EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-00842 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:150583060-150587240 
Target genes
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4970966chr1150584103hg19
rs12045807chr1150584834hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSL2MA0478.1chr1:150586157-150586168GGATGACTCAG+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:150583437-150583449GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:150585737-150585749AAACAAACAAAC-6.32
HLTFMA0109.1chr1:150583115-150583125ATATAAGGTT-6.02
HLTFMA0109.1chr1:150583421-150583431ATATAAGGTT-6.02
HNF1AMA0046.2chr1:150584460-150584475AGTTAATTTTTAATT-6.49
JUNBMA0490.1chr1:150586157-150586168GGATGACTCAG+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:150583674-150583689TGAACTCCTGACCTC-6.22
Rhox11MA0629.1chr1:150585292-150585309AAGATGCTGTTAAACAT+6.59
SRFMA0083.3chr1:150583416-150583432AGCCCATATAAGGTTT+6.05
ZfxMA0146.2chr1:150585135-150585149CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10034chr1:150581598-150589095CD14
SE_13034chr1:150582882-150587632CD34_Primary_RO01480
SE_13478chr1:150581835-150589003CD34_Primary_RO01536
SE_14186chr1:150582566-150587408CD34_Primary_RO01549
SE_14726chr1:150581631-150589008CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18894chr1:150581637-150590010CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19754chr1:150581754-150587333CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26372chr1:150581394-150588445Duodenum_Smooth_Muscle
SE_34907chr1:150581681-150588976HeLa
SE_36278chr1:150581656-150587296HMEC
SE_38345chr1:150581689-150588426HUVEC
SE_40500chr1:150583737-150584877K562
SE_40500chr1:150585014-150587099K562
SE_45206chr1:150582750-150587242NHLF
SE_56524chr1:150582934-150583594u87
SE_56524chr1:150583609-150588921u87
SE_64527chr1:150582922-150587080NHEK
SE_67845chr1:150582934-150583594u87
SE_67845chr1:150583609-150588921u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1150585611150586454
chr1150585815150586394
chr1150583722150584851
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I150609chr1150581478150588958
Enhancer Sequence
GAGCCACCCT GCCCGGCCCC TCTTTTTGTA TATCTAATTT AATTCTAACA AAAACATATA 60
AGGTTTTTAG TTTAGTTTTT GAGACAGGCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGTAGA 120
TATGGCTCAC TGCAGCCTTG ACCTCCTGGG CTCAAGGGAT CCTCCTGCTT CAGCCTCTGG 180
TACAGCTGGG ACCACAGTGC GTGCCACCAC ACCTGGCTAA TTTTTAAGGT TTTTTTGTAG 240
AGATGGGGCC TTACTCTGTA GCCTAGGCTG GTCTCAAACT TCTGGGCTCA AGTGATCCTC 300
CCATCTTGGC CTCCCAAAAT GCTGGGATTG TGGGCATAAG GCACCACGCC CAGCCCAGCC 360
CATATAAGGT TTTTTTTGTT TGTTTGTTTG GTTTTTTTGT TTTTTTTTTT TTAAAGACAG 420
AGTTTTGCTC TGTTGCCCAA GCTGGGGTGC AGTGGCACGA TCTCAGCTCA CTACAACCTC 480
TGCCTCCTGG GTTCAAGCGA TTCTCCTGCC TCAGCGTCTC GAGTAGCTGA GATTACAGGT 540
GTGCACCACC ACGCCCAGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACAGGTTT TCACCACATT 600
GGCCAGGCTG GTCCTGAACT CCTGACCTCA AGTGATCCAC CTGTCTTGGC CTCCCAAAGT 660
GCTGGGATTA CATGCTTGAG CCACTGCACC TGGCCCCATA TAGAGTTTTT ATTGTCATTA 720
TTCCCATATT ACAGATGAAG GGACTAAGGC TCAAAGGGTA AATAAGTCTG TTCTTAAATA 780
GTGACTTCCT GAGACACAGG AGATGTTTAA GAACAGTACT GGTAGGTGGG AAGTGGCATT 840
TTGGAGCAGG AGTGAGAAGC ATGAAAATGT AGCAAGAATA GAAAAGGGTG GGAAAACAGC 900
AAATTAAGAG GAAGAAAAAT GCAGGTCCTA GCAAGAATTG CTACTCACCA CTGCCAGAGT 960
CTGGGCCATG TTCTAGGTGT GTATTTAAAC AAATCTCCAT AGCAACCATC TGGTTTCTGT 1020
TTTTCTATGA CAACACGGGC TTGCATTTCT AAATACAAGC ACTGGTGAGG ACAAGTGTGG 1080
GCTGGGGAAG GGAAGTGGGA CCGCTGAGTC AAGGGGAAAT TGCGCAAAAA AGGCAAAGGT 1140
TCTCTTGGTA TGCCCTCATC TATCCCCTCC CAGCACACCC TCAAGGAAGG GGTCTTTCCT 1200
TGACTCACAG CAGTCATTGT TAAGAGCTGA GCCTTGTATG CACTTTGTCT TTTGTTTTGG 1260
AGACAGAGTC TGGCTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCGGTG GTGTAATCTT TGCTTACTTA 1320
AACCTCTTCC TCCGAAGTTC AAGCAATTCT CTTGCCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGACT 1380
ACAGGCGCCT GCCACCACTC AGTTAATTTT TAATTTTTTT GTAGAGACAA GGTCTCACTA 1440
CATCGCCCAG CCTGGTCTCA AACTCCTGGG CTGAAGAATT CCTCGTGCCT CGGCCTCTCA 1500
AAATGCTGGC ATTACAGGTG TGAGCCACTG TGGCCAGCCC ATGATATCTT ATTTTTACCA 1560
ATTATGTAAA TTCCTATCTA ATTAGGGTAT ACCCTTGGTG CAAGAGGGGG AAGGGTAGAT 1620
GCTTTTGCTT CTCATTTTCA ACCCAGGTGG CACTTTTGGA GATACTGAGG GTAGAGAGAG 1680
GTTGGAGGAT CTCATCTGAT AAAGGTGTGG TAGCCCCAGA AAGAAAGGTG AGAAAAAGGC 1740
AGCTAGGCAT GGAGATGCAG GAATAAGAAT AGATACTGCC ATGAGGACTA AGTGGGCCCA 1800
GACCTGAGTT AAAACAGCCC CCCATCCCCG CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAAATGGAGC 1860
CTCTCTCTGT CACGCAGGCT GGAGTGCAGT GGCGCGATCT CGGCTCACTG CAAGCTCCAC 1920
CTCCCGGGGT TCATGCCATT CTCCTGCCTC AGCCTCCCGA GTAGCTGGGA CTACAGACGC 1980
ATGCCACCAT GCCCAGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC ACTGTGTTAA 2040
CCAGGATGGT CTCGATCTCC TGACCTCGTG ATCCTCCCGC CTCGGCCTCC CAAAGTGCTG 2100
GGATTACAAC AAGAGCCCCT TTCTTAAGCA TAGTGATTCT CAACCAGGCA ACCAGGCAAC 2160
TCCAGGGGGC ATTTGGCAAT GTCTGGGGAC TTTTCTGATT ATTCTGACTA AGCAACTAAT 2220
GGGTAGAGGA CAAAGATGCT GTTAAACATC CTGAAATGCA CAGGACAGTC CCTGCAACAA 2280
AGAATTACTT GGCCCAAAAT GTCAGCAGTT CCAAGATTGA AAAACCTGAG TAAAGAGATG 2340
CTGGTCCTAC AGGAAACGTC TCCTTTGTCC ATTGCAGGAG CACCAGTGTG ACAGATAAAA 2400
CCATTTGAGG GGGGCCGGGC ATGGTGGCTC ACGCCTGTAA TCCCAACACT TTGGGAGGCC 2460
AAGGTGGGTG GATCACCTGA GATCAGGAGT TCGAGACCAG CCTGGCCAAC ATGATGAAAC 2520
CCCATCTCTA CTAAAAATAC AAAAAATTAG CTGGGTGTGA TGGCTACCTG GGAGGCTGCG 2580
GCAGGAGAAT CGCTTGAATC TAGGAGGTGG AGGTTGCAGT GAGCCGAGAT TGCGCCATTG 2640
CTCTCCAGCC TGGGAAACAA GAGCAACACT CTGTCTAAAA CAAACAAACA AAAAACTATT 2700
TGAGGGGGAT ATACCAGAGA TGCCTGCTTG TTCCCCTGGG CCCTGAGTCC CTCTCAGACT 2760
TTCAGACCAA GTATTTTTAG TTTACTTCTG ACAAAAATAA ATTCAAGCCA GAATCCAAAT 2820
TTGCTGTGAA ATCAGCTGGT TCTAGAGAAT AGGGTATTTT CCTATACCCT TCTTGGTATA 2880
GGCAAAACTG CCCCACAGAG GCTGTGCAAT CAGGCAAAGG CATGCTCCTC TTGGCCTTAG 2940
TTTCACCATT TGTAAAACGA GTACACTGAA CTCAATGATC TCGAATGTCC CTTTAGTTCC 3000
AAAACTCTGT ACTTTTGGAC ATTTAAGAAA TATCCTGGGC TGTACAGTTT GGGTCTGTAA 3060
AAAAGGAAAT GACTCAAATG CAATAGAGGA AGCCTAAGGA TGACTCAGAC TTCCCTAATC 3120
ATAAACGACA CTTCAGACAT GGACCTTAAC GTCAAACCAG GATTCATGAT CACTAAATGA 3180
CTTTCCTTTT GTACGTGTGA GCAGGTGGCG TTCACCAGGG GTGAGACTTT ATTGACAGTA 3240
AGTTGCCTCT GCCAAAAAAC GCCCTCATAT GTCTGCTGAT GTTTGAATTT CTCCTATGCA 3300
GAGTTTTGTC TCCAGTTAAA AATGTAAATA CTGTTGTTTC TTGTTGGAGC TCAGAGGAAA 3360
AAAAGATAAC TACTCTAGGA TATGTATCAA TTTGATGCTA CTTTATTTTA TTTATTGAGA 3420
CAGGGTCTTG CTCTGTTGCC CAGGCTGGAG TGCAGCAGTG CAATCACAGC TCACTGCAGC 3480
CTCAACCTCC TGTGCCCAAT CGATGCTCCC ACCTCAGCCT GCCATTGCTG GAACTACAGG 3540
CACATGACAA CACGCCTGGC TATTTTTTTT TAATTTTTCA GACAGGGTCT CCTTACATTG 3600
CCCAGGCTGG TCTCAAACTC CTGTACTCAA GTGATCCTCC CCCTTCAGCC TCCCAAAGTG 3660
ATGGCATTAC AGATGTGAGC CACCTCACCC CAGCAAGTTG ATTTTTAACA AAAGATAACA 3720
GCAAAACCCC AGATAAATTA GCAAACTACC TTCACAGCTC GATGTGAGAA CTCTCTTAGT 3780
TTTATTTATT TATACACAGA GTCTCATTCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGCAAA 3840
CACAGCTCAC TGCAGCCTTC ACCTTCTGGA CTCAGGCTAT CCTCCAGCCT CAGCCTCCCA 3900
CGTAGCTGGG GCCACAGGTG CATGCCATCA TGCATGGCTA ATTTTTTAAT TTTTTTGTAG 3960
AGATGGGGGT CTCATTTTGT TGCCCAGGGT GGTCTCGAAC TCCTGGGCAC AAGCCATCTT 4020
CCCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCAT GAGCCACCAC CTGGCTCCAA TCTAAAATTT 4080
TATATTCTTG CTACAATGTT TTGAACTTCC AGGTTAATCA TTTCTGCTTC TAAATCATCT 4140
GCTCTTTGAC CTTATAAAGA GTTCTCTTAA AAATAAATAA 4180