EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS073-10974 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
GM19238 
Coordinate
chr4:40214410-40217860 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr4:40216201-40216212AAGAGGATTAG+6.62
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:40217114-40217132CCCTCCTTCCTTTCCTTC-6.26
HNF4GMA0484.1chr4:40217599-40217614TGGACTCTGACCTTT-6.07
Hnf4aMA0114.3chr4:40217597-40217613GGTGGACTCTGACCTT-6.13
IRF1MA0050.2chr4:40214968-40214989CTCTCGTTTCTCTTTTTTTTT+6.27
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:40217332-40217347GAGGTCAAGAGTTCA+7.64
Nr2f6MA0677.1chr4:40217606-40217620TGACCTTTGACTTC-6.67
RARAMA0729.1chr4:40217332-40217350GAGGTCAAGAGTTCAAGA+6.45
RxraMA0512.2chr4:40217606-40217620TGACCTTTGACTTC-6.37
ZNF263MA0528.1chr4:40217115-40217136CCTCCTTCCTTTCCTTCCTTC-6.68
ZNF263MA0528.1chr4:40217118-40217139CCTTCCTTTCCTTCCTTCTCT-6.69
ZNF263MA0528.1chr4:40217102-40217123TCCTCCCTCGCTCCCTCCTTC-7.44
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10329chr4:40215716-40216705CD19_Primary
SE_10959chr4:40191443-40249782CD20
SE_11827chr4:40213035-40217061CD3
SE_14402chr4:40193769-40216813CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15401chr4:40213088-40215608CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15401chr4:40216008-40216650CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16318chr4:40212916-40215268CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16318chr4:40215530-40216944CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16853chr4:40193904-40217325CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17299chr4:40190968-40235584CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17767chr4:40191375-40225023CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18266chr4:40191435-40224711CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19152chr4:40211526-40217426CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20751chr4:40213015-40215116CD8_Memory_7pool
SE_20751chr4:40215621-40216927CD8_Memory_7pool
SE_21487chr4:40214028-40217046CD8_Naive_7pool
SE_21915chr4:40212046-40217910CD8_Naive_8pool
SE_22292chr4:40191558-40250023CD8_primiary
SE_25424chr4:40213145-40215231DND41
SE_31036chr4:40215967-40216581Fetal_Thymus
SE_58296chr4:40151405-40268478Ly1
SE_58875chr4:40171449-40215497Ly3
SE_60449chr4:40179676-40229305DHL6
SE_62215chr4:40173915-40268314Tonsil
SE_68018chr4:40190441-40215679TC32
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I040212chr44021409940217799
Enhancer Sequence
GGTAAGATGC TCCCTGATGG GGACTTGTTG GATGCTGGCC GTGCCAGCTG GCTGAAACCC 60
CCAGGGTCAG ACTTCCTTGC AGGGGATCCT TATCATGTGG ATGGCAGCCA CTGCTGATAG 120
ATTGGGGAAC TGCTTCCTTT GCCATCTCCC TATAGGGAAG GTTCCCCTAA ACTGAGTCCC 180
TAATAATCTC AGAGCGAGAC GTGTGCTGTG GGGATCTTAT CATCTTATCA GATTTTTCTA 240
AACTATAGTC CTTCTTAGAA GTGAGAGGCC CAGAACACTC TACTTTATGC AGGAATAGCA 300
GAGATGACTC ATGGTTGGGA AGACACTAGA ATTCAGCCAG GAGAATATCA TTAAAAGAGG 360
GAGAAGGGAA AACAGACTTT TTGTGTGGTA CAAAAACAAA ACCCTCTGTA TCATTATGTG 420
AACAACGGTG CAAAAAAGAG GAGACACAGT TTACCCATGG GTAGCTAACT ATGATAGTGA 480
AAGTTGCCTT GAACCTTGTT TTAGAAAAAT GGCAAGTGTG GGTCTCACTC TTCTAGTTCC 540
TGACTTCTCT CTCTCTCTCT CTCGTTTCTC TTTTTTTTTT TTTCTCTCTC TCTCTCTCTC 600
ACACACACAC CCATCTTGGG CCAGGTTTGT AAAGCCTCAT GGGAAATGGA ACACGGAAGA 660
GTCTTCTGGG AGGTTTTAAA ATTTAATTTT AGTCAGATTT AGTAAGATTT CTTCATACAA 720
AACAAAACAA AAATTCTCTA AAAAAAATCC TTGTTAGGGT CTGGTTAAGA CAACTAATAA 780
CAACAGATGT GAGGGCATAG TTCCTAGTTA CCAAAGAATC GCTCTGGTGA GAGAGGAGTG 840
GAGGCAAAAA TTCCAGATGG TACCTGGGTA GCGATTGCAC TCAGATGGGT CATCTGAGGA 900
CAGCTGCCCT AGACCGCTGC TCCTGAGCCT CTCCATTGTA ATTTTCCTTC TTCTAGTTCC 960
TTTTTAAAAA TTTTTCTTTT TTGTTGAGAT AGAGTCTTGC TCTGTCTCCC AGGCTGGAGT 1020
GCAGTGGCAT GATCCCCAGT CACTGCAACT TCCGCCTCCC AGGTTTAAGT GATTCTCCTG 1080
CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGATTACAGG TGTGTGCCAC CACGCCCGGC TAATTTTTGT 1140
ATTTTTAGTG GAGACAGGGT TTCACCATGT TGGCCAGACT GCTCTCAAAC TCCTGTGCTC 1200
AAGTGATCTG CCCGCCTCAG CTTCCCAAAG TGTTGGGATT ACAGGTGTGA GCCACTGTGC 1260
CTGGCCTAGT TCCTTTATTT TAAAAGCTTA AATGCATGAA GCATACAGTA CTGTGAAGAC 1320
TTGCTTGATG TGATGCAGGT TCCTTAATCT CCTCCTTTGC TATTTGGTTC GCAGATGGTG 1380
GTACGGGTGG CACTTTGGGG AAGGCGGGGC GGAAGGAAGC TTTCTGATGA ATGTTTGCAC 1440
AGTATACGAG AAGGTTACAA GATATGGGCA TCATGCACAG GTGGCGAGGT GGTTAGAGAA 1500
AGGTAGATGG TGTTTGGGGA TTACCCTCTG GTACATTTCA ATTCACTTTG GGGTTATGAG 1560
ATTTCAGAAG GTTAGCTAAT GCTTACGTCC TGGGGTGGGC TCTTTTGTAT TTCTTTGTTG 1620
TCTCTTTTTT ATTTTTTAGA GACAGAGTTT TACTATATTG CCCAGACTGG TCTCAGACTC 1680
CTGGCCTCAA GCGATCCTCC CACCTCAGCC TCTGAGTTAC AATTGTCTCT TGAAAGTAAT 1740
TTCAGGTAGG CTTGGGGCTA CCAAGGCAAG CCTAGGGAAG CCTACTACAT GAAGAGGATT 1800
AGAGTCCTCT GGAGAAGTTG GATTCATATG AAGAGATACT AATCAGAAAG TTGGGAGTTA 1860
GTCATCCATG GAAAACAGGC ATGTTTGAGA ATCATATTCT GGCAGTGCCC ATCCATGCAT 1920
TATCAGTGGA GAGAGAACCT TGGCTAATGG ACTTCCCCAG TTTTGATCCC ATGGATAAGA 1980
CCATGGGGGA GAGGGTAAGG CTTAGGCTAA TGCATATTCT TGGATCATTC AGTCACCTCC 2040
TTCCACTCTG AGTCCCTGTT GACCAGGGAA TGTCTTGGTG TCATAGCTTG GCTTTCCAAT 2100
GGCTCTCCCC GTGGGGAAAG AATACACAGG CTGTGTTGAT GGTATTCTAG TCCTGACGAG 2160
AGCTGCGTTT CTCATGGTCA GCAAATGAAT TGGCATCCGA TATATAAGCA AATCTTGTGA 2220
CTGTAAAGTC ATATACTTTC TTGTTAGTTG AGGGAATCAG ATTTCTGAGG GTAAGAGGTG 2280
AAGCCAAGAA CATGGCAAAT TCATTATCTT GATAAAAACT ACCCGGTAAG GCTGCCCATT 2340
TTCTTTCAAA CTGCAACACC ATATGTCCAG CGAGGTTCCT CTTACGAGAC ATCAGGGGTA 2400
TCAGGAGTGG GTGCCAAGCT GGAGTCCTGA GAATGAGGGA AATAGGAGAC CATGAGTTTT 2460
GAGCACCACC GCAATTTCTC TTCTCCTTTT GTCCCTCTTG CTTTAGGTAG TAATGCATGC 2520
CTTAAGATAA TAAAAGGTCT GTCTTTGTGG GCTCTTCATT GCCATAGAAA AATGATTGGT 2580
ATGAGTTTCC CAAGGCCTCG GATAAAAATA TTTCTTCAGA GAGGGTTTTG AAAACTTATG 2640
CCAGTTACCT GGGTGGACTC CAATCTTTCA AGCACTGTGT GTCTTTTCCT GGTCCTCCCT 2700
CGCTCCCTCC TTCCTTTCCT TCCTTCTCTA AACAGAGTCT AAGGTAATGC CCCTCTCCAG 2760
TTTCTTGGGA TAGGGAAGGG GGTGGAATTA CTTCTGACTC ACCCTTACCC TTATGGTGTA 2820
CCCTTTGGGG TTCTGGCTAA AATATATGTA TTGGGAAGTG GGACGCAGTG GCTCACGCCT 2880
GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCAAGGCG GGTGGATCAC TTGAGGTCAA GAGTTCAAGA 2940
CCAGCCTGGC CAACACCCAT CTCTACTAAA AATGCAAAAA TTAGCCTGGT GTGGTGGTGC 3000
ATGCCTGTAA TCCCAGCTAC TCAGGAGACT GAGGCATGAG AATCGCTTGA ACCTGGGAGG 3060
TGGAGAGGGT GGTGAGCCAA AATCACGCCA CTGCAGTCCA GCCTGGGTGA CAGAGCGAGA 3120
CTCTGTATCA AAAAACAAAC AAATAAGTAA AATATATATA TTGGGGTCCA TTAGTTTTTC 3180
CACCCTGGGT GGACTCTGAC CTTTGACTTC TGTCATCCTT GCCCCATGAA GCCATCGGAA 3240
CTGCAGCTCG TTTTCCGCTT TTTCATCGCC ATTTCTTTCA GCTGACAAAT GCTGTTTACC 3300
TCACTGGCTT CTCCTTTATT CTTAGGTTTT GGCCTGACAG TTGCTATTTT TTTTTTTTTT 3360
TTTAGCTCTT TGATACTTTT AAGAAAATGG TTTTTAGGCC ATGCACAGGG GCTCATGCTT 3420
GTAATCCCAG AACTTTGGGA GACCGAGGTG 3450