EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-14204 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr9:4935870-4939870 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:4939841-4939853GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:4938526-4938538AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr9:4938530-4938542AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr9:4938534-4938546AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr9:4938538-4938550AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr9:4938542-4938554AAACAAACAAAC-6.32
Gata4MA0482.1chr9:4939607-4939618TCTTATCTCCC+6.62
IRF1MA0050.2chr9:4936551-4936572GAAATGAAACAGAAAGAAATA-6.87
KLF4MA0039.3chr9:4939486-4939497CCACACCCTCC+6.32
LMX1BMA0703.2chr9:4936754-4936765ATTTTAATTAA+6.62
SPI1MA0080.4chr9:4939347-4939361TTCTTCCTCTTTTT-6.14
SPICMA0687.1chr9:4938859-4938873TTCTTCCTCATTTT-6.42
SPICMA0687.1chr9:4939347-4939361TTCTTCCTCTTTTT-7.01
STAT1MA0137.3chr9:4936544-4936555TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr9:4936544-4936555TTTCTGGGAAA+6.32
Stat4MA0518.1chr9:4936544-4936558TTTCTGGGAAATGA+6.62
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
SE_34071chr9:4938658-4939842HCC1954
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr949364704936655
chr949374654937643
chr949383344939796
chr949389094939735
chr949391464939407
chr949359014937913
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH09I004935chr949350024940000
Enhancer Sequence
GCAGCAGCAG CAGGAAGTCC AGATTTAGGA GTTGGGTCAT TCAGTTGTTT CCTTACAGAA 60
AAGCGGCTAG AGGAAGGCAC CCAGCTCAGA ATATACCTGG CACAAGGAAA GGCTCATTAA 120
GCCAAGGTTC GAAGAAACCC CAAAAAAGCA ATTTTACAGA ATCTTAGACT CGGAAGGGAC 180
TTTAGACATC ACCTACAACC TCTACCCTAT GTGTGATTCC TCTCCACAAT TCAGTCCCTG 240
TTCTTGTCCC TAGGGTTACC TCTTCTAAAT AAACATCAAG AGAGTGTCTG GCCAAGAGAT 300
TCGTGGAGGG GTCCACAATT CCCTCGCATG ATTCTTTTTG TGACCTAAGA ATTCCATTTC 360
ACTTCTGAAC TTTGATATGC CTTGGTTTTC CCACTCATAA CATGGAGGTA GGTAATGTAA 420
AATATATCAG TCTCCATTAT CTCCTTAAAC AGTTATAGTG CTTCCTGAAG AAAGTGCCAA 480
GCTGTGCTGT TAGAAAGAGT AGGAGCAAAC TAGGAAGCTG GCACCAATTG TACAGTTAGG 540
TTTCTGACAT GTAAAAATCA GGAGAAGGGA AATGTGGGTT GGAAGCTTTA ATTGTGAGCG 600
GAGAATGAAA GCTGATTCAG TTAGTGTGTA ATGTAATTTG GAAAGTGGAA ATAATGAAAG 660
GGAAACAGTT TTTATTTCTG GGAAATGAAA CAGAAAGAAA TACAAGTAAC GAGAACAACA 720
GCAACAGCAA CGACAAAGCC AAGCCCATTA CCCACAAAAG CTACAATTTT TTCTTGTATT 780
TGGGTCTTTG AATTGCTACT CTCCCCAGAA AAAAAATAGT TTTTAATTGA GTTTGCAGTT 840
CCCTTTGAAT TTCATAAGTG ATTTACACTA TTAAGTTTAC TTTAATTTTA ATTAAATATA 900
TAATATATAT TTAGTTAATA TGTAATATAT ATTTAAACAC ACACATATCT TTCTTCCAAC 960
ATTCACATTA GGATTTTTTA ATGGTCAAAG AAGATATTTC TGAGTTCAAA ACTCAGTTTT 1020
AAAGTAGAGT TTGGTAAAGT AGGGACATTT TGCTTTTTGG ACATGGCTTT CTCCCTCAGC 1080
CTATTTTTGG AGCATGAGAT CTTGTGGGCC TAAGTTCTGC ATTCACCACA TCTCTCCTGA 1140
AACCCCTGAC TTCCCCTCTG CTACCATCAC CCAGGGATCC CCCTTCCCAC TCCTGTAACA 1200
CTTTATGTCT GCTGCTCTAC AGTACTTACC ACACATCTCC CTCCCACCTG TATCAGATGG 1260
TCCTATGGGT AGAAAAATGT CTTATATCTT AGTAGTCCAA TGTACCTGGG ATGTAGTAAA 1320
TGTCAGAGTC CGAAACTGTC TTATTTTCCA GATTTGGGCT TTGTAATAAA GGCCTTTTGA 1380
AGATAATGCC TAGGTCTTTG ATATGTAATT TTAGGTAAAA AGAAAACTGA AGGAATGACT 1440
CTAATGGTAG AGGTTTCCGG CTGGAAAAGA GGATAGTGTT ATTAGAGTCT GTGGGTAATT 1500
TGGGGGACAG AATGGTCTTC CTGGTAGTCC TTGAATCATA CAAAGTCAAT GATAGTTAGC 1560
TTGGTGTACC TGCTTGTTAA GATGGGCCTG GACAATGCTC TGACTTGTTG GGAAATAAGT 1620
AGAGTGAACA ACAGTGTCTG TTTGTCTGGG ACTGTCCCCA TGTTAGCATG GAAAGTTCCA 1680
TATCTTGGGA AACCCCCAGT CCTGGGCAAA CCAGAGCACT GGTCACCCCA TACAATCCAA 1740
ATATACAGTG GAGTATGGCC TCTTAACTGT CACATTAACG TGCTGATAAC TTGGACTCTA 1800
GTACTTGTAG GGAAAAGATA AATCTTCAAA TAAGTAAACA ACTAGCCCAG TTTGGGAGGA 1860
TGTCAGTTCT GCTTTCTCAT TAAGATAAGG CAATCTTAAA ATCATTAGAG AACTCACAAA 1920
TGTGGCTATA AAAATAACAA CAGTTACATA ATTAGATTTC CTTGGCTGAA ACCACTAATA 1980
AGACATTGCC AAATTTTAGC TTATTGTTGA AGATAAATCT CTCTCACCCA TTCTCTCTCT 2040
CTCTTACACA CACACGTGCA CACACACACA CACAATTTTT ATTTTTCTGG CTTAGCATAC 2100
TTTTATTTTA ATTATAGGTT TTATCGTTTT TCACCATGTT AACAGAACAA AGTTGGTTTG 2160
TTGTTGAAGG ATATGATTTA AATGGATAGC TATTGCTGTG GTTTACTGAA AGCACAATAC 2220
TGCATTATTT TGAAAATATG TTTAATGAAG CATATTTTCA TTTAAAGCAT ACCTGTACTT 2280
AATGGAAATT TTTGAGATCC ATCATTTCTA AAGATGAAGA GAAGAGGCTG TGTAGCCACC 2340
AAATGCTTGC TGGCCCTCTA ACGCCTAAAG TGCTACATTT ATTTATTATA AGAATATAGA 2400
GATAATAAGA CTGTTTATGA ATTACAAATC AATAATGAAA TAACTCTTGG GCTAAGGACA 2460
AAATCAAATG GAAATTATAA ATCACATAAA TATGAATGGG CACAGAAGCA TTACTCTACA 2520
AAATCTGTGG GGTATGGTCA ACATGTTGTT CAGAGGGAAA TCTATAGCTT TCAATGTCCA 2580
TATCAGAAAA GAAGAGACAT GGAGAATAAA TTAACCAAAC TTTCAAATCA AAATTTAACT 2640
TCCTAATTCA ACCATCAAAC AAACAAACAA ACAAACAAAC AAACAAATAA AACACAAAGT 2700
AAAGAGAATG GAAAAAAATG TAATGGCAGG AAATAATGTG ATAGAAAAGG ATAATAGAGG 2760
CTGCTGAACT TGAGGAAATC CTCCTTTTAC ACAACAAGGA TGTCAGCTGC CCAGACTCTG 2820
ACTTGGAGAC TCACCTCCCA GCCCAAGGAA TATGCGTTAT GAGAGTAAGA AATACATGAT 2880
TACACCTCTG CATGGATGAC TGCAAAGGGG ACAATAATAA CTAACAATAA GACCCATGTG 2940
TCAAGCATTA TGCCAGGCAG CTTATATAAA TTATATGGTT TAGTTGTATT TCTTCCTCAT 3000
TTTCTGATAA GAATATTGAA ACACAGGATG GCCTAGTAAT TTCCTCAATA CTGAGGGACA 3060
GTAATTAATG TAGCTGGAAC TTGAACTTCA GAAGGGTTAT TAAGTGGGGT TTAATTTACC 3120
ACATGTTGTT AAAGATGCCA TTGGCTTTAG AAACATCTTG TTTTGAAAAT TCGTATCTGT 3180
TTGGGAAGAT CATGATACTA TCAGTCGGTC ATGCTTTAGA GTGAAATGGT TCAAACAGAT 3240
TGCTTTCCTT TCAACAGCTA GCTGAGGTTA GCTGTGTTAA GAGAATGGGA GTTTTGAAGT 3300
GGTTAAAGAG AAAGAAGTAA TGCAGGAGTG GCACTGCTTA GAGGCTAACA CCCCCATCGG 3360
AATACTGGGC AGCTGGTAAG CAAAAGTACA GAAAGGGAAG TGAGAAGATG CCAAAGATAA 3420
ACTCTATTTC AAAATTCTGA CTATGGTCAG CCCCACCCTC AAGAAGAGAG GGACAGGTTC 3480
TTCCTCTTTT TCTGTCCTGT ACAAAGCAAT CTCCTATTCC CAGGACCAGG AAGTTCAGGT 3540
CCAAGGGCCA CTCTAAGGAA AATAGAGTTG GAAGGGACTT TAGGGGTCCT ATCCAGTCTA 3600
CTCACCACAA GGCCTCCCAC ACCCTCCTGC ATGAATCCTC CAAACTCCTC CTGACCATCT 3660
TTGCATCTTT GTTGCTCCTT TGTTGTCTAT TTGGGGCTCG AGTTAGTTGT TAGAAATTCC 3720
TTTCTATCAG CCAACAATCT TATCTCCCTT CAACTTCCCC TCATTTGTCT TATATCTGCC 3780
CCTGGAATTG CCCAGTCTGT GTGGTATTTG TTCCAATGGA ATTTGATCTG TCATATACTG 3840
TTGCTTTTGG CTGATTTGCT AAATTGACTG GATCTCTCTC TAAACTCAAT GATTTGGATC 3900
AAGGTAAATG CTGGTAAAAT GTGCCAGCAA TTTCTTTTTC AGAAAGATCT TGCTATTGCT 3960
CTGTTACTTT TGTTTGTTTG TTTTTTTTTA AAGAATGTTC 4000