EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-01320 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:221884040-221888100 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs72736544chr1221887903hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:221888061-221888082TTTTCCTTTCCCTTTCTTTTG+6.21
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:221885206-221885217AGCCACTCAAG+6.62
POU2F2MA0507.1chr1:221887859-221887872TTCATTTGCATAA+6.67
Pou2f3MA0627.1chr1:221887858-221887874GTTCATTTGCATAATA-6.94
YY1MA0095.2chr1:221887776-221887788CAAAATGGCGGC+6.92
ZNF263MA0528.1chr1:221884159-221884180CCCTCCTTCTTCCTTTCCTCT-6.01
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04249chr1:221879916-221887014Brain_Anterior_Caudate
SE_05268chr1:221878604-221887069Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05268chr1:221887671-221893218Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07639chr1:221879961-221893689Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08233chr1:221879013-221887264Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09465chr1:221874588-221887471CD14
SE_09465chr1:221887611-221890943CD14
SE_12905chr1:221884503-221886669CD34_Primary_RO01480
SE_13404chr1:221878901-221887413CD34_Primary_RO01536
SE_14214chr1:221880235-221887122CD34_Primary_RO01549
SE_20410chr1:221879948-221887157CD56
SE_26005chr1:221879909-221886983Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26005chr1:221887429-221893752Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29951chr1:221881012-221885845Fetal_Muscle
SE_32563chr1:221884897-221887577GM12878
SE_36211chr1:221884199-221886891HMEC
SE_37566chr1:221884558-221886221HSMMtube
SE_48429chr1:221884109-221884872Psoas_Muscle
SE_48429chr1:221885048-221885948Psoas_Muscle
SE_51295chr1:221880793-221886889Skeletal_Muscle
SE_52175chr1:221884233-221886025Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52175chr1:221886142-221886886Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54816chr1:221879956-221886079Stomach_Smooth_Muscle
SE_63303chr1:221886936-221925458NCI-H82
SE_64034chr1:221884116-221886904HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1221887766221888016
chr1221887774221888031
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I221706chr1221880043221887540
GH01I221714chr1221887582221894075
Enhancer Sequence
TATTTTTCCT AAACAAATAT ATCTGATTTC ACTTTGTTGG TCCTAGCTTT CCTAACAAAC 60
ACTGTCTTTG CATTTCTGGT TTTTCCACAG AATTGGATTT TGAAAATAAA ACTGTTCTTC 120
CCTCCTTCTT CCTTTCCTCT AATTTCTACC AAGGTGGCTA ACTTCCTTAT GTGCACAAGA 180
GCCTGCAGTT ATTAGTGCGA ACATATTGTA GCCATGAGCA ACAATGCTGG GGTAGGGTGA 240
GGCAAGGCGG GGTGGGGGGG CAGCAAACAT TTTCAAAGCT TATGTCAAAA GTAGGTTCTC 300
TGCCAAAATG AGTATGGTCA GTACATTGAT TCTAAATGGC AGCAACAAAG AATACCTAGC 360
ACCCCTAAAG AACTATATGT GGAAATACTG CCTGCCAGTT TCTTCTAACA CACGGTCAGT 420
TCAGTGACAG TCCTACTGAA GCAATGGATT CTAGTTTTAG TGGGAAACTT CTCTTTATAG 480
ATGCATTTCA GCTCCTGTTG CTGTTTTGGC GACTGCAGTC CTAGAAACAG AAGAGTCCTC 540
TGTAATGTGA TTCAGAAGCA ATGCGCTGGG TTGTGAGTTA AAGAAACCAC ATCCAAATGC 600
AGAATCTATA AGCAAGAGAT TTTTATACTC TAAAGGTGGA CAGCCCTTTT TGGTCTTATG 660
CTAAGCTAGA AAGTGAGCTG TTTCCAGAAA TTTAAGGAAC ACTCTCACTG AAGGTCAGCA 720
AACAGAAGTA ATGTCCAAAG ACCAGGGGGA GGGGTGTAGG CTAAAATTGG ACTCTTCTAC 780
AGTTTGCTAT AAGCATATTG ATCACCCCTC TCTGTTGCCT AGTTTTTCTT ACTGAGTAAC 840
CAGTCTTTTA AAGTAAAACA GTACCTTGAT GATAGTGGTT AAGATCATAG ACTGGAGCCA 900
GATTGCTTGA GTTAAAACTC CTGACTCCTA TCACTTACCT TGTAACCTTG AGCAAGTTAT 960
TGATGTCTCT GCATCTCAGT TTACATATCT GTGACTTGTA ATATAATAAT TTCTATCTCA 1020
CAGAGCTCTC AATATGGATA AAATGCTACA TGAGAGTTAG GTGTTTTATT ATAAGTGGGA 1080
GAGACATTGC TGTAAGTTGC ATACTATTTT GTTTATACCA GGAACAGATG GATGCTATGA 1140
TATACTCCAT GGAAACAGAA CATCAGAGCC ACTCAAGATT CTATAAGCAC AAGAATCTGT 1200
GGAAGAACAA AGCCTGGATG AACTGGAGCT GATGTCAGGC TGCCAAGGCT GAAATCTTCT 1260
TCAAAGACAG GGTCAGAGTC ACTTCATAAG TTTCAGGGCA GAATATCACC TATCTTAACA 1320
GGAGAAACAT GTGGGGTGGT GGTGGGTACC AGCTCGATCC ACAAAGATTA TTTCTACTTC 1380
TTGTTTTCTA TGAAATGTTC TTTATACTCC ATAGATGTGA TTGGGTATTT TACAGTAGGA 1440
ATTGGGTATT TTACAGTAGG GTATTTTCAA GTTCAAGATG AAAATCATTC CTACTGTAAA 1500
ATACCCAAGG AAGTATTACT TAAATTGTCT TAGGATCTTG CCCCCAGGGA ACTTGTATTT 1560
CTTTCCCAAG AAGAGTAAAG GGAGGCCCTA TCAAACAGAG GCAGAGAGAG TTGAATGGGA 1620
GTGCTGTCTC ACTAGGTATA AGGTATGAAA CAAGAGATAA AGAAGTATTT ATCTTACTCA 1680
GGGGAAGAAA GAGATTTAGG AGGCTGACTA TGAGTCAGAG AGAAGTCTTC TTATGATCAC 1740
GTCATTTGAC TGCTTCCCTC AAACCAGTGT GGTCTGGCTT ACATGTGAGA TGCCTTATGT 1800
TTGAAAAGAC ATAAACAAGG AAGTATCACA AGCTTAAAAT ACACACATAT ACATAAAACT 1860
TCAGATATAC TCATATAACA TAATGGGATC TTGAATCCCA TTGAGTACCC ATCCACATTA 1920
TTTGGCTTGC TATATTATTA AGTCTTTTAG GAAGATATAT CTAAAAATAA GTTAGTCCCT 1980
CCATTCATGG GTTTTTCCTG TGTGAAGGAG ACACAGTTAT CTACAGATAT ATCTTAAAAG 2040
CCAACTCTAG AAAAGACAGT GGATGATATA TAAAGCAGCA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA 2100
AAGAGCTTTG CCTTGGATTT AGAATAGTGG GTCTGCCACA TGCCAAGTGT GTGACTTTTT 2160
GAAAGTTATT GAAGTATTCT GGGCTATCTT TCCATAACTA TAAAATAGGA TACTACTACT 2220
TAGGTCTGTC GTAATGATTC AATGATTTTG TGTGTACAAT AGCCATCCTG GTATTTTAAG 2280
AAGGCATTCA AACCCTGCAG CTATTTGAAT GACTGTCAAA TGGAGCAGCA AAGCTAACTA 2340
GCACTGGAGG TAGTCAGATG CAGGAAGATG ACCAGAGACT ACAGGGGTCA ATGTCAGTGT 2400
TGCTAGAGAT GAACTTTTGA TGCTGGTACA GTTGCTTCAG AGCAGTAGGA AAAGGAGACC 2460
ATCCTGCAGA GGCAACCCCA TGCAAGGGCA TCACCAGAGA GGGAGGACAA AGCAGGAGCC 2520
ATGAGGACAG CCCACTGTAG CTCTGCTCTG CTAAAAGTGT ACTCAGTGCT GTTAGCCTAG 2580
TCTACACTCC ATCACTGCCG GAGGAAGTGG CATGCAGAGT GGGGGTTGGG GCTGGTGGTT 2640
AGTGTGGTCT CCCTTGAAAA CCTCATTATA TTTAGTTCTT TATGTCTACG ATTTTCAGAA 2700
GCCTTGAAAA AAAAGACATT TTTTAGGCAT ATCGAATAGC CAAAAATACA TTTCTGGTAT 2760
ATTCTCTAAA AATATATGCA TACTTCTAGA AATTTTTGAA ATGGACGTAC AGAAAAGTTA 2820
TCACACACAC AACTTTTTCA TACCTCAATT TCCTCAATAA GTTGAGGTGT TTACAGTTTT 2880
TCTCAGAGTC ATTCTATAAA AACTTAGTTT CAACAACTTA TTATATGTAT ACATGCAGCC 2940
TCATTCTACA ACTATAACTG CATTATTAAT ACATATTCTT TTAAAATGTA TTTTCCTTTC 3000
TGTGTATATC CAGATTAAGA GCTTTAATAG AATTTAGGTC CTTGGAGAGC AGGACTAGTC 3060
TTATTTAAAT CCCTTTGTAC ACAGGAATTA GCCCCAAGTC ACATGAAGAC AGGTGACTGC 3120
TGATATGTTA GATACCAATA GGAGCTACAG GGAAAGAGGT ATTGAGATAG GTGGTCAATT 3180
TCTTTTTGGA AATAATTTAC AAAAACTTAA TAAAATAAAA AGATCTTCCT GGTGTTTTCC 3240
TAGTGATAAA TGATAGGCTG AAATCATTTC CAGAATAGCC CTCCCAAAAC TATCTTCCAA 3300
TAATAAAAGT TGTTCATTTT TATTTAGTTC ATCTAACCAA GTAGTATTTA GTAATGTTTT 3360
AAGAGAAAAA AAAATTCTGA AAAGTTGATA CCAGAATTTG CCTGAATTTT GAGTTAACAA 3420
TAGTCTTTTC TTTGGATTGT CTGGACAAAA CAACATAATA TAGAATACTG AGGCTTACAT 3480
GAAATAGACA TTGCTTGAGT TGTCATCGTA TAGTAACTTT GGTATCATAG TGATACAGGA 3540
GTTAAGAAGA AATTACTTAG GCAGATAGTG AGGGTACAGA AGTCCTCCGT AACGTTTTCC 3600
TTTTAATGAA AAGCAGCCCC AAATCATTTT CAACAGAGAG CAGCCTGTAA AGTTGAGCTG 3660
CAGACACAGA CAAGCAAACT GAGAGCTCGC ACGTGTGGAT GCCAGCAGGA AAGAATTACC 3720
TGCGACTAGA CATGTTCAAA ATGGCGGCTC CATCTTCCCT TCTCTGCCGG CCACGTGTAC 3780
AGTAAGGAGC AGACAAGATG GCGCCAGGCA AGGGGAGAGT TCATTTGCAT AATAAGATTA 3840
GGGTGGGGTG ACCAGCCTCC CCTGAGTGCT GTGTAAACCT CACACCTGAT CAAACCAATC 3900
TGTGAGCCCT ATGTAAATCA GATACTGCCT CCTCAAGCCA GACTATAAAA TCTGGCACAT 3960
CCACCACCAG TCGGCCTTTT TCCTCTGGGA AGTCACCTCT CTCTCACTAA AGAGCGAGCT 4020
GTTTTCCTTT CCCTTTCTTT TGCCTATTAA ACCTCTGCTT 4060