EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-04218 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr13:99933360-99935780 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP2MA0593.1chr13:99935412-99935423TTTGTTTACTT-6.62
NEUROG2MA0669.1chr13:99935749-99935759GACATATGTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09586chr13:99927015-99938758CD14
SE_10324chr13:99933325-99937392CD19_Primary
SE_11877chr13:99933419-99936730CD3
SE_16332chr13:99933482-99936233CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16931chr13:99933508-99936093CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_19205chr13:99933357-99935885CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20352chr13:99932458-99936110CD56
SE_20920chr13:99933519-99936152CD8_Memory_7pool
SE_26111chr13:99931499-99936078Duodenum_Smooth_Muscle
SE_32560chr13:99932546-99936087GM12878
SE_45967chr13:99933314-99936049Osteoblasts
SE_62226chr13:99907599-99977172Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr139993488899935365
chr139993364399933940
chr139993407599934613
chr139993480099935628
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH13I099279chr139993169699937287
Enhancer Sequence
ACCCAGGAGG CAGAGGAGGT TGCAGTGAGA TGAGATCACA CCATGGTACT CCAGCCTGGG 60
TGACAGAGCG AGACTCCATC TCAAAAAAAA CAAAACAAAA CAAAACAAAA AAAAACAACA 120
GCAACAACAA AAAAGTATAA AAGTTGAATT TCACATTTGG GTTCAGTGAT TTTTTTTTTT 180
AAGGATTGAA ATGTGGACTT ATAAAATCAT TTCCAGCATC TTACCTAAGA GAGAAGCATA 240
TAATCCATTC ATTCTTATAT TCACAAGATA TCTCCTTTCT CAACCAAAAA GTTCTCACAC 300
TTTGGGCTCA GTTCAGTATT TGGGTGTTGG ATACCATGTG TCCGGCATTG TACTTGGTAC 360
TATGTCACCT TGGTAGTCAG CAAGCACACG CCAGGCTCAT CCCAGACACT CTGCAGGTGT 420
GCCACTTTCT CTCCTTAGAA CAGCCCTGGA AGGTGAGAAC TCGCATCTAC TTTGAGGAAA 480
CAGGCTCAGA AACCTTCAGC GCTATTTTCT ATAAATTGAT AAAAGAAAAA TCATGATGTT 540
AGAAGATACA TAACAAGAGG AAGAGGCTTT TCTTGTCTCA CTTATGTCTT GACATTGCCT 600
GAGGACTGAT TAGGAACTGA GATTGCCAAT CATTTTAACA AGATTTTAGT AATGTTTGAA 660
GATCTGTGCC TTCTGAATCA AAGTGGCGTG CAGAGGTACT TACCTTATGG ATTGCTGGCT 720
AATTGTGAAA GGAGACTCAG GCTTTTAACA CTGCAGGAAT TTCAAACTGC GGTCTCAGTG 780
GCCAGAGTGT CTTACCAGGG AGCAGACCTA ATGTATCCAG TTTAAAAGGG CGTGTAAGCT 840
GTTGCCAGAA GTCTACATGA AGCCACATGA TAAGTGATTT TGTATTTGAA CATGAAGGGC 900
AGTGGCATCA TTGACCTAAG CTAGAGTTTC CTCACCCTCA GCACTTTTGA CATTTTAGTT 960
GCATAACCCT TTGCGGTGGG GGCGGTCCCG TGCACTGCAG GGTGGCTGGC AGCATCACTG 1020
GCCTCCACCC AGTGTATGCT GTTAGCAAAA CCTCCTTTCC CCAGTCTTAC CCCAGTCATG 1080
ACAACTAAAA ATGTCTCCAG ATAATGCCAA ATGACACTTG GGGGGCAAAA TCACCCATGA 1140
TGGAGAGTCA TGACATGCAT GATGCTGGGT GGTAGATAGA ACCCTGGAAA GAGTTAGCCC 1200
ACACCCTTGA GGAGCTCATG ACCTAGGAAG CTTGTTGAGA ACTTTTGACT AGGTAGAATA 1260
TTTCTAGTAG TTGACTGAAA TAGCTTTGGT TGAGGCTATT AGTAAAAATT TGTTTTAAAG 1320
AGGTTTAACA TCTGTTTTCA TTTCTGCTTT TCTGAGTTGC TTTGCTGCTC AATTCCTTTT 1380
ATTTTAGCTG TCTTCCTCTT GGGACTTCAA ACATTTGAGT GTGTCAAAAT TTCCAGTCTA 1440
ATAGGAAATA TGTTTTGTTC AAAAAGAAAT AAAGATATTT ATAACTGTTG GGCTAGAATG 1500
ATGGAAGTTT AACGCTGGTT AAGTGAGACT CAGGTAACAG ACAGCAAAGG AGATACTTTA 1560
ATAGTGAAGG GAACTTGAAG TCTGGTTGTA TTCAAGATTC ACTTCCTGTT CTTGTTTATC 1620
ACTGGAAAGT TGCACCTTGT GAAAGATTTT AGATTTAGAT CATTGTATTG TTCTAAGAAA 1680
AAAAATTCAA AATGCTAACC ATGTCTTGGT AACTATAGCA AAATATACAG CACACAAAAA 1740
TAATCTCATA CCTGTCTTAG GGTTGGATTT TTTGGTATAT GTTATGTGTT GAGTTCTGAA 1800
ATATCTAATG TGCTTGAAAT CTAATGTGCT TTTGTTATCT GAACTAAAGG AAAAAGGCTT 1860
TGTCAGTTAC AAGAGAATAG GCATCCCTGT TTTGGCTGGA TTGTTAGTTG AAGTAATAGA 1920
ATGAATTCTG GCTGATTCAG CAGAAAGGGA ATTTATTAAA GTAGCTCAGA GAATATTTAG 1980
GAAGGCAAAT AATCAGTCAT GGGTACACCA GAGCTAGAAT CAACACTTTA CAGTTCTCTC 2040
TCCTAAAATT ATTTTGTTTA CTTACTTAAT GTTTAATATT GGCTTCTAGG ATGTAGGATT 2100
CAGAGAGCAA CTTGGTCTGT GTGGTTTTCA GCTGTTATTC CAGTGTGTAG AATAGCAGCT 2160
GGTTCATAGA GACACTTGAT AATTATTTGC TGTATAAATA AATGACAATA CCAAGGATAG 2220
GTTTGTTAAT ATCAGTGACA ATATGAAGGA AAAATATGGA GTAACATTAT GAAATGTTAA 2280
CATTACGCAT TCCATTTGGA GATTTTTTTT TGACAGCAGG ATTTACCCTT TCTCTTAAGA 2340
AATCTTAATA AATTTATATT GAACAATTTT GTACCGTAGA GCCTTGTTTG ACATATGTTC 2400
CTGATTTAAA TGAATAGCCA 2420