EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-00170 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:22400960-22403320 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr1:22403044-22403055TTCTTATCTGT+6.14
Gata1MA0035.3chr1:22403044-22403055TTCTTATCTGT+6.62
HNF1AMA0046.2chr1:22402115-22402130GACTAATAATTAACA+6.01
HNF1AMA0046.2chr1:22403240-22403255TGTTAATCTTTAATG-6.09
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:22402736-22402751GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
SPICMA0687.1chr1:22402411-22402425AGAAAGGGGAAGAA+6.03
ZNF263MA0528.1chr1:22403296-22403317AAAGGAGAAGGAAAAAGGAGA+6.12
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09508chr1:22400420-22403793CD14
SE_11109chr1:22397561-22409042CD20
SE_13472chr1:22400912-22403514CD34_Primary_RO01536
SE_17408chr1:22400664-22407152CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18436chr1:22400625-22409072CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19267chr1:22400725-22401695CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19267chr1:22401907-22402757CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_22843chr1:22401251-22403371CD8_primiary
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr12240100022402200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I022074chr12240082822403513
Enhancer Sequence
CATAGGGTAT ATGAACATGT CTGACTTATA TATATTGTAA AACCCAAAGT CTCTCCCCTG 60
ATTGCTCCCT TTACCCACCC CAATCTGTGG AGTATCTGGT GACATTAAGA AAAAAAATTA 120
AGAAAAAAAG AAATAGAGGT CAGGTCTTAA CTATGTTGCC CAGGCTGGTC TTGAACTCCT 180
CAGCTCTAGT GATCTTCCCA CTTTGGCCTC CCAAAGTGCA AGGATTACAG GTGAGCCACT 240
GTGCTCTTTA ATACATGTGT TAAAGGGCAA AACTACAACA AATTTAAATC TCACTTGGCT 300
TTATTGTGAT TTTAGAGTTG GGCAGTGTGC TTCATTCCAC AAAACAGAGT TGAGCAGAAG 360
AGGTTGGCTT AATAGAAGAG CTGAGGAAAG GGGAAGCAAA GAACAAAGGG CCTATTAGTT 420
GTTTCAGAGC TACCTTTCTT GTAAGGCAGG GACAGGGAGA AGACAGAACA ATAGAAAAAT 480
AACTGATTAG TTAATATCAG GTTACTTCAG GCTGCTTTTT TTTGTGTAAG GGTTAAAGCA 540
GAGGGAACTT CATTATCATT CCAATTGAAG ATTGAAAGTG GCCTGTTTGG TAAACTGGCT 600
GTCATCTCTC CTGTTTCTCA GAAGGTCAGA TAACAACTAA ATTTAAGTTT AGTGATGTGA 660
AACTTTAGCA TGAGTAACTC CGTTTTGATT TTTAGTCTGG TCACTTGGGG CCTAGTGCAG 720
GAGATTAGTC CACAACGGTA GCCTCCTATA GTTTTTATTT AACACATGAA ACAATTATTA 780
ATACATGCCA AATGCTTTGC AGAATAGTCT TAATTAGAAC TTGACTCTGA AATGACCATC 840
TTTGTAATGG TAACTCTACA TTTGACTACA TTTGTGCTGA GAACAATTAG TATAATCTTC 900
CCTTGATATT GCAGGGGATT GATTCCAGAA CTCTCCAAGG ATACAACAAT CCTGGAATGC 960
TCAAGTTTCT TATATAAAAT TACATAGTAC AGTTATCCAT CTGTATCTGT GGGTTCTGCC 1020
TCTGTGTACA TGGAGGGCTG ACTGTACTGT AATTATCTTG GAGATAAAAA GTGTTATGAG 1080
TTCCTTTCTA AGAAGTTTGG AATTGCTGTT TTAAAATTCC TTATATTGAC TTTAAAGTTA 1140
CCATTACTTG TTAAAGACTA ATAATTAACA TGTACTAAGC ATGTACTGTA TGCCAAGCAC 1200
TGTTGCAAGT TCTTTACATG TATTATCTTA GTTTACCTTA TGAGAAAGGT AGTACTGTTT 1260
TCATTTTTAG AGAAGGGGAA ACCAAGCTAC ACAGAGGTTG AATAACACAG AGGTTGAATA 1320
GCTAGAGTGT GGTAGAGCCA CTCTGACTCC AGAACCCAGG CTTAACAGGG GACTCACAAC 1380
CAACCAGTTT GTAACAAATT GCAGAGCAGT CAGGTCGGGA AGTCTAAGAA GTGGAAGATT 1440
TGTGGGTAAA TAGAAAGGGG AAGAACAAAC TCTTATCTTA CTCCCTTCTC CCAATAAAAT 1500
TCAGTAGTTA TATGCAGGGT GAAAAACAGG AAATAAGCTT AGCCCCTATT TTTTGCTTCC 1560
TCTTCTTTAT ATTTGCTTTC CTCTTTGCAT TGCTGGTAAC TCACGGATAT ATACTTGTCA 1620
TTCCACTAGC ACTGATTATA TTTGTTTTTA TTAATGTCAC TTCTCAGACA GTATAGTGTA 1680
ATGTAATGTT TATCAAGAGC AGGGACTTGA GGTTGGGCAC GGTGGCTCAC ACCTGTAATC 1740
CTAGCACTTT GAGGGGCCCA GGCAGTTGGA TTACTTGAGG TCAGGAGTTC AAGACCAGCC 1800
TGGCCAACAT GGTGAAACCC TGTCTCTATT AAATACAAAC ATTATCCAGG CGTGGTGGCA 1860
TGCACCTGTA ATCCCAGTTG CTCTGGAGGC TGAGGCAGGA TAATCGCTTG AACCCGGGAG 1920
GCAGAGGTTG CAGTGAGCAG AGATCACGCC ACTGCACTGA CACATACACA CACACACACA 1980
CACAACAAGC AGGGACTTGA GAGTCAGACT GCTTGGGTTT AAATTACAGT TCTCCCAGTT 2040
ACTGGCTGAA TAGCCTTGGC TTAGTTACTT GCTGAGCCTC ACTCTTCTTA TCTGTAAAAT 2100
AGGGATAATA CAGCACATAC TTCATAGGCT TTTTGGGAGG ATGAAATGTG TGAATATGTG 2160
TAATATGTTT TGAACAGTAC ATAGCACTTA GTAAATGCTG TATGAGTGTT TGCTGCTTAC 2220
TATTATTATT TGAGTGCTTT TAGATTTAAC CAGTAATTGA TTGATCTTAG GGATCAGGGT 2280
TGTTAATCTT TAATGCTGTA TTAGTTAGTA TGGGTGCTTC TTAGTGCATA AAAGGGAAAG 2340
GAGAAGGAAA AAGGAGATAT 2360