EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-13756 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr8:27208560-27212050 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2322599chr827211910hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr8:27209407-27209428GGAGGGAAAGAGAAACTGCTA-6.04
Lhx3MA0135.1chr8:27209116-27209129AAATTAATTAATA+6.37
POU6F1MA0628.1chr8:27209118-27209128ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:27209118-27209128ATTAATTAAT-6.02
SREBF2MA0596.1chr8:27209731-27209741ATCACCCCAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 26             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09156chr8:27208549-27216328CD14
SE_10868chr8:27181046-27285079CD20
SE_12034chr8:27208789-27209938CD3
SE_14795chr8:27209071-27210209CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17600chr8:27208955-27210126CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17600chr8:27210641-27213321CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18325chr8:27208505-27216400CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19392chr8:27209057-27210284CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20066chr8:27208510-27210342CD56
SE_20066chr8:27210495-27212180CD56
SE_22414chr8:27208794-27210228CD8_primiary
SE_22414chr8:27210342-27213357CD8_primiary
SE_27921chr8:27206089-27209694Fetal_Intestine
SE_27921chr8:27210296-27212518Fetal_Intestine
SE_28623chr8:27205960-27216142Fetal_Intestine_Large
SE_32488chr8:27208562-27211227GM12878
SE_40108chr8:27210689-27211568K562
SE_41696chr8:27210655-27212103LNCaP
SE_43522chr8:27208299-27210240MM1S
SE_50221chr8:27210666-27212163Sigmoid_Colon
SE_52630chr8:27209228-27210079Small_Intestine
SE_53591chr8:27209161-27210079Spleen
SE_59882chr8:27206325-27247753Ly4
SE_62276chr8:27181124-27271753Tonsil
SE_66769chr8:27209012-27210077Jurkat
SE_67171chr8:27208299-27210240MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr82720860927210040
chr82721093427211655
chr82720929127209793
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH08I027347chr82720512327211867
Enhancer Sequence
TGCTTGGAGC AGGCACAGTG GTGCACACCT GTAGTCTGTA GTCCCAGCTA CTCAGGAGGC 60
TAAGGTGGGA GGATCACTTG AGCCCAGAAG TTCCAGGTAG CAATGAGCTA TAATTATACC 120
ATTGCACTCC AGTCTGGGTG ACAGAGCAAG ACCCTGTCTC TAAAAATGAA ATATATATAT 180
ATTTCACAAG GAGCAGTGGG ATTTAATCTA TGTTCTTCCT GGACCCATAG AATAGAAAGT 240
CATGGAATCA AAGAATATTA AGCCGATAGG AACTGTAATA ATCACCTGGT CCAATCCCTT 300
TAATCACGGG TGAGAAAATG GTCTCCAAGA TGTTAGAAGT GATTAATCTG GGATTGTAGA 360
AATGTTCCAT TTGCCTTTAA AATAAAAATA CAAAAATAAG AAAGCATAAA AGTGACTTAC 420
CTAAGGTTCC ACAGCCACAC AGACAAAGAA TTTGTCTAGA CCCTGAATCT GTTGACTTCC 480
ATCCCTCTAC TGGTCCTAAT GGATTCCATC TGAGGCTAGA ACTGAGTTTC CAAAAATATC 540
CTTTACCAAA AAAAATAAAT TAATTAATAA ATAAATAAAA GTGTACTAAT GCCTCCAACT 600
AGTCTTTGCA ATGTAAAACT TTCCATTTTC AACATTTCAC AATCTCCAGG ATAATTTCAT 660
CAACATTATC TTTTGAATAA AACATAGACT TATCTATGGG GAAACATTAC ACCTAAAATG 720
TCAGCAGTCA GCAAATCTCT CAAAAGACAC CTGGTTATGT AGGATTAAAA CCACCCGTTG 780
AAGGGCAATG TGAAAATGGA ACCTCTGTTT GACTTTCGTA ACCCACTTCC CACGTAGCCC 840
ATCCACTGGA GGGAAAGAGA AACTGCTAAT GGGATGGTAA AAGCAGTTTG AATGCCATCC 900
CCCGCAGAAG CTCCTGTCTA CAGCTTTTGT TCCCATGGTC TCTTCAATAA ATATGACTCA 960
GGCTGCTGTT TGGGCTTCAC TTCCTCTGGG CAGGGAGCTG ACAGCAGCGG CTCTGCTGTG 1020
CCCATCATGG TTGACTCAGG GGACCCACGG CGGGGGGGCT GCCTGTCCTC TCCCCAGCTG 1080
ACCAAACACC CTTCTGCTCT TCCAAGCGCT GCTGTCCCTG ACTCTTCTAG CTTTCAAAGT 1140
TCTCACCAAT TCATAAGGCT GGTGGCTCCC CATCACCCCA TTACTTTTTC TAAAGCAGTG 1200
CTGTGCACGT ATCTTGATAA GCTGCCAAAG TGCTTTTTTC ACCCACCTAC TCACCTATAG 1260
AATTCATAGT CTCCAGTGTA GGCATGACGC ATGGAAGGCC AAGGAAAGGC CAACATGTGT 1320
TCCTGCAAAA AACAAAAGCA AAAGACAGGA AAAGCCTCCC AACCATCTCA CCTCTTCTAA 1380
ATGCTTGTTG GAGCAAGACC ACAATCTACT TAACGTCTTC AGGGGTGGAG GGGGGGCGGT 1440
CATCTGGGCC AGCCTACACT TGTAAACTTC TTTTTGCTAT AGAATCAGCT ATGAAAGGAG 1500
CTTTCACTTA TTTGGATACA CATTATTTGA TATGGTTTGG CTGTGTCCCC ACCCAAATCT 1560
CATCTTGAAT TCTCATGTGT TGTGGGAGGG ACCCGGTGGG AGGTAATTGA ATCATGTGGG 1620
TAGGTCTTTC CAACACTGTT CTCATGATGG TGAATATGTC TTGTGAGATC TGATGGTTTT 1680
GAAAAACGGA AGTCTCCCTG CACAAGCTCT TTTTGCCTGT TGCCATCCAT GTAAGACGTG 1740
ACTTGCTCCT CCTTGCCTTC TGCCATAATT GTGAGGCTTC CCTAGCCATG TGGAACTGTA 1800
AGTTCAATTA AACCCCTTTC TTTTGTAAAT TGCCCAGTCT CAGTTATGTC TTTATCAGCA 1860
GTGTGAAAAT GGACTAATAC ATTATTATTC TAAACTCAAG GGGATGGATT CTAGAACAAG 1920
AACTGTAGCA TTTTACATAA CAAGAACAGT TACAAAGGAT TGAATAAAGA GTATGGGGGT 1980
CTCCTTCACC TAAGCCAGCC CAGGCTACAG TCACCTAAAG GATACAGAGA AGTGGAGAAC 2040
CACATTTTCA CGGGACTGCT CATCTAGTCT TGGGATTAAA GGGGATTAAT TGCAAAAATA 2100
TTTAGTTAGC AATCCAAAAA TATTTAGCGT CCACTACAGA AGAGACCCAG AAGATTTACG 2160
GTATAAGTTT GCCATAAGCT ACATACCAGT TGGGCTGTTA ATGTTGGGGG CTGTGTTTTT 2220
CTCCAATACT CAAGGGCAGT AGGGAGTGGA TGGGGAGATA CCACATCAGG CTAGTCAGTC 2280
ACCCTTGGCT TTGGGATGGC ACTCCTTGTC CAAGAAAGTG CTGTTTTTTG CTAGGACATC 2340
TCAGATGCAG GGTGCATTGC TTACCAATCT GCTGTGAAAT TTTCTCCTCC TTGTCCTTTC 2400
TTCATATGGG ATAGGAAAGG CCCAGCTTGG CCTAACTATG CCCTCACACG CTGATCTGTG 2460
AGTGTGAGTA AACACAGCTC CTAACTCATT CACTCATGCA TGCTCGCTCT CTCTCTAACA 2520
CACACACACA TTGATCCTGT GGTCACCATA GCACAGCCCT GTATCTACCT AGTAATGGCA 2580
GACCAAGACA GCACTTGAAC AGATGAGGCA ACTAGGGTAG GGCTGTTCCC AGGGGAGGCT 2640
GTTCAGGAGG CACGATTTCT ACTGCTCAGC TGCATGAAGG TTAATAGCCT GGAGTGCCAA 2700
CTCCGTAAAC CTTATCAGTC ACTTAGACCT GACTATGGGT GGCTCTGTAA GATATTTCCC 2760
AAGAGCAGGG GACAAAGAGC CTCAGCAGAA ATGGGCCTGC TATTGAAGAT GAAGCAGGGA 2820
AAGGCAGGTG TCACACCCCT GTTTATTGTC CCAGCACTCT TTTAGTTGCA GATGACAGAA 2880
ACCCAAAAGA GAGGATTCAC CTTGGCTCAC ATACCCAAAT TAAGGGAAGA TTCAGGAAGC 2940
AGCTGAACTC AGGTGTGGTG GGAATCAGGA CCTCATCCCA GAACCTCAGA CATCTCTGTG 3000
TCTGCCCCTC TGCCTCTGCT TCTGTCTCTC ACATCTCTGG CTGTCATTAC ATGTTGGCTT 3060
AATTCTTTCA GAACAACTTG TGCCAAAAGA AAGGAACTTG GTGGCTAATG GTGTCTGAGC 3120
TCCCAGCCAT AGCCCTATCA CCCAGAGAAA AGCCCTTTTC CCCAAGCTAA AGTAAAAATG 3180
CCAAAGAATA ACTCTGATTA GTTTGGCTAA GATCGTGTGT CCATTTCTGG ACTAACCCCC 3240
ACAGCCAAAA GGGTGGGGTA CTGTGTTTGC TTCCTCTTGA TTAATGTGCC CCATCCTGTG 3300
GTCCAGGCCA GGACGGGGAG GAAGAGGAGA TGGTGTTCTG TGATGAGCCG TCTCCACTAG 3360
CACACAAGGC TGGCCTGGGA GGAGGAACAG TCTCACAAAG AAAGCCAGTG AAATTCTCCC 3420
AAGCAGGGAA AGGAGACGTT GCAGACAGAT GAAACAATTG AGGTCACCTG CAATCTATGT 3480
GCAAGCAGTT 3490