EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-00398 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:41173790-41178060 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10489167chr141176466hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:41174599-41174610GGCCAATCAGA+6.02
Pou2f3MA0627.1chr1:41174024-41174040TTTTATGCAAATACTA+6.36
SOX10MA0442.2chr1:41175298-41175309TTCTTTGTTTT-6.62
SOX10MA0442.2chr1:41176221-41176232TTCTTTGTTTT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09912chr1:41173992-41180691CD14
SE_11310chr1:41173187-41180749CD20
SE_15194chr1:41173670-41178324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_22820chr1:41173545-41180177CD8_primiary
SE_26108chr1:41173936-41180309Duodenum_Smooth_Muscle
SE_35491chr1:41173792-41178431HepG2
SE_59908chr1:41156532-41180069Ly4
SE_63017chr1:41156198-41179996Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr14117391941174039
Enhancer Sequence
TTTATTAGGT ATTATACATA ACCTAGCGAT TATTTAAAGT ATGGAGGAAG CTGGGCAAAG 60
TGACATGCAC CTGTAGTTTC ACCCAAGTTG GAAGCTGCAG TGGGAAGATT GCTTGAGCCC 120
AGGAGTTTGA GGCTGTTGTG CCCTGATTGT GCCTGCATAG CTACTGCATT GCAGCCTAGC 180
AACATAGTGA GACACCATCT CTTAAAAACA AGTATACATG GGAATGTGCA AGTGTTTTAT 240
GCAAATACTA TACCATTTTA TATTAGGGAC ATGAGCACCC AAGGATTTTG GTATCCATGA 300
GAGGGTTGGC TGGGGAGTAT CCTGGAACCA GTCTCCCATG GATACCAGGG GATGATTGTA 360
TTCACTAATG TTCTAGCTTT TTTGTCATTC CCCCCAACCC CTTATCATTA TATTTCCTTC 420
TTAGGTTCCT GGTTGACTTT CTAGAAATGC CACTTCCATT GTCCCTGCCG CTAACTTCAT 480
ACATTACCTT AAAATTTTCC TATTTAAATT AGTTTGTGTT TTAAAATAAA GTGCTTTGCC 540
TTGATACCAG TCTGTGCCTT TAAAGTGCCA CTAACATAAT GACAGATGCC TTTTAGAAAT 600
CATGCAAACT ATTGTATGGC CATTGGCATC ACTCTGTTAG TGTTAAAGAA GCTGTATTTT 660
CTTTGGATTA GCCCTACCCA GTTTTGTTTT TCTTCTGTTA ATGCTCAACA GAAAACTGAA 720
GATGGTCACA ACTTTCCGAC CTTGTGCACA TTGCTTCTCT GGTCTATTGC CATAGGATAC 780
CGTAGCAGTA TCTTACAGAC ATCTTTGATG GCCAATCAGA AGCAGTTAAA TTACCTTAAA 840
TTTTTTAAAT GGAACTCTGA CAGCCAATAA GAAATCCCGT GGGTGGGAAC ACTAACAACC 900
CTTTGGCTTG TTTTTAAGAA CAATTCTAAA TTTTCAATAT TCTGTTTTAG AAGCACATGA 960
TGCCCTAGTG CAGCTGCTAT GTGCATTTGC CAGACATTTC CACGCCTTAG AGTTCCCCAT 1020
AGTTTGAAGT CTGAATCTGA CCCCTGTTCT GCTTCTCAAG GTAACTTTAA AACAGGAAGT 1080
GTACAAAAGA GGTAACTGAT GACGTGAACA GCCAATCGTG GCTTTGTGTT CTTAGCCGAT 1140
AAAGCAGTTC AGCCAATGGG ACCACTGTGG AGGCAAGGTT TGGTGTCAAA TAGCATGCTA 1200
GATTGAATGC CTTTGACTGT TAAAGTGGAA GGAGGCTGCA GGGCTTCATT GGAGCCTCGG 1260
AGTTTTTCAC TGAGGCAGGG GTCAGCTGAA AGACAAAGAA AAATGGCGAA TAGTTTGTTG 1320
GGGGGTGGGA GGACAGCTGT TCGGGTTTTC AGTGGAGTGG ACATTCCAGA CTCATGTTTC 1380
TGCATCTCCT GCTGCCTTTT GTTTCCTCCG TCCTTTGGGG GGTAGGGATA GGAGTGACTT 1440
AAATTCTCCC AGTCGGTGGA GGTATAAATA ACTACATGTA AAATTAATGC AGTTCCCGGT 1500
AAGTTTAATT CTTTGTTTTG TGTTGAAATG ATAGAAACTG TTTAGCTTCA GAGAGTGTAG 1560
ACAAGTTGCA CTGTTCAGAA AATGGCCACT TTACATTCCA TGCATACCTT TTGGTGCACC 1620
TAGAATACCT TGCTGTGTTT AGATTTTGCA TGTCCTTCAA CTAGGATTTC TTTCCTAGTT 1680
GGGTATCGAC AAGATCAGGT ACATGGAGAA AGGCTAATCA TTTTTCAGGG GCACACAGAA 1740
GCAAAACACT TTTCTCTTTG CATTGGGTAA ACTTAACTGT TTTCCAAATA ATTTTCCTTT 1800
GTTCAAGTGC CCTGAAGCTT TCCTACGGAA TAAGCTGGGT TGTTGTGAGA GTTTTTCTAT 1860
TTCCATGCAC TTTGTTGACA TCTGTGTTTT CAGATATGGA AGCAACACTG TTGCTGTTAG 1920
AAATTTGTGT GAAAATACGA TTTGCACTGC TGCAGGTTCT AATGGTGAAG GCCCACATGC 1980
CAGTGTGAAA TTTTCCCATA ACTTTCTTGA TTTACCAGTC TACCTCTAGA TTCTAATAAG 2040
TAGTAGTTAA TGTAGTAACA ATCTTTGTTT TTAATGCACA TTTTAGCTTA GAATGCTGGT 2100
TAGAAATATC TTCACTTATA TTGACAGTGA TGAGCAAATA TTTTTCCACA GATTTCACAC 2160
ATTTTGTCAG GTGTTGATTT AGTTCTTTAA AATGATGTGA GCAAAGTGCT TTCCATTTTT 2220
CCGTATTAAA TATTTAAAAT CCTGCAGTTT GTGAATAGGA AAGTTAAGAG TATAGGCACC 2280
CTATCTTTTG CCCTTGATAT GTATATATTT TTCTCTTTAT GGATATAAAG CTAATGTAGG 2340
TTGCTAATCA GTAACCAGCC AGTTCTCATG AACAGTGAAA TCTTCAATCC CACATACTAA 2400
GATCTATAAT ACACCTGATT TTAAAATGCA ATTCTTTGTT TTCTTTTTAT TTGCAAATAT 2460
GGAATGAAGG TCATTGGAAC ATTTCTGCAG CAGACTCAGT GTGGAGCCGT CAGCCAGCAG 2520
CACTTAGTCT CTGGGTACGG AAAAGGAGCA GGCCCTATTA GAGGAGAAGT TTCGAGGGTG 2580
TCGATTTGCC TTCCCTAGCT TCCCCTCTAA TAAAGGATTT ACCTTAGAGG ACTGATAGGA 2640
TTTAGATTCG GGGCTCTTGG AGTTGTAATG ATATAGCAAG TCAAAGTTCC TGGATGCAGG 2700
CCTCTGTCGT TGCTTGCAAA AGTGACCTTG AAAAACTGCT GGGGAGTTGA AAGATTGAAG 2760
GACAAAGTTT GTTTATACAG ATTTGGACTG AAAAGCTCTA TTTAAGATGA AAAGAGACTG 2820
TACTTCTGAT ATTCAAGTCG AGTGGTTAGT AGGAATATGT TATAGATTCA GATTAGGAAT 2880
TTTCAGGGAA TAAGACAATA GGGCTGCATT CATTCTCTCT CCCACTCTTT TTACTTCCCT 2940
CCCCCCAGCA AAAAATTCTA AATTCTTTTG GTATGATAGC TGAGTGAACT GCCTAACAGA 3000
TTCAGAATTC CTTGCATGCT ACCTTGTCTT CTTTGTAATC TAGAGGGTTC TTAGTGAAGG 3060
GGATAGATAG TATTTTAGGA GTTCAGAGTA GTTGTATTTG TGAAAGTTTT GGGGAATTAG 3120
AATGCTTATA ATAAGAAAAT GTTCATTCTG GGAATTTAAG TCCTAAGATG AAGAAGTATG 3180
TGTTAAGGAT TACATTTTAA GAGGTAGTTA TTTTGATTTA AATTTATTTG TTTGTCATTG 3240
ATTATTTATA TGTTATCAGT TGTTCCAGAT TATATATATG ATTTTAAAAA CAGTTGTAGG 3300
TGCTGACTTG ACCCTGTTGG CCCTAGGAGA AGGCCTGCAG CAGGGGAGGC AAAAGTGAAG 3360
GTGTGGTACA GTATGAAGTA AACTATAAAC TTGAGAACTT TGTGGATTTG GCTTCTTGGA 3420
AAGATGCCCA GTCACTGCCT CTAGCCGAGG TTCTTCACCA TTCTCTTTGA GAATGACCCA 3480
CTACCTGGAA AAATGCACAT GGGCATGCCT GTACAAAACC TTTGATGACT AAGTTATTTT 3540
TTAGTGTATG TCAAATGGTA TTTAACACTT CAGCCAGATA AATGTTTACT AGACAAATGA 3600
AGAAAACTTT GCTTCCAGAA AGAGCAAAGA CCTTCTAGAG AGCTAACTCT AATTTAGGCC 3660
ATGGGTGGCT GTGTGTGTAA GTGGGGGAGG CTTAGATGGG GTCTAGAGAT ATGGACATTT 3720
ATTTACTCTG ATCACAGTAT TTGAGGCAGC ATGGTACAGA CCATTTAAAG TCAAGAGATC 3780
TGTGTTCAAG CCCCACTCAC CTTTATCACC AGCTTTGTAG GTTTGGGCAA GTCAGCTATT 3840
TAGTGTTAGC TTCCTCACAT GTAAAAATGG AACCTAAAAA TAGTGTCTGA TTTAGTGGCG 3900
AGTCTTGAAT GAGATCATGT GTGTCAAAGT ACTTTGCAAA TTGTGAAGAG CTACATAATA 3960
TTAGTTGTTA CTAATCCAGA CTATTTGGGG GATGAAACGT TTATGAAGAT AGGTGTGGCA 4020
TCAAAGAAAA AAATGCCAGT ATTTTAATAT TTGTAAAAAG GAGTTAGTTT AAACCTGACA 4080
CATTTCTTTT TAAACTGCCT TCACCTGCAT ATTCCTATTT ATGCTGACAT GACCCTATTT 4140
ATTTAATGCA TATGTTGAGA CCACCAGTCC TTTACTCATC AAGATCCTTG TGAAAGAATT 4200
TTAACCCCTT TGTCAAAATT TAAGGACCTC TCAGAATAGG ATGAAATGGG TATGCTGATT 4260
TTTAAAAAAC 4270