EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-00499 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:53100730-53104790 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXH1MA0479.1chr1:53101814-53101825TGTGGATTGGA-6.62
FOXH1MA0479.1chr1:53101946-53101957TGTGGATTGGA-6.62
FOXH1MA0479.1chr1:53102078-53102089TGTGGATTGGA-6.62
MSCMA0665.1chr1:53104571-53104581AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr1:53104571-53104581AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr1:53104571-53104581AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr1:53104571-53104581AACAGCTGTT-6.02
RREB1MA0073.1chr1:53101026-53101046CCACCCCCCACCCCACCAGA+6.09
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10748chr1:53096945-53104928CD19_Primary
SE_11041chr1:53094424-53110405CD20
SE_12212chr1:53096995-53104689CD3
SE_16737chr1:53100871-53104488CD4_Naive_Primary_8pool
SE_20381chr1:53096948-53105006CD56
SE_21687chr1:53097189-53104360CD8_Naive_7pool
SE_22775chr1:53097032-53104959CD8_primiary
SE_60722chr1:53094816-53108250DHL6
SE_62619chr1:53096771-53108124Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr15310251053103405
chr15310150153101779
chr15310424953104308
chr15310285453102969
chr15310311453103352
Enhancer Sequence
GTATTTTCTG TTCATCCATA TATTCATTCA TTCATTCATT CATTCTAGCC TTTACTTTGT 60
GCCAGGCACT TTGCAAGGTA TTGGAGACAC AAAAATCAAT TATTCCCTGC CCCTGAGGAA 120
CTCACAGTTT ATTTAGAGAT ACAATGGTAT TCACTTGACA AGTTCATTTT GCTTGCTGCC 180
CAAAAAAACC AATGCACTGA GAACAACAGG TTTTGCAGCA AAGAAAGAGT TTAATAATCA 240
CAGGGCCAAC CAAGTGGCAA AATAGGACAT AATTCTCAAA TCCACACCCT CATTCCCCAC 300
CCCCCACCCC ACCAGAGAAT TCGGAGACTA TGGTTTCTCA AGGAATGGTG GCAGATGGGG 360
CTAGGGAATA GGGAATGCCA ATTGGTTGGG TTAGGGATAA AATCGTAGGG GATCAAAGCT 420
ACCTTCTTGC ACTGAGTCAG TTGCTGGGTA GGGGAGCTCA CAAGACCAGT TGAGCCAGTT 480
TATTGGTATG GGTTACTGGT CCAGGTGGCA CCAACTGGTC TATCAAAATG AAAGGTCTGA 540
AAGATACCTC AAACACCAGT TTTAGGTTTT ACAACTCCTC CTATAGGAGG AGTTGAGGAG 600
ATTACAAATC ATGTGACCTC CAGCTACACG ACTCCTGAAC CATAATTCTA ACCTTGTGGT 660
TAATTTGTTA GTTTAACAAA GGCAGTTGCA GTCCCTGAGC AAGGAGGGTG TTAGTTTTAG 720
GAAGGGGCTG TTATCATCTT TGTTTTAAAG TTAAACTATA AACTAAATTC CTCTTATAGT 780
TAACTTGGCC TGTGCCCAGG AATGAAGAAA GACAGCTCGT AAAGTTAGAC ACAAGATGGA 840
GTCAGCTATG TCAGATTTCT CTCACTGTGA TAATTTTTCT GTATCAGATT TCTCTTACTG 900
TGATAATATT CACTAGGGCA CTTTCACAAC ATTCACCTAA AGTGAAACAA TGAAGTTTTG 960
TTGAAGGCCC ACTGTGTAGT TGGCATTGAG CTAGGCTCTG AAATAAGATG GCACTGACCT 1020
CCCTTGTAAG TACAGAGACA ATGTGGAGCT TTGGGGCTGG TCAGAATCTG TCACTTATTA 1080
TCTATGTGGA TTGGAAAAGT TATTTAACTT CCTAGTATTT TCTCTCAACT TTAAAATGGT 1140
GATAGAGATA TTTGTGTGAT AGTACAGAGA CAGTGTGGAG CTTTGGGGCT GGTCAGAATC 1200
TGTCACTTAT TATCTATGTG GATTGGAAAA GTTATTTAAC TTCCTAGTAT TTTCTCTCAA 1260
CTTTAAAATG GTGATAGAGA TATTTGTGTG ATAGTACAGA GACAGTGTGG AGCTTTGGGG 1320
CTGGTCAGAA TCTGTCACTT ATTATCTATG TGGATTGGAA AAGTTATTTA ACTTCCTAGT 1380
ATTTTCTCTC AACTTTAAAA TGGTGATAGA GATATTTGTG TGATGGAATT GTAAGAACTA 1440
AGAGAAATAA TGCACATGAA AGTGACCAGT GCATATGTTA GGTGCTCAAT AAGAGAGTTC 1500
CCTTTCCTTG GTTCATAGGT GTGGGAAGTG AAATTCAGTG TGGAAGTGAA TTGTCCGAGA 1560
TCTCCTAGCA ATATCATAGC AGACTGAGAC TTAAAGAACA TTACCTAAGA CTATCCAAGG 1620
GTTAGATGCT CTCACACATT CACAACCCTG GCACTTCTCA TTTTACACAT GAGAAAACTT 1680
GAGAAAGGTT AAGTTACTAT CTGGGAGTGT CCCAGTGAGA GGCAGTGGCA GAGCTGGGTT 1740
GAAAACTCAG GCCTGTCTCA TCTCAAGCCC TGGCTTGTCC TGTCTACTAC TGTCTGGATC 1800
TCTCTTAACA ACCTGATCCA CTCAGATCAT CTGAAAAATA CTCACTGACC CTCTAGTGTC 1860
TTCTGGGCAC TGTGCTGGCC CCTGGGGACA CAGAGGTGAG TAATTCTCTC AGCACCCAGC 1920
CAGGACCCTT TCCCTCTTCC ACTAACCCCT TCCCTACACA GCTCTTGTGT CTTGTGGTCC 1980
CTTCCGTTGC CCTGGAAACT CTGACGTGGC ATGCTTTAGT GGCTCAGACA ATGCTTTCTT 2040
CGGGGGTTGG ATGGGCTGAT CTCTGGGGTA ACATCCCATG TCAGTGTGTT CCCATTCTGT 2100
GACCCCAAGG TGGCTAAAGG CTCTAGGGTG ACTCTTCCTG GACTCAGACA TAATGTGATT 2160
CATAAATACC ACAGACAATT GCAAAGTGCA GGAGAGGAAC TGAAAGTCCT CAGGATGTCT 2220
AGGGCATCAA CGTGCTCTGA ACCTTGAAAT AACTCTTCCG GCATGCTCCT AACAGAGCCC 2280
GGATATTGCA GGGTGGAGAC CTTGTTTTGC TGTAAATTCC GTTTGGCCCT TTTCATGAAA 2340
GTCAGTCCTT AAAAACTTCA AAATCTCCAG GTAAGCACTG TTTCCTGGGA GAGACAGTGC 2400
TCAAGGAGAA TTGCTATCTT TAAAATTGTG CCTCAGGAAG TGAAGACACC CTGTGGAGAA 2460
GCAGTTGGTG CTGTCACACC GTCTGGTCCA CTTGCCAAAC ACCCTCCTCC ATCACTAGTT 2520
CTGTTTTTTT ACGAGGGTGT GAGCCAGAAG ACAGCAGCCT TGCCGGAAGG CAGAGTTTGT 2580
GGTCAGACCG TGTCTACAGC ACCTCATTTC ATCCTTCCCA CCACCTGGTG AGATAGAAAC 2640
CTTTATAAAG GAAGAAAATG AAGGTCAGAG TGGTAAAGTG ATTTTTCAGC TTAAATGTGG 2700
CAGAACCAGG ATTTGAACTT AGAACTACCT GACTCCAAAG CCCTTGGTTG TTAGATTGTC 2760
CCTCCAATTC TTTCTTAGGA GTCACAGTGG GTTTTTATCT TTCAGAGTCA GAACAGTAAA 2820
ATCCTCGAAG ACTCGAGGCT CTCTAATTCA ATTTCCTACC CAGGGTAGGA ATCTCTAACT 2880
TCACTGAAAG ATATAACTCA TTCGTGTGTC CTGCACAAGC TTCTCCCATG ACAGGGACTC 2940
ATCCCTGCTT GAGGCAGTAC ATTCACCATG GAACAACTCG GATCATTTGA AGTTCATCTC 3000
ATGCCAAGCA CAGATTTTCC TTCTTTGGAG CCTGCCCTGT TGTTCCCAAC TCTGTCCTTG 3060
GAGTTTAGTT CCTCTGTCAC CAGGACAGAC CAGCAGAGAC AGTGCCTGCC CCCTGACTGA 3120
CCTCCGATCT GGAATGTATC ACCCCAGAGT CAGGGAAGAG GATGGGCAAG AAAGCTGGAG 3180
AAAGAATGGT AGACAGGGAC AAACAAAACT CTCCCCCTCA CTCCTCAAAG GGCCTCTCTT 3240
AGAGGCCCCT TTCTATCCAG GAACCCAGAG TTGTCCCACA CACGGGTCCC AAGCAAAGCA 3300
CAATTCTCCT AGATAACAGC CCTACGAACA GTAAGCATAT CTCAAATGAG AAAATAATGT 3360
TTAATTAAAG TAACTAAAGA ACTAAAAAGC CCTACATACT CAATGTAAAA AATGTGAAAA 3420
GGACAAGAGA AATGAAAAGA GAAAGAAGTC ATGAGTAATC CAGTGTCTAA GCTTGGATTC 3480
ACCAGGAGAC TCTGAGATGA GGATTTGATG GCAAGTAGTT TATGTGGAAA GTGATCCCAA 3540
AAATCACTGG TAGAGGATAA GAAAGTGAGA CAGGGAGAGA AAGAAGCCAA CAATGGGTGT 3600
ATTACCAAGC AAATTACACC AGAGGTAACT GGAGCTTAAA CTCTGCCAGC CAGTGTAGAA 3660
TGTACTCCTC AGGGTTATCC CACCTGACGG CCAGGAAGCT GGATATTTAG CTAACAATTT 3720
CTGTCAGTCA TCGGTCATGG GCTGGTGGGG TAAGGAAGGT ATTGATTATC CTGCACTATT 3780
GACTTGCCAG TGTGTCCACA GAGCCTGTTC TGGGCCCAAG AAACCCCTCA GACAAAGAGG 3840
TAACAGCTGT TTGCAATAGA AACTTTGGCC AGGATAGCCA AGGCGGGCAG ATTGCTTGAG 3900
CCTAAGAGTT GGAGACAACC TTGGGCAACA TGGTGAAACC CAGTCTGTAA AAAGAAATAT 3960
TAAAATTAGC TCGGTGTGGT GGCACATGCC TGTAGTCCCA GCTACTCAAC AGGCTGAGGC 4020
AGGAGGATCA CTTGAGCCCG GAAGGTTGAG GTTGCAGTGA 4060