EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-09503 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr20:30292030-30295200 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6060821chr2030294034hg19
rs80054178chr2030294682hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
TFAP4MA0691.1chr20:30293234-30293244AACAGCTGAT+6.02
ZNF143MA0088.2chr20:30294777-30294793TTCCCACAATGCCATG+7.06
Number of super-enhancer constituents: 77             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30292383-30293830Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30293974-30296822Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30293288-30294321Aorta
SE_02627chr20:30291813-30293615Astrocytes
SE_03156chr20:30292475-30293118Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30293152-30295232Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30293076-30297376Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30292005-30297574Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13448chr20:30294062-30295511CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30292092-30297225CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30292973-30294930CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20764chr20:30292149-30295366CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30294469-30295251CD8_primiary
SE_23622chr20:30291926-30293145Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30293276-30294340Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30294588-30295088Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30291945-30297378DND41
SE_25933chr20:30291811-30295349Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30291662-30293146Esophagus
SE_26879chr20:30293157-30294278Esophagus
SE_27731chr20:30291257-30297421Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30291565-30297515Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30292078-30302768Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30291980-30293111Gastric
SE_31430chr20:30293220-30295196Gastric
SE_33407chr20:30292055-30302718H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34643chr20:30291507-30295446HeLa
SE_35852chr20:30291735-30295247HMEC
SE_36989chr20:30291921-30294611HSMMtube
SE_38141chr20:30291885-30293880HUVEC
SE_39443chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_39853chr20:30292057-30293062K562
SE_39853chr20:30293169-30295459K562
SE_40644chr20:30291815-30295345Left_Ventricle
SE_42121chr20:30291801-30295313Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_45708chr20:30291884-30293174Osteoblasts
SE_47264chr20:30291858-30294978Panc1
SE_47861chr20:30291945-30292571Pancreas
SE_47861chr20:30293292-30293942Pancreas
SE_48182chr20:30293240-30294390Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30294514-30295218Psoas_Muscle
SE_50155chr20:30291979-30293164Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30293172-30295195Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30293396-30302434Skeletal_Muscle
SE_52373chr20:30291702-30295310Small_Intestine
SE_53471chr20:30292078-30292710Spleen
SE_53471chr20:30294485-30295159Spleen
SE_55108chr20:30292167-30292585Thymus
SE_55108chr20:30293280-30294299Thymus
SE_55108chr20:30294451-30295219Thymus
SE_55770chr20:30292264-30294885u87
SE_56767chr20:30292026-30292562VACO_400
SE_56767chr20:30292607-30295221VACO_400
SE_57375chr20:30291974-30292464VACO_503
SE_57375chr20:30292729-30294334VACO_503
SE_57919chr20:30292049-30292581VACO_9m
SE_57919chr20:30292673-30293103VACO_9m
SE_57919chr20:30293234-30294355VACO_9m
SE_57919chr20:30294417-30294881VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_64478chr20:30291827-30294478NHEK
SE_65412chr20:30291566-30292774Pancreatic_islets
SE_65412chr20:30293264-30294304Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_66898chr20:30292055-30302718H2171
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30292264-30294885u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr203029218730293046
chr203029349330294957
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031702chr203029062130297397
Enhancer Sequence
TGAGTAGCTG GGATTACAGG CGTGCACCAC ACCCGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGCAGAG 60
ACGGGGTTTC CACCACCTTA GCCAGGCTGG TCTTGAACTC CCGACCTGAT GATCCACCCA 120
CCTCGGCCTC CCAAAGTGCT GAGATTACAG GCATGAGCCA CCGCGCCCAG CCTGAACTTG 180
GTTTTTAAAA GACCACTTTG GCTGGAGTAT TGGGCAAGAG TGATTTTCTA AGGTCCCTTC 240
CCAGCTTTTT CCCTGTCATT CTAGGCTGCC ATGAACTGGT TGCCTGAGCC ATAAAGACAC 300
AGTTTCTGGA TTAGAGTGAC TGAAGAGCTT AGAGTGGTTC CTTGCCCTTG GCCGGAGTAG 360
GGAATCTGTG TCACCTTGTT CTGCAGGAGA TGGAGGAAGT GACTCCCTCA GGGAGGGGTG 420
GGAATCCCAT CTTGGAAAAC ATCCTCAAAC CACCTGTATT GTTTCTGCCT CCTGTGTGGA 480
AGTTTCTGCC AATGACACAG TGCTCTCTGG AATGCACCCC CCCAACGCAC ACACCCAATC 540
TTCCGTTTAC ACAGGCATAG CTGTACTTTG CATTCCTCCT AGGATTTAGT TCAAAGCTAG 600
CCTACAGGAA CTGGTCGATA AAGAGTTACT GATTGATTAC TAAAGAAAGA GAATATTCTC 660
AGCCATTAAG CAAATATTAA TGAGTTTTAT GAGTATTATG TTGGTCTCTG GGGGTGCAAG 720
GTGATTAAAT GGGTTTCTAG TCTTCACTGA GCTCAGAATT CAGTGGATAG ACCAAAAACT 780
ACAGACAACT ACAATGCTGG ATACAATAGT TATAACAGCA ACATTTACTA GGGCCTTCCT 840
TATCCAGGTA GGACAAGTTG GCTTTGGAGC CAGACTACCT GGGTTCAAAT CATGGTTTTA 900
CCACTTACTC GCTGTGCATC TTTGAACAAC TTTCTTAACT TCTCTATAGG AATAATAAGA 960
GAACCTACCT GAGTGGTACT ATTTTGAGAA TTCAATGAAC TATCTCATAT AAAACACTTA 1020
AGTGCAAGTG CTCATTGTTA AATATTACTA AAATTACCTT AATACCTGCA CCATATGATC 1080
TTACATACAT TCTTACAAAA GGCTCTTAAA TCCTTACAAA AACCCTATGA AGTATTATTA 1140
TTATCCCCAT TTTTCAGATA GGGGGACTGA GGCTCAGAAA TGGAAAGGAA TGCACCCAAA 1200
ATCTAACAGC TGATATGTAA TAGAGACCAG ATTCAAACTC AACTCTGTCT GATTCCAGAG 1260
CCCATACTTC CAATTAACAA AATGATCCCC TTTTCATAAA GAGCCCCAGC ACAGTGCCTA 1320
ACACACAGCA GAGACTTTAT AAAGGGAGCT ATGGTTATTA TGTCATTGTC CCTGGAGTTT 1380
CCAGCTGTAG ATGCTGTAGA ACCCAGAGGA GGGGGCCTCT CTTTCACCCT AAAGGGATCT 1440
GAGAAGGGTT TAAAGGTGCT GGGTGCCAAC TACAGGCTTT GCTTGGGAGT CCCAAAGGTT 1500
TCCCTCACTG GGGCTTGGGA TACTAATATG GAACCTACAC TAGCACCACT AAATCAGACC 1560
CAGAAAGTTC CCCCAGGTGT CCAAACACCT GCATGAACAA GCAGGCAGTT TCCTCTAGGT 1620
TGACTTCTTG TCTGGCCCTA CACATCTCTC AGTTTCATCA CTCAGCCACC AGCCCTGGGT 1680
CTCATGTATG CACCTGCTGC TTGACCCAGT CCCAGGAGAC ACTGAGCCTT AGAATTGGGC 1740
TCCTTCTCTG GACCTTGCCC CAAAGGCTAT TTCTGAGTGA CTCCCTGGGA CTTCCCTGAC 1800
ATGGTAACCC CTAGGGCTCC AACTGAACAT GGGTGCTGTG AGCAAGGGGA AATTCTTCTG 1860
AGTAGCAGAT GGAGAGTGGG TAGAACAAGA GGCAGTTGTT CTGGATCAGA GATAAGCATG 1920
GGGTGAGAAC CATAGTACAC TGGATTTTAT GTTTAAGCAG CACTGATCCT CGATAGTTCA 1980
GAACTCCCGC ACTGAAGTCC AGCGTAGGCA GGTAAGGACA ACCTGGAGCC AGGCATTAAT 2040
ACTCACTTCT ACTTCCCATC TGAGTCATAT TCAGAGTCTG GCCTTGCCTG GTACTTTGAC 2100
TGCAGAAGGC AACCCATGGC TAAATCAAGG CACCTCAAGC CTCATAGAGA AAAGGGAAAG 2160
ACTCAGCATT TGCTGAGCTT TTACTCTGCA CTAGGCAATG TGTAAGTGCA CTTTACATGT 2220
ACCATTAATT ATTAGGAATG TTTGTTAATC CAGTCACTAA ACACTCAGCC ACCAAGTACT 2280
AGGCCCAGCA GTAGCTGTTA AGAGTGAATA AGACATAGTT TTTATCCTCA GTAAGCTCAG 2340
AGCACCTCGT TTAGTCTTTC TCCCAACAAC CCTCTGAAAT GAGTATTACT TCCACTTTAT 2400
AGATCTTCAG GTTTACAGAG GGAAGTAACT TGTCCAAATT CATGAAGCCA GTTAAGTGAT 2460
AAGATATTGC TTCTACTCAA AAAATGCTTG TTGACTGAAT GAATGAATGA ATGACACAGC 2520
TATGGCTGTG ACTTTAGTCA AGGAGTAGCA ACAAGACCAA ATATTTATAG TTCTCAAAGT 2580
GCTTTTTCAT CTATCATCTC TTTGGGCCTC CCTGCTAGCC CATGAGGGAG GCAAGGCGGG 2640
TGTTATCTTT CTTCAACATA TGAGGCAACA GGCAGAGCTT GGGCAAGAGG CTTGAGGCCA 2700
CAGAGCAAAC AAGGAGTGAG TGGGGCCATC CTGGAAAAAC TCCAGAGTTC CCACAATGCC 2760
ATGTTTAATC ATTCAAACCC ATGTCAAGCA CCTACTGTGT GCCAGGCATG CTCCTACCCA 2820
CTTTAAATAC TTAACTCATT AAGTCTTCCA CTCAGTCAAC AAACAAGGAG GACCCTGGGA 2880
AGATAAAACA AAATATGCCC CATTGCCAAA CGCCTAGTCA ACAACACTGG CCAAACCTCT 2940
ACTGTGTACA AGGTATGACT TGGGCCTTGT AGAGGAGGTA GGGGACAAGG TTGTGAGCCA 3000
AGGCCCCAAG CTTCAGGTAC CTTAAAATCT CTAAACTCTT GGTCCAAAGA TATCCACATA 3060
TTCTGTCAGC CTGAAAGTTC ACTCCTGGAG AGTAGATCCA ATAGCAATGA CAACAATTTG 3120
TTTACCAGTG ATTGCAATGT GACAATAACA GTAATAATAG TAGCTTGTTA 3170