EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-14930 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chrX:12972540-12977060 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chrX:12976665-12976676ATATTTACATA-6.62
IRF1MA0050.2chrX:12976252-12976273AAGAGCTTTCACTTTTCTTTC+6.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chrX:12973526-12973541GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
RREB1MA0073.1chrX:12974393-12974413CCCCCAACCACTACCCACGT+6.06
ZNF263MA0528.1chrX:12973280-12973301CCCCTCACCCCTTCCTCACCC-6.12
ZNF263MA0528.1chrX:12973255-12973276TCTTCTTCCTCTGCCTCCCCT-6.58
Number of super-enhancer constituents: 53             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09612chrX:12972105-12976925CD14
SE_10462chrX:12972222-12976871CD19_Primary
SE_11231chrX:12964480-12979243CD20
SE_11864chrX:12967020-12976869CD3
SE_14440chrX:12972408-12976633CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15419chrX:12972058-12976225CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15857chrX:12970491-12974846CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15857chrX:12975338-12976613CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16331chrX:12972355-12976701CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16908chrX:12970426-12975732CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_16908chrX:12975756-12976642CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17382chrX:12964629-12977016CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17855chrX:12964647-12977052CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18339chrX:12964526-12976996CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19260chrX:12964787-12976630CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20114chrX:12964869-12976883CD56
SE_20864chrX:12972546-12976255CD8_Memory_7pool
SE_21563chrX:12972173-12973576CD8_Naive_7pool
SE_21563chrX:12973837-12976634CD8_Naive_7pool
SE_21967chrX:12967159-12977050CD8_Naive_8pool
SE_22410chrX:12965021-12976933CD8_primiary
SE_25447chrX:12972538-12976881DND41
SE_27537chrX:12972782-12973575Esophagus
SE_27537chrX:12973777-12975378Esophagus
SE_30940chrX:12972019-12976866Fetal_Thymus
SE_32462chrX:12972299-12977020GM12878
SE_38726chrX:12973561-12975965HUVEC
SE_39711chrX:12972388-12973567Jurkat
SE_39711chrX:12973722-12975601Jurkat
SE_39711chrX:12975836-12976618Jurkat
SE_40111chrX:12972823-12973718K562
SE_40111chrX:12973747-12976020K562
SE_49904chrX:12972407-12973559RPMI-8402
SE_49904chrX:12973747-12975687RPMI-8402
SE_49904chrX:12975780-12976706RPMI-8402
SE_50189chrX:12972004-12973657Sigmoid_Colon
SE_50189chrX:12973698-12975396Sigmoid_Colon
SE_50189chrX:12975885-12976626Sigmoid_Colon
SE_52563chrX:12971985-12973664Small_Intestine
SE_52563chrX:12973689-12975337Small_Intestine
SE_52563chrX:12976051-12976611Small_Intestine
SE_53489chrX:12972019-12976836Spleen
SE_55209chrX:12972557-12973719Thymus
SE_55209chrX:12973857-12975810Thymus
SE_55209chrX:12975986-12976589Thymus
SE_58417chrX:12964783-13034394Ly1
SE_58905chrX:12964721-13049077Ly3
SE_60593chrX:12964761-12998409DHL6
SE_61870chrX:12964787-12998403Toledo
SE_62231chrX:12964510-13049336Tonsil
SE_66386chrX:12972388-12973567Jurkat
SE_66386chrX:12973722-12975601Jurkat
SE_66386chrX:12975836-12976618Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 8             
ChromosomeStartEnd
chrX1297379412974181
chrX1297660012976976
chrX1297374212975937
chrX1297324712973307
chrX1297418412974672
chrX1297485412975280
chrX1297615912976277
chrX1297619812976345
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH0XI012945chrX1296392512977022
Enhancer Sequence
CATCTCTAAA TAAATAAAAA TAAAAAGAGA ACACACAGGT GGCAGCAATT GGGACAAATG 60
TCACTGCAGA AGACCTTCCA AGGGGGTATT GGGGGGTGAG GACCACATTT TGCCTTAGGG 120
TGACAAAGAA GGTTCACACA GTGGGCCACT TTCCGGGGTG TTGGTGATCT GAATCTTGAT 180
GGGGAGGGTG GTTACATGCG CGTACATGGT TGTCTAGCAC TCATCGAGGT ACATTCAAGA 240
TGAATTTTAT GTCAATTAAA CCTCAGTCAG GTTGATAGTA AAGAGTCTGA AACATCGTGT 300
TAGCACTTAG TGGGCTCTTG GGAATTCTTG CAGAATGAGA ACGTGAGGGG TATGGAGGGT 360
GGGAGTACTG GCACTTTCTG CATCCCCAGG AGCTGGCTCC ACATTGCTCC TGGCTCTGCA 420
TCCTGCTTTT GGGTGGCCAC GGGGAGAAGA CAGGGCTGAA GCCAGCCTCC ACAGCGGAGG 480
GTCCTCTAGC AAGGCCCAGC AGGGCCTCAG GGAGTTCAGA GGGAGGCTTG CTTTTGCTTG 540
CTTGTCTCAA CACAGGCCCA CCTTGACTAA ACACAGGCTT CTTGCTGGGC GGGCCAGCTC 600
TGAGCCTTGC AGGCCACTTT ATCACGTTGG TGGCTCCCAT CTGTTCTTAG AGTCCACATT 660
TCCACTGGGT TGAGCTCTCA GCCACCTCTG CCTAGGCTGC TCTCTTCTGA AACTTTCTTC 720
TTCCTCTGCC TCCCCTACTT CCCCTCACCC CTTCCTCACC CCTCCCATTC TCTCTCCCCT 780
AGGGCAGAGG ACCCAGCTGG AGCAGGGCTG ACAGGAGCCC CTGAGAGGAG AACTTAGAGG 840
CCTGAGACCC GTTGAGGGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTC TATGTTTGGG 900
AGAATTTGGA TAAAGAGACA GGCTGGTAGC GGTGGCTCCC ACCTGTAATC CCAGCACTTT 960
GGGAAGCCGA GGTGGGCTGA TCACTTGAGG TCAGGAGTTC AAAATCAACC ATGCCAAATG 1020
GTGAAACCCC GTCTCTACTA AAAATACAAA AATTAGCTGG GCGTGGTGGC ACGCACCTGT 1080
AATCCCAGCT ACTTGGGAGG CTGAGGCACG AGAATCACTT GAACCCGGGA GGCAGTAGCT 1140
GCAGCGAGCC GAGATCATGC CACTGTACTC CAGCCTGGGC AACAGAGCGA GACTCCGTCT 1200
CAAAAATAAA AAATAAAAAA TAAAAAAAAA ACAGAGACAG CCAAAGTAGC AATGTGCCTG 1260
TGAGAGGGCC TAAGTTTTCC CCCTCAGGGT AGTCTTGTCA GATGAAATAC AGGATGCCCA 1320
GTTAAATTGG AATTTCACAG AAATAAAATA ATTTCTATGG TCTCAAATAT TGCATGGGAC 1380
ATATTCATAC TAAAAAGCTA TTTGTTATTT ACCTGAAATT CCCATTTAAA TTTGAGGGCG 1440
TCTTCCATTT TTATTGGCTA AATCTGGCCA CCCTCCCTCA GGGTGTGACG GCAGGAAGCG 1500
GGAGAGAACA CAGATGTCCC CTGTTATCTC CCTGGGCCCT GCGTGGCCCT CTCAGGGAAC 1560
CACAAGCCAG GGCCAAGCCC ATCCAATCCT CCTGCACCAG GAGCAGCAGA AGCCATGCCG 1620
CTAATGGCAG TCACCTCGGT GGAAGTAGAG CGGGCCTGTG GCGGCGTGAG GCTTTTCTGC 1680
TCTGCTTCTG TGGAAGTGAT TATCCAATAA CTAGTAGGAA TCGGGCAGTT GGCAGACGCC 1740
TCCCATGCTA TAAAGCCACA CAAGGCAGGC AAGTGTGGGC ACAGATGAGA GGCTGAGAGC 1800
GGAGGTAGGA TGTCACCCCT GCCCTCGCCA GCCTCATCTG TTTTCCCAGG CGTCCCCCAA 1860
CCACTACCCA CGTGGATTCT CCCTCGAAGA GCCCCCTTTC AGGGCCCCAT TGGCACTTCA 1920
CTCTTGAGGG AGGCCTAGGA GAAGCTAGTG GAAAGTTACT TCCACATAAA CGGTCAGACA 1980
GACGGATGAT GAAACCACAG GAAACCACAG CTCCTCCCCT GCCGGGGCAC CAGGCCAGAA 2040
GCCGACCTGC TAGGCTTGGG GACCCCTTCT GGTCTTGCTA GGGGCTCAGA GACCCTGGGG 2100
AAGTCCCTTA CTGTGTGTCT CATGTCTTCA CTTATGGATG GGATGCCAGC TGCCCTCTCA 2160
TGCCCTCACA GGGCTGTTGG GAGGCAAGGG TGAGCTAGCA GATGCAAAAT AATGGCAAAA 2220
TTAAGAAACC AAGTACCTGT ACAAATGTAC ACCTTTATAG TGGTTCAATT TGGCCACACG 2280
TGCTTCTACT TAGAGAAACA CCATACATGA ATATTCAGGC ACATATACAT ATCACTATAT 2340
GATCCTACGA GCAACTTCCC TACCTCACTG AAAATATGAT TCACTTCACC AAAATGTAAT 2400
GCTATGGTCA CATTCTACAA GGAAAACATC CAAAGCACAG CCACTGTAAG TGAGGATAGT 2460
TCTCAACTGG GCCTATGGTG GGCTGGCTGA CTACACTTGC AGTCTAGAAC GGGGCCTACT 2520
GCAGACTGGT CTGCAGTTAG TTTGATCTAG GGTTATGACA GCAGTTGACT TGAAAATAAC 2580
TTTCCTCCTG CCCCTTTAAG AACACGGGTT CCTTCCCTTG CAGATAAGCA GGAAGTCCCC 2640
CTCCCTCTGT CTTGGTGCTT GGTGGTGTGT TTCACTTCCT TTCAAAGGTG TTTTCTTACT 2700
AAAGAAACCC TAAGCCCAGG GTCACATTCT GTTTCTTTCA CAGGCATACT CAACTGCGTG 2760
TTGTTGATTC TGTGACAAGT TTCTTGAGCA AGAAAATACA CAGAAAAAAT GTTAAATGTA 2820
TAAAATATGA AAGTAAAACA TCAATAATGT TTTAAATATT TAAAATATAA AAGTAATGCA 2880
TGCTTCTGGT AAAAATGTAA ATGGTAGAGG TTTCTCTATT TCCTTTCCCC AGAGGTAAGC 2940
TCTTAAAATT CCCTTCCGGA AATGGTCTCT CTACACCTCA CTTTTTTATT GCACAGAAGG 3000
GATCAGACAC TATTTATGAG GCTCTTTATT TTCCACTTAA GAGTATTCTG GCTGGGCGCG 3060
GTGGCTCACA CCTGTAATCC TAGCACTTTG GGAGGCCGAG GTGGGTGGAT CACGAAGTCA 3120
GGAGTTGGAG ACCAGCCTGG CCAACATGGT GAAACCCCAT TTCTACTAAA AATACAAAAA 3180
GTAGCTGGTG TGGTGGTGGG TGCCTCTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA 3240
ATTGTTTGAA CCCAGGAGGC AGAGGTTGCA GTGAGCCAAG ATCGCGCCAC TGCACTCCAG 3300
CCTGGGTGAC AGAGCGAGAC TCTGTCTCGG GGGAAAAAAA AAAAGAGTAT TCTTTGGACA 3360
TCCTTCCACA GCATATCATG AATAAATCTG CCTCAATCTT TTTTTAACAG CTGCATAGTT 3420
TTCCATTGTT TGGGTACTCT ATCATGTATT TAATTAATCT CCCAATTAAT ATACACTTAG 3480
GTTGATTGTA GCTTTTACTC TTATCTACAA TGCTATGGGG GAAAGATCTA GATGTTTGTG 3540
CATGTGTATG TATATGTATA TGTAAGTGTG TTAGTATGGC TATAGAATGA GAGTCCTGTC 3600
ACTGGACTTA AACTGGAAAT GCTGGGTTCA ACTGGAAATG CTGTTTTAAT TGTGACAGCC 3660
ACCGGTGCCT CTGAAAAGTC CCTACGAATT GACCCTTCCA ACAACAGCAT ATAAGAGCTT 3720
TCACTTTTCT TTCCCTGCAT TCTGGCCAAC TGGAGCCACT ACTCAACCTT TTCATTTTTG 3780
TCAGTCTGAA ATGAGCAGAG AGGTCCTCAT TGTTTGATTT GCATTTGAAA GCCTACCATA 3840
CACGGGCATC TTCTCATGTT GTTCTTAGCT CAGTGAGGAG GGCCTTAGAG ACCAGACTTT 3900
GGAACCAGAT AGAGCTGGAT ACCGTCCCAG CTCAGCCACT TGCCAACTGT GATCTCTGGA 3960
GCCTCGGTTT ATCCATCTGT AAAATGAGCA TCCTTAGACT AAATTCATGG GATTTACTGA 4020
GAAGGTGCAA CAAAGCAACA AAAAATGTTT ATCACTACAA ATGTTAGTGT GTTTCTCATC 4080
CAAACAAACA AAAAAACATA TATATATATA TATATATATA TATACATATT TACATATAGT 4140
CATGCATCGC TTAACAATGG GGATACGTTC TAGGCGATTT CCTCATTGTG CGAAGATCAC 4200
AGAGTGTACT TACACAAACC TAGATGGTAC AGCCTACTAC ATACCTAGGT TATATGGTAC 4260
AGCCCATTGT TCCTAGCTTG CAAACCTGTA CAGCATGTCA CTGCACTAAA TACTGTAGGC 4320
AACTGTAACA CAATGCTAAG TATTTGTGTA TCTAAAATTA GAAAAGGTAC AGTAAAAAAT 4380
ACAGTATTAT TTTATGGGAT CACTGAAATG TCATCACACA GTACATGACT GTGTGTGTGT 4440
GTATATATAT ATATATATAT ACACATACAT ATATGCACAT ACACACAGTC TTATACTGTA 4500
TATGTATACA GATGTGTGTA 4520