EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-01393 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:230303830-230306990 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1546954chr1230303848hg19
rs10864728chr1230304914hg19
rs10489615chr1230304988hg19
rs1321257chr1230305312hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:230303901-230303912GAGCCATAAAA+6.14
ESRRBMA0141.3chr1:230304731-230304742TATGACCTTGA-6.62
EsrraMA0592.2chr1:230304732-230304743ATGACCTTGAC-6.32
EsrrgMA0643.1chr1:230304732-230304742ATGACCTTGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:230305652-230305673GCAGTGAAAGTGAAACTGGAA-7.61
IRF2MA0051.1chr1:230305656-230305674TGAAAGTGAAACTGGAAA+6.25
PRDM1MA0508.2chr1:230305655-230305665GTGAAAGTGA-6.02
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04512chr1:230303594-230306559Brain_Anterior_Caudate
SE_09661chr1:230304445-230306637CD14
SE_25348chr1:230301904-230307084DND41
SE_39366chr1:230303651-230304629Jurkat
SE_39366chr1:230304706-230307060Jurkat
SE_50426chr1:230304929-230306238Sigmoid_Colon
SE_51527chr1:230304663-230308351Skeletal_Muscle
SE_58501chr1:230239434-230311477Ly1
SE_61418chr1:230219055-230306985Toledo
SE_66256chr1:230303651-230304629Jurkat
SE_66256chr1:230304706-230307060Jurkat
SE_67996chr1:230293025-230385938TC32
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I230167chr1230303652230304629
GH01I230169chr1230304966230308464
Enhancer Sequence
GTTGAGAGAG GGCTTTGTGT GCCACCCCCT GACTGGGGAG GCGGTGGACT CGGAGCAAGT 60
GTTAGAAAAT GGAGCCATAA AAGACTCCTT AAAGTGTCGG GCGCTCAGCT AACTTAGGGC 120
TAGAATTATA TATCATCTCT TAAAGGACCT GCTGTTCTTG CCTTCAGGAA TGGGAAGTTA 180
TCACCAGGAG CTAAGAGCTG ACCTGCTTCA TAAACTCTTA CTTAGACCTA GGAATGAGGA 240
AAAGCTGCAT GCGAGTGGCA TCCCTTGTGC TCGCTTTCTC TGGGCTAAAA CGTTTAGGAT 300
GGTCTGGCAG CTCTTGAAGA GAGGATGGTG GCGTGGAATA GATTCCTCTG AGGCCTTGCC 360
CCTCCTGTCC CCGGAGCTGA GCTGATTATT CTCATTGGAA GATTGGCTTT CGAGCATTTA 420
TCAAGAGATT TGTACCTGAG TTTTCTTGAA CGAAGAGGGA GGCAAGAGGG CTTAAAATTT 480
CCATTAAAAA TGAACAGGCA CCCAGGAAAT ACATGATTGA CGGATGTTGG CCCAGGAGTT 540
TTCAGTGTAG TTGCTTTCCC TTTAGGTAAA TAGGATTATG CGCACATTTT TGTAATTTTT 600
TACAATTTTA TTTTTTTCTA GAACAGTTTT AGACTTACAG AAACATGGGG AACATTGTGC 660
AGAAAGTTCC TATATATATC ATACCAAGTT TCCCTGTTAT TAAAATCTTA CATCAGTATG 720
ATTCATTTAT TGTAAAGAAC CAGTATTGAT ATGTTATTAA CTAAAGTTCT CTCTTTATTC 780
AGATTTTTTA CAACATCCCC TTGTGTTCTT TTTCTGTTTT AATATGTTAT CCAGAATACC 840
ACATTCCAGT TAGTGATTAT GTCTTCTTAC TGTGACATTT TTTTAGACTT TCCTTTTTTG 900
TTATGACCTT GACGGTTTTG AGGAGGCTTG GTCAGGGATT TTTTAGAATA TTCCTCGTCT 960
GGGGTTTGTT TGATGTTTTT TCTCATGATT AGATGAGAGT TATGGGTTTG GGAGAGGAAG 1020
ACCACAGAAG TAAAATATGC ATAAATTTGT AAACAAGTTG TTGAATGAGT TAATTATGGA 1080
GAGAAAGGGA AGTTTAGTAC CCCTGAATAG TAACTGGAAG AGGAGTAAAG GCTGGACCCC 1140
CAGATTGGAA GAAGGCAAGT TTAATGTTCT TAATGATGGG ACTTAATGTC TAACTTGTGT 1200
CATGCCTTAT AGTTCAAAGG GGATGGGATA GAGTGGTTCT TACATTTTCA TGTTATATCT 1260
TGGGAAACTG AGGCTCAGAG AAGCAGCCTG AGTTGCCTAA GGTCATAGAG ATAGACCAGG 1320
ATTTACTGGA TATGCCAGTG CATTTGCAAA CTATTCCTAG TTGCATTTTC TATGCCCAGA 1380
GGTTCTAGAC TCAACTGGCT GGGTCACCGA TGGCCATTTC ATCTGTGCGT AGCTATAGGG 1440
ATTTAAATAG GAGGATTTTT GTTAAATGAA GACAATTGAC CGACTGTGCG TGGAATCAAT 1500
GTGCAGGATG ATTCACCAGG CTTTCTGCCT GTTAGAGAAG TTAAATGGTT GAGAATTAAT 1560
AATTATGCGA TTGTAGTTCA CGACTTCAGC ACAAGTCATT GTTACAGTTC TCAAATGTTG 1620
AGCAGCCCCA CGTTATTCCC CACCAGTGTG TTTTTCTCTG AGGTTACACA GTAAAATAAG 1680
TGAAGTGCTG ACCTTTATCA TAACATATTT TTTATTTGTG AGCAAGTGGA GTATGTATAA 1740
AGCAGTTTGT GACTTTGAAT CCAAAATAGA AATTTGCCCT CCTCTCATTT TCGCAGCATT 1800
GAGTTTCATA AACTAAGTTG GAGCAGTGAA AGTGAAACTG GAAATGCATG GATGAAGCCA 1860
GTGGTTCTGA ACACTGAGAA CTGCCTGGGA GCTTCTAGAA AAACCCCCAA GGCTGGGTCC 1920
CATTCCCTAA AGTTGTAATT ATATTGGCCA GGGCAGGAAC AGGCCTTGGG AAATCCAAAA 1980
CTTGGCCTTT CTGTCTTGTT CCTCACTCTG TACTCTACCC AGGTCTTCAT TCTTAAACCT 2040
TTCATATCTT TTGATTCTTG CCTAAGTAGA GGTTTTGGGA GCTGTTGGGC TGGAGCTTTC 2100
AAAGCTTGCA GTAGGCTGAT CTTACTTCTC TACCTATATT TTACCTGTTC TCCCTAGGTG 2160
ATGAAACTAG GAGGGCCCAT GGCTACTTCT GCTACATGGG GCACAAAACA TGCTTCAGAA 2220
ATATTTGAGA GACTGAATGA AGCCTGTCTC TGGTCTCTAG GGTATATTAC GTTCCCTTTC 2280
TATTCTAATG ATGAGTAGGA GGAAAGATAC CACTCTTTCT TGTAAACCAA ACTGTTCTTG 2340
CTTTCAATGG GGATTTTTAT TAAGAAGCAA AAACTGATCT CTTTTATAAA TGCATAGATA 2400
CCAGTGTTTT ACACAGTACA GGCTTCTGGT TTTAAGAGAA CTTTTGCCAT GGTTCAGAGT 2460
GATCTTACTA GCCTAGTATA TTGGTTTGTT TTACATTGCT ATAAAGGAAT ACCTGAGACT 2520
GGGTAATTTA GAAAGAAAAA AGGTTTATTT GGCTCACGGT TCTGTAGGCT GTACAAGAAA 2580
CATGGCAACA GAATCTGCTT CTGGTGAGGA CTTCAGGAAA CTTTTCATCA TGGTAGAAGG 2640
TGAAGGGGAG CAGGTGTGTC ACATGGCAAG AGAGTGAGCA AGAGAGAGAG GGGAGGAGGT 2700
GCCAGGTTCT TTTAAACAAT CAAATCTGTG TGAACTCTTT CCTTTACCAT GGGGAGAGCA 2760
CAAAGCCATG CATGAGGGAT CCACCCCCAT GACGCAAACA CCCCCACCAG GCCTCACCTC 2820
CAACATTGGG GATCACATTT CAACATCAGA TTTGGAGGAG ACAGCTATCC AGATGAAATC 2880
ACCTAGTTAA CTCTGGTGTT CTTTTTTCAG GACCCTTTCC CAGTGAGTTA AAATTAAATT 2940
TGTGAGTTTA TTAATAGGTC ACACAGCCTA TTTGGAAAGT AAGTTTTTTT GCCTTCTTGT 3000
GAGAAGACCT GAAGATTATT CCTCTACACT ACCCTGGTGG AACGCCAACC TTGAAGAATT 3060
AGAAATAAGT CCTTCTGCTT CTCCCATGGG TCACTTTATA GGGAAAATGC TTGATCAGGG 3120
GAGGTCTTGG TCTTTAGCGG GAAACTAAGT CTACTCTGTA 3160