EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-01242 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:206880480-206882520 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr1:206881521-206881538CAGGTCACCCTGGCCTT+6.01
ESR1MA0112.3chr1:206881521-206881538CAGGTCACCCTGGCCTT-6.29
ESR2MA0258.2chr1:206881522-206881537AGGTCACCCTGGCCT+7.6
RREB1MA0073.1chr1:206881047-206881067TGTGTGTGGGGGTTTGGGGG-6.93
mix-aMA0621.1chr1:206882085-206882096CCTAATTAATT-6.32
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00569chr1:206877533-206881955Adipose_Nuclei
SE_18978chr1:206875455-206882087CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26063chr1:206878295-206882106Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29888chr1:206877940-206881907Fetal_Muscle
SE_31968chr1:206879401-206881247Gastric
SE_40628chr1:206875489-206884225Left_Ventricle
SE_42239chr1:206876991-206881816Lung
SE_45992chr1:206875908-206884575Osteoblasts
SE_48186chr1:206875489-206881953Psoas_Muscle
SE_48619chr1:206876986-206881752Right_Atrium
SE_49496chr1:206878752-206880748Right_Ventricle
SE_50514chr1:206879489-206881754Sigmoid_Colon
SE_51178chr1:206875456-206881974Skeletal_Muscle
SE_52589chr1:206879485-206881804Small_Intestine
SE_52589chr1:206882226-206883485Small_Intestine
SE_54245chr1:206879332-206881757Spleen
SE_59174chr1:206876376-206918919Ly3
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1206881200206881974
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I206709chr1206882446206884426
GH01I206702chr1206875994206881945
Enhancer Sequence
GGACCTAGAC GGGGTATCCT GTTGTCCTGC ATGATGAGGA TCCCAGATTT CCCCTAGGTG 60
ATGACCACAG TCATTCCAGG GTGGGAGCAG GACTTCCCCC ACCCCCAGGC ACTCCAGAGA 120
CTTCCTCCAG GCCCCCACTA AGTAGTCTGT TCCCAACTCC ATCTCTCCCC CATGGAGAAT 180
GGTGGGAAGG AAGTTCTGCC AGAGGTTGTT TTTGGTTTGT GAGGTAATAG ACTTTGGTTT 240
GAGAAACATA CATCTCTCCC TCTTCTTTAA GATGTGAAGC CAGAAGCACC AGACTCTGGT 300
TTCCTTGGAA ACCAGAGCAG CAAAGGTAGA GAAAAAAGGG GCTGGTTGTA GGCACTGAAA 360
TTGGGGAGGA TTCTCTGGAT CCCAGCACTT TTCTGGGGAA TCCACATGGT CTGCCCTGGG 420
CCCTGGGTTG TAGCCCTCAC TGTGTTAATG GACTGTGTAA CCTTGGTAAA ATGCCTGCAA 480
CTCTCTGCAC CTTAGTTTCC GCCAAGATGC CTAAGGTGGG GAACATGTTG GCTCCACTCA 540
GATTCTGTGC CCCAGAGACC TGCTGGGTGT GTGTGGGGGT TTGGGGGTAG GGCATGGGGC 600
TCCTGCTCAC TGATTTAGCA TTTGCTGTGG CTAAACTACA AAGTGGACAG TCCACATGGA 660
GACAGTTGAG AGCTACTTGC ACCCAGGTCC TTTCTTTGAG AATACAGTGA TGTAACAGGA 720
GACTTCTTGC ATTTTGCCTA TGTGAAACCA GCTGGATTTT GCTGAAGCTG TAATTGTGTC 780
TCTACATTCT TTGATTCCTG TCTAAAAAAA ATGGTTTCCA CAAATGCTGT GAAGAATAGA 840
CTGACAGAGC TGGAAAGCGT TAAGTAGGGA TCCTTTAAAC AGATCCCTAC ATTGTACATT 900
GATCCCTTCA ACCACAGCCA GAGAGGGGCA GGGACTTACT TGCTCTGATC ACACAGTCAG 960
AACAAGAACT AACAACAGTA AAGGTCTGGG TAGCAGCCTC ACATATGCTA AGATTCCCTG 1020
TTGGCTAAGT TTGTCTGTTC CCAGGTCACC CTGGCCTTTT GCAATTCTGC CCTCCGCAGG 1080
CCCCTGTGTT GGCTGAAACC AGCCCTCTTC TTCCCCTTGC GCTTTCCTCC TGTGACCTCC 1140
CAGCCACCTC TTGTTTCCCC TGTGGTGTTC CCCACCTGTT GTTACTTCCT ATTCCTCCTC 1200
ACAACTTTTT ATTATGAAAC ATTTCAGATG TGCAGCAAAC TGGAAAGAAT TGTACAGTGA 1260
ACATGATTAT ACCAAACCAC CTAGATTCAA CCATTAGCCT TTTACTATGT TTACTTTATC 1320
ATGTCTCTAC GTGTTTCAAT CTCTCTATCC ATTGACCAGT CCATCTTATT TTGGGGATGC 1380
ATTTTGTAGT AAATTGCAGA CATCAATGTA CTTTACCCCT AAACATCTCA GCATACATAG 1440
GCATTAATTT GAGTTCAATA TTTGTTCATG CATTTTTTTG ATGATAATAT TTATATTAAC 1500
AGTGAAAAAT GCACAACTCT TAAGGTATCA CCTGATAAGC TTTGATAAAT GCCTCTATCT 1560
GTGCAACCCA AACCTCTGTC AACTATAGAA CAAAAAGTTT TATTACCTAA TTAATTCCCT 1620
CGTGTTGTTT CCCAATCATC CCAACACATA CCCCCTCGCA AGTGATCACA GTTCTGATGT 1680
TTTCTCACTG TAGATTAGTT TTGCTTTTTC TGGAACCTCA TATAAATGGG ATAATCAGTA 1740
TGAACTCTCC CTTTTGTGTG AATTTCATCT GCATGGTGAC ATGTATCAGT AGTTTGTTAT 1800
GCTGAGCAGT ATTCCATTGT ATAGATATGA TAAAATTTGC TTCTCCATTC CCCTGTTGAT 1860
GGACATTTGG GCTGTGTCCA GTTTTGGGCT ATGATGAATA AAGCTCCTGT TAACATTCTT 1920
GCACAAATCT TGTTGTGGAT GTAATGTTTT CATTTCTCCT GGGTAAACAA CGAGGAGTGT 1980
GATTGCAGAG TTACAGGAGG CTGTTACTTA TTGTTCCTAT CTGACTCTCT GCCCTGCCCT 2040