EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS074-00085 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19239 
Coordinate
chr1:9740080-9742280 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:9741478-9741490GTTTGTTTGTTT+6.32
Lhx3MA0135.1chr1:9741294-9741307CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr1:9741297-9741310TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:9741301-9741314TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:9741298-9741311AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:9741302-9741315AATTAATTAATTT-6.92
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:9741678-9741693TGAACTCCTGACCTC-6.22
POU6F1MA0628.1chr1:9741295-9741305ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:9741299-9741309ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:9741303-9741313ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:9741295-9741305ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:9741299-9741309ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:9741303-9741313ATTAATTAAT-6.02
RARAMA0729.1chr1:9741675-9741693GCTTGAACTCCTGACCTC-6.52
ZNF263MA0528.1chr1:9741215-9741236AGAGAAGAGGGGAGGGGAGGG+6.07
ZNF263MA0528.1chr1:9741222-9741243AGGGGAGGGGAGGGGAGGGGG+6.82
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09834chr1:9740222-9742309CD14
SE_11127chr1:9736110-9752785CD20
SE_17476chr1:9739282-9742251CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_19640chr1:9741692-9742222CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr197416359741787
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I009679chr197392839742309
Enhancer Sequence
CCATGTTGGC CAGCCTGGTC TCGAACTCTT AACCTCAGGT GATCCACCCG CATTGGCATC 60
CCAAAGTGCT AGGATTACAG GCATGAGCCA TCATGCCTGG CCTAATGGTT TTTATTTTTA 120
TTTTTAAATT TTTTGTAGAG ATGGAGTCTT GCTATGTTGC CTAGGCTGGT TTCAAACTCT 180
TGGTGTCAAG TGATCCTCCC ACCTCGGCCT CCCAAAGTGC TAGGATTACA GGTGTCAGTC 240
ACCAAACCCC GCCTCAGTGG TTTTTAGTAT ATTCACAGTT ATGCAACCAT CAGCATCATA 300
AATTTTAAGC TGTGCATGGT GGCTCATGTC TGTAATCCAA GCACTTTGGG AGGCTGAGGC 360
TGAACTCACT TGAGCCTAGA AGTTCAAGAC CAGCCTGGGC AATATAGTGA GACCCTGTCT 420
CTATTAAAAA AAAAAAATTA AAACATTTTC ATCACTCCAA AAAGAGATTT CACACCATTA 480
GCAGTTACTC TCTACTTTTC TTCCATCTCT CAGCCTCTGG CAACCACTAA TCTGCTTTCT 540
GTCTCTATGG ATTTGCCTGT TCTGGACATT TCATATAAAT GGGATGATAC ACTATGTGGT 600
CTTTTGGGGT TGAGTTTGCA CCTTAGCATA TTGCCTTTAG AAACCTGTCT GCCTCATACC 660
ATTACAGAGG AGCTGTTGTT TGTACTGACC ATTTAGTCCA TCACAGGTAT TGATGGAGCC 720
TCTAAGCATG GAATAGTGCT GGCCCCACAG CAGGAACGCG GCAGCCATGG GTGGCGTATT 780
AGTTACTGGT TGCTGTTTAA CAAATCACGC CAACACTTGG CAGACTGAAC AGCAAGCATT 840
TATGATCCCG TAGTTTCTGT CAATCAGGAA TACAGGAGCC GCTTCGTTGG GTGGTTCCGG 900
TCCAGGGTCT CATGAGGCTG CCATTGAGCT TTCAGTGGAG GCTGCAGGTG TCTGGGGCTG 960
GAGGTACCTG CCACAGCGTG GTTGGCAGGC TCAGTGACTG GCTGGCTGTT GGCCAGATAT 1020
CTCAGTTCCT CTTCATGTGG GCTTCTTCAT AGGGTGGCTT GAGTGTCCTT ATAGCATGGC 1080
CACTGGCTTA CCCCAGAGCA AGAGATGAGA GCACTGGAGA GAGACAGAGA GAGAGAGAGA 1140
AGAGGGGAGG GGAGGGGAGG GGGTGTATAA GCCCAAGACT GAAGCCCCAG TGATGTTTCA 1200
TAACCTAATT TTTTCATTAA TTAATTAATT AATTTTAGAG ATAGGGTCTC TGCTGCCCAG 1260
GCTGAGGTGC AGTGGCACAA TCAGAGCTCA CTGCAGCCTC CAGCTCCTGG GCTCAAGCAA 1320
CCCTCCAGCC TCACCCTCTC AAGCAGCTGG GACTACAGGT ATGCATCACC ATGCCTGGCT 1380
GCTGCTGCTG CTTTTTTTGT TTGTTTGTTT GAGACGGAGT CTCACTCTGT CACCCAGGCT 1440
GGAGTGCAGT GGCGCAATCT CGGCTCACTG CAACCTCCCC TTCCCGGGTT AAAGCGATTC 1500
TCCTGCCTCA GCCTCCCGAG TAGCTGGGAC TACAGGCGTG CGCCACTAGT TTCTGTATTT 1560
TTAGTAGAGA TGGTTTCACC ATGTTAGCCA GGCTGGCTTG AACTCCTGAC CTCAGGCAAT 1620
CTGCTCGCCT CCCCGCCTCG GGCTCCAAAA GTGCTGGGAT TACAGGTGTG AGCTACCAAA 1680
CCTGGCCCGG ATTCTTTTAT AATCTAATGT TAAAGGTGCT ATCCCATCAC TGTGCCATAT 1740
TCTTTAGGTC ACATTGACTG TGAATGTGGG TGGGGGCTAC ACAACGGTGA GAATCTCAGG 1800
ACGGAAGTAA CTGAATGTAG TTTCATATGG AGAGTGATCC AGCTTGTTCT GGAAGGGACT 1860
GCAGTCTCCC CGGGACTTAG CTTTGGAGAA TGAGCCAGCT TGTTCTGGAA GGGATTTCAG 1920
TCTGCCCAGG ACTTAGCTTT GGACCAGCTA TGAGTTCTCT GTGATGAAAT CTCAGCTTTT 1980
CCCAACTGCA GCTTCAACCT CCTGAGTTCA AGTGATCTTG TTGCCTCAGC CTCCTGAGTA 2040
GCTGGGACTA CCACCACGCC TGGCTAATTT TTGTATTTTT TGTAGAAATA GGGTTTTGCC 2100
ACGTTGGCCA GGCTGGTCTC CAACTCCTGA GCTCAAGCGA TCTGCCTGCC TTGGCCTACC 2160
AAAGTGCTAG GATTACAGAC ATGAGCCACC ACACCTAGCC 2200