGT 1140 GCATGCACCT GTGCATGTGT GTGTGTAGTG TGTGGTGTGT GCGTGCATCT CTGTGTGTGT 1200 TGTGCATGTG TCTTTGCGTG TGTGTGTGGT GTGTGTTTGC ATCTGTGCAT GTGTGGGTGT 1260 GTGATGTGTA TATGCATCTG TGCGTGTGTA TGTGGTGTGT GTATGCATCT CTGTGTGTGT 1320 GCGTGTGTGT TTGCATCTGT GTGTGTGTGG TGTGTGTATG CATCTGTGTG TGTGCGTGTG 1380 TTTGTGTGCA TGCATCTGTG TGTGTGTGCG TGTGTGTGTA TGCATCTGTG TGTGTGTGCG 1440 TGTGTGTGTG GTGTGTGGTG TGTGTGTGTG TGGTGTTTCT 1480
|