EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-01045 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:169648940-169653640 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs16862512chr1169649691hg19
rs7531806chr1169651044hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:169650332-169650342TCTAATTAAA+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:169653523-169653541TCCTCCTTCTTTCCCTCC-6.07
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:169653527-169653545CCTTCTTTCCCTCCTGCC-6.75
NR2C2MA0504.1chr1:169653611-169653626TGACCTCTCCCCTCT-6.33
STAT1MA0137.3chr1:169650178-169650189TTTCCCAGAAA-6.02
STAT3MA0144.2chr1:169650178-169650189TTTCCCAGAAA-6.32
TCF7L2MA0523.1chr1:169649001-169649015AAACTTCAAAGGGA+6.74
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10569chr1:169647849-169652512CD19_Primary
SE_11089chr1:169642623-169653758CD20
SE_18548chr1:169647785-169652059CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_58649chr1:169639952-169681619Ly1
SE_58866chr1:169645496-169682054Ly3
SE_62308chr1:169636484-169681753Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1169649404169651723
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I169679chr1169648865169651709
Enhancer Sequence
TTAAGTAACT TGTCCAAGTT ACAGAGCTTA GTGAAGCCAC AATGTTGCTC AATTTGCTCT 60
CAAACTTCAA AGGGATGGGA AGGACACCTA AGTCATAGAG TCTTTAAGAA TCAGAGCTAG 120
AAGGAATCTT AGATGTTATC TAGTCAGCCT CCTCCCATTA CAGTCCAAGA GAAGATGGCC 180
CTGAGTTACT TGTAGCTATT TTTGCATGTG AATTGCAAGT GAATATACAT TCTACTGAAG 240
ATAAAAGATA TTTAAAGATA TCGCTGGATA TAGGAACAGT GGTTTTAAAT CTCTAGGCTT 300
TAACTTTTCT CAGAACAAGA AATCCTTTTT GGTTTTAATC TATATGCACA TCTGTATTTT 360
TCTCAATTAT CGGGTAGTAA AATATAACTT TTCTTCTGTA ATATTTTTTA ACTTTAATGA 420
GTGTTCCTCA TAATAGAAAA GTTTGGAAAC CATTGCTATG GGTATATACT TTCTAAAGGG 480
ATAGTAATTT CTCTAGAATA TTCATTTAAT GCTCCAGAAG TAATTAGCAC AATTGTGCAA 540
GTCTGTGCAT CATCAACTAT ACATTCTGCC TGTTTACTCC AAATCCACAT GAAACTGATT 600
ATACAGTCAA AGGCGAGCCC AGTGGAGAGG CATTTTTGGA GACTTCCTGG TACATTGAGA 660
CAGGGTCGGC CAGTCTGCGT TAGGGTCTTG GTCAAAACTG CATTTCTGAA ACTAAACTCA 720
GATTGCTTTC TTTTAAGGGG TCAGAACTGA TTCAAATCTA CATTTTTAAA AGCCTTAGAT 780
GTGGGGCTTT TCCTATTCCC AGTCTCCGCT ATTGGTCTTT GTGAATCCAC AGGCAATTTG 840
GCCACATCCT TGACTCTCTC TTATATTAAG AATTAAACAG CTAAGTTCAT GCAGAGGAAA 900
TATAACAAAG GAGGGACTTT CCTACAAGAT CTTTGAAAAA TGGAACATTT GCATAAGTCA 960
TATTTAGCCA GAACTGTTGT TTTATATTTT CCTTTCTGAA TACTTTGTTA CACCTCCTCC 1020
CAGCCAACCC CCCCCCTCCC TGACCCCAAC TAGTCAGAGA CCAAAGCCTT CACAATGGTT 1080
TACACTTGAA CCTTCCTGGC CCCACCCTCA TCATCACGCC TGAATAATTA CATTCACTGA 1140
CTGGTCTCCC CTGCTTCCGT TTATCTCCAC TCCTAAACCC TCTGACACCT TAATCTTCCC 1200
AGAATACCAT TGTGATCCTG TTCCACTCTT GCTCAAGTTT TCCCAGAAAC TAGAGTACAA 1260
ACTTTATAAG CTTTAGAGTT GAAAGCCACT CTATCTCTTT TTCATCCCCA GGTCTCTGCC 1320
AAGGCAGTAT AACCTGTCCA ACATCTCTAA CTTCAATACC TTTGTCTTAG ATACTAGACT 1380
CTCCTCCTGG TTTCTAATTA AACCTGATCT AGGATCTAAT TTTGCCTCTG AATTCTGTTG 1440
CCCTTTGCCA AGTGATCTCT TCCTCCTCTG AGCCGCAGCA TCTCTGAGCT TGCACACTTA 1500
GCATAGCCAT AGCACACACA GCCTTAGCTT GCAGTTCAGG GTGTTTACCT TCCCTCCCCT 1560
TCCAGATGCT GGATCCCCAG GGATAGGAAC TCTGCCCTTA TGTGTCCATA GCCCCTGGTA 1620
GTATGTCTTG CAGTCGTACA TTTTCAGCAA ATGTTTAATT GGTTAATTGA AGACAACTGT 1680
CCCATGCCTT AAGCCTCTCT TTTTGCTAAA CATGCCTGTG TCCTTTGTCA TTGAACAACT 1740
ATTTTGATCT ATTTTCTTCC TGACATAGGG GTCAGTTCCG AGGATGCTGA AATCAAGAGA 1800
CATAGCTTAT TCTCTCAAAA TTGCTTTCAA GAGTGATTTT GTTGTGAATT GAGAACTGGC 1860
TGCCTACTTT TGGACTACCC ACTTCAGCAA GAGTGTTTGA AACCAAATCT ATTCTAAGTA 1920
ATTTTTTATT CCCTTTTCTC TATGGCATTA GACACACAGC TCTTTTAAAC TACCTTTCGT 1980
TATCTATTAA ACAGACATTC AGTAACTCTA TAGACACTGT CTAGCTATAT GAACTTAGAC 2040
AAACTAATAT CTCTGAGCTT CAGTTTCTTA AAATTTAAAA TGAGGACAAT ACCATCTATG 2100
GCCGGGGATT AAATGCTATG AGGAATGTAA ACCAGATGTC AGGTACCATC TCTCTAAAAT 2160
CCAGATAAAA TGAATTAAAA ATACTGGCCG CAAACCCTCT CTAAGAGTTC TCAAAATTCT 2220
CAGAGAGCTT AATTTTCATG CTCACCATAG CACCGATTTT CTTCTAAATA TTTTGTTTCT 2280
ACCAAAATAT TTTGTCCCAA TTTTGCCTTT TATGGCTATT TCTTCATATC CACTTTCCCA 2340
AACTAAAGAA GCAGCCCCTT CACCTTAAAC TCCTCCTTCA AAGCAACCTA AATACAGGTC 2400
TGGGTTTGTA TTCCTAGTGG GATGTTACAG AGGTTAGTGT GATGCAGAGG AGGAGTCATG 2460
CTGTTTAAAT CCATACTAGT CCCCAGAGGC CAGGCTGCTT CTGCCACCCC TACCCCTCCC 2520
GCCACAGAGC TCTTCAGCTT CTCACATTTC TAGTTCTTCT CTCTCTACTT TCATTACCTT 2580
CTCTCTTTTT TTTTTTCTTC TCATGTGCTC ACGGGAGCAG AGAAAATTAA CTCCTCTAAG 2640
TTTTCTTAAC ACAGAGTGCC TTAATTACAT ATTACTATTG TTTGAGTTCC TGCCAACACT 2700
ACGTCTGTAG GGTCACACCT GCTATATTAG AGGCTTATCA AAAAAAGATA GCTTTCTCCT 2760
AAAAAGGGAT TTGGATGCCT ACTAAGATAA CTGGATGCCA AGATAAGTTT AACCTAACAA 2820
ACTTTATTAT TATTATTATT ATTATTATTA GAGATAGGTA CTTATTCTGT CACCCAGACT 2880
GCAGTGCAGG GATGCAATAA TAGCTCACTG CAGCCTCAAA GTCCTGAGTT CATGCAATCC 2940
TTCTGCTTCA GCTCCCTGAG TAGCTAGGAC TACAGGCATA TGCTACTCTG CCCAGCTACT 3000
TTTAAAAAAA TAATTAGGGA TGGGGTCTTG TTGTATTGCC CAGGCTCGTC TCAAACTTCT 3060
GGTTTCAAGC AATCCTCCTG CCTTTTACCT CCCTAATTGT TGGAGTTACA GGCATGAGCC 3120
ACAGCACTCA ACCAAGATTT AAAAACTTTT AAAAGAAATC ACATTACTTA CTGTTATCAT 3180
CATTATGGTT ACTACCAGTG TTAAAACAAT TGGTATTGAA AACACCACTA CCAGATCAAG 3240
CTTCAAACCA AGATGTCAAG TAAATATTAT TGTCAGACCT CTGAGCCCAA GCCTGCAGGT 3300
ATACACCCAG ATGGCCTGAA GCAAGTGAAG AATCACAAAA GAACTGAAAA TGGCCGGTTC 3360
CTGCCTTAAC TGATGACATT CCACCATTGT GATTTGTTCC TGCCCCACCT TGACTGAGGG 3420
ATTAACCTTG TGAAATTCCT TCCCCTGGCT CAGAAGCTCC CCGACTGAGT ACCTTGTGAC 3480
CCCCACCCCT GCCCACAAGT GAAAAACCCC CTTTGACTGT AATTTTCCAC TACCCACCCA 3540
AATCCTATAA AACAGCCTCA CCCCTATCTC CCTTCGCTGA CTCTCTTTTC AGACTCAACC 3600
TGCCTGCACC TAGGTGATTC AAAAGCTTTA TTGCTCACAC AAAGCCTGTT TGGTGGTCTC 3660
TTCACACAGA CCATGTGACA TTTGGTGCCG TAACTCAGAT CGGGGAACCT CCCTTGGGAG 3720
ATCAGTCCCC TGTCATCCTG CTCTTTGCTC CATGAGAAAG ATCCACCTAT GACCTCTGGT 3780
CCTCAGACCA ACCAGCCCAA GGAACATCTC ACCAATTTTA AATTGGGTAA GTGGCCTCTT 3840
TTTACTCTCT TCTCCAGCCT CTCTCACTAT CCCTCAACAT CTTTCTCCTT TCAATCTTGG 3900
CACCACGCTT CAATCTCTCC CTTCCCTTAA TTTCAGTTCC TTTCTTTTTC TGGTAGAGAC 3960
AGAGGAAACG TGTTCTATCT GTGAACCCAA AACTCCAGCA CTGGTCATGG ACTTGGAAAG 4020
ACAGTCTTCC CTTGATGTTT AATCACTGCA GGGATGCCTG CCTGATTATT CACCCACATT 4080
TCAGAGCTGT CTGATCACTG CAGGGACGCC TGCCTGGATC CTTCACCTTA GTGGCAAGTA 4140
CCACTTTGCC TGGGTGGCAA GCACCACCTC TCCTGGGGGG CAAGCACCAC CTCTCCTGGG 4200
GGGCAAGTAC CCCCCAACCC CTTCTCTCCA TGTCTCCACC CTCTCTTCTC TGGGCTTGCC 4260
TCCTTCACTA TGGGCCACCT TCCACCCTCC ATTCCTCCCT TTTCTCCCTT AGCCTGTGTT 4320
CTCAAGAACT TAAAACCTCT TCAACTCACG TCTGACCTAA AACCTAAATG CCTTACTTTC 4380
TTCTGCAATA CCGCTTGACC CCAATACAAA CTCAACAATG GTTCCAAATA GCCTGAAAAC 4440
GGCACTTTCA ATTTCTCCAT CCCACAAGAT CTAAATAATT CTTGTCGTAA AATGGACAAA 4500
TGGTCTGAGG TGCCTGACAT CTGGGCATTC TTTTACACGT CGGTCCCTCC CTAGTCTCTG 4560
TTCCCAATGC AACTCATCCC AAATCCTCCT TCTTTCCCTC CTGCCTGTCC CCTCAGTCCC 4620
AACCCCAAGT GTCGCTGAGT CTTTCCAATC TTCCTTTTCT ACTGACCCAT CTGACCTCTC 4680
CCCTCTTCCC CAGACTGCTC 4700